规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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1mg |
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5mg |
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Other Sizes |
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靶点 |
LXRβ/liver X receptor beta
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体外研究 (In Vitro) |
核受体家族的肝脏X受体(LXRs)是多种疾病的有前景的治疗靶点,如脂质紊乱、慢性炎症以及不同的人类癌症。迄今为止,还没有LXR激动剂或拮抗剂可用于临床,这强调了发现新的LXR调节剂的重要性。基于片段的先导物发现(FBLD)在设计新的支架和新的机制药物方面非常强大,但片段筛选尚未应用于LXR,这可能是由于缺乏针对LXR动态和疏水配体结合结构域(LBD)的特定片段筛选方法。本文设计、合成并测试了一系列荧光示踪剂。基于猪去氧胆酸的示踪剂显示出使用荧光偏振方法竞争性检测LXRβ配体结合的良好能力。然后,针对LXRβ的LBD(LXRβ-LBD)筛选了1074个片段,得到27个结合位点。使用共激活剂补充分析和报告基因分析进一步测试了这些片段命中,幸运的是,X射线晶体学的研究解决了LXRβ-LBD与片段F3(7-氨基-3,4-二氢异喹啉-2(1H)-羧酸叔丁酯)的共晶结构。基于荧光的片段筛选工具和新鉴定的LXRβ结合片段为开发新型LXRβ调节剂提供了基础[1]。
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酶活实验 |
FP结合试验[1]
所有FP实验均使用黑色NBS聚苯乙烯384孔微孔板,使用Victor X5微孔板读数器进行。对于饱和实验,使用FP缓冲液(50 mM Tris,pH 8.0,400 mM NaCl和5 mM 2-巯基乙醇)和LXRβ(0-20μM)以不同浓度加入。对于每种LXRβ浓度,使用三重孔。反应中DMSO的最终浓度固定为0.5%(v/v)。使用轨道振荡器在25°C下轻轻摇动微孔板(100 rpm)10分钟,并在1500 rpm下离心1分钟。在室温下平衡30分钟后,分别使用485 nm和535 nm的激发和发射滤光片记录FP值。 FP竞争分析[1] 之前报道的LXR激动剂和反向激动剂被用作阳性测试化合物。竞争结合试验中使用了400 nM LXRβ和10 nM荧光示踪剂的最终浓度。用浓度增加2倍的LXR调节剂进行三次检测。将数据拟合到以下方程式中,并根据报告的方法计算Ki值。 使用FP竞争分析进行片段筛选[1] 筛选中使用的片段库由1074个片段组成,其中486个片段选自Maybridge的Ro3片段库,246个片段选自TargetMol片段库,342个片段选自ZINC化合物库的低分子量天然产物。 片段筛选在黑色384孔板上进行。将10 nM荧光示踪剂1与400 nM LXRβ-LBD在FP缓冲液中混合,然后以1 mM的终浓度加入片段。在室温下孵育平板30分钟,然后在Victor X5酶标仪(PerkinElmer)上读取FP值。将替代示踪剂≥25%的碎片定义为阳性命中。进一步测定了取代示踪剂≥30%的碎片的Ki值。 共激活剂募集试验[1] 通过荧光偏振分析进行共激活剂补充分析。使用的缓冲液与上述FP缓冲液相同。1μM LXRβ-LBD,将0.1μM标记的共激活肽和不同浓度的片段或GW3965加入FP缓冲液中。分别使用485 nm和535 nm的激发和发射滤光片记录偏振值。EC50值通过用Graphpad Prism 6.0拟合剂量反应曲线来确定。 |
参考文献 | |
其他信息 |
In this study, three fluorescent tracers were designed, synthesized and evaluated, and the tracer 1 was used to screen fragments for LXRβ from a library containing 1074 small fragments. A set of 27 novel fragment hits were identified, and the binding affinity, agonistic activity and the binding mode of top fragment hits were studied. Especially, fragment screening suggested Boc group a privileged building block for designing LXRβ modulators. A co-crystal structure of LXRβ-LBD in complex with a Boc-containing fragment revealed that the Boc group stabilized the His-Trp activation switch of LXRβ-LBD by forming a hydrogen-bonding interaction with His435. The fluorescent tracer and hits generated in this study could help for developing novel LXRβ modulators. [1]
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分子式 |
C59H56N4O9S
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分子量 |
997.162354469299
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精确质量 |
996.376
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CAS号 |
2374144-23-5
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PubChem CID |
168006992
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外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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LogP |
7.4
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tPSA |
211
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氢键供体(HBD)数目 |
6
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氢键受体(HBA)数目 |
11
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可旋转键数目(RBC) |
21
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重原子数目 |
73
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分子复杂度/Complexity |
1740
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定义原子立体中心数目 |
0
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SMILES |
S=C(NCCCCCC(NC1=CC=CC(=C1)CN(CCCOC1C=CC=C(CC(=O)O)C=1)CC(C1C=CC=CC=1)C1C=CC=CC=1)=O)NC1C=CC2=C(C=1)C(=O)OC12C2C=CC(=CC=2OC2C=C(C=CC1=2)O)O
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InChi Key |
NSDMNSCDJXAQNR-UHFFFAOYSA-N
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InChi Code |
InChI=1S/C59H56N4O9S/c64-45-23-26-51-53(35-45)71-54-36-46(65)24-27-52(54)59(51)50-25-22-44(34-48(50)57(69)72-59)62-58(73)60-28-9-3-8-21-55(66)61-43-19-10-14-40(31-43)37-63(29-12-30-70-47-20-11-13-39(32-47)33-56(67)68)38-49(41-15-4-1-5-16-41)42-17-6-2-7-18-42/h1-2,4-7,10-11,13-20,22-27,31-32,34-36,49,64-65H,3,8-9,12,21,28-30,33,37-38H2,(H,61,66)(H,67,68)(H2,60,62,73)
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化学名 |
2-[3-[3-[[3-[6-[(3',6'-dihydroxy-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-5-yl)carbamothioylamino]hexanoylamino]phenyl]methyl-(2,2-diphenylethyl)amino]propoxy]phenyl]acetic acid
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别名 |
FITC-GW3965; 2374144-23-5; FITC-GW-3965
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HS Tariff Code |
2934.99.9001
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存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
1 mM | 1.0028 mL | 5.0142 mL | 10.0285 mL | |
5 mM | 0.2006 mL | 1.0028 mL | 2.0057 mL | |
10 mM | 0.1003 mL | 0.5014 mL | 1.0028 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。