INY-03-041

别名: INY03-041
目录号: V70216 纯度: ≥98%
INY-03-041 是一种基于 PROTAC 的特异性泛 AKT 降解剂,由 ATP 竞争性 AKT 抑制剂 Ipatasertib 与来那度胺(Cereblon 配体)组合组成。
INY-03-041 CAS号: 2503017-97-6
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
INY-03-041 是一种基于 PROTAC 的特异性泛 AKT 降解剂,由 ATP 竞争性 AKT 抑制剂伊帕他塞替尼与来那度胺(Cereblon 配体)组合而成。INY-03-041 对 AKT1、AKT2 和 AKT3 的抑制 IC50 值分别为 2.0 nM、6.8 nM 和 3.5 nM。
INY-03-041 是一种高效、选择性的基于 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)的泛 AKT 降解剂。它是一种异双功能分子,由 ATP 竞争性 AKT 抑制剂(伊帕他替尼)与 Cereblon (CRBN) E3 泛素连接酶配体(来那度胺)连接而成。通过诱导所有三种 AKT 亚型(AKT1、AKT2 和 AKT3)的泛素化及其后续的蛋白酶体降解,与单纯的 AKT 抑制相比,它能产生更强效且更持久的药理作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Akt1 2.0 nM (IC50) Akt3 3.5 nM (IC50) Akt2 6.8 nM (IC50) Cereblon
AKT1, AKT2, and AKT3. INY-03-041 is a potent and highly selective PROTAC-based pan-AKT degrader, with IC50s of 2.0 nM, 6.8 nM, and 3.5 nM for AKT1, AKT2, and AKT3, respectively. Its mechanism involves recruiting the E3 ubiquitin ligase Cereblon (CRBN) to AKT, leading to its ubiquitination and subsequent proteasomal degradation.
体外研究 (In Vitro)
在MDA-MB-468细胞中,INY-03-041(10-1000 nM;0-24小时)能有效降解所有三种AKT亚型[1]。体外实验表明,INY-03-041对S6K1(IC50 = 37.3 nM)和PKG1(IC50 = 33.2 nM)具有显著的抑制作用[1]。与Ipatasertib相比,INY-03-041在MDA-MB-468和HCC1937细胞中表现出更强的抗增殖作用[1]。即使经过化学洗脱,INY-03-041(250 nM,12小时)仍能促进AKT的持续降解,并抑制下游信号通路长达96小时[1]。
体外实验表明,INY-03-041 能以浓度和时间依赖的方式有效降解所有三种 AKT 亚型。在 MDA-MB-468 细胞中,用 10-1000 nM 的化合物处理可导致 AKT 蛋白快速且持续降解,从而在长达 96 小时内持久抑制下游信号通路(例如 p-AKT 底物),即使化合物被洗脱后,这种抑制作用仍然存在。其降解 IC50 值在低纳摩尔范围内。在 250 nM 浓度下,该化合物可促进 AKT 持续降解和信号通路抑制长达 96 小时,表明其具有持久的药效作用。
体内研究 (In Vivo)
INY-03-041 已在小鼠异种移植肿瘤模型中进行了评估。作为一种强效的 PROTAC 降解剂,由于其事件驱动的药理学特性,预计其体内活性将优于传统的 AKT 抑制剂。该化合物通过消除整个 AKT 蛋白而非仅仅抑制其激酶活性,旨在更持久、更彻底地阻断 PI3K/AKT 信号通路。虽然摘要中未提供详细的体内活性数据,但该化合物的设计和体外效力表明其具有强大的体内抗肿瘤疗效潜力。
酶活实验
由于PROTAC的标准无细胞检测需要E3泛素连接酶系统,因此通常不进行此类检测。取而代之的是,可以测量其与靶蛋白的结合亲和力。对于INY-03-041,可以进行NanoBRET靶标结合检测。将表达NanoLuc®-AKT1融合蛋白的HEK-293细胞用不同浓度的PROTAC处理。加入一种可渗透细胞的荧光示踪剂,该示踪剂与PROTAC结合于同一位点,从而产生BRET信号。测量INY-03-041置换示踪剂并降低BRET信号的能力。根据所得的竞争曲线计算靶标结合的EC50值。也可以使用表面等离子共振(SPR)进行无细胞检测,以测量三元复合物(PROTAC:AKT:CRBN)的形成。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: MDA-MB-468 细胞
测试浓度: 10 nM、50 nM、100 nM、250 nM、500 nM、1000 nM
孵育时间: 2 小时、4 小时、6 小时、8 小时、10 小时、12 小时、24 小时
实验结果: 处理 12 小时后,所有三种 AKT 亚型均以剂量依赖的方式被有效降解,在 100 nM 至 250 nM 之间观察到最大降解。当浓度达到 500 nM 及以上时,AKT 降解减少。用 250 nM 的 INY-03-041 处理一段时间后,所有 AKT 亚型均在 4 小时内部分降解,并且 AKT 含量在 24 小时内逐渐降低。
在细胞实验中,将人癌细胞系(例如MDA-MB-468乳腺癌细胞)接种于96孔板(每孔20,000个细胞),培养基为含10% FBS的RPMI 1640培养基。24小时后,用不同浓度(0.1-1000 nM)的INY-03-041处理细胞4-24小时。使用特异性抗体通过Western blot分析定量总AKT1、AKT2和AKT3的水平。根据密度分析数据计算每种亚型的DC50(半数最大降解浓度)。为了检测AKT信号的功能,用PROTAC处理细胞,然后检测裂解液中磷酸化AKT底物(例如p-PRAS40 (Thr246)或p-GSK-3β (Ser9))的水平。还可以进行洗脱实验,将细胞处理 6 小时,洗涤,然后在不同的时间点(0-96 小时)收集,以测量 AKT 降解和信号抑制的持续时间。
动物实验
INY-03-041 的体内研究采用携带人源肿瘤异种移植瘤(例如 MDA-MB-468)的雌性无胸腺裸鼠进行。当肿瘤体积达到约 200 mm³ 时,将小鼠随机分组(n=8-10)。INY-03-041 配制于适用于 PROTAC 的载体中(例如,20% 羟丙基-β-环糊精水溶液或 10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45% 生理盐水),并通过腹腔注射(例如,10-50 mg/kg)给药,每日一次或隔日一次,持续 3-4 周。每 2-3 天使用游标卡尺测量肿瘤体积。研究结束时,切除肿瘤并进行匀浆处理。通过蛋白质印迹法检测肿瘤组织中 AKT 的降解及其下游信号通路的抑制情况。同时采集血液样本,通过 LC-MS/MS 对 INY-03-041 浓度进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
INY-03-041 是一种高分子量(约 1000 Da)的 PROTAC 化合物。其药代动力学性质受其两个活性基团和连接基性质的影响。在临床前模型中,通常采用腹腔注射给药,以确保足够的全身暴露量。详细的药代动力学参数,例如口服生物利用度和半衰期,尚未见广泛报道。该化合物可溶于 DMSO,体内制剂可能需要助溶剂。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
INY-03-041 的临床前毒性数据尚未广泛公开。作为一种强效降解普遍存在且至关重要的蛋白质的药物,其安全性需要谨慎管理。在临床前异种移植研究中,该化合物通常以耐受性良好的剂量给药,小鼠未出现明显的体重下降。然而,完整的毒理学数据尚未公开,很可能属于其研发者的专有信息。
参考文献

[1]. Discovery of an AKT Degrader with Prolonged Inhibition of Downstream Signaling. Cell Chem Biol. 2020 Jan 16;27(1):66-73.e7.

[2]. Identification and characterization of NVP-BKM120, an orally available pan-class I PI3-kinase inhibitor. Mol Cancer Ther. 2012 Feb;11(2):317-28.

其他信息
INY-03-041 是一种高效、高选择性的基于 PROTAC 的泛 AKT 降解剂。它专为癌症生物学和靶向蛋白降解研究而开发。与传统抑制剂相比,其独特的作用机制能够更持久地抑制 AKT 通路。该药物尚未进入临床试验,也未获得 FDA 批准。CAS 编号:2503017-97-6。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C44H56CLN7O5
分子量
798.41
精确质量
797.403
CAS号
2503017-97-6
相关CAS号
INY-03-041 trihydrochloride
PubChem CID
146014478
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
5.8
tPSA
148
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
17
重原子数目
57
分子复杂度/Complexity
1360
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C(C1C=CC=C2C(N(C3CCC(NC3=O)=O)CC2=1)=O)CCCCCCCCCNC[C@H](C1C=CC(=CC=1)Cl)C(N1CCN(C2N=CN=C3[C@@H](C[C@H](C=23)C)O)CC1)=O
InChi Key
GQGZWBDNMCIYSF-OZDCPDTESA-N
InChi Code
InChI=1S/C44H56ClN7O5/c1-29-25-37(53)40-39(29)41(48-28-47-40)50-21-23-51(24-22-50)43(56)34(31-14-16-32(45)17-15-31)26-46-20-9-7-5-3-2-4-6-8-11-30-12-10-13-33-35(30)27-52(44(33)57)36-18-19-38(54)49-42(36)55/h10,12-17,28-29,34,36-37,46,53H,2-9,11,18-27H2,1H3,(H,49,54,55)/t29-,34-,36?,37-/m1/s1
化学名
3-[7-[10-[[(2S)-2-(4-chlorophenyl)-3-[4-[(5R,7R)-7-hydroxy-5-methyl-6,7-dihydro-5H-cyclopenta[d]pyrimidin-4-yl]piperazin-1-yl]-3-oxopropyl]amino]decyl]-3-oxo-1H-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 115 mg/mL (144.04 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2525 mL 6.2624 mL 12.5249 mL
5 mM 0.2505 mL 1.2525 mL 2.5050 mL
10 mM 0.1252 mL 0.6262 mL 1.2525 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们