Tat-NR2Baa

别名: H-TYR-GLY-ARG-LYS-LYS-ARG-ARG-GLN-ARG-ARG-ARG-LYS-LEU-SER-SER-ILE-GLU-ALA-ASP-ALA-OH
目录号: V70405 纯度: ≥98%
Tat-NR2BAA 是 Tat-NR2B9c 的对照肽,没有活性。
Tat-NR2Baa CAS号: 847829-41-8
产品类别: iGluR
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
Tat-NR2BAA 是 Tat-NR2B9c 的对照肽,不具有活性。Tat-NR2BAA 的序列与 Tat-NR2B9c 相似,但其羧基末端 tSXV 基序存在双点突变,使其无法与 PSD-95 结合。Tat-NR2B9c 是一种可透过细胞膜的肽,能够破坏 PSD-95/NMDAR 的结合。
Tat-NR2Baa 是 Tat-NR2B9c 的非活性对照肽。它与 Tat-NR2B9c 具有相似的序列,但在羧基末端的 tSXV 基序中存在双点突变,使其无法与 PSD-95(突触后致密区蛋白 95)结合。该肽被用作阴性对照,用于研究 Tat-NR2B9c 对 NR2B-PSD-95 相互作用的破坏作用,尤其是在中风、兴奋性毒性和神经性疼痛模型中。
生物活性&实验参考方法
靶点
NMDA Receptor
None (inactive control). Tat-NR2Baa is an inactive peptide that does not bind to PSD‑95. The active peptide, Tat-NR2B9c, targets the interaction between the NMDA receptor subunit NR2B (GluN2B) and PSD‑95. By blocking this protein‑protein interaction, Tat-NR2B9c prevents excitotoxic signaling without blocking NMDA receptor ion flux. Tat-NR2Baa, with its double‑point mutation (e.g., S→A, V→A), does not bind PSD‑95.
体外研究 (In Vitro)
Tat-NR2BAA(125 ng;20 分钟)不影响 PSD-95 和 NR2B 亚基的相互作用。另一方面,在腰椎背角组织中预先用破坏性肽 Tat-NR2B9c 处理的大鼠,其 PSD-95 与 NR2B 亚基的共免疫沉淀显著减少[1]。Tat-NR2B9c 的对照组为 Tat-NR2Baa(125 ng 或 1.25 μg;在收集腰椎背角组织前 20 分钟)。Tat-NR2B9c 可引起强烈的、明显的放电后抑制,表明细胞处于高兴奋状态。然而,即使剂量比活性肽 Tat-NR2B9c 高 100 倍,Tat-NR2Baa 也无影响[1]。在 Co-IP 测试中,对照组为 Tat-NR2Baa(1 μM;预处理 1 小时)。在海马神经元中,NR2B 与 PSD-95 的偶联比 NR2A/PSD95 更容易受到破坏,而 Tat-NR2B9c(1 μM)会损害 NR2B/PSD95 的相互作用[2]。
体外实验表明,Tat-NR2Baa 在共免疫沉淀实验中不会破坏 NR2B-PSD-95 的相互作用,而 Tat-NR2B9c 则会。它既不降低 NMDA 诱导的 NO 生成,也不能保护神经元培养物免受兴奋性毒性损伤。它对 PSD-95 的聚集或 NMDA 受体介导的信号传导均无影响。作为对照,在 Tat-NR2B9c 具有活性的任何实验中,Tat-NR2Baa 均未显示出活性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,Tat-NR2Baa(静脉或脑室内给药)对中脑动脉闭塞(MCAO)卒中模型中的梗死体积没有影响,这与Tat-NR2B9c不同,后者可减少梗死面积。Tat-NR2Baa也不影响神经性疼痛模型中的疼痛阈值。它被用作对照,以证实Tat-NR2B9c的作用是由于NR2B-PSD-95相互作用的特异性破坏所致。
酶活实验
不适用。作为阴性对照肽,预期不会产生结合活性。为确认缺乏结合,可进行下拉实验:将 GST-PSD-95 (1 ug) 固定在谷胱甘肽-琼脂糖珠上,并与表达 NR2B 的细胞裂解液在有或无 Tat-NR2Baa (1-100 uM) 的情况下孵育。洗涤珠子后,通过蛋白质印迹法检测结合的 NR2B。Tat-NR2Baa 不降低结合,而 Tat-NR2B9c 则会降低结合。
细胞实验
在细胞实验中,将原代皮层神经元(培养12-14天)接种于96孔板中(每孔50,000个细胞)。细胞用Tat-NR2Baa(0.1-10 uM)或Tat-NR2B9c(0.1-10 uM)处理2-4小时。在兴奋性毒性研究中,细胞在肽存在的情况下暴露于NMDA(50 uM,15分钟)。24小时后,通过MTT或LDH释放检测细胞活力。Tat-NR2Baa不能保护细胞免受NMDA诱导的细胞死亡,而Tat-NR2B9c可以。在共免疫沉淀实验中,细胞用肽处理后裂解,用抗NR2B抗体进行免疫沉淀,然后进行PSD-95蛋白印迹分析。Tat-NR2Baa不干扰共免疫沉淀。对于钙成像,用肽处理加载了 Fluo-4 AM 的神经元,然后用 NMDA 刺激;Tat-NR2Baa 不会减少钙流入。
动物实验
体内研究采用雄性C57BL/6小鼠(20-30 g)或Sprague-Dawley大鼠(250-300 g)。Tat-NR2Baa溶于无菌生理盐水中,在损伤或刺激发生前30-60分钟,通过静脉注射(3-30 nmol/g)或脑室内注射(5-10 μg/只)给药。在MCAO卒中模型中,小鼠接受60-90分钟的大脑中动脉闭塞,随后进行24-48小时的再灌注。Tat-NR2Baa在再灌注开始时注射(静脉注射)。梗死体积通过TTC染色进行测量。与溶剂对照组相比,Tat-NR2Baa无明显作用,而Tat-NR2B9c可使梗死体积减少40-60%。在CCI神经病理性疼痛模型中,Tat-NR2Baa(10-100 μg 鞘内注射)不能逆转机械性痛觉过敏或热痛觉过敏。行为学测试中,采用旷场实验排除非特异性运动效应;Tat-NR2Baa对此无影响。
药代性质 (ADME/PK)
Tat-NR2Baa(分子量 2474.8,序列 YGRKKRRQRRRxxxxx)是一种肽,与 Tat-NR2B9c 结构相似,但存在一个突变。它可溶于水。体内给药时,可通过静脉注射或脑室内注射给药。由于蛋白水解作用,其在血液中的半衰期较短(<30 分钟)。全身给药后,该肽可能无法有效穿过血脑屏障,因此对于中枢神经系统研究,脑室内给药是更优的选择。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
临床前毒性较低;在所用剂量(3-30 nmol/g 静脉注射,10-100 μg 脑室内注射)下,未观察到不良反应。该肽仅供研究使用。
参考文献

[1]. Treatment of Ischemic Brain Damage by Perturbing NMDA Receptor- PSD-95 Protein Interactions. Science.

其他信息
Tat-NR2Baa(CAS 847829-41-8)是Tat-NR2B9c的非活性对照肽。它在tSXV基序中含有双点突变,从而阻止了与PSD-95的结合。它被用作NR2B-PSD-95相互作用、中风和疼痛研究中的阴性对照。仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C103H184N42O29
分子量
2474.82707881927
精确质量
2474.424
CAS号
847829-41-8
相关CAS号
Tat-NR2Baa TFA
PubChem CID
168012956
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
-19.2
tPSA
1240
氢键供体(HBD)数目
48
氢键受体(HBA)数目
39
可旋转键数目(RBC)
97
重原子数目
174
分子复杂度/Complexity
5300
定义原子立体中心数目
20
SMILES
[C@H](CCCNC(N)=N)(C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1C=CC(O)=CC=1
InChi Key
JGOHJQLBRJDBTQ-RVYJUWCMSA-N
InChi Code
InChI=1S/C103H184N42O29/c1-7-53(4)78(96(172)140-69(34-36-76(151)152)81(157)128-54(5)79(155)141-71(48-77(153)154)92(168)129-55(6)97(173)174)145-95(171)73(51-147)144-94(170)72(50-146)143-93(169)70(46-52(2)3)142-90(166)62(22-10-13-39-106)133-85(161)63(24-15-41-122-99(111)112)135-87(163)65(26-17-43-124-101(115)116)136-88(164)66(27-18-44-125-102(117)118)138-91(167)68(33-35-74(108)149)139-89(165)67(28-19-45-126-103(119)120)137-86(162)64(25-16-42-123-100(113)114)134-84(160)61(21-9-12-38-105)132-83(159)60(20-8-11-37-104)131-82(158)59(23-14-40-121-98(109)110)130-75(150)49-127-80(156)58(107)47-56-29-31-57(148)32-30-56/h29-32,52-55,58-73,78,146-148H,7-28,33-51,104-107H2,1-6H3,(H2,108,149)(H,127,156)(H,128,157)(H,129,168)(H,130,150)(H,131,158)(H,132,159)(H,133,161)(H,134,160)(H,135,163)(H,136,164)(H,137,162)(H,138,167)(H,139,165)(H,140,172)(H,141,155)(H,142,166)(H,143,169)(H,144,170)(H,145,171)(H,151,152)(H,153,154)(H,173,174)(H4,109,110,121)(H4,111,112,122)(H4,113,114,123)(H4,115,116,124)(H4,117,118,125)(H4,119,120,126)/t53-,54-,55-,58-,59-,60-,61-,62-,63-,64-,65-,66-,67-,68-,69-,70-,71-,72-,73-,78-/m0/s1
化学名
(4S)-4-[[(2S,3S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]acetyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]-5-carbamimidamidopentanoyl]amino]hexanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-3-hydroxypropanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-5-[[(2S)-1-[[(2S)-3-carboxy-1-[[(1S)-1-carboxyethyl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.4041 mL 2.0203 mL 4.0407 mL
5 mM 0.0808 mL 0.4041 mL 0.8081 mL
10 mM 0.0404 mL 0.2020 mL 0.4041 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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