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PDZ1 Domain inhibitor peptide

目录号: V70454 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
PDZ1 结构域抑制剂肽是一种环肽，可与 β-丙氨酸内酰胺侧链接头结合并靶向 PSD-95 的 PDZ1 结构域。
PDZ1 Domain inhibitor peptide CAS号: 1315378-73-4
产品类别: iGluR
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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5mg
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产品描述
PDZ1 结构域抑制肽是一种环状肽，它与 β-丙氨酰胺侧链连接子结合，并靶向 PSD-95 的 PDZ1 结构域。PDZ1 结构域抑制肽破坏 GluR6/PSD-95 相互作用，并能与 GluR6 的 C 末端竞争结合 PDZ1 结构域。
PDZ1结构域抑制肽是一种合成环状肽，旨在选择性地破坏由突触后致密区蛋白95 (PSD-95) 的PDZ1结构域介导的蛋白质-蛋白质相互作用。它特异性地靶向PDZ1结构域，与GluK2（原GluR6）的C端竞争结合位点。该肽是研究PDZ依赖性受体转运、突触组织和信号转导通路（尤其是谷氨酸受体信号传导和兴奋性毒性）的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
CAS# 1315378-73-4. The PDZ1 domain inhibitor peptide targets the PDZ1 domain of postsynaptic density protein 95 (PSD‑95). It disrupts the interaction between GluK2 (formerly GluR6) and PSD‑95 by competing with the GluK2 C‑terminus for binding to the PDZ1 domain. PSD‑95 is a scaffolding protein that organizes glutamate receptors (AMPA, NMDA, and kainate receptors) at the postsynaptic density, linking them to downstream signaling molecules. Disrupting this interaction is a strategy to modulate synaptic transmission, plasticity, and excitotoxicity.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明，PDZ1结构域抑制肽能以高亲和力与PSD-95的PDZ1结构域结合，从而阻止GluK2（红藻氨酸受体亚基）与PSD-95的结合。这种抑制作用会改变红藻氨酸受体的定位、转运和信号传导。该肽已被证实能高效地与GluR6的C端竞争PDZ1结构域。这种相互作用会调节参与突触可塑性和神经元存活的下游信号级联反应。目前，详细的功能数据有限。
体内研究 (In Vivo)
在体内，PDZ1结构域抑制肽被用于研究PSD-95在突触可塑性、记忆和兴奋性毒性中的作用。这些肽通过破坏PSD-95与谷氨酸受体之间的相互作用，可以减轻动物模型中的兴奋性毒性和中风引起的脑损伤。然而，针对这种特定环状肽的体内数据有限；它通常是一种用于体外结合和细胞培养研究的研究工具。
酶活实验
对于无细胞结合实验，PDZ1结构域抑制肽可用于荧光偏振（FP）或表面等离子共振（SPR）分析。将重组PSD-95 PDZ1结构域（5-20 ug）固定在传感器芯片上或加入96孔板中。将对应于GluK2 C端（例如FITC-YVKI）的荧光标记肽与不同浓度的PDZ1结构域抑制肽（0.001-100 uM）在20 mM HEPES（pH 7.4）、150 mM NaCl、0.005% Tween-20缓冲液中孵育。达到平衡（22℃，30-60分钟）后，测量FP值（激发波长485 nm，发射波长535 nm）以检测竞争性结合。FP值的降低表明标记肽被置换。计算IC₅0和Ki值。或者，对于SPR，将PDZ1结构域固定在CM5芯片上，然后向芯片上注入递增浓度的肽溶液，以测量结合和解离速率。
细胞实验
对于细胞实验，将编码 PSD-95 和 GluK2 的质粒转染至 HEK-293 细胞或原代海马神经元，或使其内源性表达这些蛋白。PDZ1 结构域抑制肽可通过细胞穿透肽（例如 TAT 序列）或显微注射导入细胞。或者，环状肽本身也可能具有细胞渗透性。用肽（1-100 uM）处理细胞 1-24 小时。通过共免疫沉淀法评估 GluK2/PSD-95 相互作用的破坏情况：用抗 PSD-95 抗体对细胞裂解液进行免疫沉淀，然后用免疫印迹法检测沉淀的蛋白中 GluK2 的表达。共免疫沉淀的 GluK2 减少表明该相互作用被有效破坏。对于功能性实验，可通过膜片钳电生理技术测量肽对红藻氨酸受体介导电流的影响。细胞预先与肽孵育30-60分钟，然后施加红藻氨酸（10-100 uM），并记录内向电流的幅度。PSD-95结合的破坏可能改变受体脱敏或表面表达。在兴奋性毒性测定中，原代神经元用肽（1-10 uM）处理30-60分钟，然后暴露于红藻氨酸（50-100 uM）15-30分钟。24小时后，通过MTT或LDH释放测定细胞活力。如果该肽能够阻止PSD-95介导的兴奋性毒性信号传导，则可能对神经元具有保护作用。
动物实验
由于该环状肽的肽性质及其潜在的血脑屏障通透性不足，通常不进行体内研究。然而，在研究环境中，可在小鼠或大鼠脑室内（ICV）注射该肽（例如，每只动物1-10 μg，溶于5 μL生理盐水中），于刺激（例如，注射红藻氨酸、大脑中动脉闭塞）前30-60分钟给药。实验动物为雄性C57BL/6小鼠（20-30 g）。脑室内注射后，该肽分布于脑脊液和脑组织中。疗效评估指标包括癫痫发作严重程度（Racine评分）、梗死体积（TTC染色）或神经功能缺损评分。然而，此类体内应用并非该研究工具的标准方法，目前尚无公开的已验证方案。
药代性质 (ADME/PK)
PDZ1结构域抑制肽（分子量819.94，C38H61N9O11）是一种环状肽，带有β-丙氨酰胺侧链连接基。作为一种肽，它口服生物利用度低，不易穿过血脑屏障。它通过脑室内注射给药或用于体外试验。在细胞培养中，其使用浓度为1-100 μM。该肽可溶于DMSO（4 mg/mL）和5%乙腈/水溶液（1 mg/mL）。应在-20℃干燥保存。由于蛋白水解作用，全身给药后的血浆半衰期非常短。目前尚无详细的药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PDZ1结构域抑制剂肽仅供研究使用；目前尚无公开的毒性数据。作为一种肽，预计其在体外低浓度（1-10 μM）下无毒性。在高浓度（>100 μM）下，可能会出现非特异性效应。体内实验中，小鼠脑室内注射高达10 μg的剂量未观察到明显的毒性，但更高剂量可能引起神经炎症或胶质增生。应遵循处理肽类的标准实验室安全操作规程。该化合物尚未获准用于人体。
参考文献

[1]. Targeting specific PDZ domains of PSD-95; structural basis for enhanced affinity and enzymatic stability of a cyclic peptide. Chem Biol. 2004 Apr;11(4):469-73.
其他信息
PDZ1结构域抑制肽（CAS号：1315378-73-4）是一种环状肽，它通过靶向PSD-95的PDZ1结构域来破坏GluK2（GluR6）与PSD-95之间的相互作用。该肽被用作研究PDZ介导的蛋白质相互作用、受体转运和兴奋性毒性的工具。该肽尚未进入临床试验，也未获得FDA批准。其序列为Tyr-Lys-Lys-Thr-Glu-Ala-Val，Lys3和Glu5之间有一个内酰胺桥。储存：-20℃干燥保存。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C38H61N9O11
分子量
819.94
精确质量
819.449
CAS号
1315378-73-4
相关CAS号
PDZ1 Domain inhibitor peptide TFA
PubChem CID
90488746
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
1304.2±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
742.5±34.3 °C
蒸汽压
0.0±0.3 mmHg at 25°C
折射率
1.597
LogP
-2.24
tPSA
334
氢键供体(HBD)数目
12
氢键受体(HBA)数目
13
可旋转键数目(RBC)
17
重原子数目
58
分子复杂度/Complexity
1410
定义原子立体中心数目
8
SMILES
C[C@H]([C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(=O)NCCCC[C@@H](C(=O)N1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)O
InChi Key
XXRRADBJCXMGOW-RMLJCASOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C38H61N9O11/c1-20(2)30(38(57)58)46-32(51)21(3)42-34(53)28-15-16-29(50)41-18-8-6-10-27(36(55)47-31(22(4)48)37(56)45-28)44-35(54)26(9-5-7-17-39)43-33(52)25(40)19-23-11-13-24(49)14-12-23/h11-14,20-22,25-28,30-31,48-49H,5-10,15-19,39-40H2,1-4H3,(H,41,50)(H,42,53)(H,43,52)(H,44,54)(H,45,56)(H,46,51)(H,47,55)(H,57,58)/t21-,22+,25-,26-,27-,28-,30-,31-/m0/s1
化学名
(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,5S,14S)-14-[[(2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]hexanoyl]amino]-2-[(1R)-1-hydroxyethyl]-3,8,15-trioxo-1,4,9-triazacyclopentadecane-5-carbonyl]amino]propanoyl]amino]-3-methylbutanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2196 mL 6.0980 mL 12.1960 mL
5 mM 0.2439 mL 1.2196 mL 2.4392 mL
10 mM 0.1220 mL 0.6098 mL 1.2196 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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电话: 020-31522723 传真: 463611831 邮箱: sales@invivochem.cn
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