2'-Deoxyguanosine-13C10,15N5 monohydrate

别名: 2脱氧鸟苷:水
目录号: V72430 纯度: ≥98%
2'-Deoxyguanosine-13C10,15N5(一水合物)是 13C 和 15N 标记的 2'-Deoxyguanosine 一水合物。
2'-Deoxyguanosine-13C10,15N5 monohydrate CAS号: 2483830-26-6
产品类别: Endogenous Metabolite
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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  • 2'-Deoxyguanosine monohydrate
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产品描述
2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5(一水合物)是经13C和15N标记的2'-脱氧鸟苷一水合物。2'-脱氧鸟苷一水合物是一种内源性代谢产物。
2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5一水合物(CAS号:2483830-26-6)是2'-脱氧鸟苷的稳定同位素标记类似物,包含十个碳-13同位素和五个氮-15同位素。2'-脱氧鸟苷一水合物是一种内源性代谢产物。该标记化合物的分子式为¹³C₁₀H₁₅¹⁵N₅O₅,分子量为300.15 g/mol。作为一种稳定同位素标记化合物,2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 被用作示踪剂,用于研究 DNA 合成、核酸代谢和遗传学。该化合物的 IUPAC 名称为 2-(氨基-15N)-9-((2R,4S,5R)-4-羟基-5-(羟甲基-13C)四氢呋喃-2-基-2,3,4,5-13C4)-3,9-二氢-6H-嘌呤-6-酮-13C5-15N4 水合物。该化合物用作质谱法定量生物样品中 2'-脱氧鸟苷的内标。2'-脱氧鸟苷是一种核苷,是 DNA 的组成成分,其水平可作为 DNA 合成和细胞增殖的标志物。该完全标记的化合物能够对代谢研究中脱氧鸟苷的碱基和糖基部分进行全面追踪。
生物活性&实验参考方法
靶点
As a stable isotope-labeled compound, 2'-Deoxyguanosine-13C10,15N5 does not exert its effects through binding to specific pharmacological targets in the traditional sense. Instead, its "target" is the metabolic pathways in which 2'-deoxyguanosine participates. 2'-Deoxyguanosine is a nucleoside that is a component of DNA. It is incorporated into DNA during DNA synthesis and is also a product of DNA degradation. The compound is involved in nucleic acid metabolism and is a precursor for the synthesis of DNA. The ¹³C- and ¹⁵N-labeled version of 2'-deoxyguanosine enables researchers to track the fate of both carbon and nitrogen atoms through DNA synthesis and degradation pathways. By following the isotope labels using mass spectrometry, investigators can quantify the rates of DNA synthesis, assess the impact of disease states on DNA metabolism, and evaluate the effects of pharmacological interventions on nucleic acid metabolism. This makes 2'-Deoxyguanosine-13C10,15N5 a powerful tool for studying cell proliferation, DNA repair, and nucleic acid metabolism.
体外研究 (In Vitro)
药物化合物中通常包含碳、氢和其他元素的稳定重同位素,主要用作药物研发过程中的定量示踪剂。由于氘代可能影响药物的药代动力学和代谢特性,因此值得关注[1]。
在体外,2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 被用作示踪剂,用于研究 DNA 合成、核酸代谢和遗传学。该化合物被添加到细胞培养基中,用于研究 DNA 合成和核苷代谢。细胞在标准生长培养基中培养,并添加不同浓度的 2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5,培养时间也各不相同。孵育后,收集细胞,并使用标准方法提取 DNA。然后将 DNA 水解成核苷,并通过质谱法测定脱氧鸟苷的 ¹³C 和 ¹⁵N 富集度。这使得研究人员能够量化标记脱氧鸟苷掺入DNA的量,从而衡量DNA合成。该化合物还可用作质谱法定量生物样品中2'-脱氧鸟苷的内标。完全标记的化合物确保其能够与内源性2'-脱氧鸟苷区分开来,即使在复杂的生物基质中也能实现精确的定量分析。
体内研究 (In Vivo)
在体内,2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 可实现对 DNA 合成和核酸代谢的精确追踪。给动物给药后(通常通过灌胃、腹腔注射或静脉输注),该化合物分布于全身,并在 DNA 合成过程中掺入 DNA 中。¹³C 和 ¹⁵N 标记使得在生物样本中特异性检测该化合物成为可能,且不受内源性未标记 2'-脱氧鸟苷的干扰。在不同时间点采集血液和组织样本,提取 DNA 并将其水解为核苷。通过质谱法测定脱氧鸟苷的 ¹³C 和 ¹⁵N 富集度。这使得研究人员能够量化不同器官和组织中的 DNA 合成,评估疾病状态对细胞增殖的影响,并评价药物干预对 DNA 代谢的影响。该化合物还用于稳定同位素示踪研究,以评估 DNA 的周转和 DNA 损伤剂的影响。
酶活实验
2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 通常不进行体外酶活性测定,因为该化合物主要用作 DNA 合成和核酸代谢的示踪剂。然而,该化合物可用于酶活性测定,以研究参与核酸代谢的酶的活性,例如 DNA 聚合酶、核苷激酶和核苷酸酶。在这些测定中,将酶与 2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 和其他底物一起孵育,并通过质谱法测定标记产物(例如,脱氧鸟苷单磷酸、脱氧鸟苷三磷酸或 DNA)的生成。使用完全标记的底物可以特异性地检测酶促反应产物,而不会受到内源性未标记代谢物的干扰。这些测定通常在生理 pH 值和温度下的缓冲溶液中进行,并通过添加酸或有机溶剂终止反应。
细胞实验
体外细胞实验中,2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 的标记物被添加到细胞培养基中,并研究其掺入 DNA 的情况。细胞在标准生长培养基中培养,然后加入不同浓度(通常为 1-100 μM)的 2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5,孵育时间从数小时到数天不等。孵育后,收集细胞,并使用标准方法(例如苯酚-氯仿提取或商业试剂盒)提取 DNA。随后,使用 DNA 酶、蛇毒磷酸二酯酶和碱性磷酸酶将 DNA 水解为核苷。最后,通过液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 分析核苷,以测量脱氧鸟苷的 ¹³C 和 ¹⁵N 富集度。这使得研究人员能够量化标记脱氧鸟苷掺入 DNA 的情况,从而衡量 DNA 的合成。该化合物还用于脉冲追踪实验,其中细胞短暂暴露于标记化合物(脉冲)后,立即转移至未标记培养基(追踪),以研究DNA的周转。实验中会常规监测细胞活力,以确保标记化合物不会影响细胞健康。每个实验均包含适当的对照(未标记细胞、溶剂对照),并重复三次以确保统计可靠性。
动物实验
2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 的体内动物实验包括给动物注射标记化合物,然后收集组织进行 DNA 提取和质谱分析。该化合物通常通过灌胃、腹腔注射或静脉输注给药,剂量范围为 1-100 mg/kg。给药后,在不同时间点(通常为 1、4、8 和 24 小时)处死动物,并收集组织(肝脏、肾脏、脾脏、脑、骨髓)。从组织中提取 DNA,水解成核苷,并通过液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定脱氧鸟苷的 ¹³C 和 ¹⁵N 富集度。这使得研究人员能够量化不同器官和组织中的 DNA 合成,评估疾病状态对细胞增殖的影响,并评价药物干预对 DNA 代谢的影响。所有动物实验均按照机构动物护理和使用委员会的指导方针进行,并采用适当的样本量(通常每组 n=4-6)以确保统计效力。
药代性质 (ADME/PK)
本研究利用同位素标记追踪2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5的吸收、分布、代谢和排泄,从而研究其药代动力学特性。口服或静脉注射后,该化合物能迅速被吸收并分布至组织。¹³C和¹⁵N标记能够特异性地检测生物样本中给药的2'-脱氧鸟苷,且不受内源性未标记2'-脱氧鸟苷的干扰。通过测定血浆和组织中标记的2'-脱氧鸟苷的浓度-时间曲线,可以计算出半衰期、分布容积、清除率和生物利用度等药代动力学参数。2'-脱氧鸟苷是一种核苷,是DNA的组成成分。它通过核苷转运蛋白穿过细胞膜,并通过多种途径代谢,包括磷酸化生成脱氧鸟苷单磷酸、脱氧鸟苷二磷酸和脱氧鸟苷三磷酸,这些物质最终被掺入DNA中。标记化合物能够精确追踪这些代谢过程。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
2'-脱氧鸟苷-13C10,15N5 的毒理学特征与天然 2'-脱氧鸟苷(一种内源性核苷,是 DNA 的正常组成成分)一致。2'-脱氧鸟苷是膳食的正常成分,参与核酸代谢。¹³C 和 ¹⁵N 标记是稳定的同位素,不会给化合物带来任何额外的毒性。该化合物作为高纯度研究用化学品提供,仅供实验室使用,不得用于人体食用。处理该化合物时应遵守标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。该化合物应储存在阴凉干燥处,避光防潮。与所有化学品一样,应避免摄入、吸入和皮肤接触。
参考文献

[1]. Impact of Deuterium Substitution on the Pharmacokinetics of Pharmaceuticals. Ann Pharmacother. 2019 Feb;53(2):211-216.

其他信息
2'-脱氧鸟苷-¹³C₁₀,¹⁵N₅是研究DNA合成、核酸代谢和遗传研究的宝贵研究工具。它是2'-脱氧鸟苷的稳定同位素标记类似物,包含十个碳-13和五个氮-15同位素。该化合物的分子式为¹³C₁₀H₁₅¹⁵N₅O₅,分子量为300.15 g/mol。2'-脱氧鸟苷单水合物是内源性产生的代谢物。该化合物作为示踪剂用于研究DNA合成、核酸代谢和遗传研究。它不是药物,未被批准用于任何临床适应症,仅限于研究使用。其高纯度和同位素富集确保了分析应用中的准确和可重复结果。2'-脱氧鸟苷-¹³C₁₀,¹⁵N₅是研究DNA合成、细胞增殖和核酸代谢的重要工具。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H15N5O5
分子量
300.150195360184
精确质量
300.126
CAS号
2483830-26-6
相关CAS号
2'-Deoxyguanosine monohydrate;312693-72-4
PubChem CID
168006987
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
136
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
417
定义原子立体中心数目
3
SMILES
[13CH2]1[13C@@H]([13C@H](O[13C@H]1[15N]2[13CH]=[15N][13C]3=[13C]2[15N]=[13C]([15NH][13C]3=O)[15NH2])[13CH2]O)O.O
InChi Key
LZSCQUCOIRGCEJ-DKCGKRJGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H13N5O4.H2O/c11-10-13-8-7(9(18)14-10)12-3-15(8)6-1-4(17)5(2-16)19-6;/h3-6,16-17H,1-2H2,(H3,11,13,14,18);1H2/t4-,5+,6+;/m0./s1/i1+1,2+1,3+1,4+1,5+1,6+1,7+1,8+1,9+1,10+1,11+1,12+1,13+1,14+1,15+1;
化学名
2-(15N)azanyl-9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxy(113C)methyl)(2,3,4,5-13C4)oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one;hydrate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.3317 mL 16.6583 mL 33.3167 mL
5 mM 0.6663 mL 3.3317 mL 6.6633 mL
10 mM 0.3332 mL 1.6658 mL 3.3317 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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