| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
OTUB1 (covalent binding to non-catalytic cysteine C23); F508-CFTR (via lumacaftor moiety) [1]
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
凝胶 ABPP 实验证实 NJH-2-057 可结合重组 OTUB1,竞争性抑制 IA-罗丹明对 OTUB1 的标记 (图 3c-d)。在 CFBE41o-4.7 人囊性纤维化支气管上皮细胞中,该化合物呈剂量依赖性稳定 F508-CFTR 蛋白 (8 μM, 16 小时),10 μM 时稳定效应最强 (扩展数据图 5)。稳定的 CFTR 条带 (>225 kDa) 对应成熟糖基化形式,经三种独立抗体验证,且 CFTR 敲减后条带减弱 (扩展数据图 6-7)。
TMT 定量蛋白质组学显示:在 4,552 个定量蛋白中,NJH-2-057 选择性稳定 CFTR (较对照组提高 7.8 倍),仅 21 个蛋白稳定幅度 >5 倍 (校正 p<0.01)。伴随蛋白 (如 HSPA6、DNAJB1) 上调可能源于分子伴侣代偿反应 (图 3g; 表 S3)。 天然质谱证实三元复合物形成:NJH-2-057 诱导 OTUB1-CFTR 相互作用,而 DMSO 或 EN523 单独处理无此效应 (图 3h-i)。OTUB1 敲减或 lumacaftor/EN523 预处理完全取消稳定作用,证实靶点依赖性 (图 4a-d)。 在原代人支气管上皮细胞的跨上皮电导实验中,NJH-2-057 (10 μM, 24 小时) 联合 VX770 显著增强 CFTR 依赖性氯离子转运,疗效优于 lumacaftor (p<0.05) (图 4e-f)。 |
| 酶活实验 |
OTUB1 结合通过凝胶 ABPP 评估:重组 OTUB1 (0.1 μg) 与 NJH-2-057 或 DMSO 预孵育 (37°C, 30 分钟),后用 IA-罗丹明探针标记 (室温, 1 小时)。反应以 Laemmli 缓冲液终止,经 SDS-PAGE 分离,凝胶荧光成像检测 (第 12 页)。
去泛素化酶活性检测:OTUB1 (500 nM) ± EN523 (50 μM) 与二聚泛素、UBE2D1 和 DTT 共孵育。通过 western blot 监测单泛素释放动力学 (第 12 页)。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
NJH-2-057 是一种异双功能 DUBTAC,由靶向 OTUB1 的丙烯酰胺 (EN523) 通过 C5 烷基间隔基与 lumacaftor (F508-CFTR 校正剂) 连接而成。它以 OTUB1 依赖的方式稳定 F508-CFTR,促进去泛素化,从而减少蛋白酶体降解(第 6-9 页)。
连接基优化表明,C5/C6 烷基链能够稳定 CFTR,而 C3/C4 烷基或 PEG 连接基则无效(扩展数据图 8)。一种非反应性丙炔酰胺类似物(NJH-2-106)缺乏活性,证实了共价机制(扩展数据图 10)。 在 CFBE41o-4.7 细胞中进行的 IsoTOP-ABPP 化学蛋白质组学分析表明,该方法具有高度的蛋白质组选择性:仅有 5/1270 个半胱氨酸被 NJH-2-057 标记后 IA-炔烃标记降低 >4 倍(校正后 p<0.05),且在泛素-蛋白酶体通路中均未观察到这种现象(扩展数据图 14;表 S4)。 |
| 分子式 |
C43H44F2N6O8
|
|---|---|
| 分子量 |
810.84
|
| 精确质量 |
810.318
|
| CAS号 |
2858812-70-9
|
| PubChem CID |
162624827
|
| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
|
| 密度 |
1.40±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)
|
| 沸点 |
1071.9±65.0 °C(Predicted)
|
| LogP |
5.1
|
| tPSA |
172
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
11
|
| 可旋转键数目(RBC) |
16
|
| 重原子数目 |
59
|
| 分子复杂度/Complexity |
1550
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
|
| SMILES |
FC1(OC2=CC=C(C=C2O1)C1(C(NC2C=CC(C)=C(C3C=CC=C(C(NCCCCCNC(CCC4=CC=C(N5C(CN(C(C=C)=O)CC5)=O)O4)=O)=O)C=3)N=2)=O)CC1)F
|
| InChi Key |
GBRJFUUBXKOHMN-UHFFFAOYSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C43H44F2N6O8/c1-3-36(53)50-22-23-51(37(54)26-50)38-17-13-31(57-38)12-16-35(52)46-20-5-4-6-21-47-40(55)29-9-7-8-28(24-29)39-27(2)10-15-34(48-39)49-41(56)42(18-19-42)30-11-14-32-33(25-30)59-43(44,45)58-32/h3,7-11,13-15,17,24-25H,1,4-6,12,16,18-23,26H2,2H3,(H,46,52)(H,47,55)(H,48,49,56)
|
| 化学名 |
3-[6-[[1-(2,2-difluoro-1,3-benzodioxol-5-yl)cyclopropanecarbonyl]amino]-3-methylpyridin-2-yl]-N-[5-[3-[5-(2-oxo-4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)furan-2-yl]propanoylamino]pentyl]benzamide
|
| 别名 |
NJH-2-057; 2858812-70-9; CHEMBL5208354; SCHEMBL27163877; 3-[6-[[1-(2,2-difluoro-1,3-benzodioxol-5-yl)cyclopropanecarbonyl]amino]-3-methylpyridin-2-yl]-N-[5-[3-[5-(2-oxo-4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)furan-2-yl]propanoylamino]pentyl]benzamide;
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 100 mg/mL (123.33 mM)
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.2333 mL | 6.1664 mL | 12.3329 mL | |
| 5 mM | 0.2467 mL | 1.2333 mL | 2.4666 mL | |
| 10 mM | 0.1233 mL | 0.6166 mL | 1.2333 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。