IRE1α kinase-IN-2

别名: n-[4-[8-氨基-3-(1-甲基乙基)咪唑并[1,5-a]吡嗪-1-基]-1-萘]-n-[3-(三氟甲基)苯基]-脲
目录号: V75789 纯度: ≥98%
IRE1α 激酶-IN-2 是一种有效的 IRE1α 激酶抑制剂(拮抗剂),EC50 为 0.82 μM。
IRE1α kinase-IN-2 CAS号: 1414938-21-8
产品类别: IRE1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
IRE1α激酶抑制剂-IN-2是一种强效的IRE1α激酶抑制剂(拮抗剂),EC50为0.82 μM。IRE1α激酶抑制剂-IN-2抑制IRE1α激酶的自身磷酸化(IC50=3.12 μM)。IRE1α激酶抑制剂-IN-2抑制野生型细胞系中XBP1 mRNA的剪接。
IRE1alpha激酶抑制剂-IN-2(又名化合物3)是一种高效、选择性的小分子抑制剂,可抑制内质网(ER)应激传感器肌醇需求酶1alpha(IRE1alpha)。它是一种研究级化合物,旨在靶向IRE1alpha的激酶结构域。通过抑制未折叠蛋白反应(UPR)中的关键因子,IRE1alpha激酶抑制剂-IN-2可作为研究ER应激在癌症、神经退行性疾病和其他疾病中作用的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
IRE1alpha kinase-IN-2 specifically targets the IRE1alpha serine/threonine kinase. It functions as an ATP-competitive inhibitor, binding to the kinase active site and blocking IRE1alpha autophosphorylation (IC50 = 3.12 microM). This, in turn, inhibits its downstream endoribonuclease (RNase) activity, preventing the splicing of XBP1 mRNA (EC50 = 0.82 microM), a critical step in the IRE1alpha/XBP1s arm of the UPR signaling pathway.
体外研究 (In Vitro)
化合物 3,IRE1α 激酶-IN-2,即使在内质网处于应激状态时也能阻止 XBP1 mRNA 剪接[1]。
体外实验表明,IRE1α激酶-IN-2即使在衣霉素等药物诱导的内质网应激条件下,也能有效抑制XBP1 mRNA的剪接。它会损害IRE1α激酶的自身磷酸化,而自身磷酸化是其发挥核糖核酸酶活性的先决条件。通过阻断IRE1α-XBP1s轴,它降低了细胞对内质网应激的适应能力,这可能导致依赖该通路生存的细胞(例如多发性骨髓瘤细胞)发生凋亡。
体内研究 (In Vivo)
现有文献并未提供IRE1α激酶抑制剂IN-2的具体体内疗效数据。然而,其强效的作用机制提示,该抑制剂可用于IRE1α/XBP1s通路依赖性肿瘤的小鼠异种移植模型。口服类似的IRE1α抑制剂已被证实能够抑制肿瘤生长并降低肿瘤组织中XBP1s的剪接,从而验证了其体内应用潜力。
酶活实验
对于无细胞体系,可采用放射性或发光激酶活性测定法。将纯化的IRE1α激酶结构域与ATP和肽底物孵育。向反应混合物中加入化合物。测定肽的磷酸化水平,并计算抑制自身磷酸化的IC50值(3.12 uM)。也可使用纯化的IRE1α和代表XBP1的合成RNA茎环底物在体外测定RNase活性。
细胞实验
在细胞实验中,HeLa 或其他细胞系在存在或不存在 IRE1α 激酶-IN-2 的情况下,用内质网应激诱导剂(例如,衣霉素或毒胡萝卜素)处理。通过 RT-qPCR(使用扩增剪接异构体的引物)或含有 XBP1s 剪接位点的荧光素酶报告基因检测来测量剪接型 XBP1 (XBP1s) 的水平。EC50 (0.82 uM) 的降低证实了该化合物的有效性。
动物实验
在体内研究中,将携带人源肿瘤异种移植瘤(例如多发性骨髓瘤)的小鼠用IRE1α激酶-IN-2进行治疗。该化合物可配制成腹腔注射(IP)制剂,溶剂为5% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 50% ddH2O。使用游标卡尺测量肿瘤体积,并在研究结束时收集肿瘤组织,通过RT-qPCR定量XBP1s水平,作为药效学标志物。
药代性质 (ADME/PK)
未提供IRE1α激酶-IN-2的具体ADME数据。其分子量(278.31)表明其符合利平斯基五规则(Lipinski's Rule of Five)的药物相似性标准。该化合物在DMSO中的溶解度为11.11 mg/mL,可用于配制储备液。用于体内应用时,可能需要配制提高溶解度的制剂(例如,10% DMSO + 90%生理盐水)。该化合物以粉末形式在-20℃下可稳定保存长达三年。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无IRE1α激酶-IN-2的具体毒理学数据。作为关键应激反应通路抑制剂,其靶向毒性可能涉及破坏高分泌需求组织(如胰腺、肝脏和浆细胞)中正常的内质网稳态。IRE1α抑制剂的安全性是药物研发领域的一个活跃研究方向。
参考文献

[1]. Divergent allosteric control of the IRE1α endoribonuclease using kinase inhibitors. Nat Chem Biol. 2012;8(12):982-989.

其他信息
IRE1α是一种具有激酶和核糖核酸酶双重功能的酶,使其成为一种独特而复杂的药物靶点。IRE1α激酶-IN-2是一种工具化合物,用于解析IRE1α激酶结构域和核糖核酸酶结构域的相对作用。XBP1剪接的抑制是UPR活性的关键生物标志物。该化合物目前仍处于临床前研究阶段,尚未获准用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H23F3N6O
分子量
504.51
精确质量
504.188
CAS号
1414938-21-8
PubChem CID
60196244
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.660
LogP
5.92
tPSA
97.3
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
797
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)C1=NC(=C2N1C=CN=C2N)C3=CC=C(C4=CC=CC=C43)NC(=O)NC5=CC=CC(=C5)C(F)(F)F
InChi Key
MEJKZYOOTMLMBA-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H23F3N6O/c1-15(2)25-35-22(23-24(31)32-12-13-36(23)25)20-10-11-21(19-9-4-3-8-18(19)20)34-26(37)33-17-7-5-6-16(14-17)27(28,29)30/h3-15H,1-2H3,(H2,31,32)(H2,33,34,37)
化学名
1-[4-(8-amino-3-propan-2-ylimidazo[1,5-a]pyrazin-1-yl)naphthalen-1-yl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (198.21 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9821 mL 9.9106 mL 19.8212 mL
5 mM 0.3964 mL 1.9821 mL 3.9642 mL
10 mM 0.1982 mL 0.9911 mL 1.9821 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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