NV03

别名: NV-03
目录号: V75863 纯度: ≥98%
NV03 是 UHRF1 和 H3K9me3 之间相互作用的有效且特异性拮抗剂,Kd 为 2.4 μM。
NV03 CAS号: 2448341-58-8
产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
NV03 是一种强效且特异性的 UHRF1 与 H3K9me3 相互作用拮抗剂,其 Kd 值为 2.4 μM。NV03 具有抗癌活性。
NV03 是一种高效、选择性的小分子拮抗剂,能够破坏泛素样蛋白1 (UHRF1) 与赖氨酸9三甲基化组蛋白H3 (H3K9me3) 之间的蛋白质-蛋白质相互作用。它特异性地结合于UHRF1的串联Tudor结构域 (TTD)。NV03 可用作表观遗传学研究工具,并已被验证可作为E3连接酶的配体用于PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)设计,使其成为药物研发中的一种双用途化合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
UHRF1, H3K9me3[1]
The molecular target of NV03 is the Ubiquitin-like with PHD and RING finger domains 1 (UHRF1) protein. It specifically binds to the tandem Tudor domain (TTD) of UHRF1 with a dissociation constant (Kd) of 2.4 uM. By binding to this domain, NV03 blocks the recognition of the H3K9me3 histone mark, disrupting the ability of UHRF1 to bind to chromatin.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,NV03 对 UHRF1 TTD 具有很高的结合亲和力,其亲和力比母体化合物 NV01 高 2.1 倍。这种结合拮抗了 UHRF1 与 H3K9me3 之间的相互作用,H3K9me3 是一种对 DNA 甲基化维持和基因沉默至关重要的表观遗传标记。因此,NV03 具有抗癌活性,并被用于研究 UHRF1-H3K9me3 轴在表观遗传调控中的功能作用。
体内研究 (In Vivo)
所提供的摘要中并未详细列出NV03的具体体内疗效数据。然而,鉴于其已被证实具有UHRF1拮抗剂活性,因此可用于体内模型研究该蛋白在癌症中的作用。其作为E3连接酶配体的作用表明,它可以被整合到PROTAC分子中,从而降解活体生物体内的靶蛋白,这展现了其在先进治疗方法中的应用价值。
酶活实验
结合活性可通过无细胞荧光偏振 (FP) 竞争实验或等温滴定量热法 (ITC) 进行评估。在 FP 实验中,将荧光标记的 H3K9me3 肽与纯化的 UHRF1 蛋白孵育。结合后,极化强度增加。加入化合物与肽竞争结合,导致极化强度降低。Kd 值由此竞争实验得出。
细胞实验
在细胞研究中,使用 NV03 处理癌细胞系。主要终点是 UHRF1-H3K9me3 相互作用的破坏,这可以通过染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验来评估,该实验用于检测基因位点上 UHRF1 的占位情况。或者,也可以使用细胞相互作用实验。该化合物的抗癌活性可以通过 MTT 或 CellTiter-Glo 检测细胞活力来评估。
动物实验
为了研究UHRF1的体内功能,可将NV03配制成注射剂(例如,以生理盐水形式进行腹腔注射),用于肿瘤异种移植小鼠模型。荷瘤小鼠接受该化合物或载体对照治疗。使用游标卡尺测量肿瘤体积以评估抗肿瘤疗效。由于该化合物也是一种E3泛素连接酶配体,因此可将其用作构建模块,用于构建PROTACs,以进行体内降解研究。
药代性质 (ADME/PK)
所提供的文献中未包含NV03的详细吸收、分布、代谢和排泄(ADME)数据。然而,已知其在DMSO中的溶解度为33.33 mg/mL,这有利于其在体外试验和制备用于潜在体内应用的制剂中的应用。在干燥环境下于2-8℃储存时,NV03稳定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
所提供的摘要中未列出NV03的具体毒理学数据。作为研究表观遗传机制的研究工具以及PROTACs的构建模块,其安全性仍在持续评估中。在标准的体外试验中观察到了其抗癌活性,而任何体内疗效研究都将通过动物体重和行为来监测其总体毒性。
参考文献

[1]. Discovery of Small-Molecule Antagonists of the H3K9me3 Binding to UHRF1 Tandem Tudor Domain. SLAS Discov. 2018 Oct;23(9):930-940.

其他信息
UHRF1是一种关键的表观遗传调控因子,它连接DNA甲基化和组蛋白修饰。UHRF1在多种癌症中过度表达,并与不良预后相关。NV03是UHRF1-H3K9me3相互作用的特异性拮抗剂。这种拮抗作用可以破坏表观遗传沉默机制,并具有作为抗癌疗法的潜力。此外,NV03还可作为PROTAC设计的多功能工具,实现对UHRF1的靶向降解。目前,NV03正处于临床前研究阶段。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H27N5O2S
分子量
389.5150
精确质量
389.188
CAS号
2448341-58-8
PubChem CID
139291004
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.3
tPSA
98.2
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
595
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S1C([H])=C([H])C2=C1C(C([H])([H])[H])=C1C(N(C([H])([H])C(N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N(C([H])([H])C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])=O)N=C(C([H])([H])[H])N12)=O
InChi Key
KNZQAVKYBBYDKV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H27N5O2S/c1-5-22(6-2)10-7-9-20-16(25)12-23-19(26)17-13(3)18-15(8-11-27-18)24(17)14(4)21-23/h8,11H,5-7,9-10,12H2,1-4H3,(H,20,25)
化学名
N-[3-(diethylamino)propyl]-2-(7,12-dimethyl-9-oxo-5-thia-1,10,11-triazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-2(6),3,7,11-tetraen-10-yl)acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 33.33 mg/mL (85.57 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5673 mL 12.8363 mL 25.6726 mL
5 mM 0.5135 mL 2.5673 mL 5.1345 mL
10 mM 0.2567 mL 1.2836 mL 2.5673 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

相关产品
联系我们