| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CDK9 <3 nM (IC50) CDK1 0.14 μM (IC50) CDK2 0.72 μM (IC50) CDK7 0.40 μM (IC50) CDK12 0.055 μM (IC50)
The primary target of CDK9-IN-13 is the cyclin-dependent kinase 9 (CDK9). It acts as a highly specific inhibitor, with an IC50 for CDK9 of less than 3 nM. The compound demonstrates a favorable selectivity profile, with IC50 values of 0.14 uM for CDK1, 0.72 uM for CDK2, 0.40 uM for CDK7, and 0.055 uM for CDK12, showing that it is at least 18-fold more potent against CDK9 than CDK1. |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明，CDK9-IN-13 能有效抑制 CDK9 酶活性，IC50 < 3 nM。它是研究肿瘤学中 CDK9 依赖性转录的宝贵工具。该化合物通过抑制 CDK9，阻断转录延伸，导致短寿命抗凋亡蛋白（例如 Mcl-1）表达下调，从而诱导转录依赖性癌细胞（例如 MYC 过表达的癌细胞）死亡。
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| 体内研究 (In Vivo) |
体内研究表明，CDK9-IN-13在啮齿动物体内的半衰期较短。这一特性使其成为需要快速靶向结合和可逆抑制的研究的理想化学探针。虽然所提供的摘要中并未详细列出具体的异种移植研究数据，但其体外高效性表明，在适当的给药间隔下，它能够有效快速地抑制动物模型中的肿瘤生长。
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| 酶活实验 |
采用无细胞发光激酶活性测定法（例如，ADP-Glo 激酶活性测定法）测定 CDK9-IN-13 的 IC50 值。反应混合物包含纯化的 CDK9/Cyclin T1 酶、肽底物和 ATP。将化合物加入混合物中。孵育后，加入 ADP 检测试剂，将 ATP 生成的 ADP 转化为发光信号。测量发光信号，并根据激酶活性的降低计算 IC50 值。
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| 细胞实验 |
在细胞实验中，将癌细胞系（例如 HeLa 或 MOLM-13）接种于 96 孔板中。过夜贴壁后，用 CDK9-IN-13 的系列稀释液（例如，从 0.01 nM 到 10 uM）处理细胞 48-72 小时。使用基于发光法的 CellTiter-Glo 检测法测定细胞活力，以确定半数抑制浓度 (IC50)。为确认靶点结合，使用针对磷酸化 RNA 聚合酶 II (Ser2) 的特异性抗体，通过 Western blot 分析细胞裂解液。该信号的降低表明 CDK9 被成功抑制。
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| 动物实验 |
在体内药代动力学 (PK) 研究中，CDK9-IN-13 通过灌胃 (po) 或静脉 (iv) 注射给药于啮齿动物（例如小鼠或大鼠）。在给药后多个时间点（例如 0.25、0.5、1、2、4、6、8、12 和 24 小时）采集血样。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定血浆中化合物的浓度，并计算关键的 PK 参数，例如半衰期 (t1/2)、血浆峰浓度 (Cmax) 和口服生物利用度。该研究证实了该化合物在啮齿动物体内的半衰期较短。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
根据现有数据，CDK9-IN-13在啮齿动物体内半衰期较短。这表明其吸收迅速，但也容易从体内清除。该化合物在DMSO中的溶解度为2.5 mg/mL，足以配制储备液和药代动力学制剂。粉末状CDK9-IN-13在-20℃下可稳定保存长达3年，溶液状CDK9-IN-13在-80℃下可保存6个月。该化合物为研究用化学品，而非药品。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
CDK9-IN-13的具体毒理学数据尚未公布。作为CDK9（一种关键的转录调控因子）的抑制剂，其潜在毒性可能与其作用机制相关。然而，文献综述中并未包含详细的安全性评估。在临床前研究中，通常使用半衰期短的化合物以最大程度地减少全身暴露和潜在的靶向副作用，这或许也是该化合物的一种研究策略。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
CDK9是转录延伸的关键调控因子，也是异常转录相关癌症（例如MYC驱动的肿瘤）的潜在治疗靶点。CDK9-IN-13是一种高效且选择性强的工具化合物，可用于研究此类药物。其快速清除（半衰期短）使其区别于其他抑制剂，并可用于需要快速激活/解除靶点作用的研究。该化合物仅用于探索癌症生物学，尚未获准用于任何临床适应症。
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| 精确质量 |
461.279
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|---|---|
| CAS号 |
2768712-71-4
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| PubChem CID |
163196243
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| tPSA |
72.5
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
34
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| 分子复杂度/Complexity |
810
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
CC(C)N1C=C(C=CC1=O)C2=C3C=C(NC3=NC=C2)C4CCN(CC4)CC(=O)N5CCCCC5
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| InChi Key |
GLYHKPNATCXTDU-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C27H35N5O2/c1-19(2)32-17-21(6-7-25(32)33)22-8-11-28-27-23(22)16-24(29-27)20-9-14-30(15-10-20)18-26(34)31-12-4-3-5-13-31/h6-8,11,16-17,19-20H,3-5,9-10,12-15,18H2,1-2H3,(H,28,29)
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| 化学名 |
5-[2-[1-(2-oxo-2-piperidin-1-ylethyl)piperidin-4-yl]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl]-1-propan-2-ylpyridin-2-one
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: 2.5 mg/mL (5.42 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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