Trabectedin-d3 (Ecteinascidin 743-d3; ET-743-d3)

目录号: V76401 纯度: ≥98%
Trabectedin D3 (Ecteinascidin 743 D3) 是 Trabectedin 的氘化形式。
Trabectedin-d3 (Ecteinascidin 743-d3; ET-743-d3) 产品类别: Isotope-Labeled Compounds
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述
曲贝替定D3(Ecteinascidin 743 D3)是曲贝替定的氘代形式。曲贝替定(Ecteinascidin 743;ET-743)是一种四氢异喹啉生物碱,具有强效的抗癌作用。曲贝替定可与DNA小沟结合,阻断应激诱导的蛋白质转录,诱导DNA骨架断裂和癌细胞凋亡,并增加MCF-7和MDA-MB-453细胞中活性氧(ROS)的产生。曲贝替定可用于软组织肉瘤和卵巢癌的研究。
曲贝替定-d3(Ecteinascidin 743-d3;ET-743-d3)是曲贝替定的氘标记形式。曲贝替定是一种强效的四氢异喹啉生物碱,最初从海鞘 Ecteinascidia turbinata 中分离得到。该化合物被用作内标,用于通过液相色谱-质谱联用(LC-MS)法定量分析生物样品中的曲贝替定[29L3-L5]。标记后的曲贝替定分子式为 C39H40D3N3O11S,其结构中含有三个氘原子。该化合物是研究环境中用于已获批准的抗癌药物曲贝替定的药代动力学研究和治疗药物监测的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
The target of the unlabeled version, trabectedin, is the DNA minor groove. Trabectedin binds to the minor groove of DNA, forming adducts that interfere with DNA-binding proteins and transcription factors. This leads to the blockage of stress-induced protein transcription and the activation of DNA damage response pathways. Ultimately, this causes DNA backbone cleavage and induces cell cycle arrest and apoptosis in cancer cells. Trabectedin-d3 is intended for use as an analytical standard to study the interaction of the parent drug with this target, allowing for precise quantification in various research contexts.
体外研究 (In Vitro)
体外活性归因于其母体化合物曲贝替定。它在多种癌细胞系中表现出强效的抗肿瘤活性。研究表明,曲贝替定可与DNA小沟结合,从而阻断应激诱导蛋白的转录并诱导DNA骨架断裂,最终导致癌细胞凋亡。此外,它还能增加MCF-7和MDA-MB-453乳腺癌细胞中活性氧(ROS)的产生。这些体外活性是该标记化合物作为代谢研究中定量和追踪分析工具的基准。
体内研究 (In Vivo)
曲贝替定的体内活性已得到广泛研究,它是一种获批用于治疗软组织肉瘤和卵巢癌的药物。在动物模型中,曲贝替定已被证明能显著抑制肿瘤生长并延长生存期。作为氘代内标,曲贝替定-d3并非用于测定其自身活性,而是用于精确测量母体药物给药后的体内药代动力学和组织分布。这对于了解药物的吸收、代谢和排泄(ADME)特性至关重要。
酶活实验
在结合研究中,通常采用表面等离子共振 (SPR)、等温滴定量热法 (ITC) 或凝胶迁移率变动分析等方法研究未标记的曲贝替定与其 DNA 靶标的相互作用。典型的分析方法是将一段短的 DNA 寡核苷酸片段与浓度递增的化合物孵育。通过物理性质(例如质量、热量或迁移率)的变化来测量结合情况。在这些分析中,氘代曲贝替定用作对照或内标,以测量未标记药物的游离浓度。
细胞实验
构建 PROTAC 分子时,首先利用 HATU 或 EDCI/HOBt 等标准酰胺偶联反应,将末端伯胺与含有羧酸的靶蛋白配体偶联。该反应通常在室温下进行,以 DIPEA 为碱,溶剂为无水 DMF 或 DMSO,反应时间为 2-12 小时。所得 PROTAC 经制备型 HPLC 纯化,并用 LC-MS 进行表征。为验证其细胞活性,将细胞用 PROTAC(0.001-10 uM,4-24 小时)处理,然后裂解细胞,并通过蛋白质印迹法分析靶蛋白的降解情况。对照组包括未偶联的靶蛋白配体和 CRBN 配体。
动物实验
在体内动物研究中,曲贝替定-d3 被用作液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 分析的内标。典型的动物研究包括向啮齿动物(例如小鼠或大鼠)静脉注射治疗剂量(例如 0.1-1 mg/kg)的未标记曲贝替定。在不同时间点(例如 0、15、30、60、120、240 和 480 分钟)采集血样。然后向血浆样本中加入已知量的曲贝替定-d3 作为内标。对样本进行处理(蛋白质沉淀、提取)后,通过 LC-MS/MS 分析生成浓度-时间曲线。该曲线提供了未标记药物的药代动力学参数,这些参数对于了解其体内行为至关重要。
药代性质 (ADME/PK)
曲贝替定-d3并非治疗药物,而是一种分析标准品。因此,其药代动力学特性(吸收、分布、代谢、排泄)并未被直接研究。相反,它被用作研究未标记药物曲贝替定药代动力学的工具。该标记物的稳定性使其能够用作精确的示踪剂。该化合物以粉末形式储存在-20℃以保持其稳定性。作为内标,其化学稳定性至关重要,必须在样品制备和分析过程中保持稳定。它通常在氮气保护下储存,并避光防潮[29L10-L12]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于曲贝替定-d3并非用于治疗,因此目前尚无其具体的毒性数据。其母体化合物曲贝替定的毒性已有充分的文献记载,包括骨髓抑制(血细胞计数降低)、肝毒性(肝损伤)和心脏毒性。曲贝替定-d3用作内标时用量极低(通常浓度为ng/mL级),因此对研究人员的风险可以忽略不计。然而,与所有实验室化学品一样,使用时仍应遵循标准的安全预防措施。本品仅供研究使用,严禁人体服用。
参考文献

[1]. Sequence-dependent synergistic cytotoxicity of ecteinascidin-743 and NSC 125973 in human breast cancer cell linesin vitro and in vivo. Cancer Res. 2002 Dec 1;62(23):6909-15.

[2]. A diverse induction of apoptosis by trabectedin in MCF-7 (HER2-/ER+) and MDA-MB-453 (HER2+/ER-) breast cancer cells. Toxicol Lett. 2013 Jun 20;221(2):128-136.

[3]. Antitumor and anti-inflammatory effects of trabectedin on human myxoid liposarcoma cells. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2235-44.

其他信息
曲贝替定-d3 是一种稳定同位素标记的研究标准品,用于标记已获批准的抗癌药物曲贝替定。其主要功能是作为内标,用于通过基于质谱的方法(液相色谱-质谱联用,LC-MS)对该抗癌药物进行精确定量。该化合物是一种四氢异喹啉生物碱,具有强效的抗肿瘤活性,其作用机制包括与 DNA 小沟结合,阻断转录并诱导细胞凋亡。它仅作为研究工具,不适用于临床或治疗用途。该化合物通常以固体形式在 -20°C 的惰性条件下储存,以确保其稳定性 [29L9-L12]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C39H40D3N3O11S
相关CAS号
Trabectedin;114899-77-3
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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