| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 50mg |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
The compound targets cereblon (CRBN), a component of the E3 ubiquitin ligase complex. The thalidomide-derived moiety binds to CRBN, which is part of the CUL4-RBX1-DDB1-CRBN E3 ubiquitin ligase. Binding of the thalidomide-based ligand to CRBN induces a conformational change that promotes the recruitment of neo-substrates to the ubiquitin-proteasome system for degradation. This targeting mechanism is the foundation of PROTAC technology, where bifunctional molecules containing both a CRBN ligand and a target protein ligand induce selective degradation of the target protein.
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
PROTAC 由连接肽连接两个配体;一个配体与 E3 泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白[2]。
该化合物的体外活性主要体现在 PROTAC 偶联物中。当与靶蛋白配体偶联后,生成的 PROTAC 分子会募集 CRBN E3 连接酶至靶蛋白,导致其泛素化并随后被蛋白酶体降解。配体-连接子偶联物本身几乎没有独立的生物活性。体外验证研究采用基于细胞的检测方法,通过蛋白质印迹法检测用该连接子构建的 PROTAC 处理后靶蛋白(例如 BRD4、BET 家族蛋白)的降解情况。浓度范围通常为 0.001-10 uM,降解效力(DC50,即降解 50% 所需的浓度)通过剂量反应曲线确定。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
体内活性研究采用以该化合物为连接子-cereblon配体组分构建的完整PROTAC分子进行。动物研究(通常在小鼠异种移植瘤模型中进行)包括通过腹腔注射或静脉注射给药,剂量范围为1-50 mg/kg。疗效终点包括肿瘤生长抑制、通过免疫组织化学或Western blot评估肿瘤组织中靶蛋白的降解情况,以及评估下游药效学标志物。PEG2连接子提供适度的亲水性,在提高水溶性的同时,保持足够的细胞渗透性,从而确保体内疗效。
|
| 酶活实验 |
对于体外结合实验,可使用荧光偏振 (FP) 或表面等离子共振 (SPR) 技术测定沙利度胺-哌嗪组分与 cereblon 的结合亲和力。将纯化的 CRBN-DDB1 复合物固定化,并将不同浓度的化合物流过芯片以计算 KD 值。或者,使用荧光标记的沙利度胺探针进行竞争性结合实验可以测定 IC50 值。典型的实验缓冲液为:50 mM HEPES (pH 7.4)、150 mM NaCl、1 mM DTT 和 0.01% Tween-20。已报道的沙利度胺衍生的 CRBN 配体的 KD 值通常在低微摩尔至纳摩尔范围内,具体数值取决于连接基团的修饰。
|
| 细胞实验 |
为了利用该化合物构建 PROTAC 分子,首先使用 HATU 或 EDCI/HOBt 在 DMF 或 DMSO 中,以 DIPEA 等碱为催化剂,通过标准酰胺偶联化学方法将游离氨基与含有羧酸基团的目标蛋白配体偶联。所得 PROTAC 通过制备型 HPLC 纯化。为了进行细胞验证,将细胞用 PROTAC(0.001-10 uM)处理 4-24 小时,然后裂解细胞并进行蛋白质印迹分析以评估目标蛋白水平。对照组包括 PROTAC 分子、单独的目标配体、单独的 CRBN 配体以及未偶联的两种配体的组合(阴性对照)。
|
| 动物实验 |
在体内疗效研究中,通常将含有该连接子的完整PROTAC分子注射到携带皮下肿瘤异种移植瘤的小鼠体内。标准给药方案为腹腔注射,剂量为5-30 mg/kg,每日一次或隔日一次,持续2-4周。每2-3天使用游标卡尺测量一次肿瘤体积。研究结束时,收集肿瘤和其他组织(肝脏、肾脏、脾脏),通过Western blot分析靶蛋白降解情况,并进行组织病理学检查。在给药后不同时间点进行药代动力学血液采样,并通过LC-MS/MS测定PROTAC浓度。基线对照组包括载体对照组、仅靶标配体对照组和仅CRBN配体对照组。
|
| 药代性质 (ADME/PK) |
该化合物与PROTAC结合后的药代动力学性质取决于所连接的靶配体和整体分子性质。仅就配体-连接子偶联物而言,其分子量约为701.6 g/mol,PEG2连接子(2个环氧乙烷单元)赋予其适度的亲水性,有助于提高水溶性。作为合成单元,该化合物不适用于直接体内给药;它是一种合成中间体。PROTAC分子通常表现出中等药代动力学特征,由于快速清除和代谢,其半衰期通常较短(啮齿动物为1-6小时),但优化连接子可以改善这些性质。二三氟乙酸盐形式可提高溶解度,但一旦化合物制成制剂,则不会影响其体内药代动力学。
|
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
二三氟乙酸盐形式通常可在遵循标准化学安全操作规程的实验室操作中安全使用。三氟乙酸 (TFA) 被认为具有中等毒性,应采取适当的预防措施进行操作,包括使用通风橱和个人防护装备。目前尚无该配体-连接子缀合物作为独立实体的具体毒性数据。当将其整合到 PROTAC 中时,其毒性特征会因靶蛋白的不同而存在很大差异。沙利度胺衍生的 CRBN 配体与具有致畸作用的沙利度胺具有一定的结构相似性。因此,研究人员应谨慎处理这些化合物,尤其要注意其潜在的发育毒性。这些化合物仅供研究使用,不得用于人体,也不可用于治疗或诊断用途。
|
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
沙利度胺-哌嗪-PEG2-NH2 diTFA 是用于 PROTAC 合成的 E3 连接酶配体-连接子偶联物库的一部分。与柔性烷基链相比,哌嗪环提供了结构刚性,可能增强与 CRBN 的结合,而 PEG2 间隔基则平衡了溶解性和渗透性。PROTAC 包含两个通过连接子连接的配体;一个配体与 E3 泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性地降解靶蛋白。该化合物并非已获批准的药物,也未进行临床试验;它仅是一种用于靶向蛋白降解、癌症生物学和化学生物学研究的化学工具。该化合物应在 -20℃ 下避光保存,并置于惰性气体环境中。
|
| 分子式 |
C27H33F6N5O10
|
|---|---|
| 分子量 |
701.57
|
| 相关CAS号 |
Thalidomide-Piperazine-PEG2-NH2;2357110-14-4
|
| 外观&性状 |
Light yellow to green yellow solid powder
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
H2O :~50 mg/mL (~71.27 mM)
|
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.4254 mL | 7.1269 mL | 14.2537 mL | |
| 5 mM | 0.2851 mL | 1.4254 mL | 2.8507 mL | |
| 10 mM | 0.1425 mL | 0.7127 mL | 1.4254 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。