Thalidomide-5-O-C7-NH2 hydrochloride

目录号: V76428 纯度: ≥98%
Thalidomide-5-O-C7-NH2 HCl 是一种基于 Thalidomide 的 cereblon (E3 连接酶) 配体,可招募 CRBN 蛋白。
Thalidomide-5-O-C7-NH2 hydrochloride 产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
沙利度胺-5-O-C7-NH2 HCl 是一种基于沙利度胺的 cereblon(E3 连接酶)配体,可募集 CRBN 蛋白。沙利度胺-5-O-C7-NH2 HCl 可通过连接子与靶蛋白配体偶联,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032。
沙利度胺-5-O-C7-NH2 盐酸盐是一种基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) 配体,其特征是具有一个末端为伯胺基团的 7 碳烷基连接基 (C7),以盐酸盐形式提供。该化合物是一种合成的 E3 连接酶配体-连接基偶联物,专为 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)技术而设计。在该技术中,基于沙利度胺的配体与 E3 泛素连接酶复合物的组成部分 cereblon (CRBN) 结合,末端胺基作为偶联基团,用于连接靶蛋白结合配体。C7 烷基连接基提供了一个相对较短的疏水间隔基。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets cereblon (CRBN), an E3 ubiquitin ligase substrate receptor within the CUL4-RBX1-DDB1-CRBN complex. The thalidomide-derived moiety binds to CRBN, recruiting the E3 ubiquitin ligase machinery. When conjugated to a target protein ligand, the resulting PROTAC molecule brings the target protein into proximity with the E3 ligase, facilitating target ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. The mechanism involves modulation of immune responses through inhibition of TNF-alpha. The C7 alkyl linker is the shortest in the C7-C14 series, providing minimal spacer length between the CRBN ligand and the conjugated target ligand.
体外研究 (In Vitro)
该化合物的体外活性是通过其作为PROTAC构建单元实现的。当通过伯胺基与靶蛋白结合配体偶联时,生成的PROTAC可诱导靶蛋白泛素化和蛋白酶体依赖性降解。单独的配体-连接子偶联物本身几乎没有生物活性。在基于细胞的实验中,已评估了用C7烷基连接子构建的PROTAC对多种靶蛋白的降解作用。例如,THAL-SNS-032在癌细胞系中表现出对CDK9的降解作用。标准验证方法是将细胞用浓度范围为0.001-10 uM的PROTAC处理4-24小时,然后进行Western blot分析以定量靶蛋白水平。对于需要与CRBN最小距离的靶蛋白,短的C7连接子可能是最佳选择。
体内研究 (In Vivo)
含有C7连接基的PROTAC的体内疗效研究通常在小鼠异种移植模型中进行。将完整的PROTAC分子通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)途径给予荷瘤免疫缺陷小鼠,剂量范围为1-30 mg/kg。给药频率通常为每日一次或隔日一次,持续2-4周。疏水性C7烷基连接基会降低水溶性,因此通常需要与DMSO、PEG300、Tween 80或环糊精等助溶剂配制。疗效评估方法包括:每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积;对收集的肿瘤组织进行靶蛋白降解的Western blot分析;以及评估药效学生物标志物。
酶活实验
CRBN 结合亲和力可通过荧光偏振 (FP) 竞争性结合实验或表面等离子共振 (SPR) 进行测定。在 FP 实验中,将纯化的 CRBN-DDB1 复合物与荧光标记的沙利度胺探针和不同浓度的待测化合物孵育。通过测量探针的位移来确定 IC50 值。在 SPR 实验中,将纯化的 CRBN-DDB1 复合物固定在传感器芯片上,并让不同浓度的待测化合物流过芯片,以确定结合动力学和亲和力。典型的实验缓冲液为:50 mM HEPES (pH 7.4)、150 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Tween-20 和 0.1 mg/mL BSA。5-O 位点的 C7 连接子不会干扰 CRBN 的结合界面,因为该位点是已知的结合位点。
细胞实验
为了构建PROTAC,将该化合物的末端伯胺通过标准酰胺偶联化学与含有羧酸的目标蛋白配体偶联。通用方案:将目标配体羧酸(1.0当量)溶解于无水DMF或DMSO中,然后加入HATU或EDCI/HOBt(1.2当量)和DIPEA(2-3当量),并在室温下搅拌10-30分钟以活化。随后加入胺连接剂(1.0-1.2当量),并将反应搅拌2-12小时。所得PROTAC通过制备型HPLC纯化,并通过LC-MS和NMR进行表征。对于细胞实验,用PROTAC(0.001-10 uM,4-24小时)处理细胞,然后进行Western blotting以评估靶标降解情况。
动物实验
使用含有C7连接子的PROTACs进行的体内动物研究遵循标准的异种移植方案。将携带皮下人肿瘤异种移植瘤(约100-200 mm³)的免疫缺陷小鼠(裸鼠或NSG小鼠,6-8周龄,每组n=5-10)随机分组。PROTACs配制于适用于疏水性化合物的载体中(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80、45%生理盐水;或10% DMSO、90%玉米油),并以1-30 mg/kg的剂量腹腔注射或静脉注射给药。给药频率为每日一次至每周三次。每2-3天记录一次肿瘤体积(计算公式为0.5 × 长 × 宽²)和体重。研究结束时(2-4 周),收集肿瘤组织进行蛋白质印迹或免疫组化分析以检测靶蛋白降解,并收集血浆进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
对于独立的配体-连接子偶联物(分子量约为 424 g/mol),C7 烷基连接子较短且疏水,显著降低了其水溶性。当将其引入 PROTAC 中时,C7 连接子可能会影响其药代动力学性质,包括水性缓冲液中溶解度极低(通常需要配制)、血浆蛋白结合率增加、极性降低可能提高细胞渗透性,但同时也增加了非特异性结合的风险。盐酸盐形式可提高溶解度,便于操作和储存。作为 PROTAC 的构建单元,目前尚无针对该配体-连接子偶联物的独立药代动力学研究。由于口服生物利用度低,含有 C7 连接子的完整 PROTAC 通常需要肠外给药。在啮齿动物体内,其血浆半衰期因所连接的靶配体而异,通常为 1-6 小时。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的沙利度胺-5-O-C7-NH2盐酸盐毒理学数据。然而,已知沙利度胺衍生物具有致畸作用(胎儿畸形)和不可逆的毒性周围神经病变。沙利度胺核心结构与脑蛋白结合,这种结合既是其治疗性免疫调节作用的原因,也是其致畸作用的原因。因此,研究人员必须极其谨慎地处理该化合物。应在通风橱内操作,穿戴适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜),避免皮肤接触和吸入。孕妇或可能怀孕者应避免接触。本产品仅供研究使用,不得用于人体或治疗用途。目前尚无该化合物的临床安全性数据。
其他信息
沙利度胺-5-O-C7-NH2盐酸盐是一种用于PROTAC技术靶向降解蛋白质的专用化学工具。该化合物属于一系列同系烷基连接子(C7、C8、C9、C10、C11、C12、C13、C14),可系统地优化连接子长度。C7连接子是该系列中最短的。该化合物可通过连接子与蛋白质配体连接,形成PROTAC。例如,THAL-SNS-032是一种特性明确的PROTAC,由基于沙利度胺的CRBN配体构建而成。本产品仅用于研究应用,包括癌症生物学、化学生物学和药物发现。尚未进行临床试验,也未获批准上市。储存:粉末,-20℃避光防潮,惰性气体保护。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H26CLN3O5
分子量
423.89
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3591 mL 11.7955 mL 23.5910 mL
5 mM 0.4718 mL 2.3591 mL 4.7182 mL
10 mM 0.2359 mL 1.1796 mL 2.3591 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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