Thalidomide-4-O-C12-NH2 hydrochloride

目录号: V76436 纯度: ≥98%
Thalidomide-4-O-C12-NH2 HCl 是一种基于 Thalidomide 的 cereblon (E3 连接酶) 配体,可招募 CRBN 蛋白。
Thalidomide-4-O-C12-NH2 hydrochloride 产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
沙利度胺-4-O-C12-NH2 HCl 是一种基于沙利度胺的 cereblon(E3 连接酶)配体,可募集 CRBN 蛋白。沙利度胺-4-O-C12-NH2 HCl 可通过连接子与靶蛋白配体偶联,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032。
沙利度胺-4-O-C12-NH2 盐酸盐是一种基于沙利度胺的 cereblon (CRBN) 配体,其特点是在沙利度胺核心的 4 位连接一个 12 碳烷基连接基 (C12),末端为伯胺基团,以盐酸盐形式提供。与 5 位类似物相比,4-O 连接位点赋予连接基独特的矢量取向,这可能使 PROTAC 分子具有独特的三元复合物几何结构和降解特性。C12 烷基连接基提供了一个较长的疏水间隔,使得 CRBN 配体与共轭靶配体之间具有显著的空间分离。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets cereblon (CRBN), a component of the CUL4-RBX1-DDB1-CRBN E3 ubiquitin ligase complex. The thalidomide-derived moiety binds to CRBN, recruiting the E3 ubiquitin ligase machinery. The 4-position attachment site orients the linker in a different direction relative to the CRBN binding pocket. When conjugated to a target protein ligand, the resulting PROTAC molecule brings the target protein into proximity with the E3 ligase, facilitating target ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. The C12 alkyl linker provides significant spatial separation.
体外研究 (In Vitro)
该化合物的体外活性是通过其作为PROTAC构建单元实现的。当与靶蛋白结合配体偶联时,生成的PROTAC可诱导靶蛋白泛素化和蛋白酶体依赖性降解。单独的配体-连接子偶联物本身几乎没有生物活性。与5-O-C12类似物相比,使用4-O-C12连接子构建的PROTAC可能表现出不同的降解特性。标准验证方法是将细胞用浓度范围为0.001-10 uM的PROTAC处理4-24小时,然后进行Western blot分析以定量靶蛋白水平。
体内研究 (In Vivo)
含有4-O-C12连接基的PROTACs的体内疗效研究通常在小鼠异种移植模型中进行。将完整的PROTAC分子通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)途径给予荷瘤免疫缺陷小鼠,剂量范围为1-30 mg/kg。给药频率通常为每日一次或隔日一次,持续2-4周。疏水性C12连接基显著降低了水溶性,因此需要与DMSO、PEG300、Tween 80或环糊精等助溶剂配制。疗效评估方法包括肿瘤体积测量、对收集的肿瘤组织中靶蛋白降解情况进行Western blot分析以及药效学生物标志物的评估。
酶活实验
CRBN 的结合亲和力可通过荧光偏振 (FP) 竞争性结合实验或表面等离子共振 (SPR) 进行测定。由于沙利度胺核心药效团得以保留,4 位连接位点可能与 5 位类似物具有相似的结合亲和力。在 FP 实验中,将纯化的 CRBN-DDB1 复合物与荧光标记的沙利度胺探针和不同浓度的待测化合物孵育。典型的实验条件为:50 mM HEPES (pH 7.4)、150 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Tween-20 和 0.1 mg/mL BSA。基于沙利度胺的 CRBN 配体的 KD 值通常在低微摩尔范围内。
细胞实验
构建 PROTAC 分子时,通过标准的酰胺偶联反应,将末端伯胺与含有羧酸的目标蛋白配体连接。通用步骤:将目标配体羧酸(1.0 当量)溶解于无水 DMF 或 DMSO 中,然后加入 HATU 或 EDCI/HOBt(1.2 当量)和 DIPEA(2-3 当量),搅拌 10-30 分钟。随后加入胺连接剂(1.0-1.2 当量),继续搅拌反应 2-12 小时。所得 PROTAC 通过制备型 HPLC 纯化,并用 LC-MS 进行表征。为验证细胞活性,将细胞用 PROTAC(0.001-10 uM,4-24 小时)处理,然后裂解细胞并通过蛋白质印迹法进行分析。
动物实验
使用含有 4-O-C12 连接基的 PROTAC 进行的体内动物研究遵循标准的异种移植方案。将携带皮下人肿瘤异种移植瘤(约 100-200 mm³)的免疫缺陷小鼠(裸鼠或 NSG 小鼠,6-8 周龄,每组 n=5-10)随机分组。PROTAC 配制于适用于疏水性化合物的载体中(例如,10% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80、45% 生理盐水),并以 1-30 mg/kg 的剂量腹腔注射或静脉注射给药。每 2-3 天记录一次肿瘤体积和体重。在研究结束时(2-4 周),收集肿瘤组织进行 Western blot 或 IHC 分析以检测靶蛋白的降解情况,并收集血浆进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
对于独立的配体-连接子偶联物,C12烷基连接子具有高度疏水性,导致其水溶性极低(<0.1 mg/mL)。4-O连接位点可能影响分子的整体形状和亲脂性。当将其引入PROTACs中时,C12连接子会影响药代动力学,包括溶解度受限(需要特殊制剂)、血浆蛋白结合率高、半衰期可能延长以及脱靶结合风险增加。盐酸盐形式可在一定程度上改善其溶解度。目前尚无针对该特定位置异构体的专门药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无公开的沙利度胺-4-O-C12-NH2盐酸盐毒理学数据。沙利度胺衍生物是已知的致畸剂,可通过与CRBN结合导致严重的出生缺陷。4-O-C12修饰并不能消除这种风险。高亲脂性的长烷基链可能会增加组织蓄积和脱靶毒性的可能性。研究人员必须极其谨慎地处理该化合物:在通风橱内操作,穿戴适当的个人防护装备(手套、实验服、护目镜),避免皮肤接触、吸入和摄入。孕妇或可能怀孕者应避免接触。本产品仅供研究使用,不得用于人体或治疗用途。
其他信息
沙利度胺-4-O-C12-NH2盐酸盐是一种基于PROTAC的靶向蛋白降解研究工具。其4位连接基团赋予载体独特的取向,而C12连接基团则提供了显著的空间分离。这种组合可能使使用标准5位连接基团无法降解的靶蛋白得以降解。该化合物属于一个系列,该系列还包括4-O-C7、4-O-C11、4-O-C12和4-O-C14等变体。本产品仅供实验室研究使用,包括化学生物学、靶向蛋白降解和药物研发。尚未进行临床试验评估,也未获批准上市。储存:粉末,-20℃避光防潮,惰性气体保护。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H36CLN3O5
分子量
494.02
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0242 mL 10.1210 mL 20.2421 mL
5 mM 0.4048 mL 2.0242 mL 4.0484 mL
10 mM 0.2024 mL 1.0121 mL 2.0242 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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