SMD-3040

目录号: V76502 纯度: ≥98%
SMD-3040 是一种有效且特异性的 SMARCA2 降解剂。
SMD-3040 CAS号: 3033109-92-8
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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1mg
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产品描述
SMD-3040 是一种高效且特异性的 SMARCA2 降解剂。与 SMARCA4 蛋白相比,SMD-3040 对 SMARCA2 蛋白具有更高的降解选择性。SMD-3040 包含 SMARCA2/4 配体、连接子和 VHL 配体。在肿瘤异种移植模型中,MD-3040 表现出显著的肿瘤生长抑制作用。
SMD-3040(游离碱)是一种高效且高选择性的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)降解剂,靶向SMARCA2(BRM)蛋白。它是一种双功能分子,包含一个SMARCA2/4配体和一个VHL E3泛素连接酶配体。SMD-3040能够诱导SMARCA2的泛素化和蛋白酶体降解,且对SMARCA2的选择性远高于其旁系同源蛋白SMARCA4(BRG1)。它是探索SMARCA4突变癌症合成致死效应的重要研究化合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
SMARCA2 (BRM), a catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin-remodeling complex. SMD-3040 is a selective SMARCA2 PROTAC degrader with a DC50 of 12 nM and a maximum degradation (Dmax) of 91%. It binds to SMARCA2 and the VHL E3 ligase simultaneously, tagging SMARCA2 with ubiquitin for proteasomal destruction. This mechanism exploits the synthetic lethal relationship in cancers that have lost the paralog, SMARCA4.
体外研究 (In Vitro)
体外实验表明,SMD-3040 在多种癌细胞系中均能高效且选择性地降解 SMARCA2(DC50 = 12 nM),而对其高度相关的家族成员 SMARCA4 的影响极小。这种降解作用可抑制癌细胞增殖,尤其是在 SMARCA4 缺陷型细胞中。SMD-3040 通过诱导细胞周期阻滞和凋亡有效杀死这些癌细胞,从而验证了 SMARCA2 作为治疗靶点的有效性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,SMD-3040 在临床前异种移植模型中表现出强大的抗肿瘤活性。在携带 SMARCA4 缺陷型人肿瘤异种移植瘤的小鼠中,全身性给予 SMD-3040 可导致肿瘤组织中 SMARCA2 的显著降解,这与肿瘤生长的显著抑制或消退相关。这些研究表明,SMARCA2 降解具有治疗特定癌症(例如非小细胞肺癌)的治疗潜力。
酶活实验
采用非细胞基时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 检测方法来确认三元复合物的形成。将 VHL 蛋白(His 标签)和 SMARCA2 蛋白(Flag 标签)与浓度递增的 SMD-3040(0-10000 nM)孵育。加入铽标记的抗 His 抗体和荧光素标记的抗 Flag 抗体。测量 TR-FRET 信号。阳性信号表明该化合物能够连接 E3 连接酶和靶蛋白。
细胞实验
将SMARCA4缺陷型非小细胞肺癌细胞(例如NCI-H1299)接种于96孔板中。24小时后,用浓度递增的SMD-3040(0-1000 nM)处理细胞5天。使用CellTiter-Glo试剂盒检测细胞活力。为进行降解分析,用0.1-100 nM的化合物处理细胞8-24小时,裂解细胞,并用SMARCA2和SMARCA4抗体进行Western blotting分析。
动物实验
将SMARCA4缺陷型癌细胞皮下植入雌性BALB/c裸鼠体内。当肿瘤体积达到约150-200 mm³时,将小鼠随机分组(n=8-10)。腹腔注射SMD-3040,剂量为1-30 mg/kg,每日一次或隔日一次,持续3-4周。每3天使用游标卡尺测量肿瘤体积。研究结束时,收集肿瘤组织,进行SMARCA2降解及其下游药效学标志物的Western blot分析。
药代性质 (ADME/PK)
SMD-3040 是一种研究化合物,分子量为 943.21,纯度≥98%。它在 DMSO 中的溶解度高于 100 mg/mL。用于体内给药时,通常将其配制成含有 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水的溶剂。虽然需要进行药代动力学研究,但预计其半衰期较短至中等(2-6 小时),清除率中等,且组织分布良好。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SMD-3040 仅供研究使用,尚未获准用于人体临床。在小鼠临床前毒理学研究中,该化合物在有效剂量下通常耐受性良好,未报告明显的体重减轻或主要器官毒性。由于其靶向染色质调节因子,主要风险是靶向血液毒性,但其对 SMARCA4 的选择性可能降低这种风险。应遵循化学探针的标准操作规程。
参考文献

[1]. Yang L, et.al. Discovery of SMD-3040 as a Potent and Selective SMARCA2 PROTAC Degrader with Strong in vivo Antitumor Activity. J Med Chem. 2023 Jul 31.

其他信息
SMD-3040(CAS:3033109-92-8)是一种用于研究SMARCA2/4合成致死轴的化学探针。该化合物表现出卓越的效力(DC50 = 12 nM)和对SMARCA2相对于SMARCA4的高选择性。它并非获批药物,但是一种极具价值的研究工具。建议以粉末形式储存于-20℃以确保长期稳定性。它是一种PROTAC分子,而非传统意义上的抑制剂。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C52H66N10O5S
分子量
943.21
CAS号
3033109-92-8
相关CAS号
SMD-3040 TFA;SMD-3040 intermediate-1
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :≥ 100 mg/mL (~106.02 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0602 mL 5.3010 mL 10.6021 mL
5 mM 0.2120 mL 1.0602 mL 2.1204 mL
10 mM 0.1060 mL 0.5301 mL 1.0602 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们