PROTAC KRAS G12C degrader-1

目录号: V76591 纯度: ≥98%
PROTAC KRAS G12C degrader-1 是一款基于 Cereblon 的 KRASG12C PROTAC 降解器。
PROTAC KRAS G12C degrader-1 CAS号: 2984236-79-3
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 是一种基于 Cereblon 的 KRASG12C PROTAC 降解剂。PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 可诱导 CRBN/KRASG12C 二聚化,并在报告细胞中降解 GFP-KRASG12C。
PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 是一种基于 Cereblon 的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)分子,旨在靶向并降解 KRAS G12C 突变蛋白。这种异双功能分子可诱导 Cereblon (CRBN) 与 KRAS G12C 形成二聚体,进而导致致癌蛋白 KRAS G12C 的泛素化和蛋白酶体降解。它是一种用于研究 KRAS G12C 驱动的癌症(包括非小细胞肺癌和结直肠癌)的研究工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
PROTAC KRAS G12C degrader-1 targets the KRAS G12C mutant protein, a key oncogenic driver in several cancers, including non-small cell lung cancer (NSCLC) and colorectal cancer. The compound is a heterobifunctional molecule that binds to KRAS G12C via its KRAS-targeting ligand and to the E3 ubiquitin ligase Cereblon (CRBN) via its CRBN ligand. This induces CRBN/KRASG12C dimerization, leading to ubiquitination and proteasomal degradation of KRAS G12C.
体外研究 (In Vitro)
化合物 10(PROTAC KRAS G12C 降解剂-1)在体外与 KRASG12C 结合,在细胞内与 CRBN 结合。然后,它导致 CRBN/KRASG12C 二聚化,并以 CRBN 依赖的方式降解报告细胞中的 GFP-KRASG12C [1]。
体外实验表明,PROTAC KRAS G12C降解剂-1可诱导CRBN/KRASG12C二聚化,并在报告细胞中降解GFP-KRASG12C。它是一种基于Cereblon的KRASG12C PROTAC降解剂。该化合物能有效降解报告细胞系统中的GFP标记的KRASG12C,证明其能够靶向并消除致癌的KRAS G12C蛋白。其他细胞活性数据尚未报道。
体内研究 (In Vivo)
在体内,PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 旨在降解 KRAS G12C 突变蛋白,用于 KRAS G12C 驱动的癌症动物模型。通过促进这种致癌驱动因子的降解,该化合物有望抑制肿瘤生长并改善临床前模型的治疗效果。然而,目前尚未发表具体的体内疗效数据。该化合物基于 Cereblon,一种 PROTAC 开发中常用的 E3 连接酶。
酶活实验
用于检测 PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 的无细胞结合分析并非针对整个 PROTAC 的典型方法。为了评估 CRBN 的结合,可以使用重组 His 标签 CRBN 和生物素标记的沙利度胺衍生物进行基于时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 的分析。对于 KRAS G12C 的结合,可以使用纯化的 KRAS G12C 蛋白进行表面等离子共振 (SPR) 分析。该化合物可诱导 CRBN/KRAS G12C 二聚化,这可以通过 AlphaScreen 或使用标记的 CRBN 和 KRAS 蛋白的 TR-FRET 邻近分析进行测量。
细胞实验
使用 GFP-KRASG12C 报告基因细胞系进行细胞降解实验。将细胞接种于 96 孔板中。加入不同浓度(0.1-1000 nM)的 PROTAC KRAS G12C 降解剂-1,孵育 6-24 小时。通过测量 GFP 荧光强度来检测蛋白质降解情况。或者,裂解细胞后,使用抗 KRAS 抗体进行 Western blot 分析。根据剂量反应曲线计算 DC50(50% 降解浓度)。
动物实验
PROTAC KRAS G12C降解剂-1可在KRAS G12C驱动型癌症的小鼠异种移植模型中进行研究。将KRAS G12C突变型癌细胞(例如NCI-H358或MIA PaCa-2)皮下植入雌性BALB/c裸鼠体内。当肿瘤体积达到100-150 mm³时,将小鼠随机分组,并腹腔注射或口服PROTAC KRAS G12C降解剂-1(10-50 mg/kg),该降解剂溶于载体(10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween 80 + 45%生理盐水)中。每2-3天测量一次肿瘤体积。通过Western blot检测确认肿瘤中KRAS G12C的降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
PROTAC KRAS G12C 降解剂-1 的分子量为 917.47,分子式为 C50H54ClFN8O6。该产品为粉末,纯度 >98%。应在 -20℃ 下保存长达 3 年。在溶剂中,其在 -80℃ 下可稳定保存 6 个月,或在 -20℃ 下可稳定保存 1 个月。尚未报道具体的药代动力学参数。该化合物可溶于 DMSO。用于体内时,需要使用合适的载体进行配制。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
目前尚无PROTAC KRAS G12C降解剂-1的详细毒性数据。作为一种研究级PROTAC,它在体外和体内均以低浓度使用。该化合物基于Cereblon,Cereblon是一种成熟的PROTAC E3连接酶,具有良好的安全性。然而,尚未进行正式的毒理学研究。处理PROTAC分子时应遵循标准安全预防措施。
参考文献

[1]. Exploring Targeted Degradation Strategy for Oncogenic KRAS G12C. Cell Chem Biol. 2020 Jan 16;27(1):19-31.e6.

其他信息
PROTAC KRAS G12C 降解剂-1(CAS:2984236-79-3)是一种研究级 PROTAC,尚未获准用于临床。它是一种基于 Cereblon 的 KRASG12C PROTAC 降解剂,可诱导 CRBN/KRASG12C 二聚化并降解报告细胞中的 GFP-KRASG12C。该化合物是研究 KRAS G12C 驱动型癌症的重要研究工具。本产品仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C50H54CLFN8O6
分子量
917.47
精确质量
916.384
CAS号
2984236-79-3
PubChem CID
162642758
外观&性状
Light yellow to green yellow solid powder
tPSA
177
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
19
重原子数目
66
分子复杂度/Complexity
1700
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C=CC(=O)N1CCN(CC1)C2=NC(=NC3=C(C(=C(C=C32)Cl)C4=CC(=CC5=CC=CC=C54)O)F)NCCCCCCCCCCCCNC6=CC=CC7=C6C(=O)N(C7=O)C8CCC(=O)NC8=O
InChi Key
FMYAMLPDKZOVMB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C50H54ClFN8O6/c1-2-41(63)58-24-26-59(27-25-58)46-36-30-37(51)42(35-29-32(61)28-31-16-11-12-17-33(31)35)44(52)45(36)56-50(57-46)54-23-14-10-8-6-4-3-5-7-9-13-22-53-38-19-15-18-34-43(38)49(66)60(48(34)65)39-20-21-40(62)55-47(39)64/h2,11-12,15-19,28-30,39,53,61H,1,3-10,13-14,20-27H2,(H,54,56,57)(H,55,62,64)
化学名
4-[12-[[6-chloro-8-fluoro-7-(3-hydroxynaphthalen-1-yl)-4-(4-prop-2-enoylpiperazin-1-yl)quinazolin-2-yl]amino]dodecylamino]-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~109.00 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0900 mL 5.4498 mL 10.8995 mL
5 mM 0.2180 mL 1.0900 mL 2.1799 mL
10 mM 0.1090 mL 0.5450 mL 1.0900 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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