PROTAC CDK12/13 Degrader-1 TFA

目录号: V76596 纯度: ≥98%
PROTAC CDK12/13 Degrader-1 (7f) TFA 是一种有效且特异性的细胞周期蛋白依赖性激酶 CDK12/CDK13 双重降解剂,DC50 分别为 2.2 nM 和 2.1 nM。
PROTAC CDK12/13 Degrader-1 TFA 产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
PROTAC CDK12/13 降解剂-1 (7f) TFA 是一种高效且特异性的细胞周期蛋白依赖性激酶 CDK12/CDK13 双重降解剂,其 DC50 值分别为 2.2 nM 和 2.1 nM。PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA 具有抗增殖活性,可用于乳腺癌研究。
PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA(化合物 7f)是一种高选择性的细胞周期蛋白依赖性激酶 CDK12 和 CDK13 双重降解剂,其 DC50 值分别为 2.2 nM 和 2.1 nM。它是一种高效且特异性的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体),可通过泛素-蛋白酶体途径诱导 CDK12 和 CDK13 的降解。该化合物具有很强的抗增殖活性,是研究乳腺癌细胞周期调控和治疗策略的宝贵工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK12 2.2 nM (DC50) CDK13 2.1 nM (DC50)
PROTAC CDK12/13 Degrader‑1 TFA targets CDK12 and CDK13, two cyclin‑dependent kinases involved in transcriptional regulation, DNA damage response, and cell cycle progression. It induces the degradation of these kinases by recruiting an E3 ubiquitin ligase to the target proteins, leading to their ubiquitination and subsequent proteasomal degradation. The compound achieves DC50 values of 2.2 nM for CDK12 and 2.1 nM for CDK13, demonstrating exceptional potency.
体外研究 (In Vitro)
Protac CDK12/13 降解剂-1 TFA(0.02-10 μM,150 小时)能显著且呈剂量依赖性地抑制 MFM223 和 MDA-MB-231 细胞的生长 [1]。PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA(500 nM,4 小时)能以剂量依赖的方式显著降解 MFM223 和 MDA-MB-231 细胞中的 CDK12 和 CDK13 [1]。体外实验表明,PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA(0.02-10 μM,150 小时)能显著且呈剂量依赖性地抑制 MFM223 和 MDA-MB-231 乳腺癌细胞的生长。在 500 nM 浓度下作用 4 小时,该化合物能以剂量依赖的方式显著降解 MFM223 和 MDA-MB-231 细胞中的 CDK12 和 CDK13。这种降解作用导致抗增殖效应,使其成为乳腺癌研究的重要工具。
体内研究 (In Vivo)
PROTAC CDK12/13 降解剂-1 (7f) TFA 在大鼠体内的药代动力学特征[1]。参数如下:口服(20 mg/kg)、静脉注射(10 mg/kg)、腹腔注射(20 mg/kg)、静脉注射(2.5 mg/kg),t1/2(h)- 5.28 10.85 5.8,Tmax(h)5.33 0.08 2.17 0.08,Cmax(ng/mL)7.73 19892.4 24.79 1498.5,Cmax(ng/mL)21.83 7193.3 284.8 383.9,AUC0-∞(h*ng/mL)- 7242.7 318.5 391.55,CL(mL/h/kg)- 1406.5 - 6495.4,F(%)0.15 - 10.63
。PROTAC 的特异性体内活性数据CDK12/13降解剂-1 TFA在现有文献中并未得到详尽描述。然而,其在大鼠体内的药代动力学参数已被测定。作为一种强效降解剂,TFA对乳腺癌细胞系具有显著的抗增殖活性,因此可能在肿瘤异种移植模型中具有体内疗效潜力。
酶活实验
由于 PROTAC CDK12/13 Degrader-1 TFA 是一种在细胞内通过劫持泛素-蛋白酶体系统发挥作用的降解酶,因此通常不进行非细胞检测。其活性无法在无细胞体系中重现。相反,其作用机制的研究是在细胞内进行,通过测量 CDK12 和 CDK13 蛋白的降解情况。靶点结合情况可通过细胞热位移分析 (CETSA) 进行评估。
细胞实验
免疫荧光[1]
细胞类型: MDA-MB-231 细胞系
测试浓度: 1.0 μM
孵育时间: 15 小时
实验结果: CDK12 降解率为 88%,CDK13 降解率为 74%。对 CDK12 的 DC50 值为 2.2 nM,对 CDK13 的 DC50 值为 2.1 nM。
体外细胞实验是表征 PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA 活性的关键。将MFM223和MDA-MB-231乳腺癌细胞用不同浓度(0.02-10 μM)的化合物处理150小时,以评估其抗增殖活性。采用Western blotting法检测500 nM化合物处理4小时后CDK12和CDK13的降解情况,以确定DC50值。细胞活力采用MTT或CellTiter-Glo等标准方法进行评估。
动物实验
PROTAC CDK12/13降解剂-1 TFA的体内动物实验通常会在小鼠异种移植模型中进行,使用乳腺癌细胞系,例如MFM223或MDA-MB-231。该化合物将通过腹腔注射或口服途径给药,并测定其药代动力学参数。肿瘤生长抑制和肿瘤组织中CDK12/13的降解将是主要终点。
药代性质 (ADME/PK)
PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA 的药代动力学性质已在大鼠体内进行了表征。该化合物的分子量为 936.93,分子式为 C47H47F3N10O8。文中提供了 SMILES 表示。该化合物应以冻干粉形式储存于 -20°C,在此温度下可稳定保存 36 个月。溶液形式的该化合物应储存于 -20°C,并在 1 个月内使用,以防止效力降低。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有资料中关于 PROTAC CDK12/13 降解剂-1 TFA 的毒理学数据并不详尽。作为一种强效的 CDK12 和 CDK13 降解剂(CDK12 和 CDK13 参与转录调控和 DNA 损伤反应),它可能具有潜在的靶向毒性。任何治疗性开发都需要进行全面的毒理学研究。本品仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Discovery of a Highly Potent and Selective Dual PROTAC Degrader of CDK12 and CDK13. J Med Chem. 2022 Aug 8.

其他信息
PROTAC CDK12/13降解剂‑1 TFA(化合物7f)是一种高度选择性的CDK12和CDK13双重降解剂,DC50值分别为2.2 nM和2.1 nM。它表现出强大的抗增殖活性,是研究细胞周期调控和乳腺癌研究中治疗策略的宝贵工具。未获临床使用批准,仅供研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C47H47F3N10O8
分子量
936.93
相关CAS号
PROTAC CDK12/13 Degrader-1
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~25 mg/mL (~26.68 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.0673 mL 5.3366 mL 10.6732 mL
5 mM 0.2135 mL 1.0673 mL 2.1346 mL
10 mM 0.1067 mL 0.5337 mL 1.0673 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们