MAK683-CH2CH2COOH hydrochloride

目录号: V76797 纯度: ≥98%
MAK683-CH2CH2COOH 与 EED(胚胎外胚层发育蛋白)结合。
MAK683-CH2CH2COOH hydrochloride 产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes

Other Forms of MAK683-CH2CH2COOH hydrochloride:

  • MAK683-CH2CH2COOH
点击了解更多
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
MAK683-CH2CH2COOH 与 EED(胚胎外胚层发育蛋白)结合。PROTAC EED 降解酶-1 和 PROTAC EED 降解酶-2 是利用 MAK683-CH2CH2COOH 和 E3 泛素连接酶的 VHL 配体设计的。
MAK683-CH2CH2COOH 盐酸盐是一种功能化的 EED(胚胎外胚层发育蛋白)配体,含有羧酸基团,被设计为合成 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)的构建模块,靶向 EED,EED 是 Polycomb 抑制复合物 2 (PRC2) 的核心成分。
生物活性&实验参考方法
靶点
MAK683-CH2CH2COOH targets EED, a key component of the PRC2 complex. MAK683 (parent compound) binds EED with IC50 values of 59 nM (Alphascreen), 26 nM (ELISA), and 89 nM (LC-MS assay). The CH2CH2COOH extension enables conjugation to E3 ubiquitin ligase ligands via amide bond formation.
体外研究 (In Vitro)
经过 14 天的治疗,MAK683-CH2CH2COOH 对 Karpas422 细胞的抑制作用达到 GI50 为 14 nM [1]。
暂无数据。MAK683 是一种强效的 EED 抑制剂。功能化衍生物 MAK683-CH2CH2COOH 通过 MAK683 药效团保留了 EED 结合活性,而羧基则作为连接点。该化合物本身除了与 EED 结合外,没有其他内在活性;其活性是在整合到 PROTAC 中时才能实现的。
体内研究 (In Vivo)
暂无数据。MAK683-CH2CH2COOH 已被用于设计靶向 EED 的 PROTAC(EED 降解剂-1 和 PROTAC EED 降解剂-2),方法是将该配体与 VHL E3 泛素连接酶配体连接。在细胞中,这些 PROTAC 可诱导 EED 降解,从而降低 H3K27me3 水平,并在 PRC2 依赖性癌症模型中发挥抗增殖作用。
酶活实验
标准的EED结合实验包括将MAK683-CH2CH2COOH(1 pM至10 uM)与重组EED蛋白在Alphascreen缓冲液(25 mM HEPES,pH 7.5,0.1% BSA,0.05% Tween-20)中于室温孵育1小时,随后加入供体和受体磁珠。2小时后测量发光值。对于ELISA,生物素标记的EED被捕获在链霉亲和素包被的酶标板上,并用标记的二抗检测结合情况。
细胞实验
暂无数据。PROTAC活性检测的典型方案包括:用EED PROTAC(0.1-1000 nM)处理PRC2依赖性癌细胞(例如KARPAS-422、Pfeiffer),处理4-24小时,然后进行Western blotting以定量EED和H3K27me3的水平。处理72-120小时后,使用MTT或CellTiter-Glo检测细胞活力。
动物实验
暂无数据。为了评估 EED PROTACs 的体内疗效,标准方案包括在荷瘤异种移植小鼠模型中进行静脉或腹腔注射(通常为 10-100 mg/kg),在给药后 4-24 小时通过蛋白质印迹法评估肿瘤组织中 EED 的降解情况,并在 2-4 周内监测肿瘤生长抑制情况。
药代性质 (ADME/PK)
与未修饰的MAK683相比,CH2CH2COOH基团的延伸提高了极性并改善了水溶性。羧基使得可以通过标准的HATU或EDC/NHS化学方法与胺基功能化的E3连接酶配体进行酰胺偶联。相关化合物中的TFA盐形式(并非本盐酸盐)可增强溶解度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
MAK683 本身在临床前研究中显示出良好的安全性。作为 PROTAC 结构单元,MAK683-CH2CH2COOH 盐酸盐不适用于以游离化合物形式进行体内实验。目前尚未报告具体的毒理学数据。请遵守标准的实验室安全预防措施。
参考文献

[1]. EED-Targeted PROTACs Degrade EED, EZH2, and SUZ12 in the PRC2 Complex. Cell Chem Biol. 2019 Nov 26. pii: S2451-9456(19)30362-9.

其他信息
MAK683-CH2CH2COOH 盐酸盐是一种研究级 PROTAC 构建模块,用于靶向 EED 的蛋白质降解。MAK683 是一种在研的 EED 抑制剂,已在 PRC2 依赖性癌症的临床前研究中进行了评估。该功能化衍生物仅用于 PROTAC 开发和表观遗传癌症治疗的实验室研究,不可用于临床。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H22CLFN6O3
分子量
484.91
相关CAS号
MAK683-CH2CH2COOH;2639882-68-9
外观&性状
White to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0622 mL 10.3112 mL 20.6224 mL
5 mM 0.4124 mL 2.0622 mL 4.1245 mL
10 mM 0.2062 mL 1.0311 mL 2.0622 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们