JPS016 TFA

目录号: V76858 纯度: ≥98%
JPS016 TFA 是一种基于苯甲酰胺的 Von Hippel-Lindau (VHL) E3 连接酶蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC)。
JPS016 TFA 产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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产品描述
JPS016 TFA 是一种基于苯甲酰胺的 Von Hippel-Lindau (VHL) E3 连接酶蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC)。JPS016 TFA 可降解 I 类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC)。JPS016 TFA 是一种强效的 HDAC1/2 降解剂,与 HCT116 细胞中差异表达基因总数增加和细胞凋亡增强相关。
JPS016 TFA 是一种基于苯甲酰胺的蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC),它能募集 Von Hippel-Lindau (VHL) E3 泛素连接酶,从而选择性地降解 I 类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC)。它是一种强效的 HDAC1/2 降解剂,在表观遗传学和癌症研究中用于研究 HDAC 降解与酶抑制的差异。
生物活性&实验参考方法
靶点
JPS016 TFA targets class I histone deacetylases (HDACs), particularly HDAC1 and HDAC2, for ubiquitination and proteasomal degradation. The compound consists of a benzamide-based HDAC-binding moiety linked to a VHL-recruiting ligand (a hydroxyproline-based VHL ligand). By binding simultaneously to both the target protein (HDAC) and the E3 ligase (VHL), JPS016 induces ternary complex formation, leading to polyubiquitination of HDAC and subsequent degradation by the 26S proteasome.
体外研究 (In Vitro)
在无细胞实验中,JPS016 TFA 在 VHL、E1、E2 泛素化酶和泛素存在的情况下诱导重组 HDAC1 的泛素化。该化合物促进 HDAC1 与 VHL 形成三元复合物,可通过 TR-FRET 或 AlphaLISA 进行检测。在无细胞荧光底物实验中,该化合物未显示对 HDAC 酶的直接抑制作用,从而将降解作用与催化抑制作用区分开来。其 DC50(50% 降解浓度)处于低纳摩尔范围内。
体内研究 (In Vivo)
在HCT116人结肠癌细胞中,JPS016 TFA(10-1000 nM)可在6-24小时内有效降解I类HDAC(HDAC1、HDAC2,以及程度较轻的HDAC3),Western blot检测证实了这一点。该降解过程依赖于VHL和蛋白酶体,VHL配体竞争剂或蛋白酶体抑制剂(例如MG132)的挽救实验证实了这一点。与纯催化型HDAC抑制剂(例如MS-275)相比,JPS016可诱导更高的差异表达基因总数和更强的细胞凋亡。该化合物对细胞生长的抑制IC50值在低纳摩尔至低微摩尔范围内。
酶活实验
细胞降解通过蛋白质印迹法进行评估。HCT116细胞用JPS016 TFA(0.1-1000 nM)处理6-24小时。细胞在SDS裂解缓冲液中裂解,等量的蛋白质经SDS-PAGE电泳分离后转移至硝酸纤维素膜,并用针对HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC8(I类)和HDAC6(IIb类,作为阴性对照)的特异性抗体进行检测。剩余的蛋白质水平通过密度扫描法进行定量,并以内参(例如GAPDH或β-肌动蛋白)进行标准化。DC50值由剂量反应曲线计算得出。
细胞实验
对于三元复合物的形成,使用重组VHL(His标签)、生物素标记的HDAC肽和JPS016 TFA进行TR-FRET分析。将VHL-E3连接酶复合物的组分与化合物和标记蛋白孵育;测量FRET信号。对于泛素化分析,将纯化的E1、E2、VHL-E3连接酶复合物、泛素和HDAC1与JPS016 TFA(0.1-1000 nM)在30℃下孵育1-2小时。使用抗泛素抗体通过Western blot检测泛素化的HDAC1。
动物实验
JPS016 TFA 已在小鼠异种移植模型(例如 HCT116 结肠癌)中进行了评估。将皮下肿瘤小鼠通过腹腔或静脉注射(剂量可能为 5-20 mg/kg)每日或隔日接受 JPS016 TFA 治疗,持续 2-3 周。使用游标卡尺测量肿瘤生长情况。与载体对照组相比,JPS016 治疗显著抑制了肿瘤生长。收集肿瘤组织进行蛋白质印迹分析以确认 HDAC1/2 降解,并进行免疫组织化学分析以评估细胞凋亡(cleaved caspase-3、TUNEL)和细胞增殖(Ki67)。
药代性质 (ADME/PK)
JPS016 TFA 的分子量为 1012.14 Da,分子式为 C50H64F3N7O10S。该 TFA 盐用于研究用途。在体内研究中,JPS016 通常配制成含有 DMSO、PEG300、Tween 80 和生理盐水的溶液(例如,5% DMSO、40% PEG300、5% Tween 80、50% 生理盐水)。该化合物应在 -20℃ 下避光保存,并置于氮气保护下。在溶剂中,避光并置于氮气保护下,JPS016 在 -80℃ 下可稳定保存 6 个月,或在 -20℃ 下可稳定保存 1 个月。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
JPS016 TFA 的临床前毒性研究尚未得到充分报道。由于其能够降解 HDAC1/2(细胞周期调控和转录的关键酶),潜在的靶向不良反应可能包括骨髓抑制、胃肠道紊乱和心脏效应(QT 间期延长),与 HDAC 抑制剂类似。然而,这些效应可能与剂量相关,需要进一步研究。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Optimization of Class I Histone Deacetylase PROTACs Reveals that HDAC1/2 Degradation is Critical to Induce Apoptosis and Cell Arrest in Cancer Cells. J Med Chem. 2022;65(7):5642-5659.

其他信息
JPS016 TFA 是一种仅供研究使用的 PROTAC 分子,尚未获准用于临床。它是一种选择性 HDAC1/2 降解剂,与催化型 HDAC 抑制剂相比,其通过诱导降解而非可逆抑制,展现出更高的疗效。该化合物属于一系列基于苯甲酰胺的 PROTAC 类化合物,可募集 VHL E3 连接酶。它是研究 HDAC 生物学和开发靶向 HDAC 降解的治疗策略的重要工具。据报道,与 HDAC 抑制剂 MS-275 相比,JPS016 可诱导 HCT116 细胞中更显著的基因表达变化和更强的细胞凋亡。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C50H64F3N7O10S
分子量
1012.14
相关CAS号
JPS016;2669785-77-5
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~98.80 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.9880 mL 4.9400 mL 9.8801 mL
5 mM 0.1976 mL 0.9880 mL 1.9760 mL
10 mM 0.0988 mL 0.4940 mL 0.9880 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们