EN219-alkyne

别名: EN219-alkyne; EN-219-alkyne; EN219 alkyne
目录号: V79293 纯度: ≥98%
EN219-alkyne 是一种炔烃功能化的 EN219 探针。
EN219-alkyne 产品类别: Others 13
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
Other Sizes

Other Forms of EN219-alkyne:

  • EN219
  • EN219-O-C4-NH2 TFA
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InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
EN219-alkyne 是一种炔烃功能化的 EN219 探针。 EN219 是一种合成的共价配体,对 RNF114 的 N 端半胱氨酸 C8 具有中等特异性,IC50 为 470 nM。 EN219 抑制 RNF114 介导的自身泛素化和 p21 泛素化。 EN219-alkyne 是一种点击化学试剂。它含有炔基,可以与带有叠氮基的化合物发生 CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
EN219-alkyne (en219 -炔)探针原位标记和下拉研究(以231MFP细胞为例)[1]
1. 231MFP细胞用DMSO载体或50 μM en219 -炔探针处理90 min。
2. PBS中收集细胞,超声切割。
3. 制备western blot样品:将裂解物(1 mg蛋白,500 μL)等量分为每个样品,然后依次加入:10 μL 5mm生物素叠氮吡啶,50 μL点击反应混合物(即三份TBTA 5 mM TBTA丁醇,由一份DMSO (4:1, v/v),一份Cu(II)SO4溶液和一份50 mM TCEP组成)。
4. 轻轻搅拌样品,在室温下孵育1小时。 5. CuAAC后,6500 g离心沉淀蛋白,用预冷甲醇(500 μL)洗涤2次。
6. 样品在4℃预冷离心机中6,500 g离心4 min,吸出多余的甲醇,然后用探针超声将重组蛋白沉淀在250 μL含1.2% SDS的PBS中。
7. 蛋白质组在90℃下变性5 min,不溶性组分通过6500 g离心沉淀,可溶性蛋白质组用1.2 mL PBS(样品中SDS终浓度为0.2%)稀释至总体积1450 μL,保留50 μL作为输入。
8. 每个样品中加入85 μL预洗的50%链亲和素琼脂糖珠,室温下轻轻搅拌,孵育过夜。
9. 室温下6,500 g旋转2分钟后,从每个样品中吸出上清。
10. 将珠子转移到旋转柱上,用PBS洗涤3次。将微珠在50 μL LDS样品缓冲液中煮沸5分钟进行洗脱。离心后收集洗脱液,western blot分析。
参考文献
[1]. Luo M, et al. Chemoproteomics-enabled discovery of covalent RNF114-based degraders that mimic natural product function. Cell Chem Biol. 2021 Apr 15;28(4):559-566.e15.
其他信息
将具有功能活性的天然产物转化为全合成的小分子模拟物一直是药物化学领域的重要课题。我们近期发现萜类天然产物印楝素可作为E3泛素连接酶RNF114的共价募集剂,用于靶向蛋白降解——这是现代药物研发中一种强有力的治疗手段。本文利用基于活性的蛋白质谱分析共价配体筛选方法,报道了全合成的RNF114募集剂分子的发现,这些分子也可用于PROTAC应用,并证实了它们在细胞中降解BRD4和BCR-ABL等治疗相关靶点的有效性。鉴定出能够模拟复杂天然产物功能的简单易操作的类药骨架,有助于进一步拓展E3连接酶募集剂的工具箱,这对于药物研发和化学生物学而言至关重要。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H19BRCLN3O3
分子量
488.76
精确质量
487.02983
相关CAS号
EN219;380351-29-1
PubChem CID
170902951
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
3.4
tPSA
71Ų
SMILES
C#CCNC(=O)COC1=CC=C(C=C1)C2CC(=NN2C(=O)CCl)C3=CC=C(C=C3)Br
InChi Key
FGJLZQWWDKBXBM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
nChI=1S/C22H19BrClN3O3/c1-2-11-25-21(28)14-30-18-9-5-16(6-10-18)20-12-19(26-27(20)22(29)13-24)15-3-7-17(23)8-4-15/h1,3-10,20H,11-14H2,(H,25,28)
化学名
2-[4-[5-(4-bromophenyl)-2-(2-chloroacetyl)-3,4-dihydropyrazol-3-yl]phenoxy]-N-prop-2-ynylacetamide
别名
EN219-alkyne; EN-219-alkyne; EN219 alkyne
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0460 mL 10.2300 mL 20.4599 mL
5 mM 0.4092 mL 2.0460 mL 4.0920 mL
10 mM 0.2046 mL 1.0230 mL 2.0460 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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