Amino-PEG7-t-butyl ester

目录号: V82362 纯度: ≥98%
氨基-PEG7-叔丁基酯是PEG类别的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
Amino-PEG7-t-butyl ester CAS号: 2428400-07-9
产品类别: E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
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产品描述
氨基-PEG7-叔丁酯是一种PEG类别的PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
氨基-PEG7-叔丁酯(CAS#: 2428400-07-9)是一种基于PEG的PROTAC连接剂,由7个单元的聚乙二醇(PEG7)间隔基、末端伯胺(氨基)基团和叔丁酯保护的羧基组成。这种异双功能PEG试剂广泛用于靶向蛋白降解研究中PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)蛋白降解剂的合成。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
No direct pharmacological target; functions as a PROTAC linker (PEG-based linker) that joins an E3 ubiquitin ligase ligand (e.g., cereblon or VHL ligand) and a target protein ligand. It belongs to the PEG class of linkers and enhances the physicochemical properties of PROTAC molecules.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为PROTAC连接子,氨基-PEG7-叔丁酯本身不具有直接的生物活性;其活性仅在整合到完整的PROTAC分子中时才能发挥。PROTAC是一种异双功能分子,包含一个E3泛素连接酶配体和一个目标蛋白配体,二者通过连接子连接。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性地降解目标蛋白,其催化作用机制不同于传统的基于配体占据的抑制剂。PEG7间隔基赋予PROTAC构建体最佳的长度、柔性和亲水性,从而增强其药代动力学性质(溶解度、稳定性、生物利用度)。
体内研究 (In Vivo)
无直接体内活性。当引入PROTAC分子中时,PEG7连接子会影响PROTAC的体内行为。亲水性的PEG7间隔基可减少聚集,提高水溶性,并通常减少非特异性蛋白结合,从而与烷基连接子相比,提高血浆稳定性、延长半衰期并改善组织分布。在PROTAC设计中,通常使用最佳长度的PEG7连接子(末端距约为29-31埃),以实现E3连接酶与靶蛋白之间合适的空间取向。
酶活实验
无特定检测方法;连接剂的评估包括表征其理化性质(纯度、分子量、溶解度)并确认偶联成功。通过高效液相色谱(HPLC)和核磁共振(NMR)进行质量控制,确保连接剂纯度≥95%且结构正确。末端胺基可通过EDC/NHS偶联与羧酸反应形成稳定的酰胺键,或直接与活化的NHS酯反应。叔丁酯是一种保护基,可在温和的酸性条件下(例如,在二氯甲烷中的三氟乙酸溶液中)去除,从而暴露游离的羧基,用于后续的偶联反应。
细胞实验
(1) 直接细胞实验:无需任何步骤;连接剂本身不具有生物活性。(2) PROTAC 细胞实验:用含有氨基-PEG7-叔丁酯连接剂的完整 PROTAC 处理细胞(0.1-1000 nM,4-24 小时)。(3) 在含有蛋白酶/磷酸酶抑制剂的 RIPA 缓冲液中裂解细胞。(4) 进行 SDS-PAGE 和 Western blot 分析,使用针对靶蛋白(例如 BRD4、AR、ER、BTK、EGFR 等)的抗体。(5) 通过密度分析定量靶蛋白降解,并以内参(GAPDH、β-肌动蛋白或微管蛋白)进行标准化。(6) 通过 CCK-8 或 MTT 法评估细胞毒性,处理时间为 48-72 小时。
动物实验
含有PEG7连接子的PROTAC分子通常在小鼠异种移植模型中进行测试:(1) 使用6-8周龄的雌性BALB/c裸鼠,其皮下移植有肿瘤(例如,靶蛋白阳性癌细胞,150-250 mm³)。(2) 静脉注射(尾静脉)、腹腔注射或口服PROTAC(1-50 mg/kg,每日或隔日一次)。(3) 制剂:10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80、45%生理盐水(用于腹腔注射/静脉注射)或0.5%甲基纤维素+0.2% Tween-80(用于口服)。(4) 监测肿瘤体积和体重。(5) 在末次给药后4-24小时收集肿瘤组织,进行Western blot分析以确认靶蛋白降解。(6) 通过LC-MS/MS测定血浆和肿瘤组织中PROTAC的浓度。
药代性质 (ADME/PK)
作为连接子,它有助于PROTAC偶联物的药代动力学(PK)。PEG7间隔基可提高水溶性并减少聚集。标准配方:10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45%生理盐水,适用于腹腔注射(IP)、静脉注射(IV)、肌肉注射(IM)和皮下注射(SC)。溶于DMSO(≥100 mg/mL,220.47 mM)。含有该连接子的PROTAC的典型药代动力学特征为:中等清除率(CL ~ 10-30 mL/min/kg)、中等分布容积(Vd ~ 1-3 L/kg)、半衰期(t1/2) ~ 2-6 h(静脉注射)、口服生物利用度~ 20-50%(取决于靶蛋白配体)。由于连接子本身清除迅速且无药理活性,因此没有其药代动力学数据。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
连接子本身通常无毒,但当其被整合到完整的PROTAC分子中时,需评估其细胞毒性。体外实验:在HEK293细胞上进行CCK-8检测(单独使用连接子的IC50 > 200 μM)。叔丁酯基团可被酯酶水解,释放出叔丁醇(一种相对无毒的代谢物)。单独使用连接子在体内无毒性。对于含有该连接子的完整PROTAC,需在啮齿动物中进行最大耐受剂量(MTD)研究(通常为10-100 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续14天)。监测体重、临床症状和临床化学指标(ALT、AST、BUN、肌酐)。本产品仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562.

其他信息
氨基-PEG7-叔丁酯是一种PEG类PROTAC连接剂,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。其主要特点包括:(1) 末端NH2基团可用于与E3连接酶配体或靶蛋白配体偶联;(2) 叔丁酯作为保护基团,可在温和酸性条件下(例如,二氯甲烷中的三氟乙酸)脱除,从而露出-COOH基团,用于其他偶联;(3) PEG7提供最佳的亲水性和柔韧性;(4) 高纯度(≥95-98%),适用于PROTAC合成。本产品未经批准用于人体,仅供靶向蛋白降解疗法的研究用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H43NO9
分子量
453.567427873611
精确质量
453.293
CAS号
2428400-07-9
PubChem CID
154730422
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
-0.9
tPSA
117
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
25
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
392
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C(CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCN)=O)C(C)(C)C
InChi Key
DQPAYUNKPDINFW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H43NO9/c1-21(2,3)31-20(23)4-6-24-8-10-26-12-14-28-16-18-30-19-17-29-15-13-27-11-9-25-7-5-22/h4-19,22H2,1-3H3
化学名
tert-butyl 3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2047 mL 11.0237 mL 22.0473 mL
5 mM 0.4409 mL 2.2047 mL 4.4095 mL
10 mM 0.2205 mL 1.1024 mL 2.2047 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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