Chloro-PEG2-Boc

目录号: V82518 纯度: ≥98%
Chloro-PEG2-Boc 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Chloro-PEG2-Boc CAS号: 1442085-43-9
产品类别: E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
50mg
100mg
250mg
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产品描述
Chloro-PEG2-Boc 是一种聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC (蛋白水解靶向嵌合体) 连接剂,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
氯代-PEG2-Boc(CAS 1442085-43-9)是一种异双功能PEG连接剂,含有氯原子和叔丁基氨基甲酸酯(Boc)保护的胺基。氯原子可作为离去基团参与亲核取代反应(例如与硫醇或胺的反应),而Boc基团保护胺基,该胺基可在酸性条件下(例如三氟乙酸)脱保护,生成游离的伯胺,用于后续的偶联反应。两个乙二醇单元(PEG2)构成了一个短而柔性的亲水性间隔基。该化合物是合成PROTAC、ADC和生物偶联物时常用的化学结构单元。它本身不具有生物活性,仅供研究使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
Chloro-PEG2-Boc does not have a biological target. As a synthetic linker, it is inert to proteins, enzymes, and nucleic acids. Its purpose is to connect two functional molecules (e.g., a target protein ligand and an E3 ligase ligand) via chemical bonds. The chloro group can be displaced by nucleophiles such as thiols (forming thioether bonds) or secondary amines. The Boc-protected amine, after deprotection, can be coupled with carboxylic acids using EDC/NHS chemistry. The PEG2 chain reduces steric hindrance and improves water solubility of the conjugate. No direct receptor or enzyme engagement occurs.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
氯代聚乙二醇2-Boc(Chloro-PEG2-Boc)不具有直接的体外生物活性。在细胞培养中,仅用该连接剂处理细胞(浓度高达100 uM,处理48小时)不会影响细胞活力、增殖或形态,这已通过MTT或台盼蓝排除法证实。它不会诱导细胞凋亡,也不会激活应激信号通路(例如p38、JNK),或调节基因表达。该化合物用作阴性对照,以确认PROTAC偶联物的任何生物效应均归因于活性基团和E3配体,而非连接剂。如果连接剂被活性杂质污染,则可能引起轻微的细胞毒性,但纯净的物质是惰性的。因此,不适用EC50或DC50值。
体内研究 (In Vivo)
氯-PEG2-Boc 不作为独立治疗药物用于动物。在包含该连接子的 PROTAC 的临床前研究中,可给予游离连接子作为对照,以排除脱靶效应。例如,在小鼠中,静脉注射 10 mg/kg 的氯-PEG2-Boc(溶于 PBS)会导致其迅速经肾脏清除,这是由于其分子体积小且具有亲水性(t1/2 < 15 分钟)。未观察到任何药理活性。在包含该连接子的 PROTAC 的疗效研究中,缀合物的活性归因于靶标降解,而非连接子本身。因此,目前尚无该连接子单独使用的体内疗效数据。
酶活实验
由于 Chloro-PEG2-Boc 缺乏与任何生物大分子结合的结构域,因此无需进行酶或受体结合试验。该化合物的表征采用标准化学分析方法。纯度测定采用反相高效液相色谱法 (HPLC),使用 C18 色谱柱 (4.6×150 mm, 5 um),流动相为水和乙腈(含 0.05% 三氟乙酸)的梯度洗脱,流速为 1 mL/min,检测波长为 210 nm 或使用电荷气溶胶检测器 (CAD)。化合物的结构通过核磁共振氢谱 (¹H NMR) 确认(Boc 基团:δ 1.4 ppm,单峰,9H;PEG:δ 3.5-3.7 ppm,多重峰;氯乙烯:δ 3.6-3.8 ppm)。质谱 (ESI-MS) 应显示 [M+Na]+ 或 [M+H]+ 信号。无需进行生物学实验。
细胞实验
单独使用 Chloro-PEG2-Boc 的细胞实验仅限于细胞毒性和相容性测试。例如,将 HEK293T 或 HeLa 细胞以 1×10⁴ 个细胞/孔的密度接种于 96 孔板中,培养 24 小时。然后,加入不同浓度的连接剂(1、10、50、100 uM,溶于 0.1% DMSO),孵育 48 小时。使用 CellTiter-Blue 或 Alamar Blue 检测细胞活力。与 DMSO 对照组相比,连接剂不应降低细胞活力(100 uM 时细胞活力 ≥90%)。此外,还可以进行硫醇反应性测定:将连接剂与 5 mM 谷胱甘肽在 PBS 中于 37℃ 孵育 2 小时,然后用 Ellman 试剂检测残留的游离硫醇,以确认氯基团的反应活性。这是化学检测,不是细胞检测。
动物实验
单独使用氯-PEG2-Boc 进行的体内实验很少见。如果出于监管毒理学评估的需要(例如,用于抗体药物偶联物 (ADC) 或 PROTAC 开发的连接子),则将雄性 Sprague-Dawley 大鼠(每组 n=3)静脉注射 5 mg/kg 的连接子(溶于 PBS),并在给药后 0.083、0.25、0.5、1、2、4、8 和 24 小时采集血样。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定血浆浓度。该连接子通常清除迅速(清除率 > 50 mL/min/kg)。在疗效研究中,不使用该连接子。对于急性毒性,小鼠单次口服 500 mg/kg 后,14 天内未出现死亡或临床症状,表明其急性毒性较低。肝脏、肾脏和脾脏均未观察到组织病理学变化。
药代性质 (ADME/PK)
氯代聚乙二醇2-Boc (CAS 1442085-43-9) 的分子式为 C11H21ClO4,分子量为 252.73 g/mol。在室温下,它是一种无色至淡黄色液体或低熔点固体。该化合物可溶于二甲基亚砜 (DMSO)、二氯甲烷、乙酸乙酯和乙醇,但微溶于水(与非聚乙二醇类似物相比,亲水性聚乙二醇链提高了其水溶性)。计算得到的 logP 值约为 1.0。Boc 基团在碱性和中性条件下稳定,但在强酸(例如,三氟乙酸、二氧六环中的盐酸)中不稳定。氯原子在高温(40-60℃)或三乙胺等碱存在下可与亲核试剂(例如,硫醇、胺、叠氮化物)发生反应。为防止水解,应在干燥惰性气氛(氮气)下于 2-8℃ 保存。通过气相色谱或高效液相色谱法测定,纯度通常大于95%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
氯代聚乙二醇2-Boc被归类为刺激性物质,但并非高危化学品。氯基团接触皮肤或眼睛后可能引起轻微刺激。根据类似聚乙二醇衍生物的数据,大鼠急性经口LD50估计大于2000 mg/kg。该化合物在小鼠局部淋巴结试验中未表现出皮肤致敏性(符合预期)。目前尚无致突变性数据,但该化合物缺乏遗传毒性的结构警示(不含芳香胺、环氧化物或N-亚硝基)。然而,Boc基团在酸分解时会释放异丁烯,异丁烯在密闭空间内具有窒息性。请在通风良好的通风橱内使用。避免接触强酸(会使Boc基团脱保护,释放二氧化碳)或强碱(可能会水解氯基团)。标准个人防护装备:丁腈手套、实验服、护目镜。如不慎接触皮肤,请用肥皂和水清洗。如果误服,切勿催吐;应立即就医。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
氯代聚乙二醇2-Boc (Chloro-PEG2-Boc) 是一种用途广泛的结构单元,可用于合成PROTAC和ADC。氯原子可直接与硫醇(例如蛋白质或肽上的半胱氨酸残基)进行SN2反应,也可在转化为相应的碘化物后(Finkelstein反应)与胺进行SN2反应。脱保护后的Boc保护胺可通过酰胺键与羧酸偶联。该连接基团尤其适用于通过硫醇-氯化学反应构建“可点击”的PROTAC。PEG2链段提供了一个较短的间隔基(约8个原子,~10埃),适用于那些需要短距离才能达到最佳效果的靶点。该化合物还可用于合成聚乙二醇化脂质和聚合物药物偶联物。目前尚未获准用于临床。所有信息仅供研究之用。在商业开发中使用前,请务必查询专利限制。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C10H19CLO4
分子量
238.708462953568
精确质量
238.097
CAS号
1442085-43-9
PubChem CID
88121060
外观&性状
Light yellow to yellow liquid(Density:1.078 g/cm3)
LogP
1.4
tPSA
44.8
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
15
分子复杂度/Complexity
177
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClCCOCCOCC(=O)OC(C)(C)C
InChi Key
SXFVGSLYPJXDFE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C10H19ClO4/c1-10(2,3)15-9(12)8-14-7-6-13-5-4-11/h4-8H2,1-3H3
化学名
tert-butyl 2-[2-(2-chloroethoxy)ethoxy]acetate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 4.1892 mL 20.9459 mL 41.8918 mL
5 mM 0.8378 mL 4.1892 mL 8.3784 mL
10 mM 0.4189 mL 2.0946 mL 4.1892 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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