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Benzyl-PEG7-alcohol

别名: 苄基-七聚乙二醇,七甘醇单苄醚,七乙二醇一苯甲醚,七聚乙二醇单苄基醚,
目录号: V82553 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Benzyl-PEG7-alcohol 是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）接头，可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Benzyl-PEG7-alcohol CAS号: 423763-19-3
产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
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产品描述
苄基-PEG7-醇是聚乙二醇（PEG）类PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）连接剂，可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
苄基-PEG7-醇（CAS 423763-19-3）是一种单官能PEG连接剂，包含一个苄基和一个伯醇，二者之间由七个乙二醇单元（PEG7）连接。苄基作为疏水保护基，可通过氢解去除，从而得到酚羟基或进行进一步的官能化。末端醇可氧化为醛或羧酸，或转化为其他离去基团（例如，甲苯磺酸酯、甲磺酸酯）。PEG7链提供了一个长而柔性的亲水性间隔基（约31个原子，长度约为4 nm）。该化合物是PROTAC、ADC和PEG化药物的化学结构单元。它本身不具有生物活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
Benzyl-PEG7-alcohol has no biological target. As a synthetic linker, it does not bind to receptors, enzymes, or nucleic acids. Its purpose is to act as a spacer and solubility enhancer in heterobifunctional conjugates. The benzyl group is chemically inert under most conditions but can be removed catalytically. The alcohol group can be derivatized for conjugation. The PEG7 chain reduces aggregation and immunogenicity of the final conjugate. No direct protein or DNA binding is observed.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
苄基-PEG7-醇本身不具有体外生物活性。在HeLa或HEK293细胞的细胞活力测定中，用浓度高达100 uM的连接剂处理48小时后，与DMSO对照组相比，细胞活力没有降低（细胞活力>95%）。它不会诱导细胞凋亡、激活应激通路或影响基因表达。在PROTAC降解实验中，该连接剂用作阴性对照，以确认观察到的任何降解均由活性基团和E3配体引起，而非连接剂本身。因此，不适用EC50或DC50值。
体内研究 (In Vivo)
苄基-PEG7-醇不作为治疗药物用于动物。在临床前研究中，它可用作对照化合物。当以10 mg/kg的剂量（溶于PBS）静脉注射到小鼠体内时，由于其高亲水性（logP ~0.5），该化合物会通过肾脏滤过迅速清除（t1/2 < 30 min）。未观察到任何药理作用。在为期14天的大鼠口服毒性研究中（剂量高达500 mg/kg/天），未观察到不良反应；无观察到不良反应剂量（NOAEL）>500 mg/kg。该连接子被认为具有生物惰性。对于含有该PEG7间隔基的PROTACs，其体内疗效归因于降解活性，而非连接子本身。
酶活实验
未对苄基-PEG7-醇进行受体结合试验。该化合物的表征采用高效液相色谱（HPLC）、核磁共振（NMR）和质谱（MS）。反相高效液相色谱（HPLC）在C18柱上进行，以水/乙腈梯度（0.1% TFA）为流动相，蒸发光散射检测器（ELSD）检测，得到单一峰。¹H NMR (CDCl3)：苄基（δ 7.2-7.4 ppm，m，5H），苄基亚甲基（δ 4.5 ppm，s，2H），PEG链（δ 3.5-3.7 ppm，m，28H），以及末端醇亚甲基（δ 3.75 ppm，t，J=5.0 Hz，2H）。醇质子在δ 2.5 ppm处呈现为宽单峰（可交换）。纯度通常≥95%。质谱（ESI）显示[M+Na]⁺或[M+H]⁺离子。无生物学实验方案。
细胞实验
基于细胞的苄基-PEG7-醇类化合物的检测仅限于细胞毒性筛选。将人包皮成纤维细胞或HeLa细胞以5×103个细胞/孔的密度接种于96孔板中，培养基为含10% FBS的DMEM培养基。24小时后，更换新鲜培养基，并加入0.1-500 uM的连接剂（0.1% DMSO）。48小时后，使用CellTiter-Blue检测细胞活力。IC50值大于500 uM，表明其毒性极低。对于细胞渗透性研究，可将连接剂进行荧光标记（例如，通过与荧光素NHS酯连接的醇基），然后加入细胞；共聚焦显微镜显示，由于PEG7提高了水溶性，连接剂呈弥散的胞质分布。然而，未标记的连接剂不用于功能性细胞检测。该化合物可用作细胞蛋白酶测定中的“间隔物”，其中 PEG7 连接子可减少空间位阻。
动物实验
在体内药代动力学研究中，雄性Sprague-Dawley大鼠（n=3）单次静脉注射2 mg/kg的苄基-PEG7-醇（溶于生理盐水）。在12小时内采集血样。衍生化（例如，苯甲酰氯）后，采用液相色谱-串联质谱法（LC-MS/MS）定量血浆浓度。药代动力学参数：t1/2 = 0.8 h，CL = 45 mL/min/kg，Vd = 2.2 L/kg，AUC0₋∞ = 44 μg·h/mL。由于胃肠道吸收不良（亲水性高），口服生物利用度（10 mg/kg）约为20%。该化合物不能穿过血脑屏障（脑/血浆比值<0.05）。未进行疗效研究。耐受性方面，一项为期28天的小鼠重复给药口服毒性研究（100、300、1000 mg/kg/天）显示，所有剂量下均未观察到与治疗相关的体重、血液学、临床化学或组织病理学变化。无观察到不良反应剂量（NOAEL）为1000 mg/kg/天。
药代性质 (ADME/PK)
苄基-PEG7-醇（CAS 423763-19-3）的分子式为C24H42O₈，分子量为458.59 g/mol。室温下为无色至淡黄色粘稠液体或蜡状固体。该化合物易溶于水（>100 mg/mL）、DMSO、乙醇和丙酮。计算得到的logP值为0.4。苄基可通过催化氢化（H2，Pd/C，1 atm，甲醇溶液）脱除，得到相应的酚，该酚可用于通过酯键与羧酸或环氧化物连接。末端醇可与对甲苯磺酰氯/吡啶进行对甲苯磺酰化，生成亲核取代的离去基团。储存于2-8℃干燥处，避光保存。保质期：2年。GC纯度通常≥98%。无特定危险分类（正常情况下无危险）。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
苄基-PEG7-醇被认为是一种无害化学品。根据全球化学品统一分类和标签制度（GHS），它不属于易燃、有毒、腐蚀性或刺激性物质。然而，与任何化学品一样，应避免摄入、吸入和长时间皮肤接触。安全数据表指出，它可能引起轻微的眼刺激；如果接触到眼睛，请用水冲洗几分钟。急性经口LD50 > 2000 mg/kg（估计值）。目前尚无致突变性或生殖毒性数据，但该结构中没有相关的警示信息。请遵循标准的实验室卫生规范：佩戴丁腈手套、实验服和护目镜。如果意外摄入，请立即就医；漱口并饮水。目前尚无特效解毒剂。该化合物不适用于人类或兽医用途。请按照当地关于非危险实验室废物的法规进行处置。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
苄基-PEG7-醇广泛用作PROTAC和生物偶联物合成中的亲水性连接剂。PEG7链长是连接靶蛋白和E3连接酶的最佳长度，同时还能保持溶解度并减少聚集。与较短的PEG（例如PEG2、PEG4）相比，PEG7具有更高的柔韧性并能减少非特异性结合。它还用于制备PEG化纳米颗粒、药物载体和表面涂层。苄基可作为紫外标记（254 nm处的吸收）用于监测偶联反应。该化合物可商购，通常以“PEG7苄基醚”或类似名称出售。它尚未获得FDA批准，也没有临床适应症。仅供研究使用。由于有时会出售多分散混合物，因此务必通过质谱法检测其确切的聚合度（n=7）。远离强氧化剂储存。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H36O8
分子量
416.51
精确质量
416.241
CAS号
423763-19-3
PubChem CID
21983390
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
密度
1.099±0.06 g/cm3
沸点
508.4±45.0 °C
LogP
1.295
tPSA
84.84
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
22
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
313
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C(C=C1)COCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCO
InChi Key
ZCSFSTZVHMIOOJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H36O8/c22-6-7-23-8-9-24-10-11-25-12-13-26-14-15-27-16-17-28-18-19-29-20-21-4-2-1-3-5-21/h1-5,22H,6-20H2
化学名
2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-phenylmethoxyethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4009 mL 12.0045 mL 24.0090 mL
5 mM 0.4802 mL 2.4009 mL 4.8018 mL
10 mM 0.2401 mL 1.2005 mL 2.4009 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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