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Bis-PEG6-t-butyl ester

别名: 丙酸叔丁酯-五甘醇-丙酸叔丁酯,4,7,10,13,16-五氧杂十九烷二酸叔丁酯,
目录号: V82597 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Bis-PEG6-t-丁基酯是聚乙二醇 (PEG) 类别的 PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）接头，可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
Bis-PEG6-t-butyl ester CAS号: 439114-12-2
产品类别: Ligands for E3 Ligase
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
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产品描述
双-PEG6-叔丁酯是一种聚乙二醇（PEG）类的PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）连接剂，可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
双-PEG6-叔丁酯是一种对称的聚乙二醇（PEG）基PROTAC连接剂，由两个叔丁酯保护的羧酸基团通过一个6单元的PEG间隔基（PEG6）连接而成。这种同双功能连接剂用于PROTAC分子的合成，其中叔丁酯基团作为保护基，可在酸性条件下（例如用三氟乙酸TFA）脱除，从而暴露羧酸基团，以便与含胺配体偶联。PEG6间隔基赋予连接剂亲水性、柔性和较小的空间位阻，有利于形成高效的三元配合物。该化合物也称为二叔丁基3,3′-((氧双(乙烷-2,1-二基))双(氧))二丙酸酯（PEG6）。其分子式为C22H42O9，分子量为450.57。该产品纯度≥95%，室温下呈固体状。应密封保存于-20℃，并避免受潮。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
PROTAC Linkers.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
作为连接分子，双-PEG6-叔丁酯本身不具有生物活性；它作为结构连接体，用于连接两个配体（例如，两个靶蛋白配体或两个E3连接酶配体），从而合成PROTAC分子或其他生物偶联物。叔丁酯基团是酸不稳定的保护基团，可在酸性条件下（例如，用三氟乙酸TFA）脱除，从而释放出羧酸。这些游离的羧酸随后可被EDC和NHS活化，与含伯胺的配体形成酰胺键。PEG6间隔基赋予了化合物柔韧性和水溶性，有利于形成靶向蛋白降解所需的三元复合物。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道该连接子本身具有特定的体内活性；其活性来源于与适当配体偶联后的最终PROTAC分子。完整的PROTAC的体内疗效需在动物模型中进行测定。
酶活实验
不适用；该化合物未在分离酶/受体结合试验中进行评估。作为合成中间体，其质量通常通过高效液相色谱 (HPLC) 和核磁共振 (NMR) 等分析方法进行确认，标准纯度≥95%。叔丁酯保护基可通过核磁共振波谱进行表征（1.4-1.5 ppm 附近出现单峰）。PEG6 间隔基可通过质谱进行确认。
细胞实验
不适用；该连接子未单独进行细胞实验测试。它用作构建PROTAC的结构单元。典型的两步合成中，首先使用三氟乙酸(TFA)去除叔丁酯基团，生成二羧酸。然后用乙二胺四乙酸(EDC)和氨基磺酸(NHS)活化游离的羧酸，并与含伯胺的配体（例如，靶蛋白配体或E3连接酶配体）反应形成酰胺键。所得缀合物随后在细胞中测试其生物活性。对于PROTAC应用，将测试该缀合物对靶标的降解能力。
动物实验
不适用；未对单独的连接子进行动物研究。对于完整的PROTAC偶联物，体内研究将按照机构指南进行。该化合物通常使用含有DMSO、PEG300、Tween-80和生理盐水的载体配制，并通过腹腔注射(IP)或静脉注射(IV)给药。PEG6间隔基可通过提高水溶性和减少聚集来改善偶联物的药代动力学性质。
药代性质 (ADME/PK)
该化合物的分子量为450.57，分子式为C22H42O9，标准纯度≥95%。其IUPAC名称为二叔丁基3,3′-((氧双(乙烷-2,1-二基))双(氧))二丙酸酯(PEG6)。室温下为固体。储存时，应密封于-20℃，并避光保存，最长可达3年。该化合物可溶于DMSO和其他有机溶剂。叔丁酯基团在中性和碱性条件下稳定，但对酸不稳定，因此应避免接触强酸。CAS号：439114-12-2。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本产品仅供研究使用，不得用于人类或兽医用途。操作过程中应遵守标准化学品安全预防措施。仅供研究和进一步生产使用，不得直接用于人体。该化合物并非已获批准的药物，也未获准用于临床。
参考文献
[1]. An S, et al. Small-molecule PROTACs: An emerging and promising approach for the development of targeted therapy drugs. EBioMedicine. 2018 Oct;36:553-562
其他信息
双-PEG6-叔丁酯的同双功能特性使其能够合成对称的PROTAC分子（两端均与同一种配体偶联，例如同二聚体PROTAC），或者在依次脱保护和活化后，以逐步的方式偶联两种不同的配体。与PEG3或PEG4相比，PEG6间隔基提供了一个更长、更柔性的亲水性连接基团，这可能更适合需要更大结合位点间距的靶标-E3连接酶对。该化合物是PROTAC开发和生物偶联化学的重要结构单元。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H42O9
分子量
450.56
精确质量
450.283
CAS号
439114-12-2
PubChem CID
18374579
外观&性状
Colorless to light yellow liquid（Density：1.046±0.06 g/cm3）
LogP
2.533
tPSA
98.75
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
22
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
425
定义原子立体中心数目
0
SMILES
CC(C)(C)OC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCC(=O)OC(C)(C)C
InChi Key
RYJCLSVRARTBFI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H42O9/c1-21(2,3)30-19(23)7-9-25-11-13-27-15-17-29-18-16-28-14-12-26-10-8-20(24)31-22(4,5)6/h7-18H2,1-6H3
化学名
tert-butyl 3-[2-[2-[2-[2-[3-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-3-oxopropoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2195 mL 11.0973 mL 22.1946 mL
5 mM 0.4439 mL 2.2195 mL 4.4389 mL
10 mM 0.2219 mL 1.1097 mL 2.2195 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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