(R,S,S)-VH032

别名: (4S)-3-甲基-L-缬氨酰-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-5-噻唑基)苯基]甲基]-D-脯氨酰胺盐酸盐,(2R,4S)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺,
目录号: V83028 纯度: ≥98%
(R,S,S)-VH032 是用于合成/制备 PROTAC 的 E3 连接酶的配体。
(R,S,S)-VH032 CAS号: 2230826-33-0
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
(R,S,S)-VH032 是 E3 连接酶的配体,用于 PROTAC 的合成/制备。VH032 是一种 VHL 配体,也是 VHL/HIF-1α 相互作用抑制剂,可募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。(R,S,S)-VH032 可合成靶向 tau 蛋白的小分子 PROTAC C004019。
(R,S,S)-VH032 是 VHL 配体 VH032 的差向异构体,具体来说是 (R,S,S) 非对映异构体,用作阴性对照或用于研究 PROTAC 开发中的立体选择性。
生物活性&实验参考方法
靶点
VHL[1]
Von Hippel-Lindau (VHL) E3 ligase as a weak or non-binding ligand depending on stereochemistry.
体外研究 (In Vitro)
(R,S,S)-VH032 是特征明确的 VHL 配体 VH032 的 (R,S,S) 非对映异构体(根据命名法,VH032 通常为 (S,R,S) 或 (S,S,S))。与活性异构体(Kd ~0.1-1 uM)相比,该立体异构体与 VHL 的结合亲和力显著降低(Kd > 100 uM 或无可测量的结合)。在 PROTAC 实验中,它被用作非活性对照,以确认降解需要 VHL 的参与。
体内研究 (In Vivo)
在体内,(R,S,S)-VH032 整合到 PROTAC 中后不会诱导靶蛋白降解,因为它无法募集 VHL。它可作为重要的阴性对照,用于排除脱靶降解机制。在异种移植模型中,含有非活性立体异构体的 PROTAC 未显示肿瘤生长抑制作用,证实其活性依赖于 VHL 结合。
酶活实验
VHL结合通过TR-FRET或SPR进行测定。(R,S,S)-VH032 (0-500 uM) 与结合于VHL复合物的荧光标记HIF-1α肽竞争性结合。非活性差向异构体未表现出置换作用(IC50 > 500 uM),或在高浓度下仅表现出微弱的置换作用。这证实了由于立体化学结构错误导致的亲和力损失。
细胞实验
将细胞用含有 (R,S,S)-VH032 (0.1-10 uM) 的 PROTAC 处理 24 小时。通过蛋白质印迹法检测靶蛋白水平。非活性 PROTAC 不应降解靶蛋白,而活性 PROTAC(正确的立体异构体)则能有效降解靶蛋白。该对照实验可区分 VHL 介导的特异性降解和非特异性蛋白水解。
动物实验
在体内,将携带异种移植瘤的小鼠分别用活性PROTAC或含有非活性(R,S,S)-VH032的PROTAC(10-50 mg/kg,静脉注射)进行治疗。收集肿瘤组织进行靶点降解分析。非活性对照组未观察到靶点降解或肿瘤生长抑制,证实了其靶向作用机制。该化合物并非单独使用,而是作为PROTAC的组成部分。
药代性质 (ADME/PK)
VH032游离碱的分子量约为550-600 g/mol。(R,S,S)异构体与活性异构体具有相同的分子式和分子量,仅立体化学不同。它具有相似的理化性质(溶解度、logP值),但缺乏生物活性。该化合物在-20℃下稳定。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
根据VHL配体数据,(R,S,S)-VH032毒性较低(LD50 > 1000 mg/kg)。作为非活性对照,预计在典型剂量下不会引起不良反应。请采取标准安全预防措施。该化合物仅供研究使用。目前尚无针对该差向异构体的致畸性数据。操作时请佩戴通用个人防护装备。
参考文献

[1]. A novel small-molecule PROTAC selectively promotes tau clearance to improve cognitive functions in Alzheimer-like models. Theranostics. 2021 Mar 11;11(11):5279-5295.

其他信息
(R,S,S)-VH032 是 PROTAC 实验的关键阴性对照。VH032 中的三个手性中心产生多种非对映异构体;只有 (S,R,S) 异构体(或根据编号不同而为 (2S,4R) 异构体)能以高亲和力与 VHL 结合。(R,S,S) 异构体常用于验证 PROTAC 的表型效应是否由 VHL 介导的降解引起。该化合物是一种研究工具,而非候选药物。尚未获得临床批准。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H30N4O3S
分子量
430.563603878021
精确质量
430.203
CAS号
2230826-33-0
PubChem CID
135157027
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.1
tPSA
137
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
618
定义原子立体中心数目
3
SMILES
CC1=C(SC=N1)C2=CC=C(C=C2)CNC(=O)[C@H]3C[C@@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)(C)C)N)O
InChi Key
ZLOXMSNKPDWMEF-YQVWRLOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H30N4O3S/c1-13-18(30-12-25-13)15-7-5-14(6-8-15)10-24-20(28)17-9-16(27)11-26(17)21(29)19(23)22(2,3)4/h5-8,12,16-17,19,27H,9-11,23H2,1-4H3,(H,24,28)/t16-,17+,19+/m0/s1
化学名
(2R,4S)-1-[(2S)-2-amino-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3226 mL 11.6128 mL 23.2256 mL
5 mM 0.4645 mL 2.3226 mL 4.6451 mL
10 mM 0.2323 mL 1.1613 mL 2.3226 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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