Boc-NH-PEG7-acetic acid

别名: 叔丁氧羰基七聚乙二醇乙酸;叔丁氧羰基-PEG7-乙酸;甲基-PEG18-羧酸;氨基叔丁酯-七聚乙二醇-乙酸
目录号: V83031 纯度: ≥98%
Boc-NH-PEG7-乙酸是一种PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,属于聚乙二醇(PEG)类别,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
Boc-NH-PEG7-acetic acid CAS号: 141282-29-3
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
Boc-NH-PEG7-乙酸是一种PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接剂,属于聚乙二醇(PEG)类,可用于制备PROTAC蛋白降解剂。
Boc-NH-PEG7-乙酸是一种基于聚乙二醇(PEG)的PROTAC连接子,其结构包含一个叔丁氧羰基(Boc)保护的胺基和一个末端羧酸。该连接子由七个乙二醇单元组成,可作为亲水性柔性间隔基,用于在PROTAC合成中将E3泛素连接酶配体与靶蛋白配体偶联。Boc基团在合成过程中提供稳定性,并可在酸性条件下去除。该化合物的分子量为483.55 g/mol,分子式为C21H41NO11。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
Boc-NH-PEG7-acetic acid targets the chemical conjugation process rather than biological receptors. As a bifunctional linker, its target is the formation of stable amide bonds between the carboxylic acid group and amine-containing protein-targeting ligands, and between the deprotected amine and E3 ligase ligands bearing carboxyl groups. In PROTAC applications, the assembled molecule targets specific disease-related proteins for ubiquitination and degradation via the proteasome pathway.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
Boc-NH-PEG7-乙酸本身并不具有直接的生物活性,因为它是一种合成结构单元。其体外应用价值是通过使用该连接子组装的PROTAC分子间接体现的。例如,与较短的PEG连接子相比,含有该PEG7连接子的PROTAC分子由于其更高的柔性和更小的空间位阻,表现出更高的溶解度和对靶蛋白(如BRD4)的降解效率。
体内研究 (In Vivo)
通过构建以Boc-NH-PEG7-乙酸为连接子的PROTAC,评估了该连接子的体内活性。基于PEG7的PROTAC通常表现出更优的药代动力学特性,包括延长血浆半衰期和降低免疫原性,这归因于PEG间隔基的亲水性和非免疫原性。在啮齿动物异种移植模型中,使用该连接子的PROTAC已证实可通过靶向蛋白降解有效抑制肿瘤生长。
酶活实验
典型的偶联反应包括在室温下,使用EDC(1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺)和NHS(N-羟基琥珀酰亚胺)在无水DMF或DMSO中反应2小时,活化末端羧酸。然后,将活化的NHS酯与含胺基的蛋白质靶向配体(摩尔比1:1)在DIPEA存在下于室温反应过夜。最后,用TFA/DCM(1:1)溶液反应1小时,除去Boc基团。
细胞实验
细胞实验并非直接在 Boc-NH-PEG7-乙酸上进行。而是用该连接子组装的最终 PROTAC 构建体(0.1-10 uM,24-48 小时)处理细胞(例如 HEK293T 或 HeLa 细胞)。处理后,裂解细胞,并使用特异性抗体通过蛋白质印迹法分析靶蛋白水平。GAPDH 或 β-肌动蛋白用作上样对照。计算降解效率 (DC50) 和最大降解率 (Dmax)。
动物实验
体内实验采用以PEG7连接子合成的PROTAC分子。在小鼠异种移植模型(例如,BRD4依赖性癌症模型)中,PROTAC以10-50 mg/kg的剂量,通过腹腔注射或口服途径给药,通常每日一次或隔日一次,持续14-21天。每2-3天使用游标卡尺测量肿瘤体积。研究结束时,收集肿瘤组织,并通过Western blot和免疫组织化学分析靶蛋白的降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
作为PROTAC连接剂而非治疗剂,Boc-NH-PEG7-乙酸本身缺乏吸收-分布-代谢-排泄(ADME)特性。然而,PEG7连接剂显著影响最终PROTAC的药代动力学。PEG化可降低血浆蛋白结合率,减少肾清除率,并延长半衰期。含PEG7的PROTAC通常具有中等的口服生物利用度(啮齿动物为20-40%)和2-6小时的血浆半衰期。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Boc-NH-PEG7-乙酸被归类为实验室试剂,在采取标准防护措施的情况下,其毒性极低。该化合物不可用于人类食用。预计其急性经口毒性较低(啮齿动物LD50 > 2000 mg/kg)。潜在危害包括轻微的皮肤和眼睛刺激。Boc保护基团在生理条件下稳定,但在强酸处理下会释放CO2和异丁烯。请遵循标准安全操作规程(佩戴手套、实验服和护目镜)。
参考文献

[1]. PROTACs: An Emerging Therapeutic Modality in Precision Medicine. Cell Chem Biol. 2020;27(8):998-985.

其他信息
Boc-NH-PEG7-乙酸(CAS:141282-29-3)是一种研究级PROTAC连接剂,纯度≥98%。它是一种异双功能PEG连接剂,广泛应用于化学生物学和药物研发领域。该化合物通常以固体形式储存于-20℃,并需防潮。它可溶于DMSO、DMF和二氯甲烷,但由于Boc基团的存在,其水溶性有限。其较长的PEG链长(7个单元)赋予了它优异的溶解性和柔韧性,使其适用于PROTAC应用。该化合物并非已获批准的药物,仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H41NO11
分子量
483.550348043442
精确质量
483.267
CAS号
141282-29-3
PubChem CID
53983441
外观&性状
Colorless to light yellow liquid
LogP
-0.5
tPSA
140
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
25
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
472
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(OC(C)(C)C)(=O)NCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCC(O)=O
InChi Key
JZVPPASVRSYVSR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H41NO11/c1-21(2,3)33-20(25)22-4-5-26-6-7-27-8-9-28-10-11-29-12-13-30-14-15-31-16-17-32-18-19(23)24/h4-18H2,1-3H3,(H,22,25)(H,23,24)
化学名
2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]acetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0680 mL 10.3402 mL 20.6804 mL
5 mM 0.4136 mL 2.0680 mL 4.1361 mL
10 mM 0.2068 mL 1.0340 mL 2.0680 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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