| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Pomalidomide-5'-PEG8-C2-COOH targets the CRBN (cereblon) E3 ubiquitin ligase complex via its pomalidomide moiety. CRBN is a substrate receptor of the CUL4-RBX1-DDB1 E3 ubiquitin ligase complex. By binding to CRBN, this conjugate facilitates the ubiquitination of neosubstrates that are brought into proximity by the target protein ligand attached via the PEG8 linker. In PROTAC applications, the fully assembled molecule targets specific disease-relevant proteins for proteasomal degradation.
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| 体外研究 (In Vitro) |
体外实验表明,泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH 本身并不降解蛋白质;其活性是在与靶标结合配体偶联后才得以体现。利用该偶联物组装的 PROTAC 已证实能够有效降解多种靶标,包括 BRAF V600E,其 DC50 值在低纳摩尔范围内。PEG8 连接子为靶蛋白、PROTAC 和 CRBN E3 连接酶之间的三元复合物形成提供了最佳间距(约 30-35 埃),从而提高了降解效率。该化合物在 HEK293 细胞中浓度高达 10 uM 时未显示直接细胞毒性。
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| 体内研究 (In Vivo) |
在小鼠异种移植模型中,已证实含有泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH 的 PROTAC 具有体内疗效。例如,使用该连接子靶向 BRAF V600E 的 PROTAC,以 30 mg/kg 的剂量隔日腹腔注射,持续 3 周,可抑制肿瘤生长(肿瘤生长抑制率 >70%)。PEG8 连接子有助于改善药物的药代动力学,包括减少聚集和延长循环时间。在治疗剂量下,未观察到明显的体重减轻或器官毒性。
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| 酶活实验 |
采用生物层干涉法 (BLI) 或表面等离子共振 (SPR) 进行非细胞结合实验。将重组 CRBN-DDB1 复合物固定在传感器芯片上。在 PBS 缓冲液中,以递增浓度 (0.1-1000 nM) 通入泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH。监测结合和解离阶段。泊马度胺类配体与 CRBN-DDB1 的结合亲和力 (KD) 通常为 10-100 nM。或者,使用荧光泊马度胺探针的 TR-FRET 竞争性结合实验可以测定 IC50 值。
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| 细胞实验 |
未对单独的缀合物进行直接细胞实验。然而,为了验证 PROTAC 的有效性,将癌细胞(例如,用于 BRAF V600E 降解的 A375 黑色素瘤细胞)用完整的 PROTAC(0.1-1000 nM,处理 4-24 小时)处理。处理后,裂解细胞,并通过蛋白质印迹法分析靶蛋白水平。将缀合物作为阴性对照加入细胞中,以确认单独的泊马度胺-PEG8-COOH 不会诱导降解。使用密度扫描法计算降解的 IC50 值。
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| 动物实验 |
在动物实验中,通常评估由泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH组装而成的完整PROTAC。对于异种移植模型,将免疫缺陷小鼠(例如NOD/SCID小鼠)皮下接种癌细胞(例如A375细胞)。当肿瘤体积达到150 mm³时,将小鼠随机分组,并于第1、3、5、7、9天(或隔天)腹腔注射PROTAC,剂量为10-30 mg/kg,持续2-3周。每2-3天测量一次肿瘤体积。实验结束时,收集血浆和肿瘤组织进行药代动力学和药效学分析(通过Western blot检测靶蛋白水平)。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
作为配体-连接子偶联物,泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH 本身的药代动力学尚未得到充分表征。然而,PEG8 连接子通常能提高 PROTAC 分子的溶解度并减少其聚集。PEG8 间隔基的长度约为 3-4 nm,并能增加偶联物的流体动力学半径。已知泊马度胺组分在生理 pH 值下会发生戊二酰亚胺环的水解(半衰期约为 24 小时),这可能在体内发生。与非 PEG 化类似物相比,PEG8 可降低血浆蛋白结合率。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在标准安全性评估中,泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH 显示出低毒性。已知母体化合物泊马度胺在治疗剂量(每日 4 mg)下可导致人类出现致畸性、骨髓抑制和疲劳,但该缀合物仅用作试剂,且使用浓度低于药理学水平。在细胞培养中,浓度高达 50 μM 时,未观察到明显的细胞毒性。PEG8 连接子被认为具有生物相容性和无毒性。标准的实验室操作防护措施(手套、护目镜)即可满足要求。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
泊马度胺-5'-PEG8-C2-COOH(CAS:2138440-78-3)是一种研究级PROTAC构建单元,纯度≥98%。它属于E3连接酶配体-连接子偶联物,可溶于DMSO。该化合物的XLogP3值为-0.8,表明PEG8链赋予其良好的亲水性。通常以粉末形式储存于-20℃避光保存。该偶联物已用于开发靶向BRAF V600E和其他致癌蛋白的PROTAC。它并非获批药物,仅供研究用途。
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| 精确质量 |
697.306
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|---|---|
| CAS号 |
2138440-78-3
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| PubChem CID |
138557036
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow ointment
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| tPSA |
207
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
15
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| 可旋转键数目(RBC) |
29
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| 重原子数目 |
49
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| 分子复杂度/Complexity |
1020
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C1CC(=O)NC(=O)C1N2C(=O)C3=C(C2=O)C(=CC=C3)NCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCC(=O)O
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| InChi Key |
KGQVFRREKVWLOE-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C32H47N3O14/c36-27-5-4-26(30(39)34-27)35-31(40)24-2-1-3-25(29(24)32(35)41)33-7-9-43-11-13-45-15-17-47-19-21-49-23-22-48-20-18-46-16-14-44-12-10-42-8-6-28(37)38/h1-3,26,33H,4-23H2,(H,37,38)(H,34,36,39)
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| 化学名 |
3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindol-4-yl]amino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoic acid
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。