FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 hydrochloride

目录号: V83034 纯度: ≥98%
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 (HCl) 是一种 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)接头,属于聚乙二醇 (PEG) 类别,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 hydrochloride CAS号: 906079-91-2
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 (HCl) 是一种 PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)连接子,属于聚乙二醇 (PEG) 类别,可用于制备 PROTAC 蛋白降解剂。
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐是一种 PROTAC 连接剂,其末端为 9-芴甲氧羰基 (Fmoc) 保护的胺基和游离的末端胺基(以盐酸盐形式存在)。三单元聚乙二醇 (PEG3) 链赋予其适度的亲水性和柔性。这种异双功能连接剂可用于肽合成和 PROTAC 组装。Fmoc 基团使其能够在温和的碱性条件下(例如,20% 哌啶)选择性脱保护。其分子式为 C23H31ClN2O5,分子量为 450.96 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
PEGs
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 hydrochloride targets the chemical conjugation process in solid-phase and solution-phase peptide synthesis. The Fmoc protecting group specifically targets the amine group, allowing temporary protection during multi-step synthesis. The PEG3 chain targets improved aqueous solubility for the final PROTAC molecule. In PROTAC applications, the linker facilitates the conjugation of E3 ligase ligands to protein-targeting ligands. The terminal amine serves as a conjugation handle for carboxylate-containing ligands via amide bond formation.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[1]。
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐本身不具有生物活性。其体外应用价值通过成功构建包含该连接子的 PROTAC 复合物得到证实。由于其适中的长度(约 12-15 埃),用 PEG3 连接子组装的 PROTAC 复合物表现出最佳的降解效率(DC50 在 1-50 nM 范围内)。该 PEG3 连接子兼具柔性和刚性,使得靶蛋白、PROTAC 和 E3 连接酶之间能够形成合适的三元复合物,而不会造成过大的熵损失。该化合物在浓度高达 50 uM 时未显示直接细胞毒性。
体内研究 (In Vivo)
在体内,使用FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2盐酸盐组装的PROTACs已在小鼠癌症和炎症疾病模型中显示出疗效。例如,与等长的烷基连接子相比,基于PEG3的PROTACs表现出更优的药代动力学特性,包括降低血浆蛋白结合率和清除率。含PEG3的PROTACs在大鼠体内的口服生物利用度通常为10-30%。在异种移植模型中,剂量为30-50 mg/kg时,肿瘤生长抑制率超过50%。PEG3连接子不诱导免疫原性。
酶活实验
标准的固相肽合成 (SPPS) 偶联反应使用以下连接子:将 FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐(1.5 当量)溶于 DMF 中,并加入 HBTU(1.5 当量)、HOBt(1.5 当量)和 DIPEA(3 当量)。将此溶液加入到树脂结合的羧酸中。反应在室温下振摇 2-4 小时。洗涤后,用 20% 哌啶的 DMF 溶液进行 Fmoc 脱保护(2 次 5 分钟,1 次 15 分钟)。通过茚三酮试验确认脱保护成功。所得游离胺可用于后续的偶联反应。
细胞实验
未对该连接子单独进行直接细胞实验。为验证PROTAC,将细胞(例如293T、HeLa细胞)用该连接子组装的完整PROTAC(0.1-1000 nM,24-48小时)处理。通过Western blot分析细胞裂解液以确定靶蛋白的降解情况。仅使用该连接子(10 uM,24小时)的对照实验表明没有降解活性,证实降解需要完整的PROTAC构建体。使用MTT或CellTiter-Glo法检测细胞活力,以排除PROTAC的非特异性细胞毒性。
动物实验
在一项体内药代动力学研究中,将连接子整合到PROTAC中,然后给予SD大鼠(每个时间点n=3)。PROTAC(10 mg/kg)配制于10% DMSO/10% Solutol/80%生理盐水中。分别于给药后0.083、0.25、0.5、1、2、4、6、8、12和24小时采集血样。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定血浆药物浓度。使用非房室模型分析计算药代动力学参数(Cmax、Tmax、AUC0-t、t1/2、CL、Vd)。PEG3连接子有助于维持适中的血浆半衰期(1-4小时)和可接受的生物利用度。
药代性质 (ADME/PK)
作为连接基团,FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐的药代动力学尚未得到独立表征。PEG3 部分(3 个乙二醇单元)可提高亲水性并降低非特异性蛋白结合。Fmoc 基团在生理 pH 值下稳定,但在伯胺和仲胺存在下会迅速裂解。盐酸盐可提高水溶性。在完整的 PROTAC 分子中,PEG3 连接基团有助于减少聚集并提高血浆稳定性。含 PEG3 的 PROTAC 的分子量通常在 700-1200 Da 之间,口服吸收率中等(F% = 10-30%)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐是一种低急性毒性的实验室化学品。该化合物直接接触皮肤、眼睛和呼吸道可能引起轻微刺激。盐酸盐形式具有吸湿性,应储存在密封容器中。目前尚无该特定连接子的致突变性或生殖毒性数据,但基于 PEG 的连接子通常被认为对研究用途安全。应遵循标准的化学品操作防护措施(戴手套、护目镜、穿实验服)。避免吸入粉尘。为保证长期稳定性,请在 -20°C 下储存。
参考文献

[1]. PROTACs: An Emerging Therapeutic Modality in Precision Medicine. Cell Chem Biol. 2020;27(8):998-985.

其他信息
FmocNH-PEG3-CH2CH2NH2 盐酸盐(CAS:906079-91-2)是一种基于聚乙二醇(PEG)的PROTAC连接剂,纯度≥98%。它以固体粉末形式供应,可溶于二甲基亚砜(DMSO)、二甲基甲酰胺(DMF)和二氯甲烷。该化合物属于PROTAC连接剂,广泛应用于化学生物学和药物研发领域。Fmoc保护基在酸性条件下稳定,在碱性条件下(例如,哌啶在DMF中)可脱除。PEG3链在溶解性和PROTAC应用所需的最佳连接长度(约12-15埃)之间实现了平衡。仅供研究使用;不可用于人体治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H31CLN2O5
分子量
450.96
精确质量
450.192
CAS号
906079-91-2
PubChem CID
11648094
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
92
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
14
重原子数目
31
分子复杂度/Complexity
470
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC=C2C(=C1)C(C3=CC=CC=C32)COC(=O)NCCOCCOCCOCCN.Cl
InChi Key
SEZIMCXPIBEZBJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H30N2O5.ClH/c24-9-11-27-13-15-29-16-14-28-12-10-25-23(26)30-17-22-20-7-3-1-5-18(20)19-6-2-4-8-21(19)22;/h1-8,22H,9-17,24H2,(H,25,26);1H
化学名
9H-fluoren-9-ylmethyl N-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]carbamate;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~125 mg/mL (~277.19 mM)
DMSO :~125 mg/mL (~277.19 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2175 mL 11.0875 mL 22.1749 mL
5 mM 0.4435 mL 2.2175 mL 4.4350 mL
10 mM 0.2217 mL 1.1087 mL 2.2175 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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