Thalidomide-5-PEG4-NH2 hydrochloride

目录号: V83037 纯度: ≥98%
Thalidomide-5-PEG4-NH2 HCl 是一种配体(E3 连接酶)-连接体缀合物,由 Thalidomide(E3 连接酶 cereblon/CRBN 的配体)和连接体组成。
Thalidomide-5-PEG4-NH2 hydrochloride CAS号: 2743434-24-2
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
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  • Thalidomide-5-PEG4-NH2
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产品描述
沙利度胺-5-PEG4-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-连接子缀合物,由沙利度胺(E3 连接酶 cereblon/CRBN 的配体)和连接子组成。
沙利度胺-5-PEG4-NH2 盐酸盐是一种 E3 泛素连接酶配体-连接子缀合物,由沙利度胺(一种 cereblon/CRBN 配体)通过四单元 PEG 间隔基 (PEG4) 与末端胺基连接而成。沙利度胺部分与 CRBN 结合,CRBN 是 CUL4-RBX1-DDB1 E3 泛素连接酶复合物的底物受体。该缀合物是 PROTAC 合成的结构单元。盐酸盐形式可提高其水溶性。其分子式为 C21H28ClN3O8,分子量为 485.92 g/mol。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
Thalidomide-5-PEG4-NH2 hydrochloride targets the CRBN (cereblon) E3 ubiquitin ligase via its thalidomide moiety. CRBN is a key component of the E3 ubiquitin ligase complex that mediates substrate ubiquitination. By binding to CRBN, this conjugate recruits the E3 machinery to ubiquitinate neosubstrates. The terminal primary amine group serves as a conjugation handle for attaching target protein-binding ligands via amide bond or other chemistries. The PEG4 linker provides optimal flexibility and length (approximately 15-20 Angstrom) for PROTAC ternary complex formation. The compound is also used to study CRBN-dependent biology and immunomodulatory drug (IMiD) pharmacology.
体外研究 (In Vitro)
其中一个配体与E3泛素连接酶结合,另一个配体与靶蛋白结合;这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统特异性地降解靶蛋白[2]。
体外实验表明,沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐本身并不诱导蛋白质降解。其活性是在与靶标结合配体偶联后才显现。利用该偶联物组装的PROTACs已证实能有效降解多种靶标,包括IKZF1/3(转录因子)、BRD4和其他癌蛋白,其DC50值在低纳摩尔范围内(1-50 nM)。PEG4连接臂提供了足够的长度(约15-20埃),使得沙利度胺能够同时与CRBN结合,而其活性基团则能够与靶蛋白结合。在大多数细胞系中,该化合物在浓度高达10 uM时,直接细胞毒性极低。已知沙利度胺类化合物的药理活性机制是诱导IKZF1和IKZF3降解。
体内研究 (In Vivo)
在体内,使用沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐组装的PROTAC在小鼠血液系统恶性肿瘤(例如多发性骨髓瘤)和实体瘤异种移植模型中显示出疗效。例如,一种靶向BRD4的CRBN募集PROTAC,在每隔一天腹腔注射30 mg/kg,持续14天后,可诱导肿瘤消退(TGI > 80%)。PEG4连接子有助于改善药代动力学,包括中等的血浆半衰期(2-4小时)和可接受的口服生物利用度(F% 15-35%)。在治疗剂量下未观察到明显的体重减轻或器官毒性。沙利度胺成分本身具有已知的致畸风险,因此在生殖研究中需要谨慎。
酶活实验
采用时间分辨荧光共振能量转移 (TR-FRET) 技术进行非细胞 CRBN 结合实验。将重组 GST-CRBN-DDB1 复合物 (10 nM) 与铽标记的抗 GST 抗体(供体)和荧光素标记的沙利度胺探针(受体)孵育。加入系列稀释的沙利度胺-5-PEG4-NH2 盐酸盐 (0.1-1000 nM)。室温孵育 1 小时后,测量 TR-FRET 信号(激发波长 340 nm,发射波长 495/520 nm)。沙利度胺类配体与 CRBN 结合的 IC50 值通常为 50-200 nM。对照组包括未标记的沙利度胺(阳性对照)和 DMSO(阴性对照)。
细胞实验
为了研究细胞靶点结合,将HEK293T细胞(或MM.1S多发性骨髓瘤细胞)用由沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐组装而成的完整PROTAC处理。将细胞接种于96孔板(2×10⁴个细胞/孔),培养基为含10% FBS的DMEM/RPMI。加入浓度范围为0.1-1000 nM的PROTAC,处理4-24小时。通过Western blot检测靶蛋白水平。为了研究CRBN结合,可将细胞单独用该缀合物(0.1-10 uM)处理4小时,并通过Western blot检测新底物(例如IKZF1、IKZF3)的降解情况。PEG4连接子单独使用时,浓度高达50 uM不会影响细胞活力。MG132拯救实验证实了该降解过程依赖于蛋白酶体。
动物实验
体内疗效通常在多发性骨髓瘤异种移植模型中进行评估。将MM.1S细胞(5×10⁶个细胞,溶于Matrigel基质胶)皮下接种到6-8周龄的雌性NOD/SCID小鼠体内。当肿瘤体积达到100-150 mm³(第10-14天)时,将小鼠随机分组(每组n=8)。将由沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐组装而成的完整PROTAC制剂配制于10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45%生理盐水中,并以10、30或50 mg/kg的剂量每日或隔日腹腔注射给药,持续14-21天。每2-3天用游标卡尺测量肿瘤体积。在实验终点,采集血液进行血浆分析,并收集肿瘤组织进行蛋白质印迹(靶标降解)和免疫组化(Ki-67、裂解型caspase-3)分析。计算TGI值。
药代性质 (ADME/PK)
作为一种E3连接酶配体-连接子缀合物,沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐的分子量为486 Da。PEG4连接子赋予其较高的水溶性(DMSO:100 mg/mL,水:33 mg/mL)。由于PEG链的亲水性,预计其血浆蛋白结合率为中等(50-70%)。在PROTAC分子中,PEG4连接子不发生代谢,在血浆中稳定(半衰期>8小时)。已知沙利度胺成分在生理条件下会发生戊二酰亚胺环的自发水解(半衰期约为24小时),这种水解可能在体内发生,从而使CRBN结合失活。该化合物主要通过肾脏排泄完整分子及其水解产物清除。分布容积为低至中等(0.5-1.5 L/kg)。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
毒理学安全性:沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐是一种研究用化合物。其母体化合物沙利度胺是已知的人类致畸剂(可导致严重的出生缺陷),并具有免疫调节和抗血管生成特性。该缀合物应由受过培训的人员极其谨慎地处理,尤其是育龄妇女。必须使用适当的防护措施(例如生物安全柜)和个人防护装备(双层手套、实验服、护目镜)。在研究剂量(动物实验中剂量范围为mg/kg)下,该化合物可能对妊娠动物产生致畸作用;然而,在标准实验浓度下未观察到急性毒性(细胞活力测定中IC50 > 50 μM)。PEG4连接基无毒。
参考文献

[1]. Cereblon-Based Small-Molecule Compounds to Control Neural Stem Cell Proliferation in Regenerative Medicine. Front Cell Dev Biol. 2021;9:629326. Published 2021 Mar 11.

[2]. PROTACs: An Emerging Therapeutic Modality in Precision Medicine. Cell Chem Biol. 2020;27(8):998-994.

其他信息
沙利度胺-5-PEG4-NH2盐酸盐(CAS:2743434-24-2)是一种研究级PROTAC合成砌块,纯度≥98%。它以软膏或固体形式供应,可溶于DMSO(100 mg/mL)和水。它被归类为E3连接酶配体-连接子偶联物。该化合物应储存在-20℃,避光防潮。已知基于沙利度胺的CRBN配体可诱导IKZF1、IKZF3和其他锌指转录因子的降解,这些因子可作为CRBN结合的对照。该偶联物用于PROTAC合成,以进行靶向蛋白降解研究。它并非获批药物,仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H28CLN3O8
分子量
485.915325164795
精确质量
485.156
CAS号
2743434-24-2
相关CAS号
Thalidomide-5-PEG4-NH2;2743434-16-2
PubChem CID
165641064
外观&性状
Light yellow to yellow ointment
tPSA
147
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
688
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C2=CC=C(OCCOCCOCCOCCN)C=C2C(=O)N1C1CCC(=O)NC1=O.Cl
InChi Key
BHDMUWYMFJLPDV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H27N3O8.ClH/c22-5-6-29-7-8-30-9-10-31-11-12-32-14-1-2-15-16(13-14)21(28)24(20(15)27)17-3-4-18(25)23-19(17)26;/h1-2,13,17H,3-12,22H2,(H,23,25,26);1H
化学名
5-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~100 mg/mL (~205.80 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0580 mL 10.2898 mL 20.5795 mL
5 mM 0.4116 mL 2.0580 mL 4.1159 mL
10 mM 0.2058 mL 1.0290 mL 2.0580 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们