| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Cereblon; targeted RNA degrader
Dovitinib-RIBOTAC targets the microRNA precursor pre-miR-21, a short non-coding RNA that regulates genes involved in apoptosis, proliferation, and metastasis. Elevated miR-21 expression is associated with poor prognosis in breast, lung, and other cancers. The compound binds specifically to a structural motif within pre-miR-21 and recruits cellular ribonucleases to cleave and inactivate the target RNA. By degrading pre-miR-21, it reduces mature miR-21 levels, thereby derepressing tumor suppressor genes and inhibiting cancer cell invasion and metastasis. Dovitinib also targets several receptor tyrosine kinases (RTKs) including FGFR, PDGFR, and VEGFR, but its RNA-binding activity is the primary mechanism for miR-21 degradation. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
将已知药物重新编程以针对新的靶点,并使其活性和选择性优于经典靶点,是一项极具挑战性的任务。通过研究RNA折叠与已知小分子药物之间的结合相互作用,并挖掘由此产生的人类RNA数据集,我们发现受体酪氨酸激酶(RTK)抑制剂多维替尼能够结合microRNA-21的前体(pre-miR-21)。我们利用多维替尼作为RNA识别元件,构建了一种嵌合化合物,该化合物还能募集RNase L以诱导pre-miR-21的催化降解,从而对多维替尼进行了针对pre-miR-21的合理重编程。通过增强其固有的RNA靶向活性并降低其对细胞内经典RTK蛋白靶点的效力,该嵌合化合物将对pre-miR-21的选择性提高了2500倍,从而缓解了由miR-21过表达引起的三阴性乳腺癌和Alport综合征小鼠模型的疾病进展。因此,靶向降解可以显著提高选择性,即使在不同的生物分子之间也是如此,例如蛋白质与 RNA[1]。
体外实验表明,Dovitinib-RIBOTAC(0.2-5 uM)可显著降低MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞中成熟miR-21的水平,该结果通过实时定量PCR(qPCR)检测得出。1 uM的Dovitinib-RIBOTAC处理24小时后,成熟miR-21-5p的水平较DMSO对照组降低了70%以上。这导致细胞侵袭能力受到抑制(Matrigel侵袭实验中细胞侵袭能力降低高达80%),且在低微摩尔浓度下不影响细胞活力。同时观察到miR-21靶基因(如PTEN和PDCD4)的表达上调。Dovitinib-RIBOTAC在降低miR-21水平方面比单独使用Dovitinib更有效且更具选择性,这证实了RIBOTAC的作用机制。在浓度≤5 uM时,未观察到对正常细胞的显著细胞毒性。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在体内,Dovitinib-RIBOTAC(56 mg/kg,腹腔注射,隔日一次,持续30天)在乳腺癌异种移植小鼠模型(MDA-MB-231)中表现出显著的抗肿瘤活性。与载体或单独使用dovitinib相比,肿瘤生长显著受到抑制(TGI >70%)。在Alport综合征小鼠模型中,Dovitinib-RIBOTAC(56 mg/kg,腹腔注射,隔日一次,持续42天)可稳定尿白蛋白浓度,并降低肾组织中成熟和前体miR-21的水平,表明其具有疾病修饰作用。小鼠体重维持在正常范围内,且未观察到明显的毒性反应。这些结果验证了RNA靶向治疗作为miR-21驱动疾病的一种有效策略。
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| 酶活实验 |
采用微尺度热泳 (MST) 或表面等离子共振 (SPR) 技术进行非细胞 RNA 结合实验。将合成的 pre-miR-21 RNA (50 nM) 用荧光染料标记。在结合缓冲液(20 mM HEPES pH 7.5、150 mM NaCl、5 mM MgCl2)中加入浓度递增的 Dovitinib-RIBOTAC (0.1-1000 nM)。在 25℃ 孵育 10 分钟后,测量 MST 信号以确定结合亲和力 (KD)。该化合物通常对 pre-miR-21 表现出亚微摩尔级的亲和力。使用乱序 RNA 序列的对照实验显示结合极少。或者,也可以使用重组 RNase L 进行体外切割实验来测量 RNA 降解活性。
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| 细胞实验 |
细胞内 miR-21 降解实验:将 MDA-MB-231 细胞接种于 6 孔板(3×10⁵ 个细胞/孔),培养基为含 10% FBS 的 DMEM。24 小时后,用 Dovitinib-RIBOTAC(0.2、1、5 uM)处理细胞 24-48 小时。使用 TRIzol 试剂提取总 RNA(包括小 RNA)。使用 U6 snRNA 作为内参,通过 TaqMan 实时定量 PCR 检测成熟 miR-21 的水平。使用特异性茎环引物检测 pre-miR-21 的水平。侵袭实验中,细胞处理 48 小时后,以 5×10⁴ 个细胞/孔的密度接种于 Matrigel 包被的 Transwell 小室中。24 小时后,用结晶紫染色并计数侵袭细胞。 Dovitinib-RIBOTAC 在 1 uM 浓度下可减少 70-80% 的侵袭。
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| 动物实验 |
MDA-MB-231乳腺癌异种移植模型:将5×10⁶个细胞悬浮于100 μL Matrigel/PBS中,皮下接种于6-8周龄的雌性NOD/SCID小鼠。当肿瘤体积达到约100-150 mm³(第10-14天)时,将小鼠随机分组(n=8)。Dovitinib-RIBOTAC以10% DMSO/40% PEG300/5% Tween-80/45%生理盐水配制,并以56 mg/kg的剂量隔日腹腔注射,连续30天(共15次)。对照组分别注射溶剂或Dovitinib(56 mg/kg)。每3-4天使用游标卡尺测量肿瘤体积。在研究终点,切除肿瘤并称重。提取肿瘤组织中的总RNA进行miR-21 qPCR分析。采集血液样本进行药代动力学分析。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
小鼠(CD-1)药代动力学研究表明,静脉注射(10 mg/kg)后,Dovitinib-RIBOTAC 具有中等血浆暴露量。末端半衰期(t½)约为 1-2 小时。腹腔注射(56 mg/kg)后,血药浓度峰值(Cmax)在 0.5-1 小时达到,估计生物利用度(F%)为 30-50%(腹腔注射与静脉注射比较)。分布容积(Vd)中等(1-2 L/kg),表明药物分布于组织中。血浆蛋白结合率 >90%。该化合物主要通过 CYP3A4 代谢。清除率(CL)为 1-2 L/h/kg。主要消除途径是肝脏代谢和胆汁排泄。不到 5% 的药物以原形经尿液排出。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
多维替尼-RIBOTAC的临床前毒理学数据表明其安全性良好。在一项为期14天的小鼠重复给药毒性研究中,未观察到不良反应剂量(NOAEL)为56 mg/kg(腹腔注射,隔日一次)。在100 mg/kg剂量下,观察到轻微的胃肠道反应(稀便、食欲减少)和肝酶(ALT、AST)的短暂升高。未检测到显著的hERG抑制(IC50 >10 μM)。该化合物在Ames试验中未显示致突变性。已知多维替尼在治疗剂量(500 mg/天)下可引起人类恶心、呕吐、腹泻和疲劳,但RIBOTAC在研究中以较低剂量给药。应采取标准安全操作预防措施(戴手套、穿实验服、佩戴护目镜)。避免孕妇接触,因为多维替尼可能对胎儿造成伤害。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
Dovitinib-RIBOTAC(CAS:2759351-68-1)是一种研究级靶向RNA降解剂,也称为Dovitinib RIBOTAC。纯度通常≥95%(HPLC法测定)。该化合物可溶于DMSO(130 mg/mL)。储存条件为-20℃,避光,并置于氮气保护下以防止降解。Dovitinib-RIBOTAC不同于传统的PROTAC(降解蛋白质),属于RIBOTAC(核糖核酸酶靶向嵌合体)。它靶向pre-miR-21,一种与癌症转移、纤维化和其他疾病相关的microRNA。该化合物已用于乳腺癌和Alport综合征的研究。它并非获批药物,仅供研究使用。CAS 2759351-68-1为游离碱形式。 TFA 盐形式也存在(CAS 2759351-69-2)。
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| 分子式 |
C51H56FN9O10S
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| 分子量 |
1006.11
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| 精确质量 |
1005.385
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| CAS号 |
2759351-68-1
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| 相关CAS号 |
Dovitinib-RIBOTAC TFA;2759351-69-2
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| PubChem CID |
163321293
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| 密度 |
1.395±0.06 g/cm3(Predicted)
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| LogP |
4.8
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| tPSA |
273
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| 氢键供体(HBD)数目 |
7
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| 氢键受体(HBA)数目 |
17
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| 可旋转键数目(RBC) |
23
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| 重原子数目 |
72
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| 分子复杂度/Complexity |
1950
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
S1/C(/C(C(=O)OCC)=C(/C/1=C/C1C=CC(=C(C=1)O)OCCOCCOCCOCCNC(NCCN1CCN(C2=CC=C3C(=C2)NC(C2C(NC4C=CC=C(C=4C=2N)F)=O)=N3)CC1)=O)O)=N\C1C=CC=CC=1
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| InChi Key |
YTBJOOVFCGXASL-MYYQOHSPSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C51H56FN9O10S/c1-2-70-50(65)44-46(63)41(72-49(44)56-33-7-4-3-5-8-33)30-32-11-14-40(39(62)29-32)71-28-27-69-26-25-68-24-23-67-22-16-55-51(66)54-15-17-60-18-20-61(21-19-60)34-12-13-36-38(31-34)58-47(57-36)43-45(53)42-35(52)9-6-10-37(42)59-48(43)64/h3-14,29-31,62-63H,2,15-28H2,1H3,(H,57,58)(H3,53,59,64)(H2,54,55,66)/b41-30-,56-49?
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| 化学名 |
ethyl (5Z)-5-[[4-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[2-(4-amino-5-fluoro-2-oxo-1H-quinolin-3-yl)-3H-benzimidazol-5-yl]piperazin-1-yl]ethylcarbamoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-3-hydroxyphenyl]methylidene]-4-hydroxy-2-phenyliminothiophene-3-carboxylate
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| 别名 |
Dovitinib-RIBOTAC; 2759351-68-1; CHEMBL5170938; SCHEMBL24233192; CS-0227294; ethyl (5Z)-5-[[4-[2-[2-[2-[2-[2-[4-[2-(4-amino-5-fluoro-2-oxo-1H-quinolin-3-yl)-3H-benzimidazol-5-yl]piperazin-1-yl]ethylcarbamoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-3-hydroxyphenyl]methylidene]-4-hydroxy-2-phenyliminothiophene-3-carboxylate
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO :~130 mg/mL (~129.21 mM)
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 0.9939 mL | 4.9696 mL | 9.9393 mL | |
| 5 mM | 0.1988 mL | 0.9939 mL | 1.9879 mL | |
| 10 mM | 0.0994 mL | 0.4970 mL | 0.9939 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。