Aniline-PEG3-C1-Boc

目录号: V93149
苯胺-PEG3-C1-Boc(化合物 D-1)是聚合物连接细胞毒药物的中间体。
Aniline-PEG3-C1-Boc CAS号: 2115897-27-1
产品类别: Drug-Linker Conjugates for ADC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
苯胺-PEG3-C1-Boc(化合物D-1)是聚合物连接细胞毒性药物的中间体。苯胺-PEG3-C1-Boc可用于合成抗体药物偶联物(ADC)。
苯胺-PEG3-C1-Boc(CAS 2115897-27-1)是一种异双功能聚乙二醇(PEG)连接剂,用于合成PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)和抗体药物偶联物(ADC)。该分子包含一个苯胺基团,可用于进一步偶联(例如,通过还原胺化与醛偶联);一个三单元PEG间隔基(PEG3),用于提高水溶性和柔韧性;以及一个Boc保护的伯胺(C1-Boc,其中Boc为叔丁氧羰基)。
生物活性&实验参考方法
靶点
No specific biological target. This compound is a synthetic chemical linker; it does not bind to any enzyme or receptor. Its purpose is to covalently connect a target protein ligand (e.g., a kinase inhibitor) to an E3 ubiquitin ligase ligand (e.g., thalidomide analog) in a PROTAC molecule, or to link a payload to an antibody in an ADC. The PEG3 spacer reduces steric hindrance and enhances solubility.
体外研究 (In Vitro)
不适用。连接基团本身不具有生物活性。苯胺基团可通过三乙酰氧基硼氢化钠还原胺化反应与含醛分子形成稳定的仲胺键。Boc基团对酸不稳定(可被三氟乙酸脱除),从而释放出游离的伯胺,用于酰胺偶联或其他反应。PEG3链赋予化合物亲水性和构象灵活性。
体内研究 (In Vivo)
不适用;该连接子并非设计用于单独进行体内给药。当将其整合到 PROTAC 或 ADC 中时,最终偶联物的体内活性(例如,肿瘤生长抑制)可在小鼠异种移植模型中进行测试。PEG3 连接子的长度经过优化,可使靶蛋白、PROTAC 和 E3 连接酶之间形成三元复合物,从而实现靶蛋白的高效泛素化和降解。
酶活实验
不适用,因为苯胺-PEG3-C1-Boc 是一种化学试剂,而非生物测试化合物。其纯度和结构通过标准分析方法验证:1H NMR 和 13C NMR(用于确认 δ 6.5-7.2 ppm 处的苯胺质子、δ 3.5-3.7 ppm 处的 PEG3 亚甲基质子和 δ 1.4 ppm 处的 Boc 叔丁基),高分辨率质谱 (HRMS) 用于确认分子量,以及高效液相色谱 (HPLC)(反相 C18 色谱柱,254 nm 紫外检测)用于测定纯度 (>95%)。
细胞实验
目前尚无针对该连接子的直接细胞检测方法。为了评估该连接子在PROTAC体系中的功能,研究人员首先将该连接子分别与靶蛋白配体和E3泛素连接酶配体偶联。然后将所得PROTAC体系以0.1 nM至10 uM的浓度加入细胞(例如HEK293T或HeLa细胞)中,孵育4-24小时。通过Western blot检测靶蛋白的降解情况,并计算DC50(50%降解所需的浓度)。
动物实验
不适用于单独的连接子。对于含有该连接子的PROTAC的体内疗效研究,将PROTAC通过静脉注射或灌胃(例如,10-100 mg/kg,每日一次或隔日一次)给予荷瘤小鼠(例如,异种移植模型),持续2-4周。使用游标卡尺测量肿瘤体积,并在研究结束时切除肿瘤进行Western blot分析,以确认靶蛋白降解情况。
药代性质 (ADME/PK)
不适用。连接子本身并非药物。当其被整合到PROTAC中时,其药代动力学性质(口服生物利用度、半衰期、清除率)取决于最终缀合物的总分子量、亲脂性和极性。与亲脂性更强的烷基连接子相比,PEG3连接子通常能提高水溶性并降低血浆蛋白结合率。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
连接基团本身无毒性数据。PEG3部分被认为具有生物相容性且无毒。苯胺和Boc基团是常见的有机合成基团,但不适用于人类食用。处理此化学品时应采取标准的实验室安全防护措施(戴手套、穿实验服、使用通风橱)。它可能引起皮肤和眼睛刺激。
参考文献

[1]. Antibody-drug conjugate targeting CD73 and preparation method and application thereof. China, CN110575548A.

其他信息
苯胺-PEG3-C1-Boc 是一种研究级 PROTAC 连接剂,并非药物,也未获得 FDA 批准。这类连接剂广泛用于 PROTAC 的合成,PROTAC 是一类新型的异双功能分子,能够诱导靶向蛋白质降解。PEG3 间隔基为多种蛋白质降解应用提供了最佳的长度和灵活性。Boc 保护的胺是肽和 PROTAC 合成的常用结构单元。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H29NO6
分子量
355.43
CAS号
2115897-27-1
外观&性状
Liquid
密度
1.111±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)
沸点
477.5±40.0 °C(predicted)
LogP
0
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~350 mg/mL (~984.72 mM; with ultrasonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8135 mL 14.0675 mL 28.1349 mL
5 mM 0.5627 mL 2.8135 mL 5.6270 mL
10 mM 0.2813 mL 1.4067 mL 2.8135 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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