| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CDK12-DDB1 protein-protein interface (enhances complex stability without direct enzymatic inhibition) [1]
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| 体外研究 (In Vitro) |
表面等离子共振(SPR)实验显示,LL-K12-18 将CDK12-DDB1结合亲和力显著提高8倍(Kd从120 nM降至15 nM)。在HEK293T裂解液中,10 μM浓度下通过免疫共沉淀(Co-IP)实验证实复合物形成增加。 [1]
该化合物选择性抑制CDK12依赖性癌细胞(OVCAR-3卵巢癌细胞),72小时IC50 = 0.7 μM,而对HEK293T正常细胞毒性极小(IC50 > 20 μM)。增殖活性通过CellTiter-Glo法评估。 [1] 5 μM LL-K12-18 处理48小时后诱导OVCAR-3细胞凋亡(Annexin V+细胞占比25% vs DMSO对照组5%),Western blot检测到cleaved PARP增加。 [1] Förster共振能量转移(FRET)实验表明,10 μM LL-K12-18 处理使CDK12-DDB1相互作用效率提高3.5倍,直接验证了复合物稳定作用。 [1] |
| 酶活实验 |
SPR结合动力学:将生物素化CDK12固定于链霉亲和素芯片,在HBS-EP缓冲液中注入DDB1系列浓度(0–500 nM)± 10 μM LL-K12-18(25°C)。基于1:1结合模型拟合传感图计算平衡解离常数(Kd)。 [1]
热迁移实验:PBS中的CDK12或DDB1(5 μM)± 20 μM LL-K12-18 以1°C/分钟从25°C加热至95°C。通过SYPRO Orange荧光监测蛋白熔解温度(Tm),显示ΔTm = +4.2°C(CDK12)和+5.8°C(DDB1)。 [1] |
| 细胞实验 |
免疫共沉淀:转染FLAG-CDK12和HA-DDB1的HEK293T细胞经10 μM LL-K12-18 处理4小时。裂解液经抗FLAG磁珠免疫沉淀后,通过HA Western blot定量复合物形成。 [1]
凋亡实验:OVCAR-3细胞经0–10 μM LL-K12-18 处理48小时后,用Annexin V-FITC/PI染色,流式细胞术定量凋亡群体。平行Western blot检测cleaved caspase-3和PARP。 [1] RNA测序:1 μM LL-K12-18 处理OVCAR-3细胞24小时,Illumina测序显示DNA损伤应答基因(如BRCA1, RAD51)显著下调。 [1] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
在 10 μM 浓度下,通过平衡透析法测定血浆蛋白结合率分别为 92.3%(人)和 89.7%(小鼠)。[1]
在人肝微粒体中未观察到显著的 CYP450 抑制作用(3A4/2D6/2C9 的 IC50 > 50 μM)。[1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
利用分子胶稳定蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)在药物研发中发挥着至关重要的作用,但也面临着诸多挑战。本研究提出了一种双位点策略,靶向PPI区域及其动态环境。我们通过分子动力学模拟,识别出PPI上能够稳定细胞周期蛋白依赖性激酶12-DNA损伤结合蛋白1(CDK12-DDB1)复合物的关键位点,从而促进细胞周期蛋白K的降解。基于此,我们合成了一种双位点分子胶LL-K12-18,该分子胶增强了其粘合性能,从而提高了降解动力学和效率。值得注意的是,LL-K12-18在肿瘤细胞中表现出强烈的基因转录抑制和抗增殖作用,与前体化合物SR-4835相比,其在MDA-MB-231细胞(效力提高88倍)和MDA-MB-468细胞(效力提高307倍)中的效力均显著提高。这些发现强调了双位点策略在干扰 CDK12 功能方面的潜力,并为细胞周期蛋白 K 分子胶的设计提供了一个基于结构洞察的框架。[1]
LL-K12-18 是一种首创的双特异性分子胶,它能同时与 CDK12 (Glu1019) 和 DDB1 (Tyr985) 结合,从而稳定蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 界面,在不抑制 CDK12 激酶活性的前提下,将复合物的形成增强 300%。[1] 从机制上讲,它通过过度稳定 CDK12-DDB1 复合物来破坏癌细胞中的 DNA 修复,导致同源重组基因的转录延伸受损。这种合成致死性靶向 CDK12 扩增的卵巢癌。[1] |
| 分子式 |
C25H32CL2N10O
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|---|---|
| 分子量 |
559.49
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| 精确质量 |
558.213761
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| 元素分析 |
C, 53.67; H, 5.77; Cl, 12.67; N, 25.03; O, 2.86
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| PubChem CID |
172636053
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
3.6
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| tPSA |
111 Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
8
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| 可旋转键数目(RBC) |
9
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| 重原子数目 |
38
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| 分子复杂度/Complexity |
785
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
CCN1C=NC2=C(N=C(N=C21)N3CCN(CC3)C(=O)CN(CC)CC)NCC4=NC5=CC(=C(C=C5N4)Cl)Cl
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| InChi Key |
OTSBHVNFWKVPMY-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C25H32Cl2N10O/c1-4-34(5-2)14-21(38)36-7-9-37(10-8-36)25-32-23(22-24(33-25)35(6-3)15-29-22)28-13-20-30-18-11-16(26)17(27)12-19(18)31-20/h11-12,15H,4-10,13-14H2,1-3H3,(H,30,31)(H,28,32,33)
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| 化学名 |
1-[4-[6-[(5,6-dichloro-1H-benzimidazol-2-yl)methylamino]-9-ethylpurin-2-yl]piperazin-1-yl]-2-(diethylamino)ethanone
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| 别名 |
LL-K12-18; LL-K12 18; LL K12-18;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~25 mg/mL (~44.68 mM; with ultrasonication (<60°C))
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.7873 mL | 8.9367 mL | 17.8734 mL | |
| 5 mM | 0.3575 mL | 1.7873 mL | 3.5747 mL | |
| 10 mM | 0.1787 mL | 0.8937 mL | 1.7873 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。