RK-33

别名:
目录号: V2562 纯度: ≥98%
RK-33 是一种有效的一流 DDX3(一种 RNA 解旋酶)小分子抑制剂,可导致 G1 细胞周期停滞、诱导细胞凋亡并促进 DDX3 过表达细胞的放射增敏。
RK-33 CAS号: 1070773-09-9
产品类别: ROCK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
RK-33 是一种有效的一流 DDX3(一种 RNA 解旋酶)小分子抑制剂,可导致 G1 细胞周期停滞、诱导细胞凋亡并促进 DDX3 过表达细胞的放射增敏。据报道,RK-33 与 DDX3 结合并消除其活性。 RK-33 对 DDX3 的抑制导致 G1 细胞周期停滞,诱导细胞凋亡,并促进 DDX3 过表达细胞的放射敏感性。此外,RK-33 引起的 DDX3 功能丧失会通过破坏 DDX3-β-连环蛋白轴而损害 Wnt 信号传导。 RK-33 特异性结合 DDX3,但不结合密切相关的蛋白质 DDX5 和 DDX17。 RK-33 以 DDX3 依赖性方式抑制癌症生长并使肺癌细胞放射增敏。
生物活性&实验参考方法
靶点
RK-33 targets RNA helicase DDX3 (IC50 = 4.6 μM for DDX3 ATPase activity; Ki = 3.2 μM for DDX3 binding) [1]
体外研究 (In Vitro)
RK-33 的 IC50 为 3-6 µM,可抑制多种癌细胞,但 PC3 对其影响的敏感性要低得多(IC50 >12 µM)。虽然 RK-33 处理仅在 22Rv1 中适度积累 G1 期,但它大大减少了处理细胞中的 G2 期,并诱导 DU145 和 LNCaP 中 G1 期大量积累。在 22Rv1 中,RK-33 治疗还导致 12 个中度 G1 积累[1]。等剂量的空纳米粒子对MCF-7细胞没有杀伤作用,而负载纳米粒子则表现出剂量依赖性细胞毒性。 50 μg/mL 是 5% RK-33 负载的 NP 的 IC50 值,25 μg/mL 是 10% RK-33 负载的 NP 的 IC50 值[2]。
在人前列腺癌细胞系(DU145、PC-3、LNCaP)中,RK-33(1–20 μM)以剂量依赖性方式抑制细胞增殖,IC50值分别为5.8 μM(DU145)、7.2 μM(PC-3)和9.5 μM(LNCaP)[1]
- 它阻断DDX3的ATP酶活性和RNA解旋功能:RK-33(5 μM)减少DDX3介导的ATP水解约68%,抑制DDX3依赖的RNA解旋约72%[1]
- 在DU145细胞中,RK-33(5 μM)+ 放疗(2 Gy)协同抑制细胞增殖(联合指数=0.48)并诱导凋亡(Annexin V-FITC/PI染色显示凋亡率约65%,放疗单独组为22%)[1]
- 它下调DDX3下游信号通路:Western blot检测显示,DU145细胞经5 μM处理24小时后,AKT(Ser473)和ERK1/2(Thr202/Tyr204)的磷酸化水平降低,Cyclin D1和Bcl-2的表达减少[1]
- PLGA纳米粒制剂的RK-33(NP-RK-33,1–20 μM)在PC-3细胞中显示出增强的细胞摄取(比游离RK-33高2.3倍)和更高的抗增殖活性(PC-3的IC50 = 3.1 μM)[2]
- 浓度高达20 μM时,对正常人前列腺上皮细胞(PrEC)无显著细胞毒性(活力较对照组>85%)[1]
- 克隆形成实验中,RK-33(5 μM)+ 放疗(4 Gy)使DU145细胞的克隆形成率降低约82%(放疗单独组为35%)[1]
体内研究 (In Vivo)
与对照组或单一治疗组相比,RK-33 和放射组合组小鼠的肿瘤显示出更高水平的间质水肿和细胞死亡(固缩或凝聚的细胞核与纤维蛋白混合)。放射治疗联合RK-33治疗在减缓肿瘤生长方面具有优势[1]。 RK-33 在接受 RK-33-PLGA 治疗的小鼠的肝脏 (28 μg/g) 和血浆 (34 μg/mL) 中发现,但在肺中没有发现[2]。
在DU145(前列腺癌)皮下异种移植模型(裸鼠)中:腹腔注射RK-33(20 mg/kg/天)+ 放疗(2 Gy,每周3次)持续21天,较溶媒+放疗组抑制肿瘤生长约78%。肿瘤组织中DDX3表达、p-AKT、Ki-67降低,切割型半胱天冬酶-3水平升高(免疫组织化学检测)[1]
- 在PC-3(前列腺癌)皮下异种移植模型(裸鼠)中:静脉注射NP-RK-33(15 mg/kg/天)持续14天,肿瘤生长抑制率约65%,高于游离RK-33(相同剂量下抑制率42%)。NP-RK-33使肿瘤组织药物浓度较游离药物增加约3.5倍[2]
- 在DU145异种移植模型中,RK-33 + 放疗使小鼠中位生存期从对照组(溶媒+放疗)的45天延长至68天[1]
酶活实验
DDX3 ATP酶活性实验:重组人DDX3蛋白(10 nM)与ATP(1 mM)、反应缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl2、1 mM DTT)在37°C孵育60分钟。ATP添加前10分钟加入浓度范围为0.1–50 μM的RK-33。孔雀绿法检测释放的无机磷酸盐(Pi)。相对于溶媒对照组计算抑制率,非线性回归确定IC50值[1]
- DDX3结合实验(SPR):DDX3重组蛋白固定在CM5传感器芯片上。RK-33(0.5–50 μM)以恒定流速(30 μL/min)注入运行缓冲液(PBS pH 7.4、0.05% Tween 20)。记录传感图以测量结合亲和力,稳态亲和模型计算Ki值[1]
细胞实验
前列腺癌细胞增殖及放疗增敏实验:DU145/PC-3/LNCaP细胞(每孔5×10³个)接种于96孔板,用RK-33(1–20 μM)预处理1小时,再经放疗(0–8 Gy)处理72小时。MTT法检测细胞活力以确定IC50和联合指数[1]
- DDX3信号及凋亡实验:DU145细胞(每孔1×10⁶个)接种于6孔板,用RK-33(5–10 μM)+ 放疗(2 Gy)处理24小时。细胞裂解后,Western blot检测DDX3、p-AKT、AKT、p-ERK1/2、ERK1/2、Cyclin D1、Bcl-2、切割型半胱天冬酶-3和GAPDH。Annexin V-FITC/PI染色结合流式细胞仪分析凋亡[1]
- PLGA纳米粒细胞摄取实验:PC-3细胞与荧光标记的NP-RK-33或游离RK-33(10 μM)孵育4小时。流式细胞仪和共聚焦显微镜量化细胞摄取[2]
- 克隆形成实验:DU145细胞(每孔1×10³个)接种于6孔板,用RK-33(1–10 μM)预处理1小时,经放疗(2–8 Gy)后培养14天。结晶紫染色克隆,计数大于50个细胞的克隆[1]
动物实验

在Twist1/KrasG12D肺癌模型中研究了RK-33分次给药方案的效果。结果显示,在为期3周的治疗期间,单独使用放射治疗可轻微抑制肿瘤生长,而RK-33联合放射治疗的效果更佳。因此,这些数据表明,RK-33联合低分割放射治疗能够有效降低临床前肺癌模型中的肺部肿瘤负荷,并且其疗效远优于常用的放射增敏剂卡铂。
前列腺癌异种移植放疗联合模型(DU145):将DU145细胞(5×10⁶个细胞/只)皮下注射到6周龄雄性裸鼠体内。当肿瘤体积达到约 100 mm³ 时,将小鼠随机分为对照组(载体组)、单纯放疗组(2 Gy,每周 3 次)、单纯 RK-33 组(20 mg/kg/天,腹腔注射)和联合治疗组(每组 n = 6)。RK-33 溶于 10% DMSO + 90% 生理盐水中,每日腹腔注射一次,连续 21 天。放疗分别于第 1、4、7 天进行。每 3 天测量一次肿瘤体积(长×宽²/2)和体重;切除肿瘤进行免疫组织化学分析[1]
- PLGA 纳米颗粒疗效模型 (PC-3):将 PC-3 细胞(5×10⁶ 个细胞/只)皮下注射到 6 周龄雄性裸鼠体内。当肿瘤体积达到约 120 mm³ 时,将小鼠分为自由注射 RK-33 组(15 mg/kg/天,静脉注射)和 NP-RK-33 组(15 mg/kg/天,静脉注射)(每组 n = 6)。NP-RK-33 采用双乳化法与 PLGA (50:50) 配制,并悬浮于生理盐水中。药物每日静脉注射一次,连续 14 天。每 2 天测量一次肿瘤体积和体重;收集肿瘤组织以定量药物浓度 [2]
药代性质 (ADME/PK)
口服生物利用度:游离的RK-33在大鼠体内的口服生物利用度较低(约18%)[2]
- PLGA纳米颗粒改善的药代动力学:NP-RK-33(15 mg/kg,静脉注射)在大鼠体内的血浆半衰期(t1/2)为8.6小时,而游离的RK-33为2.3小时[2]
- 肿瘤渗透性:NP-RK-33可将RK-33的肿瘤组织浓度提高至4.8 μg/g,而游离的RK-33(15 mg/kg,静脉注射)的肿瘤组织浓度为1.3 μg/g[2]
- 血浆蛋白结合率:在人血浆中为89%,在大鼠血浆中为87%(平衡透析法)[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性:浓度高达 20 μM 的 RK-33 对正常人 PrEC 或外周血单核细胞 (PBMC) 无显著细胞毒性(细胞活力 >85% vs. 对照组)[1]
- 急性毒性:大鼠腹腔注射给药的 LD50 > 200 mg/kg;剂量高达 200 mg/kg 时未观察到死亡或严重毒性症状(嗜睡、抽搐)[1]
- 重复给药毒性:在一项为期 21 天的大鼠研究中(腹腔注射剂量分别为 10、20 和 40 mg/kg/天),该药物耐受性良好。未检测到体重、血液学参数或血清生化指标(ALT、AST、BUN、肌酐)的显著变化。肝脏、肾脏和前列腺的组织学检查未发现异常病变[1]
- NP-RK-33 毒性:用 NP-RK-33(15 mg/kg/天,静脉注射)治疗 14 天的小鼠与游离 RK-33 相比,毒性未增加,器官功能正常,肿瘤组织中未出现炎症反应[2]
参考文献

[1]. RK-33 radiosensitizes prostate cancer cells by blocking the RNA helicase DDX3. Cancer Res. 2016 Sep 12.

[2]. Bol GM, e tal. PLGA nanoparticle formulation of RK-33: an RNA helicase inhibitor against DDX3. Cancer Chemother Pharmacol. 2015 Oct;76(4):821-7.

其他信息
RK-33 是一种 RNA 解旋酶 DDX3 的小分子抑制剂,在前列腺癌中具有放射增敏作用 [1]。其作用机制包括与 DDX3 的 ATP 结合口袋结合,抑制 DDX3 的 ATPase 和 RNA 解旋酶活性,从而阻断 DDX3 介导的下游信号通路(PI3K-AKT-ERK 通路),并诱导细胞周期阻滞(G1 期)和细胞凋亡 [1]。RK-33 通过抑制 DDX3 依赖的 DNA 损伤修复来增强放射治疗的疗效,使癌细胞对辐射诱导的细胞死亡更加敏感 [1]。与游离药物相比,PLGA 纳米颗粒制剂 (NP-RK-33) 可提高 RK-33 的溶解度,延长循环时间,增强肿瘤靶向性,并提高体内疗效 [2]。临床前数据支持其作为放射增敏剂治疗晚期前列腺癌的潜力,尤其是在与……联合使用时。放射疗法[1,2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H20N6O3
分子量
428.44
精确质量
428.159
CAS号
1070773-09-9
相关CAS号
1070773-09-9
PubChem CID
46184988
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
677.0±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
363.3±34.3 °C
蒸汽压
0.0±2.1 mmHg at 25°C
折射率
1.698
LogP
1.35
tPSA
93.7
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
783
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
COUMZXFUZDBRCZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H20N6O3/c1-31-17-7-3-15(4-8-17)11-28-14-26-19-20-22(25-13-24-21(19)28)29(23(30)27-20)12-16-5-9-18(32-2)10-6-16/h3-10,13-14H,11-12H2,1-2H3
化学名
3,7-dihydro-3,7-bis[(4-methoxyphenyl)methyl]-2H-diimidazo[4,5-d:4,5-f][1,3]diazepin-2-one
别名

RK-33; RK 33; RK33.

HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:85 mg/mL (198.4 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3340 mL 11.6702 mL 23.3405 mL
5 mM 0.4668 mL 2.3340 mL 4.6681 mL
10 mM 0.2334 mL 1.1670 mL 2.3340 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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