UNC0379 trifluoroacetate salt

目录号: V27846 纯度: ≥98%
UNC0379 TFA 是赖氨酸甲基转移酶 SETD8 (KMT5A) 的选择性底物竞争性抑制剂,IC50 为 7.3 μM,Kd 为 18.3 μM。
UNC0379 trifluoroacetate salt CAS号: 1620401-83-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述
UNC0379 TFA 是一种选择性底物竞争性赖氨酸甲基转移酶 SETD8 (KMT5A) 抑制剂,IC50 为 7.3 μM,Kd 为 18.3 μM。UNC0379 TFA 可用于炎症性癌症的研究,例如肺纤维化、卵巢癌和神经母细胞瘤。
UNC0379 三氟乙酸盐(CAS 1620401-83-3)是首个赖氨酸甲基转移酶 SETD8(也称为 KMT5A)的底物竞争性抑制剂,SETD8 是目前已知的唯一一种催化组蛋白 H4 第 20 位赖氨酸 (H4K20) 单甲基化的甲基转移酶。它是一种选择性抑制剂,对 SETD8 的 IC50 为 7.3 μM,并且对其他 15 种甲基转移酶也表现出良好的选择性。该化合物用于表观遗传学研究,以研究 H4K20 甲基化在 DNA 损伤反应、染色质结构和基因表达中的作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
UNC0379 targets the lysine methyltransferase SETD8 (KMT5A). It is a substrate-competitive inhibitor that prevents the methylation of histone H4 lysine 20 (H4K20). SETD8 expression is observed in cancers including bladder cancer, chronic myelogenous leukemia, hepatocellular carcinoma, non-small-cell lung carcinoma, prostate cancer, and small-cell lung carcinoma. Inhibition of SETD8 by UNC0379 may prevent cancer progression.
体外研究 (In Vitro)
UNC0379 TFA(1–10 μM,9 天)可抑制高级别浆液性卵巢癌 (HGSOC) 细胞的生长 [2]。在 HGSOC 细胞中,UNC0379 TFA(10 μM,96 小时)可提高亚 G1 期细胞的比例 [2]。48 小时内给予 10 μg UNC0379 TFA 可导致肌成纤维细胞去分化,并阻止新生成纤维细胞分化为肌成纤维细胞 [3]。UNC0379 对 SETD8 具有选择性抑制作用,IC50 值为 7.3 μM。它对其他 15 种甲基转移酶具有良好的选择性,对其他甲基转移酶的 IC50 值均高于 100 μM。H4K20 甲基化参与多种生物过程的调控,包括 DNA 损伤反应。抑制 H4K20 甲基化会导致染色质结构和基因表达的改变。
体内研究 (In Vivo)
在博来霉素 (BLM) 诱导的大鼠肺纤维化模型中,UNC0379 TFA(气管内给药,1 mg/kg/天,第 7、8 和 9 天)可减轻肺纤维化 [3]。现有文献中关于 UNC0379 体内活性数据不够详尽。作为一种 SETD8 抑制剂(SETD8 在多种癌症中过度表达),该化合物具有潜在的抗癌活性。该化合物可用作化学探针,研究 H4K20 甲基化在不同细胞环境中的生物学功能。目前尚无具体的体内疗效数据报道。
酶活实验
针对 UNC0379 的特定无细胞酶/受体结合分析方案包括组蛋白甲基转移酶分析。该化合物对 SETD8 的 IC50 值为 7.3 μM,通过基于肽的甲基化分析测定。通过对其他 15 种甲基转移酶进行测试,证实了其选择性,这些酶的 IC50 值均超过 100 μM。底物竞争性抑制作用通过动力学分析得到证实。
细胞实验
细胞活力检测 [1]
细胞类型: JHOS2、JHOS3、JHOS4、OVCAR3、OVCAHO、OVKATE、KURAMOCHI、TYKnu
测试浓度: 1-10 μM
孵育时间: 9 天
实验结果: 抑制 HGSOC 细胞增殖,IC50 范围为 0.39 至 3.20 μM。
细胞周期分析[1]
细胞类型:JHOS3、OVCAR3
测试浓度:10 µM
孵育时间:96 小时
实验结果:细胞被捕获于亚 G1 期。
UNC0379 的体外细胞实验采用表达 SETD8 的癌细胞系。用 UNC0379 处理细胞,并使用特异性抗体通过 Western blot 检测 H4K20 单甲基化水平。评估其对细胞增殖、DNA 损伤反应和基因表达的影响。通过评估其对其他组蛋白甲基化标记的影响来验证该化合物的选择性。
动物实验
动物/疾病模型:博来霉素 (BLM) 诱导的小鼠肺纤维化模型 [3]
剂量: 1 mg/kg/天
给药途径: 第 7、8 和 9 天进行管内给药。
实验结果: 改善了 BLM 诱导的肺纤维化(通过 Ashcroft 评分和肺组织样本中胶原蛋白含量的变化评估),且不影响肺部炎症。
现有文献中未详细描述 UNC0379 的体内动物研究。作为一种靶向 SETD8(在多种癌症中过表达)的表观遗传抑制剂,典型的体内评估将采用异种移植小鼠模型。将荷瘤小鼠用 UNC0379 治疗,并监测肿瘤生长抑制、H4K20 甲基化水平和生存率。
药代性质 (ADME/PK)
UNC0379 三氟乙酸盐的详细药代动力学性质尚未得到广泛报道。该化合物的分子式为 C23H35N5O2·xC2HF3O2,分子量为 527.58 g/mol。它在水中的溶解度为 5 mg/mL,呈白色至米色粉末状。纯度 ≥98%(HPLC)。储存条件:2–8°C,干燥保存。该化合物的 SMILES 字符串为 COC1=C(OC)C=C(N=C(N2CCCC2)N=C3NCCCCCN4CCCC4)C3=C1。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
现有文献中未详细列出UNC0379的具体毒理学数据。该化合物仅供研究使用,不用于人类治疗。作为一种组蛋白甲基化抑制剂,其潜在毒性可能与基因表达的表观遗传效应有关,但目前尚未有正式的毒理学报告。
参考文献

[1]. Discovery of a Selective, Substrate-Competitive Inhibitor of the Lysine Methyltransferase SETD8. J Med Chem. 2014 Aug 14;57(15):6822-33.

[2]. Epigenetic Modifier SETD8 as a Therapeutic Target for High-Grade Serous Ovarian Cancer. Biomolecules. 2020 Dec 16;10(12):1686.

[3]. Inhibition of the SET8 Pathway Ameliorates Lung Fibrosis Even Through Fibroblast Dedifferentiation. Front Mol Biosci. 2020 Aug 5;7:192.

其他信息
UNC0379 三氟乙酸盐(CAS 1620401-83-3)是首个赖氨酸甲基转移酶 SETD8 的底物竞争性抑制剂。SETD8 是目前已知唯一催化组蛋白 H4 第 20 位赖氨酸 (H4K20) 单甲基化的甲基转移酶。UNC0379 对 SETD8 的 IC50 值为 7.3 μM,并且对其他 15 种甲基转移酶具有良好的选择性。SETD8 在多种癌症中均有表达。目前尚无临床试验或已批准适应症的数据。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H36F3N5O4
分子量
527.5797
精确质量
527.271
CAS号
1620401-83-3
相关CAS号
UNC0379;1620401-82-2
PubChem CID
92044361
外观&性状
Light yellow to khaki solid powder
tPSA
100
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
581
定义原子立体中心数目
0
SMILES
COC1=C(C=C2C(=C1)C(=NC(=N2)N3CCCC3)NCCCCCN4CCCC4)OC.C(=O)(C(F)(F)F)O
InChi Key
NRGGPYZTHNAVFM-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H35N5O2.C2HF3O2/c1-29-20-16-18-19(17-21(20)30-2)25-23(28-14-8-9-15-28)26-22(18)24-10-4-3-5-11-27-12-6-7-13-27;3-2(4,5)1(6)7/h16-17H,3-15H2,1-2H3,(H,24,25,26);(H,6,7)
化学名
6,7-dimethoxy-2-pyrrolidin-1-yl-N-(5-pyrrolidin-1-ylpentyl)quinazolin-4-amine;2,2,2-trifluoroacetic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~100 mg/mL (~189.54 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8954 mL 9.4772 mL 18.9545 mL
5 mM 0.3791 mL 1.8954 mL 3.7909 mL
10 mM 0.1895 mL 0.9477 mL 1.8954 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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