VPC-70063

别名: VPC70063; VPC-70063; VPC 70063
目录号: V4825 纯度: ≥98%
VPC-70063 是一种有效的 Myc-Max 抑制剂(拮抗剂),抑制 Myc-Max 转录活性的 IC50 为 8.9 μM。
VPC-70063 CAS号: 13571-44-3
产品类别: c-Myc
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
VPC-70063 是一种有效的 Myc-Max 抑制剂(拮抗剂),抑制 Myc-Max 转录活性的 IC50 为 8.9 μM。 VPC-70063 降低 UBE2C 启动子活性和 AR-V7 水平,并诱导 PARP 裂解。 VPC-70063 可引起细胞凋亡并阻断 Myc-Max 与 DNA 之间的相互作用。 VPC-70063可用于抗癌研究。
生物活性&实验参考方法
靶点
Myc-Max (IC50 = 8.9 μM)
Fat mass and obesity-associated protein (FTO) demethylase.
FB23 inhibits FTO-mediated m⁶A demethylation with an IC₅₀ of 0.06 μM.
FB23-2 maintains inhibitory activity on FTO demethylation in vitro. [1]
体外研究 (In Vitro)
VPC-70063(25 μM;96 h)显示 Myc-Max 转录活性抑制 106%,Myc-Max/UBE2C 下游通路抑制 94%[1]。 VPC-70063 (6.25-25 μM, 48 h) 诱导 LNCaP 细胞凋亡,如 PARP 裂解所示[1]。 VPC-70063(0-500 μM;0-600 s)以剂量依赖性方式破坏 Myc-Max 与 DNA 的相互作用[1]。
FB23-2 处理导致 NB4 和 MONOMAC6 AML 细胞转录组中 m⁶A 丰度显著增加,这通过 m⁶A 斑点印迹实验检测证实。
LC-MS/MS 定量分析进一步确认了 AML 细胞暴露于 FB23-2 后 mRNA 中细胞 m⁶A 的增加。
FB23-2 显著抑制一组 AML 细胞系(NB4, MONOMAC6, MA9.3ITD, MA9.3RAS, U937, ML-2, MV4-11)的增殖,IC₅₀ 值范围在 0.8 μM 至 5.2 μM 之间。
FB23-2 对正常人骨髓细胞的增殖影响很小。
FB23 和 FB23-2 处理显著增加了 NB4 和 MONOMAC6 细胞中 ASB2 和 RARA 的 mRNA 和蛋白水平,并抑制了 MYC 和 CEBPA 的表达。
FB23-2 显著加速了全反式维甲酸(ATRA)诱导的 AML 细胞髓系分化,诱导了细胞凋亡,并导致细胞周期阻滞在 G1 期。
FB23-2 抑制了来自四位患者的原代 AML 细胞的增殖,诱导了凋亡,降低了集落形成能力,并加速了 ATRA 介导的髓系分化。[1]
体内研究 (In Vivo)
在使用移植了 MONOMAC6 AML 细胞的 NSGS 小鼠的异种移植白血病模型中,每日腹腔注射 FB23-2(2 mg/kg)连续 10 天,显著延迟了白血病症状的出现,显著延长了中位生存期,抑制了白血病恶性程度(减轻脾肿大和肝肿大),并在体内促进了 AML 细胞的分化。
在患者来源异种移植(PDX)AML 小鼠模型中,使用 FB23-2(6 mg/kg/天,腹腔注射,持续 17 天)治疗显著延长了疾病潜伏期,降低了外周血和骨髓中 AML 原始细胞的比例,诱导了 AML 细胞分化,削弱了白血病恶性程度(集落更少更小),并显著消除了白血病干细胞(LSC)。二次移植实验证实了 FB23-2 治疗后功能性 LSC 的减少。[1]
酶活实验
使用基于 HPLC 的测定法来测量对 RNA 中 m⁶A 去甲基化的抑制。反应体系包含 FTO 蛋白、含有 m⁶A 的单链 RNA 底物、辅助因子(2-氧戊二酸、硫酸亚铁铵、L-抗坏血酸)以及所需浓度的抑制剂,置于 Tris-HCl 缓冲液中。混合物孵育后,通过加热终止反应。产物经核酸酶 P1 和碱性磷酸酶消化后进行 HPLC 分析。IC₅₀ 值根据 m⁶A 去甲基化的抑制百分比进行定量。[1]
进行细胞热位移测定(CETSA)以验证细胞条件下化合物与蛋白质的相互作用。细胞裂解物与化合物或 DMSO 孵育,然后在不同温度下加热以使蛋白质变性。离心后,通过蛋白质印迹分析上清液以检测目标蛋白的热稳定性。[1]
进行药物亲和反应靶点稳定性(DARTS)测定。细胞裂解物与化合物或 DMSO 孵育,然后用 Pronase 消化。反应被淬灭后,对裂解物进行蛋白质印迹以确定目标蛋白的丰度,该蛋白在配体结合后对蛋白酶具有抗性。[1]
使用荧光、AlphaLISA 或基于放射性的方法,按照标准方案对各种表观遗传酶(HDAC、LSD1、Jumonji 去甲基酶、BRD4、DOT1L)进行体外抑制实验。[1]
使用荧光抑制剂筛选试剂盒评估对环氧化酶 COX-1 和 COX-2 的抑制效果。酶与测试化合物孵育后,加入花生四烯酸和检测试剂,测量荧光。[1]
使用基于放射性的滤膜结合法对 405 种人类激酶进行了广泛的酶学特异性测试。计算并绘制了抑制百分比。[1]
细胞实验
细胞增殖使用比色法细胞增殖测定试剂盒进行测定。细胞接种后用化合物或 DMSO 处理指定时间(72 或 96 小时)。加入测定试剂,孵育后测量吸光度。[1]
对于 m⁶A 斑点印迹实验,从处理过的细胞中分离总 RNA,并富集 poly(A)+ mRNA。RNA 样品变性后点样到膜上并进行交联。膜封闭后,与 m⁶A 抗体孵育,然后与 HRP 标记的二抗孵育并进行显色。[1]
AML 细胞中 m⁶A 和 m⁶Aₘ 的 LC-MS/MS 定量分析涉及 mRNA 分离、去帽、核酸酶 P1 和碱性磷酸酶消化,以及使用液相色谱-串联质谱联用进行分析。[1]
对于细胞凋亡分析,细胞经化合物处理后收集、洗涤,并用 Annexin V 和 7-AAD 或 PI 染色。染色后的细胞通过流式细胞术进行分析。[1]
通过流式细胞术分析髓系分化。细胞在化合物存在下用 ATRA 诱导,然后用针对分化标记物(如 CD11b, CD14, CD15)的荧光标记抗体染色并分析。[1]
通过流式细胞术进行细胞周期分析。处理后的细胞固定/透化后,用碘化丙啶(PI)或 Hoechst 33342 与 Pyronin Y 的组合染色,然后进行分析。[1]
原代 AML 细胞的集落形成实验通过将细胞悬浮在含有或不含化合物的甲基纤维素培养基中,接种于培养皿,孵育 12 天后计数集落来进行。[1]
动物实验
For the toxicity study in BALB/c mice, FB23-2 was formulated in a vehicle (composition not specified) and administered intraperitoneally daily at doses of 10, 20, 40, and 80 mg/kg for 14 days. Body weight and organ conditions were monitored. [1]
For pharmacokinetic profiling in Sprague Dawley rats, a single dose of 3 mg/kg FB23-2 (formulated in DMSO) was administered intraperitoneally. Blood samples were collected at multiple time points via retro-orbital bleeding for LC-MS/MS analysis. [1]
For the MONOMAC6 xeno-transplantation efficacy study, NSGS mice were transplanted with AML cells via tail vein. After 10 days, mice received daily intraperitoneal injections of FB23-2 (2 mg/kg) or vehicle control for 10 days. Mice were monitored for survival and symptoms. [1]
For the PDX model efficacy study, NSGS mice were sublethally irradiated and transplanted with primary human AML cells via tail vein. When engraftment reached 3–5% in peripheral blood, mice received daily intraperitoneal injections of FB23-2 (6 mg/kg) or vehicle control (DMSO) for 17 days. Mice were monitored for survival and engraftment levels. [1]
药代性质 (ADME/PK)
Following a single 3 mg/kg intraperitoneal dose in rats, FB23-2 had a Cₘₐₓ of 2421.3 ± 90.9 ng/ml, Tₘₐₓ of 0.08 hr, elimination half-life (T₁/₂) of 6.7 ± 1.3 hr, and AUC₀–₂₄ of 2184 ± 152 hr × ng/ml.
FB23 (a hydrolysis metabolite of FB23-2) was also detected, with a Cₘₐₓ of 142.5 ± 26.1 ng/ml and Tₘₐₓ of 0.4 ± 0.1 hr.
The metabolic stability of FB23-2 in rat liver microsomes showed an estimated T₁/₂ of 128 min and an intrinsic clearance of 19.7 ml/min/kg.
Plasma protein binding for FB23-2 was nearly 100%. [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
In a 14-day repeat-dose toxicity study in BALB/c mice, intraperitoneal administration of FB23-2 at 20 mg/kg daily showed no evidence of body weight loss or physical damage to vital organs (heart, kidney, lung, liver, spleen).
Hematology and plasma biochemistry analysis revealed no significant differences between the vehicle control and the 20 mg/kg FB23-2-treated group. [1]
参考文献

[1]. Computer-aided drug discovery of Myc-Max inhibitors as potential therapeutics for prostate cancer. Eur J Med Chem. 2018 Dec 5;160:108-119.

其他信息
FB23 and FB23-2 are small-molecule inhibitors developed through structure-based rational design targeting the oncogenic mRNA m⁶A demethylase FTO, which is overexpressed in a subset of acute myeloid leukemias (AML).
FB23-2 is a benzohydroxamic acid derivative of FB23, designed to improve cellular permeability.
The inhibitors display high selectivity for FTO over the related demethylase ALKBH5 and a panel of other epigenetic targets and kinases.
The anti-leukemic effects are mediated through FTO inhibition, leading to increased m⁶A RNA methylation, which in turn regulates critical genes and signaling pathways (e.g., downregulating MYC, CEBPA and upregulating RARA, ASB2), resulting in suppressed proliferation, induced differentiation, and apoptosis in AML cells and LSCs. [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H12N2F6S
分子量
378.335
精确质量
378.06
元素分析
C, 50.80; H, 3.20; F, 30.13; N, 7.40; S, 8.47
CAS号
13571-44-3
相关CAS号
13571-44-3
PubChem CID
4142933
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4.8
tPSA
56.2
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
423
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
PIQMVCPITQIXGJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H12F6N2S/c17-15(18,19)11-6-12(16(20,21)22)8-13(7-11)24-14(25)23-9-10-4-2-1-3-5-10/h1-8H,9H2,(H2,23,24,25)
化学名
1-benzyl-3-[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]thiourea
别名
VPC70063; VPC-70063; VPC 70063
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6431 mL 13.2156 mL 26.4313 mL
5 mM 0.5286 mL 2.6431 mL 5.2863 mL
10 mM 0.2643 mL 1.3216 mL 2.6431 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • (A) Inhibition of Myc with VPC-70067 and VPC-70063 resulted in apoptosis of LNCaP cells as indicated by cleavage of PARP in Western blot. Eur J Med Chem . 2018 Dec 5:160:108-119.
  • (A) Predicted binding pose of VPC-70063 in space-filling representation within the Myc-Max DBD pocket (cyan = carbon, blue = nitrogen, green = fluorine, yellow = sulfur). Eur J Med Chem . 2018 Dec 5:160:108-119.
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