EFdA-TP

别名: EFdA-TP; EFdA-TP; 950913-56-1; Islatravir triphosphate; 2'-Deoxy-4'-Ethynyl-2-Fluoroadenosine 5'-(Tetrahydrogen Triphosphate); 7HAE2A23SL; CHEMBL518606; 2'-Deoxy-4'-c-ethynyl-2-fluoroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate); Adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate), 2'-deoxy-4'-c-ethynyl-2-fluoro-; EFdA TP
目录号: V52139 纯度: ≥98%
EFdA-TP 是一种新型选择性核苷逆转录酶 (RT) 抑制剂。 EFdA-TP 作为有效的立即或延迟链终止剂(ICT 或 DCT)来抑制 RT 催化的 DNA 合成。 EFdA-TP 通过多种机制抑制 HIV-1 RT。
EFdA-TP CAS号: 950913-56-1
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
Other Sizes

Other Forms of EFdA-TP:

  • 依斯拉韦
  • EFdA-TP tetraammonium
  • EFdA-TP tetrasodium
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产品描述
EFdA-TP 是一种有效的核苷逆转录酶 (RT) 抑制剂。 EFdA-TP 作为有效的立即或延迟链终止剂(ICT 或 DCT)来抑制 RT 催化的 DNA 合成。 EFdA-TP 通过多种机制抑制 HIV-1 RT。
生物活性&实验参考方法
靶点
HIV-1
体外研究 (In Vitro)
作为 ICT 或 DCT,EFdA-TP (0.05–10 μM) 可抑制 RT 催化的 DNA 合成 15 分钟[1]。作为一种易位缺陷型 RT 抑制剂,可显着减慢 DNA 合成速度,EFdA-TP 可以阻断 RT,并起到事实上的立即链终止剂的作用。在阻止 DNA 合成之前,EFdA-TP 可以充当延迟链终止子,允许插入额外的 dNTP[1]。
体内研究 (In Vivo)
EFdA对野生型(EC50低至50pmol/l)和大多数高度NRTI抗性病毒具有活性。活性代谢产物EFdA三磷酸盐已被证明在人类和恒河猴(Rh)血细胞中具有延长的细胞内半衰期。因此,在感染猿猴免疫缺陷病毒mac251的Rh猕猴和感染HIV-1的个体中测试的单次药物剂量显示出7-10天的强效抗病毒活性。EFdA作为Rh猕猴/猿猴/人类免疫缺陷病毒低剂量直肠内攻击模型暴露前预防的临床前研究表明,以临床相关剂量给药时,EFdA具有完全的保护作用[2]。
酶活实验
4'-乙炔基-2-氟-2'-脱氧腺苷(EFdA)是一种核苷类似物,与批准的抗人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)核苷逆转录酶抑制剂不同,它具有3'-OH,对野生型和耐药性HIV-1表现出显著的效力。EFdA三磷酸(EFdA-TP)在核苷逆转录酶抑制剂中是独一无二的,因为它通过多种机制抑制HIV-1逆转录酶(RT)。(a) EFdA-TP可以阻断RT,作为一种易位缺陷的RT抑制剂,显著减缓DNA合成,起到事实上的直接链终止剂的作用。尽管非易位的EFdA MP封端引物可以被解锁,但它们可以有效地转化回EFdA-MP封端形式。(b)EFdA-TP可以作为延迟链终止剂,允许在阻断DNA合成之前掺入额外的dNTP。在这种情况下,EFdA-MP终止的引物受到保护,不会被切除。(c) RT可以有效地错误掺入EFdA-MP,导致引物不匹配,极难延伸,也无法切除。模板序列的上下文定义了每种机制的相对贡献,并影响了EFdA-MP对潜在掺入位点的亲和力,部分解释了EFdA和替诺福韦之间缺乏拮抗作用。EFdA-MP掺入前核苷酸类型的变化可以将其抑制机制从延迟链终止子改变为立即链终止子。EFdA通过多种机制抑制HIV复制的多功能性可能解释了为什么对EFdA的耐药性更难出现[1]。
参考文献

[1]. 4'-Ethynyl-2-fluoro-2'-deoxyadenosine (EFdA) inhibits HIV-1 reverse transcriptase with multiple mechanisms. J Biol Chem. 2014 Aug 29;289(35):24533-48.

[2]. 4'-Ethynyl-2-fluoro-2'-deoxyadenosine, MK-8591: a novel HIV-1 reverse transcriptase translocation inhibitor. Curr Opin HIV AIDS. 2018 Jul;13(4):294-299.

其他信息
4'-Ethynyl-2-fluoro-2'-deoxyadenosine (EFdA) is a nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NRTI) with a novel mechanism of action, unique structure, and amongst NRTIs, unparalleled anti-HIV-1 activity. We will summarize its structure and function, antiviral activity, resistance profile, and potential as an antiretroviral for use in the treatment and preexposure prophylaxis of HIV-1 infection. Summary: EFdA is a novel antiretroviral with activity against both wild-type and NRTI-resistant viruses. As a result of the prolonged intracellular half-life of its active moiety, it is amenable to flexibility in dosing of at least daily to weekly and perhaps longer.[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C12H15FN5O12P3
分子量
533.193488359451
精确质量
532.99
CAS号
950913-56-1
相关CAS号
Islatravir;865363-93-5;EFdA-TP tetraammonium;EFdA-TP tetrasodium;2883783-00-2
PubChem CID
44568060
外观&性状
Typically exists as White to off-white solid at room temperature
LogP
-4.4
tPSA
259
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
17
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
946
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C#C[C@]1([C@H](C[C@@H](O1)N2C=NC3=C(N=C(N=C32)F)N)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O
InChi Key
BUMPFXRZUYYODO-QRPMWFLTSA-N
InChi Code
InChI=1S/C12H15FN5O12P3/c1-2-12(4-27-32(23,24)30-33(25,26)29-31(20,21)22)6(19)3-7(28-12)18-5-15-8-9(14)16-11(13)17-10(8)18/h1,5-7,19H,3-4H2,(H,23,24)(H,25,26)(H2,14,16,17)(H2,20,21,22)/t6-,7+,12+/m0/s1
化学名
[[(2R,3S,5R)-5-(6-amino-2-fluoropurin-9-yl)-2-ethynyl-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
别名
EFdA-TP; EFdA-TP; 950913-56-1; Islatravir triphosphate; 2'-Deoxy-4'-Ethynyl-2-Fluoroadenosine 5'-(Tetrahydrogen Triphosphate); 7HAE2A23SL; CHEMBL518606; 2'-Deoxy-4'-c-ethynyl-2-fluoroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate); Adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate), 2'-deoxy-4'-c-ethynyl-2-fluoro-;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8755 mL 9.3775 mL 18.7550 mL
5 mM 0.3751 mL 1.8755 mL 3.7510 mL
10 mM 0.1876 mL 0.9378 mL 1.8755 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • EFdA-TP inhibits RT-catalyzed DNA synthesis as an ICT or DCT. J Biol Chem . 2014 Aug 29;289(35):24533-48
  • Effect of template sequence on mechanism of inhibition by EFdA-TP. J Biol Chem . 2014 Aug 29;289(35):24533-48
  • SPR to determine the kinetic constants of EFdA-TP and dATP binding to HIV-1 RT. J Biol Chem . 2014 Aug 29;289(35):24533-48
  • Pre-steady state kinetics of correct single nucleotide incorporation of EFdA-TP and dATP by HIV-1 RT. J Biol Chem . 2014 Aug 29;289(35):24533-48
  • Interactions of EFdA-triphosphate (EFdA-TP) at the dNTP binding site of RT shown as Van der Waals surface. Curr Opin HIV AIDS . 2018 Jul;13(4):294-299.
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