AFN-1252 tosylate monohydrate

别名: AFN-1252 tosylate monohydrate; AFN-1252 tosylate; AFN1252; AFN-12520000; API-1252 tosylate; AFN-1252; Debio 1452; AFN 1252; API-1252; AFN-1252 tosylate monohydrate; 1047981-30-5; API-1252 tosylate monohydrate; UNII-004HXS4MNN; 004HXS4MNN; 2-Propenamide, N-methyl-N-((3-methyl-2-benzofuranyl)methyl)-3-(5,6,7,8-tetrahydro-7-oxo-1,8-naphthyridin-3-yl)-, (2E)-, 4-methylbenzenesulfonate, hydrate (1:1:1); (E)-N-methyl-N-((3-methylbenzofuran-2-yl)methyl)-3-(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-3-yl)acrylamide 4-methylbenzenesulfonate hydrate; SCHEMBL726863;
目录号: V17656 纯度: ≥98%
AFN-1252甲苯磺酸盐一水合物(API-1252;AFN-12520000;Debio-1452)是一种新型、有效的烯酰基(酰基载体蛋白)还原酶 Fabl 抑制剂,具有治疗急性细菌性皮肤的潜力。
AFN-1252 tosylate monohydrate CAS号: 1047981-30-5
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
Other Sizes

Other Forms of AFN-1252 tosylate monohydrate:

  • AFN-1252 tosylate
  • AFN-1252 (API1252; Debio1452)
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
AFN-1252 甲苯磺酸盐一水合物(API-1252;AFN-12520000;Debio-1452)是一种新型、有效的烯酰基(酰基载体蛋白)还原酶 Fab1 抑制剂,具有治疗急性细菌性皮肤的潜力。 AFN-1252 对金黄色葡萄球菌的多种临床分离株表现出 ≤0·015 μg/ml 的典型 MIC(90) 值、口服生物可吸收性、消除半衰期长以及动物模型中的功效。 AFN-1252 显示出葡萄球菌特异性的活性谱。
生物活性&实验参考方法
靶点
FabI/enoyl-acyl carrier protein reductase
体外研究 (In Vitro)
AFN-1252是烯酰基载体蛋白还原酶(FabI)的强效抑制剂,在浓度<=0.12微克/毫升时,抑制了所有测试的金黄色葡萄球菌(n=502)和表皮葡萄球菌(t=51)的临床分离株,包括耐甲氧西林(甲氧西林)的分离株。相比之下,AFN-1251对肺炎链球菌、β-溶血性链球菌、肠球菌属、肠杆菌科、非发酵革兰氏阴性杆菌和卡他莫拉菌的临床分离物没有活性(MIC(90)>4微克/毫升)。这些数据支持AFN-1252继续开发用于治疗耐药葡萄球菌感染患者[1]。
体内研究 (In Vivo)
类鼻疽是一种热带细菌感染,由革兰阴性菌假鼻疽伯克氏菌(B.pseudomallei;Bpm)引起。目前的治疗选择主要限于甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和β-内酰胺类药物,治疗时间约为4个月。此外,有报道称对这些药物有耐药性。因此,迫切需要开发新的类鼻疽抗生素。抑制脂肪酸生物合成途径中的关键酶烯酰基ACP还原酶(FabI)在抗菌药物开发方面显示出巨大的前景。FabI已被确定为假鼻疽杆菌中存在的主要烯酰基ACP还原酶。在这项研究中,我们评估了目前正在临床开发的金黄色葡萄球菌FabI抑制剂AFN-1252与BpmFabI酶结合并抑制拟鼻疽杆菌生长的潜力。AFN-1252稳定了BpmFabI并抑制了酶活性,IC50为9.6 nM。它对从类鼻疽患者中分离出的拟鼻疽杆菌R15菌株显示出良好的抗菌活性(MIC为2.35mg/L)。以2.3Å的分辨率确定了含有AFN-1252的BpmFabI的X射线结构。BpmFabI与AFN-1252的复合物形成了一个对称的四聚体结构,每个单体亚基上都结合有一个AFN-125二分子。动力学和热熔融研究支持了AFN-1252可以独立于辅因子与BpmFabI结合的发现。这些研究的结构和机理见解可能有助于新FabI抑制剂的合理设计和开发[2]。
酶活实验
AFN-1252的BpmFabI酶抑制试验[2] AFN-1252是使用已发表的合成方案在内部合成的。38通过监测辅因子NADH.33的氧化,在分光光度测定中评估了AFN-1252中抑制BpmFabI的效力。用于测定的缓冲液为30 mM PIPES,pH 6.8,含有150 mM NaCl和1 mM EDTA。试验中使用了175 nM BpmFabI酶。米氏常数(Km)和Kcat是根据巴豆酰辅酶A浓度增加时的酶活性确定的。Km(257µM)和Kcat(307分钟-1)的值略高于报告的值(分别为188µM和215分钟-1)。为了测定IC50,将AFN-1252与BpmFabI预孵育30分钟,并通过加入含有巴豆酰辅酶A(300µM)和NADH(375µM)的底物混合物开始反应。通过跟踪340nm处吸光度的降低来监测NADH的氧化。IC50值是通过使用Graphpad Prism软件V4将剂量反应数据拟合到S形剂量反应(可变斜率)曲线来确定的。为了确定结合机制,在不同浓度的抑制剂下进行了动力学研究,并在固定浓度的巴豆酰辅酶a(300µM)下改变NADH的浓度,同时通过改变巴豆酰CoA的浓度将NADH浓度固定在375µM。随后生成Lineweaver–Burk图,以确定AFN-1252与BpmFabI结合的机制。
细胞实验
使用Wiegand等人描述的微量稀释技术进行最低抑菌浓度(MIC)测定,并进行了一些修改。39在脑心输注肉汤(BHIB)中制备化合物的两倍连续稀释液,并将其分配到96孔板中。将1×108cfu/mL的BpR15接种物加入每个孔中,在37°C下孵育24小时。同时制备生长对照(仅细菌接种物)、无菌对照(仅肉汤)和阳性对照(含三氯生的细菌接种)孔并孵育。记录了MIC,定义为抑制BpR15可见生长的AFN-1252的最低浓度。MIC结果为n=2[2]的平均值。
动物实验
Burkholderia pseudomallei strain R15 (herein referred to as BpR15) was isolated from an individual who succumbed to melioidosis at the Kuala Lumpur Hospital in Malaysia.40 BpR15 was routinely cultured on Ashdown agar at 37°C and overnight bacterial cultures were prepared in BHIB. AFN-1252 was dissolved in dimethyl sulfoxide (DMSO) and stored at −20°C until use[2].
参考文献

[1].Karlowsky JA, et al. AFN-1252, a FabI inhibitor, demonstrates a Staphylococcus-specific spectrum of activity. Antimicrob Agents Chemother. 2009 Aug;53(8):3544-8.

[2].Narasimha Rao K, et al. AFN-1252 is a potent inhibitor of enoyl-ACP reductase from Burkholderia pseudomallei-Crystal structure, mode of action, and biological activity. Protein Sci. 2015 May;24(5):832-40.

[3].Yao J, et al. Resistance to AFN-1252 arises from missense mutations in Staphylococcus aureus enoyl-acyl carrier protein reductase (FabI). J Biol Chem. 2013 Dec 20;288(51):36261-71.

[4].Parsons JB, et al. Perturbation of Staphylococcus aureus gene expression by the enoyl-acyl carrier protein reductase inhibitor AFN-1252. Antimicrob Agents Chemother. 2013 May;57(5):2182-90.

[5]. Yao J, Ericson ME, Frank MW, Rock CO. Enoyl-Acyl Carrier Protein Reductase I (FabI) is Essential for the Intracellular Growth of Listeria monocytogenes. Infect Immun. 2016 Oct 10. pii: IAI.00647-16. PubMed PMID: 27736774.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H31N3O7S
分子量
565.637346506119
精确质量
565.188
元素分析
C, 61.58; H, 5.52; N, 7.43; O, 19.80; S, 5.67
CAS号
1047981-30-5
相关CAS号
1047981-31-6;620175-39-5;1047981-30-5 (tosylate hydrate);
PubChem CID
25029351
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
6.036
tPSA
150.91
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
829
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S(C1C=CC(C)=CC=1)(=O)(=O)O.O1C2C=CC=CC=2C(C)=C1CN(C)C(/C=C/C1C=NC2=C(C=1)CCC(N2)=O)=O.O
InChi Key
OUSNFNLWEQZRCQ-WRQJSNHTSA-N
InChi Code
1S/C22H21N3O3.C7H8O3S.H2O/c1-14-17-5-3-4-6-18(17)28-19(14)13-25(2)21(27)10-7-15-11-16-8-9-20(26)24-22(16)23-12-151-6-2-4-7(5-3-6)11(8,9)10/h3-7,10-12H,8-9,13H2,1-2H3,(H,23,24,26)2-5H,1H3,(H,8,9,10)1H2/b10-7+
化学名
(E)-N-methyl-N-((3-methylbenzofuran-2-yl)methyl)-3-(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-3-yl)acrylamide 4-methylbenzenesulfonate hydrate
别名
AFN-1252 tosylate monohydrate; AFN-1252 tosylate; AFN1252; AFN-12520000; API-1252 tosylate; AFN-1252; Debio 1452; AFN 1252; API-1252; AFN-1252 tosylate monohydrate; 1047981-30-5; API-1252 tosylate monohydrate; UNII-004HXS4MNN; 004HXS4MNN; 2-Propenamide, N-methyl-N-((3-methyl-2-benzofuranyl)methyl)-3-(5,6,7,8-tetrahydro-7-oxo-1,8-naphthyridin-3-yl)-, (2E)-, 4-methylbenzenesulfonate, hydrate (1:1:1); (E)-N-methyl-N-((3-methylbenzofuran-2-yl)methyl)-3-(7-oxo-5,6,7,8-tetrahydro-1,8-naphthyridin-3-yl)acrylamide 4-methylbenzenesulfonate hydrate; SCHEMBL726863;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7679 mL 8.8395 mL 17.6791 mL
5 mM 0.3536 mL 1.7679 mL 3.5358 mL
10 mM 0.1768 mL 0.8840 mL 1.7679 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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