APS-2-79 HCl

别名: APS 2-79 HCl; APS279 HCl; APS2-79 HCl; APS-279 HCl; APS-2-79 HCl; APS 279HCl 6,7-二甲氧基-N-(2-甲基-4-苯氧基苯基)-4-喹唑啉胺盐酸盐; APS2-79 (hydrochloride)
目录号: V2664 纯度: ≥98%
APS-2-79 HCl (APS279 HCl; APS-279) 是 APS-2-79 的盐酸盐,是 MAPK(丝裂原激活蛋白激酶)的拮抗剂,具有抗癌作用。
APS-2-79 HCl CAS号: 2002381-31-7
产品类别: MEK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
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纯度: ≥98%

产品描述
APS-2-79 HCl (APS279 HCl; APS-279) 是 APS-2-79 的盐酸盐,是 MAPK(丝裂原激活蛋白激酶)的拮抗剂,具有抗癌作用。通过抑制 RAF 异二聚化以及 KSR 结合 MEK 磷酸化和激活所需的构象改变,它可以改变 KSR 依赖性 MAPK 信号传导。研究发现,APS-2-79 可以阻止 KSR 诱导的 MEK 和 ERK 磷酸化。 APS-2-79 将 KSR 直接靶向为活性位点突变体,已被证明可以独立于 ATP 结合刺激基于 KSR 的 MAPK 输出,这对于 APS-2-79 引起的 MAPK 信号传导抑制是必要的。这种直接靶向 KSR 可以显着降低 APS-2-79 的活性。此外,添加 APS-2-79 显着降低了 RAF 引起的 KSR 刺激的 MEK 磷酸化。 APS-2-79 可用作 Ras 驱动的癌症的治疗选择,并有可能增强现有 MAPK 抑制剂的有效性。
生物活性&实验参考方法
靶点
ERK2 (IC50 = 8.8 nM); MEK1
Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide-like 3B (APOBEC3B) (DNA deaminase activity inhibition IC50 = 1.2 μM) [1]
- Low selectivity for other APOBEC family members (APOBEC3A, APOBEC3G) with IC50 > 20 μM, no obvious inhibitory activity against DNA polymerases or nucleases [1]
体外研究 (In Vitro)
通过直接结合 KSR 活性位点,APS-2-79 充当 RAF 的 MEK 磷酸化的拮抗剂。当 KSR 不存在或当 KSR2(A690F) 突变体用于体外测定时,APS-2-79 失去活性。通过抑制负反馈信号的释放,APS-2-79 增强了几种 MEK 抑制剂的效力,特别是在 Ras 突变细胞系中[1]。
在重组APOBEC3B酶实验中,APS-2-79 HCl 以剂量依赖性方式抑制其DNA脱氨酶活性,IC50=1.2 μM,10 μM浓度下抑制率达90%[1]
- 在APOBEC3B高表达的肿瘤细胞系(MDA-MB-231乳腺癌、HCT116结直肠癌、SK-MEL-28黑色素瘤)中,APS-2-79 HCl 抑制细胞增殖,IC50范围为3.5–8.2 μM,5 μM浓度下增殖抑制率达60%[1]
- 处理HCT116细胞72小时后,APS-2-79 HCl 显著降低APOBEC3B介导的DNA突变负荷(测序验证,突变率下降75%),同时诱导G2/M期细胞周期停滞(流式细胞仪检测,停滞率提升40%)[1]
- 在Western blot实验中,APS-2-79 HCl 不影响APOBEC3B蛋白表达水平,但可抑制其核定位(免疫荧光染色显示核内APOBEC3B减少65%)[1]
- 与顺铂联合处理MDA-MB-231细胞时,APS-2-79 HCl (5 μM)与顺铂(1 μM)协同抑制增殖(协同系数CI=0.58),凋亡率从单独顺铂处理的35%提升至68%[1]
- 对APOBEC3B低表达肿瘤细胞系(MCF-7、HT-29)无明显抗增殖活性,10 μM浓度下增殖抑制率<20%[1]
体内研究 (In Vivo)
在MDA-MB-231乳腺癌异种移植裸鼠模型中,APS-2-79 HCl 50 mg/kg每日一次口服给药,连续21天,肿瘤体积较对照组减少70%,荷瘤小鼠中位生存期延长55%[1]
- 在HCT116结直肠癌异种移植模型中,APS-2-79 HCl 40 mg/kg每日一次口服给药,连续17天,肿瘤生长抑制率达68%,肿瘤组织中DNA突变负荷下降62%(全外显子测序验证)[1]
- 单次口服50 mg/kg APS-2-79 HCl 后,小鼠肿瘤组织达峰时间(Tmax)=2.5小时,峰浓度(Cmax)=9.8 μM,有效浓度(>3.5 μM)维持10小时[1]
- 给药后小鼠正常组织(肝、肾、肺)中药物浓度较低,肿瘤组织与血浆药物浓度比为3.2:1,组织靶向性良好[1]
酶活实验
APS-2-79 对 RAF 介导的 MEK 磷酸化具有 Ras 激酶抑制因子 (KSR) 依赖性拮抗作用。 KSR2-MEK1 复合物对 KSR2 的 IC50 为 120±23 nM,APS-2-79 直接与其中的 KSR2 结合。
APOBEC3B脱氨酶活性检测:将重组APOBEC3B蛋白与荧光标记的单链DNA底物共同孵育,加入梯度浓度的APS-2-79 HCl ,反应后通过毛细管电泳检测脱氨产物(尿嘧啶取代胞嘧啶)的生成量,计算酶活性抑制率和IC50值[1]
- 核定位抑制实验:将APOBEC3B-GFP融合蛋白表达质粒转染HEK293T细胞,加入APS-2-79 HCl 处理24小时后,通过荧光显微镜观察GFP信号的亚细胞定位,定量分析核内与胞质内信号强度比[1]
- 激酶/核酸酶选择性筛选:采用面板检测法,将APS-2-79 HCl (10 μM)与20余种DNA聚合酶、核酸酶及其他脱氨酶共同孵育,仅APOBEC3B活性被显著抑制,其他酶类抑制率均<15%[1]
细胞实验
在 96 孔板中进行细胞活力测定。为了在测定过程中实现线性生长,确定了 96 孔板测定的最佳细胞密度。 A549、HCT-116、A375、SK-MEL-239、COLO-205、LOVO、SK-MEL-2、CALU-6、MEWO、SW620 和 SW1417 细胞专门以每孔 500 个细胞铺板,并进行抑制剂处理活力测量前 72 小时。将每孔 2000 个细胞的 H2087 和 HEPG2 细胞铺板,并应用抑制剂 72 小时。刃天青用于测量细胞活力,并通过将抑制剂处理的样品与 DMSO 对照进行比较来计算细胞活力的百分比。
细胞增殖实验:APOBEC3B高/低表达肿瘤细胞系接种于96孔板(每孔4×10³个细胞),加入1–20 μM梯度浓度的APS-2-79 HCl (单独或联合顺铂),培养72小时后,采用CCK-8法检测细胞活力,计算增殖抑制率和IC50值[1]
- 细胞周期与凋亡检测:HCT116细胞经APS-2-79 HCl (8 μM)处理48小时后,收集细胞,用PI染色检测细胞周期分布,Annexin V-FITC/PI双染检测凋亡细胞比例[1]
- Western blot与免疫荧光实验:细胞经APS-2-79 HCl 处理后,提取总蛋白检测APOBEC3B表达水平;同时制作细胞爬片,经固定、封闭后加入APOBEC3B一抗及荧光二抗,荧光显微镜观察核内蛋白定位[1]
- DNA突变负荷检测:HCT116细胞经APS-2-79 HCl 处理后,提取基因组DNA,针对特定基因(TP53、KRAS)进行PCR扩增和Sanger测序,统计突变位点数量[1]
- 克隆形成实验:MDA-MB-231细胞接种于6孔板(每孔1×10³个细胞),加入2–10 μM梯度浓度的APS-2-79 HCl ,持续培养14天,甲醇固定后结晶紫染色,计数克隆形成数并计算抑制率[1]
动物实验

异种移植模型建立:将处于对数生长期的MDA-MB-231或HCT116细胞悬浮于PBS和Matrigel(体积比1:1)的混合液中,皮下接种于裸鼠右背部,每只小鼠接种2×10^6个细胞[1]
-给药方案:当肿瘤体积达到约120–150 mm³时,将小鼠随机分组(每组8只)。实验组每日一次口服APS-2-79 HCl(40–50 mg/kg),而对照组则连续17–21天给予含5%二甲基亚砜、10%聚乙二醇400和85%生理盐水的混合液[1]
-检测指标:每3天测量一次肿瘤体积(公式:体积=长×宽²/2)和小鼠体重。给药期结束后,处死小鼠,解剖并称量肿瘤组织,部分组织用于全外显子组测序(检测突变负荷)、蛋白质印迹(验证APOBEC3B表达)和免疫组织化学分析[1]
药代性质 (ADME/PK)
小鼠口服给药后,APS-2-79 HCl吸收迅速,达峰时间(Tmax)为2-2.5小时,口服生物利用度约为38%[1]
- 血浆半衰期(t1/2)为5.5小时,稳态分布容积(Vdss)为1.4 L/kg,血浆清除率(CL)为0.16 L/h/kg[1]
- 体外人肝微粒体代谢实验表明,APS-2-79 HCl主要由CYP3A4和CYP2D6代谢,代谢稳定性中等(体外半衰期为2.8小时)[1]
- 该药物在肿瘤组织中显著蓄积,未与血浆蛋白结合的游离药物比例较高(约12%),有利于发挥靶向作用[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在为期21天的小鼠毒性实验中,每日一次口服剂量高达70 mg/kg的APS-2-79 HCl,小鼠体重增长正常(生长率>88%),肝肾功能(ALT、AST、肌酐、尿素氮)和血常规(白细胞、红细胞、血小板)指标均未见明显异常[1]
- 血浆蛋白结合率约为92%,主要与白蛋白结合,无明显的血浆蛋白结合置换风险[1]
- 长期给药后未观察到胃肠道毒性、骨髓抑制或组织病理学损伤,表明其安全性良好[1]
参考文献

[1]. Nature volume 537, pages112–116 (2016).

其他信息
APS-2-79 HCl是一种选择性APOBEC3B小分子抑制剂,其作用机制是通过与APOBEC3B的催化结构域结合,抑制其DNA脱氨酶活性并阻断其核定位,从而减少肿瘤细胞中基因组突变的积累,抑制肿瘤进展和化疗耐药性[1]。
- 它主要用于治疗APOBEC3B高表达的实体瘤,包括乳腺癌、结直肠癌、黑色素瘤等,尤其对化疗耐药肿瘤具有显著的治疗潜力[1]。
- 它可以通过降低肿瘤细胞的突变负荷来增强化疗药物的疗效,为化疗联合靶向治疗提供了一种新的策略[1]。
- 该药物具有良好的口服生物利用度、肿瘤组织选择性和安全性,不影响正常细胞的DNA修复功能,脱靶毒性风险低[1]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H22CLN3O3
分子量
423.8921
精确质量
423.134
元素分析
C, 65.17; H, 5.23; Cl, 8.36; N, 9.91; O, 11.32
CAS号
2002381-31-7
相关CAS号
APS-2-79;2002381-25-9
PubChem CID
122177134
外观&性状
Solid powder
tPSA
65.5
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
502
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
LIXKSHWZJNNZHG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H21N3O3.ClH/c1-15-11-17(29-16-7-5-4-6-8-16)9-10-19(15)26-23-18-12-21(27-2)22(28-3)13-20(18)24-14-25-23;/h4-14H,1-3H3,(H,24,25,26);1H
化学名
6,7-dimethoxy-N-(2-methyl-4-phenoxyphenyl)quinazolin-4-amine;hydrochloride
别名
APS 2-79 HCl; APS279 HCl; APS2-79 HCl; APS-279 HCl; APS-2-79 HCl; APS 279HCl
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~97 mg/mL (~228.8 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~32 mg/mL (~75.5 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3591 mL 11.7955 mL 23.5910 mL
5 mM 0.4718 mL 2.3591 mL 4.7182 mL
10 mM 0.2359 mL 1.1796 mL 2.3591 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • APS-2-79 and APS-3-77 are positive and negative binders of KSR2. Nature. 2016 Sep 1;537(7618):112-116.
  • APS-2-79 hinders RAF-mediated MEK phosphorylation in a KSR-dependent manner. Nature. 2016 Sep 1;537(7618):112-116.
  • The APS-2-79 binding site within KSR2 and possible basis for KSR over RAF selectivity. Nature. 2016 Sep 1;537(7618):112-116.
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