| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 500mg | ||
| 1g | ||
| Other Sizes |
| 靶点 |
VHL; FKBP12F36V fusion protein
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|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
FKBP12F36V-Nluc 在 293FT FKBP12F36V-Nluc 或 FKBP12WT-Nluc 细胞上不会被 dTAGV-1-NEG(1-10 µM;24 小时)降解 [1]。 PATU-8902 FKBP12F36V-KRASG12V 和 KRAS−/− 细胞在响应 dTAGV-1-NEG(500 nM;24 小时)时不会表现出 KRASG12V 蛋白降解 [1]。
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| 细胞实验 |
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: PATU-8902 FKBP12F36V-KRASG12V、KRAS−/− 细胞 测试浓度: 50、500 nM 孵育时间:24小时 实验结果:不诱导KRASG12V蛋白的降解。 细胞活力测定[1] 细胞类型: EWS502 FKBP12F36V-GFP 细胞 测试浓度: 1 μM 孵育时间:0、2、4、6、8天 实验结果:细胞相对生长与对照组相同,高于dTAGV-1处理组。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
化学生物学策略,例如降解标签(dTAG)系统,可直接扰乱蛋白质稳态,与基因方法相比具有时间优势,并且比小分子抑制剂具有更高的选择性。我们描述了dTAGV-1,一种特异性VHL募集dTAG分子,可快速降解FKBP12F36V标记的蛋白质。dTAGV-1克服了先前报道的CRBN募集dTAG分子降解难降解癌基因的局限性,支持联合降解剂研究,并有助于在细胞和小鼠中研究蛋白质功能。[1]
我们报道了dTAGV-1,一种高效且特异性VHL募集的FKBP12F36V标记蛋白质降解剂。dTAGV-1具有更优的药代动力学/药效学特性,可作为体内应用的优化工具。通过对PDAC模型中突变型KRAS降解的评估,我们发现CRBN或VHL均可被协同利用,以缓解由该癌蛋白协调的异常信号传导。相反,我们观察到这些E3泛素连接酶复合物降解EWS/FLI的能力存在情境差异。这与我们最近的报告一致,该报告显示,在HCT116细胞中,dTAGV-1能够有效降解核心介导亚基(MED14),而CRBN募集的dTAG分子在该细胞中无效。我们观察到,MED14的快速降解会阻断谱系特异性转录回路。总之,我们的研究支持使用dTAGV-1来克服dTAG系统目前的局限性,从而能够评估难以被CRBN募集的dTAG分子降解的融合蛋白的直接效应。 [1] 我们利用dTAGV-1研究EWS/FLI,结果表明VHL介导的EWS/FLI降解能够快速改变下游靶蛋白的表达,并导致尤文氏肉瘤细胞出现明显的生长缺陷,从而为研究EWS/FLI缺失的直接后果提供了一个强有力的模型系统。该数据支持使用直接作用的异双功能降解剂或分子胶来靶向降解EWS/FLI可能是一种可行的策略,并揭示了与BET溴结构域降解剂联合使用的潜在策略。本研究提供的dTAG分子及其配对对照将有助于评估针对更广泛靶点的精确翻译后蛋白去除的功能后果。dTAG系统能够快速调控蛋白丰度,并可作为一种多功能策略,用于确定靶向降解是否是针对特定靶点在体外和体内进行药物开发的有效方法。[1] |
| 分子式 |
C68H90N6O14S
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|---|---|
| 分子量 |
1247.53901815414
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| 精确质量 |
1246.623
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| 元素分析 |
C, 65.47; H, 7.27; N, 6.74; O, 17.95; S, 2.57
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| CAS号 |
2451573-87-6
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| 相关CAS号 |
2624313-15-9 (dTAGV-1 TFA); 2624313-16-0 (dTAGV-1 hydrochloride); 2451573-87-6 (dTAGV-1-NEG)
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| PubChem CID |
154828676
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| LogP |
10.1
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| tPSA |
271
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| 氢键供体(HBD)数目 |
4
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| 氢键受体(HBA)数目 |
16
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| 可旋转键数目(RBC) |
32
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| 重原子数目 |
89
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| 分子复杂度/Complexity |
2210
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| 定义原子立体中心数目 |
7
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| SMILES |
CC[C@@H](C1=CC(=C(C(=C1)OC)OC)OC)C(=O)N2CCCC[C@H]2C(=O)O[C@H](CCC3=CC(=C(C=C3)OC)OC)C4=CC=CC=C4OCC(=O)NCCCCCCC(=O)N[C@H](C(=O)N5C[C@H](C[C@@H]5C(=O)N[C@@H](C)C6=CC=C(C=C6)C7=C(N=CS7)C)O)C(C)(C)C
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| InChi Key |
ANLKEOUWAHUESE-SVUPEXKHSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C68H90N6O14S/c1-12-49(47-36-57(84-9)61(86-11)58(37-47)85-10)65(79)73-34-20-18-22-51(73)67(81)88-54(31-25-44-26-32-55(82-7)56(35-44)83-8)50-21-16-17-23-53(50)87-40-60(77)69-33-19-14-13-15-24-59(76)72-63(68(4,5)6)66(80)74-39-48(75)38-52(74)64(78)71-42(2)45-27-29-46(30-28-45)62-43(3)70-41-89-62/h16-17,21,23,26-30,32,35-37,41-42,48-49,51-52,54,63,75H,12-15,18-20,22,24-25,31,33-34,38-40H2,1-11H3,(H,69,77)(H,71,78)(H,72,76)/t42-,48-,49-,51-,52+,54+,63+/m0/s1
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| 化学名 |
[(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[2-[2-[[7-[[(2S)-1-[(2R,4S)-4-hydroxy-2-[[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-7-oxoheptyl]amino]-2-oxoethoxy]phenyl]propyl] (2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carboxylate
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| 别名 |
dTAGV-1-NEG; 2451573-87-6; [(1R)-3-(3,4-Dimethoxyphenyl)-1-[2-[2-[[7-[[(2S)-1-[(2R,4S)-4-hydroxy-2-[[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-7-oxoheptyl]amino]-2-oxoethoxy]phenyl]propyl] (2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carboxylate; SCHEMBL25887266;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 0.8016 mL | 4.0079 mL | 8.0158 mL | |
| 5 mM | 0.1603 mL | 0.8016 mL | 1.6032 mL | |
| 10 mM | 0.0802 mL | 0.4008 mL | 0.8016 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。