GNE684

别名: GNE-684; GNE 684; GNE684; 2438637-64-8; CHEMBL5208359; (5S)-N-[(3S)-7-Methoxy-1-methyl-2-oxo-4,5-dihydro-3H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl]-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; (5S)-N-[(3S)-7-methoxy-1-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl]-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; rel-(S)-N-((S)-7-Methoxy-1-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl)-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; SCHEMBL25798914; GTPL13107; GNE684
目录号: V2133 纯度: ≥98%
GNE684 是一种新型有效的受体相互作用蛋白 1 (RIP1) 抑制剂,它对人 RIP1 的抑制作用强于小鼠和大鼠,IC50 分别为 21 nM、189 nM 和 691 nM。
GNE684 CAS号: 2438637-64-8
产品类别: Others 8
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纯度: ≥98%

产品描述
GNE684(GNE-684)是一种新型高效的受体相互作用蛋白1 (RIP1) 抑制剂,其对人RIP1的抑制效力显著高于小鼠和大鼠,IC50值分别为21 nM、189 nM和691 nM。激酶RIP1参与多种信号通路,调控炎症反应,并可诱导细胞凋亡和坏死性凋亡。其激酶活性与多种炎症性疾病、神经退行性疾病和肿瘤性疾病相关。GNE684是受体相互作用蛋白1 (RIP1) 的高效抑制剂,RIP1是坏死性凋亡和炎症信号传导的关键调节因子。它对人RIP1的表观Ki值为21 nM,对小鼠RIP1 (189 nM) 和大鼠RIP1 (691 nM) 的抑制效力略低。 GNE684已被证实能够抑制体内肠上皮细胞中由NEMO缺陷引起的结肠炎和回肠炎。该化合物是研究RIP1在坏死性凋亡、炎症和免疫介导疾病中作用的重要工具。
生物活性&实验参考方法
靶点
Receptor interacting protein 1 (RIP1)
GNE684 targets receptor-interacting protein 1 (RIP1), a serine/threonine-protein kinase that plays a central role in the regulation of cell death and inflammation. RIP1 is a key upstream activator of necroptosis (a form of programmed necrosis) and also regulates NF-κB-mediated inflammatory signaling. Inhibition of RIP1 kinase activity blocks necroptosis and reduces inflammatory cytokine production. GNE684 potently inhibits human RIP1 with an apparent Ki of 21 nM. The compound's species selectivity (higher potency for human vs. mouse and rat RIP1) is important for interpreting preclinical studies.
体外研究 (In Vitro)
在多种人和动物细胞系中,GNE684(20 μM;20 小时)能有效抑制 RIP1 激酶驱动的细胞死亡[1]。GNE684(20 μM;0-60 分钟)能抑制 TBZ(2 μM BV6、20 ng/ml TNF、20 μM zVAD)诱导的 RIP1 自磷酸化,以及 RIP3 自磷酸化和 RIP3 介导的 MLKL 磷酸化[1]。GNE684 对人 RIP1 具有强效抑制作用,表观 Ki 值为 21 nM。该化合物对小鼠 RIP1(189 nM)和大鼠 RIP1(691 nM)的抑制效力较低。在细胞实验中,GNE684 能阻断 RIP1 激酶活性,从而阻止 TNF-α 和其他刺激诱导的坏死性凋亡。该化合物还能抑制RIP1依赖的炎症信号通路,包括NF-κB激活和细胞因子生成。GNE684的体外活性已在多种细胞系中得到验证,证实其作为选择性RIP1激酶抑制剂的作用机制。
体内研究 (In Vivo)
此外,在KPP或KPR(LSL-Kras G12D/+;p16/p19 fl/wt;Trp53 R270H/wt;Pdx1-cre)PDAC模型中,GNE684对总生存期或肿瘤生长均无影响[1]。缺乏NEMO的肠上皮细胞(IECs)是结肠炎和回肠炎的来源,而GNE684(50 mg/kg;口服,每日两次)可抑制这些炎症[1]。体内研究表明,GNE684可抑制小鼠模型中由肠上皮细胞NEMO缺陷引起的结肠炎和回肠炎。口服GNE684(例如50 mg/kg,每日两次)可减轻这些模型中的肠道炎症和组织损伤。该化合物阻断RIP1介导的炎症的功效支持了RIP1抑制剂在炎症性肠病和其他免疫介导疾病治疗中的应用潜力。体内药效学研究证实了靶点结合和 RIP1 依赖性炎症通路的抑制。
酶活实验
体外酶/受体结合试验利用重组RIP1酶和合适的肽底物来测定GNE684对RIP1激酶活性的抑制作用。激酶活性可通过测量[γ-³²P]ATP中³²P掺入底物的情况,或使用发光ADP检测法(例如ADP-Glo)来评估。IC50或Ki值由剂量反应曲线确定。选择性评估通过筛选GNE684与一系列激酶的相互作用来确认其对RIP1的特异性。结合亲和力(Kd)可通过表面等离子共振(SPR)或使用荧光标记的RIP1抑制剂的竞争性结合试验来测定。
细胞实验
细胞活力检测[1]
细胞类型: L929 细胞、Jurkat 细胞、MEF 细胞
测试浓度: 20 μM
孵育时间: 20 小时
实验结果: 在多种人和小鼠细胞系中有效抑制了 RIP1 激酶驱动的细胞死亡。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型:HT-29细胞,J774A.1细胞
测试浓度:0 μM,20 μM
孵育时间:0分钟,15分钟,60分钟
实验结果:抑制TBZ(2 μM BV6,20 ng/ml TNF,20 μM zVAD)诱导的RIP1自磷酸化、RIP1与RIP3的相互作用、RIP3自磷酸化以及RIP3对MLKL的磷酸化。
在细胞系中进行GNE684的体外细胞实验,以评估其对RIP1依赖性坏死性凋亡和炎症信号的抑制作用。坏死性凋亡可通过TNF-α、SMAC模拟物和泛caspase抑制剂(TSZ)诱导,细胞死亡可通过碘化丙啶摄取、LDH释放或CellTiter-Glo检测进行评估。GNE684阻断坏死性凋亡的能力通过比较处理组和未处理组细胞的存活率来确定。RIP1依赖性NF-κB激活可通过检测IκBα的磷酸化和降解或通过报告基因检测进行评估。细胞因子(例如TNF-α、IL-6、IL-1β)的产生通过ELISA检测。
动物实验
动物/疾病模型: Nemofl/fl Villin.creERT2 小鼠 (NEMO IEC-KO)[1]
剂量: 50 mg/kg
给药途径: 口服;每日两次;第 2-6 天用他莫昔芬治疗
实验结果: 几乎完全保护了 NEMO 缺陷型肠道免受结肠炎和回肠炎的侵害。
使用 GNE684 进行体内动物研究是在炎症和坏死性凋亡的小鼠模型中进行的。使用 NEMO 缺陷型肠上皮细胞模型研究结肠炎和回肠炎,GNE684 以 50 mg/kg 的剂量口服,每日两次。通过组织学、炎症细胞因子水平和临床评分评估疾病严重程度。其他RIP1依赖性炎症模型可能包括TNF诱导的全身炎症反应综合征(SIRS)和缺血再灌注损伤模型。药效学终点包括评估组织中RIP1活性、坏死性凋亡标志物(例如磷酸化MLKL)和炎症细胞因子水平。
药代性质 (ADME/PK)
GNE684 的药代动力学特性已得到表征,以支持体内疗效研究。口服 50 mg/kg 后,该化合物可达到足以抑制 RIP1 的治疗性血浆浓度。该化合物的半衰期、清除率、分布容积和口服生物利用度已在临床前动物模型中测定。GNE684 显示出良好的口服吸收和合理的血浆暴露量。其代谢途径为肝细胞色素 P450 酶。药代动力学特征支持在临床前疗效研究中采用每日两次给药方案。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
GNE684的毒理学数据主要来源于小鼠模型的临床前疗效研究。在有效剂量(例如,每日两次,每次50 mg/kg)下,该化合物似乎耐受性良好,已发表的文献中未报道严重不良反应。然而,临床开发需要开展全面的毒理学研究,包括啮齿类和非啮齿类动物的遗传毒性、安全性药理学和重复给药毒性研究。作为一种RIP1抑制剂,鉴于RIP1在调节细胞死亡和炎症中的作用,其潜在的靶向毒性可能包括对免疫功能和组织稳态的影响。
参考文献

[1]. RIP1 inhibition blocks inflammatory diseases but not tumor growth or metastases. Cell Death Differ. 2019 May 17.

其他信息
激酶RIP1参与多种信号通路,调控炎症反应,并能诱导细胞凋亡和坏死性凋亡。其激酶活性与多种炎症性疾病、神经退行性疾病和肿瘤性疾病相关。本研究探讨了在小鼠中敲入催化失活的RIP1 D138N突变体以及使用强效鼠源抑制剂GNE684进行RIP1药理学抑制的效果。结果表明,RIP1抑制可减轻胶原抗体诱导的关节炎,并预防由Sharpin基因突变引起的皮肤炎症以及由Nemo基因缺失引起的肠上皮细胞结肠炎。相反,在Kras突变驱动的胰腺肿瘤模型中,RIP1抑制对肿瘤生长或存活没有影响,在B16黑色素瘤模型中也未减少肺转移。总之,我们的数据突显了RIP1激酶活性在某些炎症疾病模型中的作用,但也对其与肿瘤进展和转移的关联性提出了疑问。
GNE684是一种强效的RIP1激酶抑制剂,对人RIP1的表观Ki值为21 nM。它具有物种选择性,对小鼠(189 nM)和大鼠(691 nM)RIP1的抑制效力较低。GNE684已证实能有效抑制小鼠结肠炎和回肠炎模型。它是研究RIP1在坏死性凋亡和炎症中作用的科研工具。目前尚未有临床开发或监管审批的报道。该化合物可用于实验室研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H24N6O3
分子量
432.475064277649
精确质量
432.190988
元素分析
C, 63.88; H, 5.59; N, 19.43; O, 11.10
CAS号
2438637-64-8
PubChem CID
138377384
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
2.4
tPSA
102
SMILES
N1=C(C(N[C@H]2C(=O)N(C)C3C=NC(OC)=CC=3CC2)=O)N=C2CC[C@H](C3=CC=CC=C3)N12
InChi Key
JXFYROJRZJPKTQ-IRXDYDNUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H24N6O3/c1-28-18-13-24-20(32-2)12-15(18)8-9-16(23(28)31)25-22(30)21-26-19-11-10-17(29(19)27-21)14-6-4-3-5-7-14/h3-7,12-13,16-17H,8-11H2,1-2H3,(H,25,30)/t16-,17-/m0/s1
化学名
(5S)-N-[(3S)-7-methoxy-1-methyl-2-oxo-4,5-dihydro-3H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl]-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide
别名
GNE-684; GNE 684; GNE684; 2438637-64-8; CHEMBL5208359; (5S)-N-[(3S)-7-Methoxy-1-methyl-2-oxo-4,5-dihydro-3H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl]-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; (5S)-N-[(3S)-7-methoxy-1-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl]-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; rel-(S)-N-((S)-7-Methoxy-1-methyl-2-oxo-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[3,4-b]azepin-3-yl)-5-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-b][1,2,4]triazole-2-carboxamide; SCHEMBL25798914; GTPL13107; GNE684
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3122 mL 11.5612 mL 23.1225 mL
5 mM 0.4624 mL 2.3122 mL 4.6245 mL
10 mM 0.2312 mL 1.1561 mL 2.3122 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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