GSK-5959

别名: GSK-5959; GSK 5959; GSK5959 GSK5959 ; GSK 5959

目录号: V4084 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

GSK5959 是一种新型、有效、选择性和细胞渗透性的 BRPF1（含溴结构域和 PHD 指）溴结构域抑制剂，IC50 为 80 nM。

GSK-5959 CAS号: 901245-65-6
产品类别: Epigenetic Reader Domain

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

规格	价格	库存	数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes

加入购物车结帐大包装询价

020-31522723 sales@invivochem.cn

点击了解更多

与全球5000+客户建立关系
覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
产品被大量CNS顶刊文章引用

InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用

Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

纯度/质量控制文件

批次：

纯度: ≥98%

COA

MSDS

产品说明书

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
生物数据图片
相关产品

产品描述

GSK5959 是一种新型、有效、选择性和细胞渗透性 BRPF1（含溴结构域和 PHD 指）溴结构域抑制剂，IC50 为 80 nM。与 35 个其他溴结构域（包括 BRPF2/3 和 BET 家族溴结构域）相比，它对 BRPF1 的选择性高出 100 倍以上。 BRPF 蛋白家族是 MYST 组蛋白乙酰转移酶复合物组装的重要支架蛋白，参与基因表达的表观遗传调控，并与人类癌症有关。

生物活性&实验参考方法

靶点	Selectivity for the closely related family members BRPF2 (100-fold) and BRPF3 (>1000-fold) is also demonstrated by GSK-5959 (3a) [2]. EC50 = 0.98 μM is demonstrated by GSK-5959 (3a) in the cellular NanoBRET experiment [2]. There is no impact of GSK-5959 on TRIM24 SUMOylation [3].
体外研究 (In Vitro)	GSK-5959 也证明了对密切相关的家族成员 BRPF2（100 倍）和 BRPF3（>1000 倍）的选择性 (3a) [2]。 GSK-5959 (3a) 在细胞 NanoBRET 实验中证明 EC50 = 0.98 μM [2]。 GSK-5959 对 TRIM24 SUMOylation 没有影响 [3]。化合物3 在生化实验中表现出对BRPF1溴结构域强效且选择性的抑制。在细胞NanoBRET蛋白相互作用实验中，它能以微摩尔级效力（IC₅₀未给出具体数值，但显示了剂量反应曲线）剂量依赖性地破坏BRPF1溴结构域与组蛋白H3.3之间的相互作用。活性较弱的类似物 5 在此细胞实验中无效果。在包含35种溴结构域的结合实验面板（BROMOscan）中，该化合物对其他溴结构域（包括BET家族成员BRD2、BRD3、BRD4、BRDT以及密切相关的BRPF2和BRPF3）表现出优异的选择性。[1]
酶活实验	使用TR-FRET竞争结合实验测定化合物对BRPF1溴结构域和BRD4 BD1的结合亲和力。该实验通过测量荧光示踪剂从溴结构域上的 displacement 来计算。pIC₅₀值源自该实验生成的剂量反应曲线。[1] 使用¹⁵N–¹H HSQC NMR实验验证与BRPF1溴结构域的直接结合。化合物引起的乙酰化赖氨酸结合位点附近特定残基（如Ile652， Phe653）的化学位移扰动，证实了与靶点的结合。[1]
细胞实验	采用细胞NanoBRET实验来测量细胞内NanoLuc标记的BRPF1溴结构域从HaloTag标记的组蛋白H3.3上被置换的程度。该实验证明了化合物的细胞通透性及其对染色质相互作用的功能性破坏。用系列浓度化合物处理表达标记蛋白的细胞，通过测量BRET信号比来生成剂量反应曲线。[1]
药代性质 (ADME/PK)	Based on its activity in the NanoBRET assay, the compound is described as having cell permeability. [1]
参考文献	[1]. 1,3-Dimethyl Benzimidazolones Are Potent, Selective Inhibitors of the BRPF1 Bromodomain. (2014) ACS Med Chem Lett. 5(11):1190-1195. [2]. Development of small molecule inhibitors of BRPF1 and TRIM24 bromodomains Discovery Today: Technologies Volume 19, March 2016, Pages 65-71. [3]. Cross-talk between chromatin acetylation and SUMOylation of tripartite motif-containing protein 24 (TRIM24) impacts cell adhesionJ Biol Chem. 2018 May 11;293(19):7476-7485.
其他信息	Compound 3 is the first discovered highly efficient and selective BRPF1 bromine domain chemical probe. Its binding mode was elucidated by X-ray crystallography, which showed that the 1,3-dimethylbenzimidazolone core mimics acetylated lysine and forms key hydrogen bonds with Asn708 and Tyr665 of BRPF1. The N1-methyl group occupies a conserved acetylated lysine binding pocket. Its selectivity for BRPF2/3 is attributed to subtle differences near the binding site, possibly involving proline residues (Pro658 in BRPF1) versus serine/asparagine residues in BRPF2/3. This compound is available from certain commercial compound libraries. [1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式

C22H26N4O3

分子量

394.48

精确质量

394.2

元素分析

C, 66.99; H, 6.64; N, 14.20; O, 12.17

CAS号

901245-65-6

相关CAS号

901245-65-6

PubChem CID

15990224

外观&性状

Light yellow to yellow solid powder

密度

1.3±0.1 g/cm3

沸点

527.3±50.0 °C at 760 mmHg

闪点

272.7±30.1 °C

蒸汽压

0.0±1.4 mmHg at 25°C

折射率

1.636

LogP

2.35

tPSA

65.1

氢键供体(HBD)数目

氢键受体(HBA)数目

可旋转键数目(RBC)

重原子数目

分子复杂度/Complexity

609

定义原子立体中心数目

SMILES

O=C(C1C(OC)=CC=CC=1)NC1C(N2CCCCC2)=CC2N(C)C(N(C=2C=1)C)=O

InChi Key

LTUGYAOMCKNTGG-UHFFFAOYSA-N

InChi Code

InChI=1S/C22H26N4O3/c1-24-18-13-16(23-21(27)15-9-5-6-10-20(15)29-3)17(26-11-7-4-8-12-26)14-19(18)25(2)22(24)28/h5-6,9-10,13-14H,4,7-8,11-12H2,1-3H3,(H,23,27)

化学名

N-[2,3-Dihydro-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(1-piperidinyl)-1H-benzimidazol-5-yl]-2-methoxybenzamide

别名

GSK-5959; GSK 5959; GSK5959

HS Tariff Code

2934.99.9001

存储方式

Powder -20°C 3 years

4°C 2 years

In solvent -80°C 6 months

-20°C 1 month

运输条件

Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)

DMSO:≥ 10 mg/mL

Water:N/A

Ethanol:N/A

溶解度 (体内实验)

注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)

注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil)
示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。

View More

注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备（4°C，储存1周）：将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中，得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如： 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精)→ 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如： 50 μL DMSO → 100 μL PEG300 → 200 μL Castor oil → 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10： 10 : 80 (如： 100 μL Ethanol → 100 μL Cremophor → 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL EtOH → 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL EtOH → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline)

口服配方

口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。

View More

口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合

注意: 以上为较为常见方法，仅供参考， InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型，对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物，需通过前期实验来确定（建议先取少量样品进行尝试），包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.5350 mL	12.6749 mL	25.3498 mL
	5 mM	0.5070 mL	2.5350 mL	5.0700 mL
	10 mM	0.2535 mL	1.2675 mL	2.5350 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

(A) Fragment1. (B) Lower: STD spectrum of fragment1with 5 μM BRD4(1–477).ACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5.
X-ray structure of BRPF1 with3, showing lipophilic interactions between the 5- and 6-substituents and the protein (E655 and E661) as yellow dotted lines.ACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5

GSK-5959

(A) X-ray structure of BRPF1/compound3(blue) and of BRD4 BD1 (orange)/fragment1 (green). (B) The complex of BRPF1 with3(blue) compared to apo BRPF1 (green, PDB codeACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5.

BRPF1 isoform 1 bromodomain NanoBRET dose–response curves of (A) compound3and (B) analogue5.ACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5.
15N–1H HSQC chemical shift of residues Ile652 and Phe653 of the BRPF1 bromodomain (red), which move on the addition of 1 mM1(blue),2(green), or3(orange).ACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5.
Selectivity of initial 1,3-dimethyl benzimidazolones for BRPF1 over BRD4 BD1, with the line of unity (dashed).ACS Med Chem Lett.2014 Sep 10;5(11):1190-5.