Ebvaciclib (PF-06873600)

别名: PF06873600; Ebvaciclib; PF 06873600; PF-06873600 依瓦西里布
目录号: V4452 纯度: ≥98%
Ebvaciclib (PF-06873600; PF06873600) 是一种新型、有效、选择性和口服生物可利用的细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 泛抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
Ebvaciclib (PF-06873600) CAS号: 2185857-97-8
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
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纯度: ≥98%

产品描述
Ebvaciclib (PF-06873600; PF06873600) 是一种新型、有效、选择性和口服生物可利用的细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 泛抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 CDK2、CDK4 和 CDK6,Ki 值分别为 0.09 nM、0.13 nM 和 0.16 nM。 PF-06873600 通过选择性结合并抑制 CDK 的活性而表现出抗肿瘤活性。抑制这些激酶会导致细胞周期停滞、诱导细胞凋亡和抑制肿瘤细胞增殖。 CDK 是 ATP 依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶,是细胞周期进程和细胞增殖的重要调节因子,在肿瘤细胞中经常过度表达。
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK2 (Ki = 0.1 nM); CDK6 (Ki = 0.1 nM); CDK4 (Ki = 1.2 nM)
CDK2 (Ki = 0.13 nM), CDK4 (Ki = 1.25 nM), CDK6 (Ki = 0.11 nM).
CDK1 (Ki = 4.5 nM, resulting in ~35-fold selectivity vs. CDK2).
CDK9 (Ki = 19.6 nM, resulting in high selectivity).
Also shows activity against CDK2/cyclinE1, CDK4/cyclinD1, and CDK6/cyclinD1 complexes. [1]
体外研究 (In Vitro)
PF-06873600 (PF06873600) 是一种新型、有效、选择性和口服生物可利用的细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 CDK2、CDK4 和 CDK6,Ki 值分别为 0.09 nM、0.13 nM 和 0.16 nM。 PF-06873600 通过选择性结合并抑制 CDK 的活性而表现出抗肿瘤活性。抑制这些激酶会导致细胞周期停滞、诱导细胞凋亡和抑制肿瘤细胞增殖。 CDK 是 ATP 依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶,是细胞周期进程和细胞增殖的重要调节因子,在肿瘤细胞中经常过度表达。 PF-06873600(实施例8)是一种口服生物可利用的细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性[1]。 PF-06873600 选择性地靶向、结合并抑制 CDK 的活性。抑制这些激酶会导致细胞周期停滞、诱导细胞凋亡和抑制肿瘤细胞增殖。 CDK(ATP 依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶)是细胞周期进程和细胞增殖的重要调节因子,在肿瘤细胞中经常过度表达[2]。
PF-06873600 在 OVCAR3 卵巢癌细胞中抑制 RB1(Ser807/811位点)磷酸化,EC50 为 19 nM。
抑制 OVCAR3 细胞增殖的 EC50 为 45 nM。
在三阴性乳腺癌 HCC1806 细胞的细胞靶点占据实验中,PF-06873600 置换共价探针 (XO44) 与 CDK2 结合的 OC50 为 9 nM,与 CDK1 结合的 OC50 为 597 nM,表明在细胞水平对 CDK2 的选择性约为 CDK1 的 60 倍。
在浓度高达约 100 nM 时,诱导 OVCAR3 细胞 G1 期周期阻滞;在更高浓度下引起 G1 和 G2 期混合阻滞。
值得注意的是,CDK4/6抑制剂如palbociclib在这些CDK2驱动的细胞系中无活性。[1]
体内研究 (In Vivo)
在携带 OVCAR3 肿瘤的小鼠中,口服给予 PF-06873600 抑制肿瘤细胞中 RB1 磷酸化,EC50 为 40 nM。
在 OVCAR3 模型肿瘤生长抑制研究中,以 50 mg/kg 每日两次口服给药作为单药,显示 90% 的肿瘤生长抑制。
在 FBXW7 突变的非小细胞肺癌患者来源异种移植模型中,PF-06873600(30 mg/kg,每日两次口服)在 CTG-0464 模型中显示 93% 的生长抑制,在 CTG-0192 模型中显示 103% 的生长抑制。[1]
酶活实验
CDK/cyclin 激酶复合物的生化效力 (Ki) 通过移动位移测定法进行。该检测通过毛细管电泳在微流体环境中监测荧光标记肽底物被激酶磷酸化的过程。对于 CDK6/cyclinD1,反应体系包含 3 μM 荧光标记的肽底物,并在预孵育后加入 2 mM ATP 启动反应。通过将数据拟合至 Morrison 方程计算抑制常数。对于 CDK1、CDK2、CDK4 和 CDK9 复合物使用了类似的 MSA 形式。对于 GSK3β,反应监测另一个荧光标记肽的磷酸化,并用 40 μM ATP 启动反应。[1]
细胞实验
磷酸化RB1 ELISA实验: 将OVCAR3细胞接种并用羟基脲处理过夜使其同步于G1/S期。然后用测试化合物处理细胞1小时。裂解细胞,将裂解液转移至预先包被了抗磷酸化Ser807/811 RB1抗体的ELISA板中孵育过夜。洗涤后,使用相应的抗体检测总RB1,接着使用HRP标记的二抗和化学发光底物。测量化学发光信号,计算 IC50/EC50 值。[1]
抗增殖实验 (CyQUANT): 将OVCAR3细胞接种于96孔板,用测试化合物处理6天。使用荧光核酸染料测定相对活细胞数。测量荧光值,并使用非线性回归曲线拟合计算IC50值。[1]
细胞靶点占据实验: 将Kuramochi或HCC1806细胞与化合物预孵育,然后用广谱共价激酶探针XO44处理。裂解细胞,与生物素标记的叠氮化物进行铜催化的叠氮-炔环加成反应。用链霉亲和素珠富集、洗脱并进行SDS-PAGE后,通过Western blot定量化合物在不同CDK亚型上的占据率,从而计算OC50值。[1]
动物实验
荷瘤小鼠
50 mg/kg
口服
小鼠单剂量药代动力学:PF-06873600配制于10% N-甲基-2-吡咯烷酮 (NMP)/40% 聚乙二醇300 (PEG 300)/50% 10 mM 柠檬酸盐缓冲液中。小鼠 (n=3) 分别经尾静脉单次静脉注射(3 mg/kg)或灌胃单次口服(10 mg/kg)。在指定时间点采集血样。采用液相色谱-串联质谱法 (LC-MS/MS) 测定血浆药物浓度。 [1]
犬单剂量药代动力学研究:PF-06873600配制成静脉注射剂型(10% NMP/40% PEG 300/50% 10 mM 柠檬酸盐缓冲液,0.5 mg/mL)和口服剂型(0.5% 甲基纤维素和 0.1% 表面活性剂,0.5 mg/mL)。两只犬分别经头静脉单次静脉注射(0.25 mg/kg)或灌胃单次口服(0.5 mg/kg)。连续采集血样,并采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定血浆药物浓度。[1]
肿瘤生长抑制研究:将来自 Champions TumorGraft PDX 模型(CTG-0192、CTG-0464)的肿瘤组织块植入免疫缺陷雌性小鼠体内。当平均肿瘤体积达到 150-300 mm³ 时,将小鼠随机分为载体对照组和 PF-06873600 组(30 mg/kg)(n=5),并每日两次(BID)口服给药。定期测量肿瘤体积和体重。研究持续进行,直至对照组的平均肿瘤体积达到 1500 mm³ 或第 60 天。[1]
药代性质 (ADME/PK)
PF-06873600是一种中性分子,具有以下理化性质:分子量 = 471.5,pH 7.4 时的 SFlogD = 1.9,总极性表面积 = 126,氢键供体 = 2,氢键受体 = 5,pH 7.4 时的溶解度 = 265 μM。
在采用低外排细胞系进行的体外试验中,该化合物表现出较高的被动渗透性(AB ~14 × 10⁻⁶ cm/s)。
在小鼠中:血浆清除率 (CLp) = 63 mL/min/kg,分布容积 (Vss) = 0.9 L/kg,口服生物利用度 (F) = 13%。
在犬中:CLp = 8.4 mL/min/kg,Vss = 1.1 L/kg,F = 59%。
达到最大血浆浓度所需时间小鼠体内药物浓度峰值(Tmax)为 0.25 小时,犬体内为 1 小时。吸收率高(小鼠 fFa 约为 1.0,犬为 0.8)。
PF-06873600 的人肝微粒体(HLM)清除率(Clint,app)< 10.8 μL/min/mg。[1]
参考文献

[1]. J Med Chem . 2021 Jul 8;64(13):9056-9077.

其他信息
依伐西利是一种口服生物利用度高的细胞周期蛋白依赖性激酶 (CDK) 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。给药后,依伐西利选择性地靶向、结合并抑制 CDK 的活性。抑制这些激酶可导致细胞周期阻滞、诱导细胞凋亡并抑制肿瘤细胞增殖。CDK 是 ATP 依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶,是细胞周期进程和增殖的重要调控因子,在肿瘤细胞中经常过表达。
PF-06873600 是一种强效且选择性的 CDK2、CDK4 和 CDK6 抑制剂,通过基于结构的药物设计和 Free-Wilson 分析发现。其设计目的是通过同时靶向 CDK2 来克服对选择性 CDK4/6 抑制剂的潜在耐药性,CDK2 可作为一种补偿机制发挥作用。该化合物含有一个(1R,2R)-2-羟基-2-甲基环戊基基团,分子动力学模拟表明,该基团赋予其高亲脂性和对CDK9的选择性。PF-06873600于2018年进入I期临床试验,用于治疗癌症。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H27F2N5O4S
分子量
471.521290063858
精确质量
471.18
元素分析
C, 53.99; H, 7.29; N, 13.69; O, 12.51; S, 12.53
CAS号
2185857-97-8
相关CAS号
PF-06873600 HCl;2185857-97-8;2185859-59-8 (SS-isomer);
PubChem CID
134247638
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
1.4
tPSA
124
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
859
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C[C@]1(CCC[C@H]1N2C3=NC(=NC=C3C=C(C2=O)C(F)F)NC4CCN(CC4)S(=O)(=O)C)O
InChi Key
QIEKHLDZKRQLLN-FOIQADDNSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H27F2N5O4S/c1-20(29)7-3-4-15(20)27-17-12(10-14(16(21)22)18(27)28)11-23-19(25-17)24-13-5-8-26(9-6-13)32(2,30)31/h10-11,13,15-16,29H,3-9H2,1-2H3,(H,23,24,25)/t15-,20-/m1/s1
化学名
6-(difluoromethyl)-8-[(1R,2R)-2-hydroxy-2-methylcyclopentyl]-2-[(1-methylsulfonylpiperidin-4-yl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
别名
PF06873600; Ebvaciclib; PF 06873600; PF-06873600
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1208 mL 10.6040 mL 21.2080 mL
5 mM 0.4242 mL 2.1208 mL 4.2416 mL
10 mM 0.2121 mL 1.0604 mL 2.1208 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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