Phleomycin

别名: 腐草霉素;(博莱霉素);博莱霉素; 腐草霉素(抗菌防腐剂); 腐草霉素PHLEOMYCIN (POWDER);在链霉菌中发现的广谱糖肽类抗生素,源于链霉菌。与博莱霉素类似, 是一种DNA 裂解剂, 与 DNA 结合并插入, 破坏双螺旋结构
目录号: V7480 纯度: =90.9%
Phleomycin 是链霉菌中发现的一种糖肽抗生素(抗生素),具有抗肿瘤活性,并可导致 DNA 断裂。
Phleomycin CAS号: 11006-33-0
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
50mg
100mg
250mg
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纯度/质量控制文件

纯度: =90.9%

产品描述
博来霉素是一种存在于链霉菌中的糖肽类抗生素,具有抗肿瘤活性,并能导致DNA断裂。与博来霉素类似,它能与DNA结合并插入其中,破坏双螺旋结构的完整性。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA: Phleomycin is an anticancer glycopeptide antibiotic that causes DNA cleavage. The mechanism involves DNA degradation, leading to cell death. [1]
体外研究 (In Vitro)
DNA切割活性:在没有添加辅助因子的情况下,博来霉素本身并不能有效催化质粒DNA的切割。然而,在二硫苏糖醇(DTT)、谷胱甘肽(GSH)、2-巯基乙醇或抗坏血酸等单电子还原剂存在的情况下,它可以诱导单链和双链DNA损伤。在1 mM抗坏血酸存在下,超螺旋质粒DNA(pBR322)降解为线性形式(III型)的速率达到最大值。[1] DNA切割动力学:在pH 7.4的条件下,当存在0.01 mM博来霉素和1 mM抗坏血酸时,观察到超螺旋DNA(I型)随时间降解为缺口环状DNA(II型),最终降解为线性DNA(III型)。该过程表明单链断裂的积累最终导致双链断裂。[1]
活性氧(ROS)的生成:在辅因子(H₂O₂、抗坏血酸、谷胱甘肽、2-巯基乙醇、二硫苏糖醇)存在下,博来霉素会产生活性氧,包括羟基自由基(•OH),而羟基自由基是导致DNA断裂的原因。DMSO(一种•OH清除剂)和NaN₃(一种单线态氧清除剂)抑制了DNA断裂,证实了ROS的参与。 [1]
羟基自由基生成速率:在pH 7.4和37°C条件下,于0.01 mM博来霉素和1 mM辅因子存在下,测定了NDMA(一种羟基自由基清除剂)分解的准一级反应速率常数(kobs × 10⁻² [s⁻¹]):抗坏血酸(1.73)、谷胱甘肽(2.26)、2-巯基乙醇(2.52)和二硫苏糖醇(5.48)。二硫苏糖醇表现出最高的•OH生成速率,60分钟后可分解近85%的NDMA。[1]
药代性质 (ADME/PK)
金属离子配位:博来霉素天然存在,并以铜(II)配合物的形式商业化销售。本研究详细表征了Cu(II)的结合过程。电位滴定表明,博来霉素表现为七质子酸(H₇L),释放7个质子。测定了各种官能团的酸解离常数(pKa):嘧啶氮(~1.7)、噻唑氮(~1.8)、噻唑啉氮(~2.7)、咪唑氮(6.38)、β-氨基丙氨酸的α-NH₃⁺(7.12)以及4-氨基-5-甲基嘧啶胍基和氨基的同时解离(11.19, 11.20)。[1]
铜(II)配位模式:博来霉素与Cu(II)的配位涉及多达五个氮供体原子。其中四个氮原子位于赤道平面:嘧啶环氮原子(N1)、β-氨基丙氨酸的仲胺氮原子(N2)、咪唑氮原子(N3)以及与β-羟基组氨酸相邻肽键的酰胺氮原子(N4)。第五个氮原子,即β-氨基丙氨酸的α-氨基(N5),位于顶端位置,形成四方锥几何构型。这种配位方式形成四个热力学稳定的螯合环(三个五元环和一个六元环)。 [1]
铜(II)配合物稳定性:采用电位滴定法测定了各种Cu(II)-博来霉素配合物(CuH₄L⁶⁺、CuH₃L⁵⁺、CuH₂L⁴⁺、CuHL³⁺、CuL²⁺、CuH₋₁L⁺、CuH₋₂L)的整体稳定性常数(log β)。从CuHL³⁺到CuH₋₂L,配位层保持不变,仅发生远端部分(胍基、氨基)和配位水分子的去质子化。[1]
结构关系:铜结合位点与分子中与DNA相互作用的部分相对接近,这支持了金属离子在涉及DNA降解的抗癌活性中起重要作用的假设。[1]
参考文献

[1]. Phleomycin complex - Coordination mode and in vitro cleavage of DNA. J Inorg Biochem. 2019 Jun;195:71-82.

其他信息
背景:博来霉素是一种糖肽类抗生素,属于博来霉素家族。它于1956年首次从链霉菌(Streptomyces verticillus)中分离得到。博来霉素是一种广谱抗生素,其抗癌活性基于DNA断裂。严重的DNA损伤会导致细胞死亡。[1]
结构特征:博来霉素与博来霉素的区别在于,前者具有噻嗪基噻唑基团,而后者具有联噻唑基团。这种结构变化提高了其溶解度,但并不影响其与金属离子的配位模式。博来霉素天然存在,并以铜(II)络合物的形式进行商业化生产。[1]
作用机制:其抗癌作用机制被认为是在分子氧和单电子还原剂存在下通过DNA断裂发挥作用。铜(II)离子被还原剂(例如抗坏血酸、硫醇)还原为铜(I)离子,并通过类芬顿反应生成活性氧(ROS)。这些ROS,特别是羟基自由基,是造成DNA氧化损伤的罪魁祸首,会导致单链和双链断裂。[1]
去除铜离子以进行研究:为了在不添加金属的情况下研究配体的性质,必须去除铜(II)离子。使用Chelex® 100螯合树脂可以有效地实现这一点,EPR信号的消失证实了这一点。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C51H75N17O21S2
分子量
418.44
精确质量
1323.47
CAS号
11006-33-0
PubChem CID
21226163
外观&性状
Light blue to blue solid powder
密度
1.83 g/cm3
沸点
1718.8ºC at 760 mmHg
闪点
993.3ºC
蒸汽压
0mmHg at 25°C
折射率
1.777
LogP
-10.2
tPSA
664.89
氢键供体(HBD)数目
20
氢键受体(HBA)数目
31
可旋转键数目(RBC)
31
重原子数目
91
分子复杂度/Complexity
2650
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
QRBLKGHRWFGINE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C51H75N17O21S2/c1-16-29(65-41(68-38(16)54)21(8-27(53)72)60-9-20(52)39(55)78)44(82)67-31(34(22-10-58-15-61-22)88-49-50(5,36(76)33(74)25(11-69)87-49)89-47-37(77)51(85,48(57)84)35(75)26(12-70)86-47)45(83)62-18(3)32(73)17(2)42(80)66-30(19(4)71)43(81)59-7-6-28-63-24(14-90-28)46-64-23(13-91-46)40(56)79/h10,13,15,17-18,20-21,24-26,30-37,47,49,60,69-70,73-77,85H,6-9,11-12,14,52H2,1-5H3,(H2,53,72)(H2,55,78)(H2,56,79)(H2,57,84)(H,58,61)(H,59,81)(H,62,83)(H,66,80)(H,67,82)(H2,54,65,68)
化学名
2-[2-[2-[[2-[[4-[[2-[[6-amino-2-[3-amino-1-[(2,3-diamino-3-oxopropyl)amino]-3-oxopropyl]-5-methylpyrimidine-4-carbonyl]amino]-3-[3-[4-carbamoyl-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-methyloxan-2-yl]oxy-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-hydroxy-2-methylpentanoyl]amino]-3-oxobutanoyl]amino]ethyl]-4,5-dihydro-1,3-thiazol-4-yl]-1,3-thiazole-4-carboxamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O : ~100 mg/mL
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3898 mL 11.9491 mL 23.8983 mL
5 mM 0.4780 mL 2.3898 mL 4.7797 mL
10 mM 0.2390 mL 1.1949 mL 2.3898 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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