Fibronectin Type III Connecting Segment Fragment 1-25

别名: 107978-77-8; CS1 Peptide; CS-1 fibronectin; Connecting segment 1 fibronectin; Fibronectin connecting segment 1; L-Threonine, L-alpha-aspartyl-L-alpha-glutamyl-L-leucyl-L-prolyl-L-glutaminyl-L-leucyl-L-valyl-L-threonyl-L-leucyl-L-prolyl-L-histidyl-L-prolyl-L-asparaginyl-L-leucyl-L-histidylglycyl-L-prolyl-L-alpha-glutamyl-L-isoleucyl-L-leucyl-L-alpha-aspartyl-L-valyl-L-prolyl-L-seryl-; 纤连蛋白III型连接片段1-25
目录号: V59745 纯度: ≥98%
纤连蛋白III型连接片段1-25是一种负责黑色素瘤细胞粘附的生物活性肽,在鸡周围神经系统的发育中发挥重要作用。
Fibronectin Type III Connecting Segment Fragment 1-25 CAS号: 107978-77-8
产品类别: Peptides | 多肽
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
1mg
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产品描述
纤连蛋白III型连接片段1-25是一种负责黑色素瘤细胞粘附的生物活性肽,在鸡周围神经系统的发育中发挥重要作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cell adhesion
体外研究 (In Vitro)
纤维连接蛋白至少包含两个支持细胞粘附的主要结构域。一个是通过整合素α5β1被多种细胞类型识别的中心细胞结合结构域。第二种最初是通过其支持黑色素瘤细胞粘附的能力来鉴定的,位于选择性剪接的III型连接段(IIICS)。IIICS内的显性细胞类型特异性粘附位点已定位到指定为CS1的肽上,该肽包含其氨基末端25个残基。CS1的受体是整合素α4β1。我们合成了多种具有重叠序列的肽,以鉴定该主要细胞粘附位点的最小活性氨基酸序列。发现包含CS1羧基末端8个氨基酸的肽EILDVPST支持黑色素瘤细胞扩散,而所有没有此序列的肽几乎没有活性。两个较小的重叠五肽EILDV和LDVPS也具有活性,而含有Glu保守替代Asp的EILEV则没有活性。这些数据表明,细胞粘附活性的最小序列是Leu-Asp-Val,这是两种活性肽共有的三肽序列。这一预测得到了观察到的Leu-Asp-Val肽本身阻断纤维连接蛋白扩散的能力的证实,而Leu-Glu-Val是无活性的。种间氨基酸序列比较也支持LDV序列的重要性,因为它在人类、大鼠、牛和鸟类纤维连接蛋白的IIICS区域完全保守。[1]
纤维连接蛋白至少包含两个支持细胞粘附的结构域。一个是中央细胞结合结构域,被多种细胞类型识别,包括成纤维细胞。第二种最初是通过其支持黑色素瘤细胞粘附的能力来鉴定的,位于选择性剪接的III型连接段(IIICS)。使用特定的粘附配体和抑制性探针,我们研究了这些结构域在纤维连接蛋白介导的鸡胚背根和交感神经节神经元神经突起延伸中的作用。在使用移植神经节的研究中,fl3(一种含有中央细胞结合结构域的75kD人血浆纤维连接蛋白胰蛋白酶片段)和CS1 IgG(一种合成肽-IgG缀合物,含有IIICS的主要细胞粘附位点)在吸附到底物上后都支持神经突起的生长。fl3和CSl-IgG的最大活性分别为完整纤维连接蛋白的45-55%和25-30%。基质与f13和CS1 IgG的共涂层产生了神经突起生长的加性刺激,其程度接近纤维连接蛋白。通过胰蛋白酶分离背根神经节分离的纯化神经元细胞制剂也获得了类似的结果。在补充研究中,阻断中央细胞结合结构域(用mAb 333,一种抗粘附单克隆抗体)或IIICS(用CS1肽)的粘附功能,分别导致纤维连接蛋白介导的神经突起生长减少约60%或30%。当联合测试时,mAb 333和CSl的抑制活性是累加的。从这些结果中,我们得出结论,外周神经系统的神经元可以在纤维连接蛋白的中央细胞结合结构域和IIICS区域延伸神经突起,因此这些细胞是第一种粘附IIICS的正常胚胎细胞类型。这些结果表明,纤维连接蛋白IIICS区选择性mRNA剪接的时空波动可能在外周神经系统发育过程中调节细胞粘附事件中起重要作用[2]。
参考文献
[1]. The minimal essential sequence for a major cell type-specific adhesion site (CS1) within the alternatively spliced type III connecting segment domain of fibronectin is leucine-aspartic acid-valine. J Biol Chem. 1991 Aug 15;266(23):15075-9.
[2]. Neurite extension of chicken peripheral nervous system neurons on fibronectin: relative importance of specific adhesion sites in the central cell-binding domain and the alternatively spliced type III connecting segment. J Cell Biol. 1988 Apr;106(4):1289-97.
其他信息
值得注意的是,在细胞铺展促进实验中,CS1-A 相对于 CS1 的活性远低于其在细胞铺展抑制实验中的生物活性(比较图 3 和图 4A)。这种明显的差异可能是由于以下原因造成的:在细胞铺展促进实验中,肽段通过添加的氨基末端半胱氨酸残基的侧链与 IgG 偶联;而在细胞铺展抑制实验中,使用的是游离的 CS1-A 肽段。与其他 CS1 亚肽相比,CS1-A 中具有生物学意义的残基在空间上更靠近 IgG 载体蛋白。因此,IgG 分子可能产生的空间位阻会部分干扰 CS1-A 肽段与其受体——整合素 α4pl 复合物之间的相互作用。我们鉴定出的对α4整合素受体识别纤连蛋白至关重要的最小LDV序列,与包括α1、α2、α3等在内的其他几种整合素受体识别纤连蛋白所必需的RGD序列相似(15-17)。这两个肽段都含有天冬氨酸残基,但除此之外它们似乎并不相关。此外,人纤连蛋白IIICS区的另一个最小序列是REDV(1),它可能与LDV(两者都含有DV)或RGDS(大鼠同源物为RGDV(18))相关。细胞利用这些短识别序列进行纤连蛋白介导的功能,表明特定整合素受体对局部肽序列的识别存在一种共同模式。这些肽段中的天冬氨酸残基是否构成受体识别的潜在机制的一部分,仍有待确定。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C123H195N31O39
分子量
2732.05
精确质量
2730.42
CAS号
107978-77-8
PubChem CID
16131087
序列
H-Asp-Glu-Leu-Pro-Gln-Leu-Val-Thr-Leu-Pro-His-Pro-Asn-Leu-His-Gly-Pro-Glu-Ile-Leu-Asp-Val-Pro-Ser-Thr-OH; Asp-Glu-Leu-Pro-Gln-Leu-Val-Thr-Leu-Pro-His-Pro-Asn-Leu-His-Gly-Pro-Glu-Ile-Leu-Asp-Val-Pro-Ser-Thr; L-alpha-aspartyl-L-alpha-glutamyl-L-leucyl-L-prolyl-L-glutaminyl-L-leucyl-L-valyl-L-threonyl-L-leucyl-L-prolyl-L-histidyl-L-prolyl-L-asparagyl-L-leucyl-L-histidyl-glycyl-L-prolyl-L-alpha-glutamyl-L-isoleucyl-L-leucyl-L-alpha-aspartyl-L-valyl-L-prolyl-L-seryl-L-threonine
短序列
DELPQLVTLPHPNLHGPEILDVPST; H-DELPQLVTLPHPNLHGPEILDVPST-OH
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
0.507
tPSA
1071.2
氢键供体(HBD)数目
32
氢键受体(HBA)数目
42
可旋转键数目(RBC)
80
重原子数目
193
分子复杂度/Complexity
6430
定义原子立体中心数目
27
SMILES
OC(CCC(C(NC(C(N1CCCC1C(NC(C(NC(C(NC(C(NC(C(NC(C(N1CCCC1C(NC(C(N1CCCC1C(NC(C(NC(C(NC(C(NCC(N1CCCC1C(NC(C(NC(C(NC(C(NC(C(NC(C(N1CCCC1C(NC(C(NC(C(=O)O)C(O)C)=O)CO)=O)=O)C(C)C)=O)CC(=O)O)=O)CC(C)C)=O)C(CC)C)=O)CCC(=O)O)=O)=O)=O)CC1=CN=CN1)=O)CC(C)C)=O)CC(=O)N)=O)=O)CC1=CN=CN1)=O)=O)CC(C)C)=O)C(O)C)=O)C(C)C)=O)CC(C)C)=O)CCC(=O)N)=O)=O)CC(C)C)=O)NC(C(CC(=O)O)N)=O)=O
InChi Key
NXAKDBCNODQXBZ-YSZCVPRFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C123H195N31O39/c1-19-64(16)97(117(186)140-74(42-58(4)5)106(175)138-78(50-94(167)168)109(178)146-96(63(14)15)122(191)154-40-24-29-87(154)115(184)144-82(54-155)110(179)149-99(66(18)157)123(192)193)147-104(173)72(32-35-92(163)164)134-111(180)83-25-20-36-150(83)90(160)53-129-101(170)76(46-67-51-127-55-130-67)137-105(174)73(41-57(2)3)136-107(176)77(49-89(126)159)139-113(182)85-27-22-39-153(85)121(190)81(47-68-52-128-56-131-68)142-114(183)86-28-23-38-152(86)120(189)80(45-61(10)11)143-118(187)98(65(17)156)148-116(185)95(62(12)13)145-108(177)75(43-59(6)7)135-102(171)70(30-33-88(125)158)133-112(181)84-26-21-37-151(84)119(188)79(44-60(8)9)141-103(172)71(31-34-91(161)162)132-100(169)69(124)48-93(165)166/h51-52,55-66,69-87,95-99,155-157H,19-50,53-54,124H2,1-18H3,(H2,125,158)(H2,126,159)(H,127,130)(H,128,131)(H,129,170)(H,132,169)(H,133,181)(H,134,180)(H,135,171)(H,136,176)(H,137,174)(H,138,175)(H,139,182)(H,140,186)(H,141,172)(H,142,183)(H,143,187)(H,144,184)(H,145,177)(H,146,178)(H,147,173)(H,148,185)(H,149,179)(H,161,162)(H,163,164)(H,165,166)(H,167,168)(H,192,193)/t64-,65+,66+,69-,70-,71-,72-,73-,74-,75-,76-,77-,78-,79-,80-,81-,82-,83-,84-,85-,86-,87-,95-,96-,97-,98-,99-/m0/s1
化学名
(4S)-4-[[(2S)-1-[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-4-amino-2-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-5-amino-2-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-carboxypropanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-oxopentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-(1H-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-[[(2S,3S)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-3-carboxy-1-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-1-[[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]amino]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]amino]-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
别名
107978-77-8; CS1 Peptide; CS-1 fibronectin; Connecting segment 1 fibronectin; Fibronectin connecting segment 1; L-Threonine, L-alpha-aspartyl-L-alpha-glutamyl-L-leucyl-L-prolyl-L-glutaminyl-L-leucyl-L-valyl-L-threonyl-L-leucyl-L-prolyl-L-histidyl-L-prolyl-L-asparaginyl-L-leucyl-L-histidylglycyl-L-prolyl-L-alpha-glutamyl-L-isoleucyl-L-leucyl-L-alpha-aspartyl-L-valyl-L-prolyl-L-seryl-;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.3660 mL 1.8301 mL 3.6603 mL
5 mM 0.0732 mL 0.3660 mL 0.7321 mL
10 mM 0.0366 mL 0.1830 mL 0.3660 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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