pNP-ADPr disodium (ADP-ribose-pNP disodium)

目录号: V76616 纯度: ≥98%
pNP-ADPr disodium 是一种比色底物,用于连续测定聚 (ADP-核糖) 糖水解酶 (PARG) 和 ADP-核糖基水解酶 3 (ARH3) 的活性。
pNP-ADPr disodium (ADP-ribose-pNP disodium) 产品类别: PAR
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
pNP-ADPr二钠是一种比色底物,可用于连续测定聚(ADP-核糖)糖苷水解酶(PARG)和ADP-核糖水解酶3(ARH3)的活性。pNP-ADPr二钠也可用于研究聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)。
pNP-ADPr 二钠(ADP-核糖-pNP 二钠)是一种合成显色底物,其中 NAD+ 的烟酰胺部分被对硝基苯基取代。作为一种比色底物,它能够实现体外酶活性的连续实时测定,为放射性测定或终点测定提供了一种替代方法。该化合物被归类为聚(ADP-核糖)(PAR)领域的研究试剂。它以二钠盐的形式提供,这提高了其水溶性和稳定性,使其适用于生化应用。所有信息仅供研究使用,不应被解释为临床或治疗指导。
生物活性&实验参考方法
靶点
The compound targets the enzymatic activity of Poly(ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) and ADP-ribosyl hydrolase 3 (ARH3). These enzymes are responsible for cleaving the glycosidic bond between the ribose and ADP-ribose moieties of poly(ADP-ribose) (PAR) generated by PARP activity. The substrate is also useful for general poly(ADP-ribose)polymerase (PARP) enzyme studies. By interacting with the active site of these hydrolases, pNP-ADPr serves as a tool to probe the catalytic mechanisms of PAR hydrolysis without acting as a traditional ligand or drug target.
体外研究 (In Vitro)
在最初的连续聚(ADP-核糖)糖苷水解酶(PARG)和ADP-核糖水解酶3(ARH3)活性测试中,pNP-ADPr是所采用的比色底物[1]。
在体外,pNP-ADPr二钠可作为显色底物,用于首次连续测定PARG和ARH3活性。当ADP-核糖-pNP键被酶促裂解后,释放出对硝基苯酚基团,产生黄色,可通过分光光度法在405 nm处进行定量分析。这使得酶活性的实时动力学测定成为可能,无需使用放射性底物。该方法也用于PARP酶的研究。
体内研究 (In Vivo)
目前尚未报道pNP-ADPr二钠的体内活性数据,或者此类数据不适用于该化合物。作为一种基于底物的研究工具,pNP-ADPr二钠是为体外生化分析而设计的,不适用于动物模型研究。因此,目前科学文献或产品文件中均无关于其在活体生物体内的疗效、药代动力学或药效学信息。
酶活实验
典型的连续比色法测定方案:在96孔板中配制反应缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.5,5 mM MgCl2,1 mM DTT)。向含有pNP-ADPr二钠(终浓度100-500 uM)的孔中加入纯化的PARG或ARH3酶(0.1-1 ug)。使用酶标仪在37℃下,每30秒监测一次405 nm处的吸光度,持续30分钟。405 nm处吸光度的增加对应于对硝基苯酚的释放,其值与酶活性成正比。使用不含酶的对照孔来扣除背景值。无需预孵育。可以使用已知浓度的对硝基苯酚生成校准曲线。通过将初始速率数据(每分钟吸光度的变化)拟合到米氏方程,计算酶动力学参数(Vmax、Km、kcat)。
细胞实验
虽然并非传统的基于细胞的检测方法,但该化合物可用于细胞裂解液检测,以定量PARG/ARH3活性。收集细胞后,用冰冷的裂解缓冲液(50 mM Tris-HCl,pH 7.5,150 mM NaCl,1% NP-40,蛋白酶抑制剂)裂解。裂解液经12,000 × g离心10分钟澄清。使用BCA法测定蛋白浓度。将20-50 ug裂解液蛋白加入96孔板的每个孔中。加入pNP-ADPr二钠至终浓度为200 uM。将孔板在37℃孵育30-60分钟。在405 nm处测定吸光度,可采用动力学方法或终点法测定。测得的活性与裂解液中PARG/ARH3的量成正比。该方案允许对治疗组进行比较(例如,药物治疗组与对照组)。
动物实验
该化合物不适用于体内动物研究,目前尚无针对该试剂的标准动物实验方案。若用于体外实验,可按照相同的裂解液处理方案将其应用于组织匀浆:将目标组织(例如 50-100 mg)在裂解缓冲液中匀浆,离心澄清,测定蛋白浓度,并将标准化的裂解液与 pNP-ADPr 二钠底物(200-500 μM)于 37℃ 孵育 30-60 分钟。最后,在 405 nm 波长处测定吸光度。该方法可测定从组织样本中提取的总 PARG/ARH3 活性。
药代性质 (ADME/PK)
由于该化合物是一种体外生化试剂,不适用于全身给药,因此尚未测定其药代动力学参数。其二钠盐形式具有较高的水溶性(例如,在水中的溶解度为 250 mg/mL),这对于其在缓冲体系中的应用而言是一项重要的理化性质。然而,目前尚无关于其吸收、分布、代谢、消除或半衰期的相关数据。建议研究人员将该化合物作为标准实验室化学品进行处理,而非作为潜在的候选药物。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于pNP-ADPr二钠不适用于体内实验,因此目前尚无详细的毒性数据。处理粉末或溶液时,应遵循标准的实验室安全预防措施。避免吸入、吞咽和皮肤接触。使用适当的个人防护装备(PPE),包括手套、实验服和护目镜。应在通风良好的区域(例如化学通风橱)操作该化合物。如发生泄漏,请遵循机构危险品处理规程。如果皮肤或眼睛接触到该化合物,请立即用清水彻底冲洗15分钟,如果刺激持续存在,请就医。
参考文献

[1]. Monitoring Poly(ADP-ribosyl)glycohydrolase Activity with a Continuous Fluorescent Substrate. Cell Chem Biol. 2018;25(12):1562-1570.e19.

[2]. A colorimetric substrate for poly(ADP-ribose) polymerase-1, VPARP, and tankyrase-1. Angew Chem Int Ed Engl. 2007;46(12):2066-2069.

其他信息
本产品仅为研究级生化试剂,未经任何司法管辖区批准用于临床、诊断或治疗用途。它是一种比色底物,用于首次连续PARG/ARH3活性测定。对硝基苯基的存在使其易于进行分光光度检测。二钠盐是确保其在水性缓冲液中溶解的标准形式。该化合物以粉末形式在-20℃下可稳定保存3年,在4℃下可稳定保存2年。溶液在-80℃下可稳定保存6个月。请储存在密封、避光、防潮的环境中。本产品仅供研究使用,不得用于人体。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H24N6NA2O16P2
分子量
724.37
相关CAS号
pNP-ADPr;939028-75-8
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
H2O :~250 mg/mL (~345.13 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.3805 mL 6.9025 mL 13.8051 mL
5 mM 0.2761 mL 1.3805 mL 2.7610 mL
10 mM 0.1381 mL 0.6903 mL 1.3805 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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