THI0019

别名: THI-0019; THI0019; THI 0019;
目录号: V3567 纯度: ≥98%
THI-0019 (THI0019) 是一种新型强效整合素 α4β1 (VLA-4) 激动剂(EC50 在 1-2 μM 范围内)。
THI0019 CAS号: 1378532-99-0
产品类别: Integrin
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
10mg
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产品描述
THI-0019 (THI0019) 是一种新型、有效的整合素 α4β1 (VLA-4) 激动剂(EC50 在 1-2 μM 范围内)。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
THI0019 是通过对先前发现的 α4β1 拮抗剂进行两次结构修饰而生成的。THI0019 大大增强了培养细胞系和原代祖细胞在静态和流动条件下对 α4β1 配体 VCAM-1 和 CS1 的粘附。此外,THI0019 促进了细胞在 VCAM-1 上的滚动和扩散以及细胞向 SDF-1α 的迁移。分子建模预测该化合物在与配体结合位点重叠的 α/β 亚基界面处结合,从而表明该化合物必须在配体结合时被取代。为了支持该模型,使用了一种经过修饰以包含光反应性基团的 THI0019 类似物来证明当交联到整合素时,该化合物表现为拮抗剂而不是激动剂。此外,THI0019 与相关整合素 α4β7 以及 α5β1 和 αLβ2 表现出交叉反应性。当与 αLβ2 交联时,THI0019 的光反应性类似物仍是一种激动剂,这与它与 α/β 亚基界面结合而不是与 αL 亚基插入(“I”)结构域中的配体结合位点结合一致。将祖细胞与 THI0019 等化合物共同给药可能提供一种增强干细胞治疗的机制。[1]
细胞实验
平行板流动分离试验
将重组人 VCAM-1(10 μg/ml 或 5 μg/ml,0.1 m NaHCO3 溶液)在 4 °C 下过夜固定在从 15 × 100 mm 聚苯乙烯培养皿切下的 24 × 50 mm 载玻片上。用 PBS 清洗载玻片,在室温下用 2% (w/v) BSA 封闭 2 小时,然后组装到平行板流动室中。对于分离试验,将载体、10 μm THI0019、10 μg/ml mAb TS2/16 或每种的组合与 Jurkat 细胞在低亲和力运行缓冲液中混合,然后将 2.0 × 106 个细胞注入流动室并让其在载玻片上停留 10 分钟。使用计算机控制的注射泵(哈佛仪器)将线性梯度递增的剪切流拉过粘附细胞 300 秒。每 50 秒计算一次剪切应力。剪切应力(达因/cm2)定义为 (6 μQ)/(wh2),其中 μ 是介质的粘度(0.007);Q 是流速(cm3/s);w 是腔室宽度(0.3175 cm),h 是腔室高度(0.01524 cm)。每 50 秒用数字显微镜 (VI-470 电荷耦合器件摄像机;Optronics Engineering) 在倒置尼康 DIAPHOT-TMD 显微镜上以 ×20 记录一次附着的细胞数,并绘制成时间图。[1]
细胞滚动测定
将基质细胞 (M2-10B4) 接种在从 125 毫升组织培养瓶中切下的 24 × 50 毫米载玻片上,在标准组织培养条件下培养过夜,并组装到平行板流动室中。将 TF1 细胞 (2.0 × 106) 与载体或 10 μm THI0019 在运行缓冲液中混合,然后注入平行板流动室系统。对系统施加 0.5 达因/cm2 的恒定剪切流 300 秒,并用数字显微镜记录滚动穿过基质细胞单层的 TF1 细胞。然后使用 Imaris Bitplane 软件(版本 7.6.1)分析数字记录,以确定单个细胞在单层上移动的速度。观察区域为 500 μm,仅包括移动至少 400 μm 的细胞。细胞速度定义为移动距离除以移动该距离的时间。[1]
迁移测定
迁移测定在 3 μm 孔径 Transwells(24 孔,Costar,马萨诸塞州剑桥)中进行。上室在 50 μl TBS 中预涂 3 μg/ml 纤连蛋白或 10 μg/ml VCAM-1,在 4 °C 下过夜,然后在室温下用 2% BSA 封闭 1 小时。用迁移培养基(RPMI 1640 培养基,添加 1% FBS、100 单位/ml 青霉素和 100 μg/ml 链霉素)清洗后,上室中装有 160 μl 迁移培养基中的 Jurkat 细胞(2 × 105 个细胞)。下室含有 600 μl 迁移培养基,添加 10 μg/ml SDF-1α 以诱导趋化性。将 Jurkat 细胞与载体(1% DMSO)或 THI0019 以所示浓度混合,然后立即加入上室。在 37 °C、5% CO2 下孵育 4 小时后,取出上室,收集下室中的细胞并在血细胞计数器上计数。结果表示为迁移的细胞总数。[1]
THI0019 与 α4β7 晶体结构的计算机对接
在 16 核 2.4 GHz AMD Operon 系统上使用 Modeling Suite 2012 来可视化 THI0019 与整合素模型的结合。从 α4β7 的晶体结构开始生成 Glide 对接模型。从蛋白质数据库下载结构 3v4v 并读入 Maestro 。删除除 A(α4)和 B(β7)之外的所有链。使用程序默认值进行基本的蛋白质制备,另外填充缺失的侧链并删除杂原子中 5 Å 以外的水分子。在链 A 中的 Ser-559 和链 B 中的 Cys-455 中发现了缺失的原子。模型蛋白质部分的完整制备包括以下内容:1)基本蛋白质制备; 2) 杂原子状态的分配;3) H 键分配,包括 PROPKA;4) 将少于三个 H 键的水删除为非水;5) Impref“仅 H”最小化;6) Impref“最小化所有”至均方根偏差 = 0.5。对于 THI0019,使用默认标准和 Epik 电离对结构(导入为 SDF 文件)执行 Lig PREP 计算。使用基于晶体结构配体的默认设置生成 Glide Grid。此外,还为金属离子指定了约束。为晶体结构配体提交了虚拟筛选工作流程,然后为 THI0019 提交了虚拟筛选工作流程。虚拟筛选工作流程涉及与 Glide XP 模式对接,从三个额外构象开始,然后使用 Prime MMGBSA ΔGbind 重新评分。[1]
参考文献
Small molecule agonist of very late antigen-4 (VLA-4) integrin induces progenitor cell adhesion. J Biol Chem 2013 Jul 5;288(27):19414-28.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C29H35N3O7S2
分子量
601.733
精确质量
601.19
元素分析
C, 57.89; H, 5.86; N, 6.98; O, 18.61; S, 10.66
CAS号
1378532-99-0
PubChem CID
67704761
外观&性状
Solid powder
LogP
4.7
tPSA
172
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
41
分子复杂度/Complexity
835
定义原子立体中心数目
2
SMILES
CCCC[C@@H](COC(=O)N(CC1=CC=CS1)CC2=CC=CS2)NC(=O)N[C@@H](CC(=O)OC)C3=CC4=C(C=C3)OCO4
InChi Key
QWDGYRDMZTZEHQ-URXFXBBRSA-N
InChi Code
InChI=1S/C29H35N3O7S2/c1-3-4-7-21(18-37-29(35)32(16-22-8-5-12-40-22)17-23-9-6-13-41-23)30-28(34)31-24(15-27(33)36-2)20-10-11-25-26(14-20)39-19-38-25/h5-6,8-14,21,24H,3-4,7,15-19H2,1-2H3,(H2,30,31,34)/t21-,24-/m0/s1
化学名
methyl (3S)-3-(1,3-benzodioxol-5-yl)-3-[[(2S)-1-[bis(thiophen-2-ylmethyl)carbamoyloxy]hexan-2-yl]carbamoylamino]propanoate
别名
THI-0019; THI0019; THI 0019;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6619 mL 8.3094 mL 16.6187 mL
5 mM 0.3324 mL 1.6619 mL 3.3237 mL
10 mM 0.1662 mL 0.8309 mL 1.6619 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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