| 规格 | 价格 | |
|---|---|---|
| 10mg | ||
| 100mg | ||
| 250mg | ||
| Other Sizes |
| 体外研究 (In Vitro) |
THI0019 是通过对先前发现的 α4β1 拮抗剂进行两次结构修饰而生成的。THI0019 大大增强了培养细胞系和原代祖细胞在静态和流动条件下对 α4β1 配体 VCAM-1 和 CS1 的粘附。此外,THI0019 促进了细胞在 VCAM-1 上的滚动和扩散以及细胞向 SDF-1α 的迁移。分子建模预测该化合物在与配体结合位点重叠的 α/β 亚基界面处结合,从而表明该化合物必须在配体结合时被取代。为了支持该模型,使用了一种经过修饰以包含光反应性基团的 THI0019 类似物来证明当交联到整合素时,该化合物表现为拮抗剂而不是激动剂。此外,THI0019 与相关整合素 α4β7 以及 α5β1 和 αLβ2 表现出交叉反应性。当与 αLβ2 交联时,THI0019 的光反应性类似物仍是一种激动剂,这与它与 α/β 亚基界面结合而不是与 αL 亚基插入(“I”)结构域中的配体结合位点结合一致。将祖细胞与 THI0019 等化合物共同给药可能提供一种增强干细胞治疗的机制。[1]
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| 细胞实验 |
平行板流动分离试验
将重组人 VCAM-1(10 μg/ml 或 5 μg/ml,0.1 m NaHCO3 溶液)在 4 °C 下过夜固定在从 15 × 100 mm 聚苯乙烯培养皿切下的 24 × 50 mm 载玻片上。用 PBS 清洗载玻片,在室温下用 2% (w/v) BSA 封闭 2 小时,然后组装到平行板流动室中。对于分离试验,将载体、10 μm THI0019、10 μg/ml mAb TS2/16 或每种的组合与 Jurkat 细胞在低亲和力运行缓冲液中混合,然后将 2.0 × 106 个细胞注入流动室并让其在载玻片上停留 10 分钟。使用计算机控制的注射泵(哈佛仪器)将线性梯度递增的剪切流拉过粘附细胞 300 秒。每 50 秒计算一次剪切应力。剪切应力(达因/cm2)定义为 (6 μQ)/(wh2),其中 μ 是介质的粘度(0.007);Q 是流速(cm3/s);w 是腔室宽度(0.3175 cm),h 是腔室高度(0.01524 cm)。每 50 秒用数字显微镜 (VI-470 电荷耦合器件摄像机;Optronics Engineering) 在倒置尼康 DIAPHOT-TMD 显微镜上以 ×20 记录一次附着的细胞数,并绘制成时间图。[1] 细胞滚动测定 将基质细胞 (M2-10B4) 接种在从 125 毫升组织培养瓶中切下的 24 × 50 毫米载玻片上,在标准组织培养条件下培养过夜,并组装到平行板流动室中。将 TF1 细胞 (2.0 × 106) 与载体或 10 μm THI0019 在运行缓冲液中混合,然后注入平行板流动室系统。对系统施加 0.5 达因/cm2 的恒定剪切流 300 秒,并用数字显微镜记录滚动穿过基质细胞单层的 TF1 细胞。然后使用 Imaris Bitplane 软件(版本 7.6.1)分析数字记录,以确定单个细胞在单层上移动的速度。观察区域为 500 μm,仅包括移动至少 400 μm 的细胞。细胞速度定义为移动距离除以移动该距离的时间。[1] 迁移测定 迁移测定在 3 μm 孔径 Transwells(24 孔,Costar,马萨诸塞州剑桥)中进行。上室在 50 μl TBS 中预涂 3 μg/ml 纤连蛋白或 10 μg/ml VCAM-1,在 4 °C 下过夜,然后在室温下用 2% BSA 封闭 1 小时。用迁移培养基(RPMI 1640 培养基,添加 1% FBS、100 单位/ml 青霉素和 100 μg/ml 链霉素)清洗后,上室中装有 160 μl 迁移培养基中的 Jurkat 细胞(2 × 105 个细胞)。下室含有 600 μl 迁移培养基,添加 10 μg/ml SDF-1α 以诱导趋化性。将 Jurkat 细胞与载体(1% DMSO)或 THI0019 以所示浓度混合,然后立即加入上室。在 37 °C、5% CO2 下孵育 4 小时后,取出上室,收集下室中的细胞并在血细胞计数器上计数。结果表示为迁移的细胞总数。[1] THI0019 与 α4β7 晶体结构的计算机对接 在 16 核 2.4 GHz AMD Operon 系统上使用 Modeling Suite 2012 来可视化 THI0019 与整合素模型的结合。从 α4β7 的晶体结构开始生成 Glide 对接模型。从蛋白质数据库下载结构 3v4v 并读入 Maestro 。删除除 A(α4)和 B(β7)之外的所有链。使用程序默认值进行基本的蛋白质制备,另外填充缺失的侧链并删除杂原子中 5 Å 以外的水分子。在链 A 中的 Ser-559 和链 B 中的 Cys-455 中发现了缺失的原子。模型蛋白质部分的完整制备包括以下内容:1)基本蛋白质制备; 2) 杂原子状态的分配;3) H 键分配,包括 PROPKA;4) 将少于三个 H 键的水删除为非水;5) Impref“仅 H”最小化;6) Impref“最小化所有”至均方根偏差 = 0.5。对于 THI0019,使用默认标准和 Epik 电离对结构(导入为 SDF 文件)执行 Lig PREP 计算。使用基于晶体结构配体的默认设置生成 Glide Grid。此外,还为金属离子指定了约束。为晶体结构配体提交了虚拟筛选工作流程,然后为 THI0019 提交了虚拟筛选工作流程。虚拟筛选工作流程涉及与 Glide XP 模式对接,从三个额外构象开始,然后使用 Prime MMGBSA ΔGbind 重新评分。[1] |
| 参考文献 |
| 分子式 |
C29H35N3O7S2
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|---|---|
| 分子量 |
601.733
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| 精确质量 |
601.19
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| 元素分析 |
C, 57.89; H, 5.86; N, 6.98; O, 18.61; S, 10.66
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| CAS号 |
1378532-99-0
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| PubChem CID |
67704761
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| 外观&性状 |
Solid powder
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| LogP |
4.7
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| tPSA |
172
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
9
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| 可旋转键数目(RBC) |
16
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| 重原子数目 |
41
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| 分子复杂度/Complexity |
835
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| 定义原子立体中心数目 |
2
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| SMILES |
CCCC[C@@H](COC(=O)N(CC1=CC=CS1)CC2=CC=CS2)NC(=O)N[C@@H](CC(=O)OC)C3=CC4=C(C=C3)OCO4
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| InChi Key |
QWDGYRDMZTZEHQ-URXFXBBRSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C29H35N3O7S2/c1-3-4-7-21(18-37-29(35)32(16-22-8-5-12-40-22)17-23-9-6-13-41-23)30-28(34)31-24(15-27(33)36-2)20-10-11-25-26(14-20)39-19-38-25/h5-6,8-14,21,24H,3-4,7,15-19H2,1-2H3,(H2,30,31,34)/t21-,24-/m0/s1
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| 化学名 |
methyl (3S)-3-(1,3-benzodioxol-5-yl)-3-[[(2S)-1-[bis(thiophen-2-ylmethyl)carbamoyloxy]hexan-2-yl]carbamoylamino]propanoate
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| 别名 |
THI-0019; THI0019; THI 0019;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.6619 mL | 8.3094 mL | 16.6187 mL | |
| 5 mM | 0.3324 mL | 1.6619 mL | 3.3237 mL | |
| 10 mM | 0.1662 mL | 0.8309 mL | 1.6619 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。