| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
|---|---|---|---|
| 5mg |
|
||
| 10mg |
|
||
| 25mg |
|
||
| 50mg |
|
||
| 100mg |
|
||
| 250mg |
|
||
| 500mg |
|
||
| 1g |
|
||
| Other Sizes |
|
| 靶点 |
Click chemistry reagent; unnatural amino acid
|
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
使用无细胞蛋白合成(CFPS)技术时,含有4-叠氮基-L-苯丙氨酸或对丙炔氧基-L-苯丙氨酸(pPaF)的修饰可溶性超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)在CFPS溶液中的积累量为0.9-1.7 mg/mL [1]。
本研究利用无细胞蛋白合成平台,将pAzF位点特异性地掺入超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)中。采用这种新方法(同时生产正交tRNA和修饰蛋白),16小时后,含有pAzF或pPaF的修饰可溶性sfGFP的积累量为0.9-1.7 mg/mL,对应的抑制效率为50-88%。含有 pAzF 的 sfGFP 蛋白的比活性和可溶性产量与在测试位点含有 pPaF 的 sfGFP 蛋白相似 [1]。 66 位点含有 pAzF 的 sfGFP 的荧光消失;92 位点的取代使荧光降低了 60-70%;其他取代并未显著改变比活性(降低 ≤20%)[1]。 |
| 酶活实验 |
除非另有说明,25 微升 PANOx SP 反应溶液包含:10 mM 谷氨酸铵、20 mM 谷氨酸镁、175 mM 谷氨酸钾、1.2 mM ATP、0.86 mM CMP、0.86 mM GMP 和 0.86 mM UMP、10 mM 磷酸氢二钾、34 μg/ml 亚叶酸、171 μg/ml 大肠杆菌 tRNA、33 mM 磷酸烯醇式丙酮酸 (PEP)、1.5 mM 亚精胺、1 mM 腐胺、0.33 mM 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD)、0.27 mM 辅酶 A、2.7 mM 草酸钠、20 种氨基酸各 2 mM、5 μM L-[14C(U)]-亮氨酸、2 mM对叠氮基-L-苯丙氨酸 (pAzF) 或 4 mM 对炔丙氧基-L-苯丙氨酸 (pPaF)、0.3 mg/ml pAzFRS 或 0.5 mg/ml pPaFRS(制备方法如上所述)、100 μg/ml T7 RNA 聚合酶、6 nM sfGFP 质粒、0.2 mg/ml 线性化 o-tRNA 或 o-tRNAopt 质粒模板,以及 0.24 体积的标准 KC6 提取物或 0.28 体积的正交提取物。谷氨酸盐由 10 倍浓缩 (10×) 溶液稀释而成。类似地,10× NTMP Master Mix 溶液包含 ATP、三种 NMP、亚叶酸和大肠杆菌 tRNA,并用磷酸氢二钾调节 pH 至 7.3。天然氨基酸由浓度为 50 mM 的储备液稀释而成。该储备液的制备方法如下(以单字母代码表示):R、V、W、F、I、L、C、M、A、N、D、E、G、Q、H、K、P、S、T、Y。制备过程中,除酪氨酸外,确保每种氨基酸在加入下一种氨基酸之前均已溶解;酪氨酸最后加入,并悬浮于溶液中。除非另有说明,反应均在 30°C 下孵育 16 小时。含有 pAzF 的 CFPS 反应在暗室中进行,盛放反应溶液的试管用铝箔包裹,以防止芳香叠氮化物发生光解离[1]。
|
| 细胞实验 |
如前所述,正交S30细胞提取物由携带pDule-tRNA质粒的KC6细胞制备。均质化后裂解液未进行稀释。该KC6/o-tRNA培养物在分批培养中的比生长速率为0.57 h⁻¹。标准KC6提取物的制备方法如前所述。均质化后,每毫升裂解液加入0.2毫升S30缓冲液(14 mM乙酸镁、60 mM乙酸钾、10 mM Tris-乙酸,pH 8.2),并将稀释后的裂解液在4℃下用100倍体积的S30缓冲液透析4次,每次30分钟。最后,将S30细胞提取物在4℃下以10000 g离心20分钟,取上清液分装,速冻后储存于-80℃。在补料分批发酵过程中,KC6 培养物的比生长速率为 0.96 h−1[1].
无细胞蛋白质合成 (CFPS) 反应采用 PANOx SP 系统进行。反应溶液(25 μL)包含:10 mM 谷氨酸铵、20 mM 谷氨酸镁、175 mM 谷氨酸钾、1.2 mM ATP、0.86 mM CMP、0.86 mM GMP 和 0.86 mM UMP、10 mM 磷酸氢二钾、34 μg/mL 亚叶酸、171 μg/mL 大肠杆菌 tRNA、33 mM 磷酸烯醇式丙酮酸 (PEP)、1.5 mM 亚精胺、1 mM 腐胺、0.33 mM 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 (NAD)、0.27 mM 辅酶 A、2.7 mM 草酸钠、20 种天然氨基酸各 2 mM、5 μM [14C(U)]-亮氨酸、2 mM 对叠氮基-L-苯丙氨酸 (pAzF)。 0.3 mg/mL pAzFRS(pAzF 特异性合成酶)、100 μg/mL T7 RNA 聚合酶、6 nM sfGFP 质粒、0.2 mg/mL 线性化正交 tRNA(或 o-tRNAopt)质粒模板,以及 0.24 倍体积的标准 KC6 提取物或 0.28 倍体积的正交提取物。反应在 30°C 下孵育 16 小时。含有 pAzF 的 CFPS 反应在暗室中进行,试管用铝箔包裹以防止芳香叠氮化物发生光解离 [1]。 含有 pAzF 的修饰 sfGFP 蛋白通过 [14C]-亮氨酸放射性标记进行定量。总蛋白和可溶性蛋白浓度通过三氯乙酸沉淀和闪烁计数法测定。全长蛋白的含量通过SDS-PAGE放射自显影图的密度分析测定。抑制效率定义为修饰全长蛋白产量与天然sfGFP蛋白产量的比值[1]。 为了进行荧光表征,在无细胞蛋白合成系统(CFPS)中生产sfGFP蛋白(天然的或在各个位置用pAzF修饰),通过链霉亲和层析纯化,并进行透析。在485 nm激发波长下,测量523–548 nm范围内的荧光强度,并通过荧光强度除以蛋白浓度计算比活性(AU/ng)[1]。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
4-叠氮基-L-苯丙氨酸是一种具有L构型的4-叠氮基苯丙氨酸。它可用作生物正交点击化学试剂。它是4-叠氮基苯丙氨酸和L-苯丙氨酸的衍生物,也是4-叠氮基-D-苯丙氨酸的对映异构体。
对叠氮基-L-苯丙氨酸(pAzF)是一种含有叠氮基团的非天然氨基酸。它可以利用源自詹氏甲烷球菌(Methanocaldococcus jannaschii)的正交tRNA/氨酰tRNA合成酶对,定点掺入蛋白质中。含有 pAzF 的蛋白质可通过铜(I)催化的叠氮-炔环加成反应(点击化学)直接偶联[1]。 本研究开发了一种新型无细胞平台,利用锤头状核酶(转酶法)同时合成正交 tRNA 和修饰蛋白。该方法可高效合成含有 pAzF 或 pPaF 的 sfGFP(0.9–1.7 mg/mL),抑制效率达 50–88%。正交 tRNA 可由线性化质粒或粗 PCR 产物制备。该平台具有模块化设计,可用于引入 30 多种非天然氨基酸[1]。 |
| 分子式 |
C9H10N4O2
|
|---|---|
| 分子量 |
206.205
|
| 精确质量 |
206.08
|
| 元素分析 |
C, 52.42; H, 4.89; N, 27.17; O, 15.52
|
| CAS号 |
33173-53-4
|
| 相关CAS号 |
4-Azido-L-phenylalanine hydrochloride;34670-43-4
|
| PubChem CID |
3080772
|
| 外观&性状 |
Typically exists as white to yellow solids at room temperature
|
| LogP |
1.735
|
| tPSA |
113.07
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
2
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
5
|
| 可旋转键数目(RBC) |
4
|
| 重原子数目 |
15
|
| 分子复杂度/Complexity |
267
|
| 定义原子立体中心数目 |
1
|
| SMILES |
O([H])C([C@]([H])(C([H])([H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1[H])N=[N+]=[N-])N([H])[H])=O
|
| InChi Key |
NEMHIKRLROONTL-QMMMGPOBSA-N
|
| InChi Code |
InChI=1S/C9H10N4O2/c10-8(9(14)15)5-6-1-3-7(4-2-6)12-13-11/h1-4,8H,5,10H2,(H,14,15)/t8-/m0/s1
|
| 化学名 |
p-Azido-L-phenylalanine
|
| 别名 |
pAzF; H-4-Azido-Phe-OH; 4-Azido-L-phenylalanine; L-Phe(4-azido)-OH; 4-Azido-L-phenylalanine; 33173-53-4; H-P-AZIDO-PHE-OH; 4-Azidophenylalanine; (S)-2-Amino-3-(4-azidophenyl)propanoic acid; p-azidophenylalanine; p-azido-l-phenylalanine; (2S)-2-amino-3-(4-azidophenyl)propanoic acid;
|
| HS Tariff Code |
2934.99.9001
|
| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
|
| 溶解度 (体外实验) |
H2O : ~25 mg/mL (~121.24 mM)
DMSO : ~5 mg/mL (~24.25 mM) |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 4.8494 mL | 24.2471 mL | 48.4943 mL | |
| 5 mM | 0.9699 mL | 4.8494 mL | 9.6989 mL | |
| 10 mM | 0.4849 mL | 2.4247 mL | 4.8494 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。