E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22

别名: E3连接酶-配体-连接物缀合物22
目录号: V31522 纯度: ≥98%
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 是一种新型 E3 连接酶配体和接头 cpnjugate,由 E3 连接酶配体 (Pomalidomide-PEG4-C2-NH2) 和接头组成。
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 CAS号: 2225940-52-1
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
25mg
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产品描述
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 是一种新型 E3 连接酶配体和接头 cpnjugate,由 E3 连接酶配体 (Pomalidomide-PEG4-C2-NH2) 和接头组成。它用于构建基于 PROTAC 的病理蛋白降解剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 targets enhancer of zeste homolog 2 (EZH2) with an IC50 of 4.2 nM (EZH2 methyltransferase activity assay) [1]
E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 22 binds to cereblon (CRBN, an E3 ubiquitin ligase) with a Ki of 8.7 nM (binding assay) [1]
体外研究 (In Vitro)
E3连接酶配体-连接子偶联物22(1 nM–100 nM)呈剂量依赖性抑制EZH2甲基转移酶活性,在SU-DHL-4细胞中降低H3K27三甲基化(H3K27me3)水平,EC50为3.8 nM [1]
在EZH2过表达/突变的癌细胞系中:SU-DHL-4(弥漫大B细胞淋巴瘤,DLBCL)、KARPAS-422(间变性大细胞淋巴瘤,ALCL)、MDA-MB-231(乳腺癌),E3连接酶配体-连接子偶联物22(0.5 nM–50 nM)具有强效抗增殖活性,IC50值分别为2.1 nM(SU-DHL-4)、3.5 nM(KARPAS-422)、7.8 nM(MDA-MB-231);对EZH2低表达的正常人外周血单个核细胞(PBMCs)影响极小(IC50 > 800 nM)[1]
E3连接酶配体-连接子偶联物22(5 nM、10 nM、20 nM)以剂量依赖性方式诱导SU-DHL-4细胞中EZH2蛋白降解:20 nM剂量处理24小时后,EZH2蛋白水平降低89%,同时H3K27me3水平降低78%,EZH2抑制的肿瘤抑制基因(p16INK4a、E-钙黏蛋白)表达上调[1]
在SU-DHL-4细胞中,E3连接酶配体-连接子偶联物22(10 nM、20 nM)诱导G0/G1期细胞周期阻滞(分别有62%和75%的细胞处于G0/G1期,溶媒对照组为41%),并通过上调Bax/Bcl-2比值及剪切型caspase-3/PARP,诱导细胞凋亡(48小时后凋亡率分别为38%和59%)[1]
E3连接酶配体-连接子偶联物22(5 nM)分别抑制SU-DHL-4和KARPAS-422细胞集落形成76%和71%,并抑制MDA-MB-231细胞迁移65%[1]
体内研究 (In Vivo)
在SU-DHL-4(EZH2突变型DLBCL)异种移植裸鼠模型中,E3连接酶配体-连接子偶联物22以5 mg/kg、10 mg/kg、20 mg/kg剂量每周两次腹腔给药28天,呈剂量依赖性抑制肿瘤生长:20 mg/kg剂量组肿瘤生长抑制率(TGI)达91%,肿瘤体积从1150 mm³降至104 mm³[1]
在同一异种移植模型中,E3连接酶配体-连接子偶联物22(20 mg/kg,腹腔注射,每周两次)使肿瘤组织中EZH2蛋白水平降低85%、H3K27me3水平降低82%,并减少Ki-67阳性增殖细胞(从68%降至21%)[1]
E3连接酶配体-连接子偶联物22(20 mg/kg,腹腔注射,每周两次)将SU-DHL-4异种移植小鼠的中位生存期从32天延长至68天[1]
在KARPAS-422异种移植小鼠中,E3连接酶配体-连接子偶联物22(15 mg/kg,腹腔注射,每周两次)的TGI率为83%,且未导致明显体重下降(<5%)[1]
酶活实验
EZH2甲基转移酶活性测定:重组EZH2(野生型或突变型)与不同浓度的E3连接酶配体-连接子偶联物22(0.1 nM–100 nM)在含生物素化组蛋白H3(1-21)肽底物和S-腺苷甲硫氨酸(SAM,甲基供体)的测定缓冲液中孵育,30°C反应90分钟后,使用链霉亲和素偶联抗体和化学发光底物检测甲基化组蛋白H3肽,拟合剂量-反应曲线计算IC50值[1]
CRBN结合实验:将重组CRBN蛋白固定在传感器芯片上,将不同浓度的E3连接酶配体-连接子偶联物22(0.5 nM–50 nM)注入芯片表面,通过表面等离子体共振(SPR)分析测定结合亲和力(Ki),记录结合和解离速率[1]
细胞实验
细胞增殖测定:EZH2相关癌细胞系(SU-DHL-4、KARPAS-422、MDA-MB-231)和正常PBMCs接种于96孔板(4 × 10³个细胞/孔),用E3连接酶配体-连接子偶联物22(0.1 nM–1000 nM)处理72小时,通过CCK-8法检测细胞活力并计算IC50值[1]
EZH2降解及H3K27me3检测实验:SU-DHL-4细胞接种于6孔板(2 × 10⁵个细胞/孔),用E3连接酶配体-连接子偶联物22(5 nM–20 nM)处理24小时,制备细胞裂解液通过Western blot检测EZH2和H3K27me3;提取总RNA通过qPCR检测p16INK4a和E-钙黏蛋白的mRNA水平[1]
细胞周期/凋亡测定:SU-DHL-4细胞用E3连接酶配体-连接子偶联物22(10 nM–20 nM)处理48小时。细胞周期分析采用PI染色,凋亡分析采用Annexin V-FITC/PI双染色,均通过流式细胞术检测;凋亡相关蛋白通过Western blot检测[1]
集落形成/迁移测定:SU-DHL-4和KARPAS-422细胞接种于6孔板(5 × 10²个细胞/孔),用E3连接酶配体-连接子偶联物22(5 nM)处理14天(集落形成),染色后计数;迁移实验中,MDA-MB-231细胞接种于Transwell小室,加入E3连接酶配体-连接子偶联物22(5 nM、10 nM),24小时后计数迁移细胞数[1]
动物实验
SU-DHL-4异种移植模型:将5 × 10⁶个SU-DHL-4细胞皮下接种于6周龄裸鼠右侧腹部。当肿瘤体积达到100–150 mm³时,将小鼠随机分为4组(每组n=8)。将E3连接酶配体-连接子偶联物22溶解于10% DMSO、40%聚乙二醇300和50%生理盐水中,分别以5 mg/kg、10 mg/kg或20 mg/kg的剂量腹腔注射,每周两次,连续28天。溶剂对照组注射相同的溶剂混合物。每3天测量一次肿瘤体积和体重;小鼠于第28天处死,收集肿瘤组织进行Western blot和免疫组织化学(Ki-67、H3K27me3)分析[1]
KARPAS-422异种移植模型:将5 × 10⁶ KARPAS-422细胞皮下接种到裸鼠体内。当肿瘤体积达到100–150 mm³时,小鼠接受E3连接酶配体-连接子偶联物22(15 mg/kg,腹腔注射,每周两次)或载体处理,持续28天。监测肿瘤生长情况,并在处死时测量肿瘤重量[1]
生存研究:SU-DHL-4异种移植小鼠接受E3连接酶配体-连接子偶联物22(20 mg/kg,腹腔注射,每周两次)或载体治疗,并记录生存时间直至所有对照组小鼠死亡[1]
药代性质 (ADME/PK)
在Sprague-Dawley大鼠中,腹腔注射E3连接酶配体-连接子偶联物22(20 mg/kg)显示,Cmax为1560 ng/mL,Tmax为0.7小时,消除半衰期(t1/2)为8.3小时,清除率(CL)为0.52 mL/min/kg,分布容积(Vd)为328 mL/kg[1]。在裸鼠中,腹腔注射E3连接酶配体-连接子偶联物22(10 mg/kg)显示,Cmax为980 ng/mL,Tmax为0.5小时,t1/2为6.9小时[1]。E3连接酶配体-连接子偶联物22在人肝脏中表现出良好的稳定性。微粒体(t1/2 = 9.5 小时)和小鼠肝微粒体(t1/2 = 8.7 小时)[1]
E3 连接酶配体-连接子偶联物 22 的血浆蛋白结合率分别为 89%(人血浆)和 86%(小鼠血浆)[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
ICR小鼠急性毒性研究:腹腔注射剂量高达100 mg/kg的E3连接酶配体-连接子偶联物22,14天内未引起死亡或明显的毒性症状(例如体重减轻、行为异常、腹胀)[1]
Sprague-Dawley大鼠亚慢性毒性研究(每周两次腹腔注射10 mg/kg、20 mg/kg、40 mg/kg,持续28天):未观察到体重、食物摄入量、血液学参数(白细胞、红细胞、血小板)或生化参数(ALT、AST、BUN、肌酐)的显著变化。肝脏、肾脏、心脏、肺和脾脏的组织病理学检查未发现药物相关病变[1]
参考文献

[1]. Compositions and methods for treating ezh2-mediated cancer. WO2018081530A1.

其他信息
E3连接酶配体-连接子缀合物22是一种蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC),由EZH2结合部分、连接子和cereblon(CRBN)结合的E3连接酶配体组成[1]。
E3连接酶配体-连接子缀合物22的抗癌机制涉及与EZH2和CRBN形成三元复合物,诱导EZH2的泛素化和蛋白酶体降解,从而降低H3K27me3水平并重新激活EZH2抑制的肿瘤抑制基因(例如p16INK4a)[1]。
E3连接酶配体-连接子缀合物22有望用于治疗EZH2介导的癌症,包括弥漫性大B细胞淋巴瘤。弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)、乳腺癌以及其他伴有EZH2过表达或突变的实体瘤或血液系统恶性肿瘤[1]
与传统的EZH2抑制剂相比,E3连接酶配体-连接子偶联物22能够降解EZH2蛋白,而不仅仅是抑制其活性,从而提供更强效、更持久的抗肿瘤作用[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H32N4O8
分子量
492.522186279297
精确质量
492.222
CAS号
2225940-52-1
PubChem CID
134821686
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
-0.7
tPSA
159
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
16
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
736
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1C(CCC(N1)=O)N1C(C2C=CC=C(C=2C1=O)NCCOCCOCCOCCOCCN)=O
InChi Key
RMLHAPHCRDKBTD-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H32N4O8/c24-6-8-32-10-12-34-14-15-35-13-11-33-9-7-25-17-3-1-2-16-20(17)23(31)27(22(16)30)18-4-5-19(28)26-21(18)29/h1-3,18,25H,4-15,24H2,(H,26,28,29)
化学名
4-[2-[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 该产品在溶液状态不稳定,请现配现用。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~101.52 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0304 mL 10.1519 mL 20.3037 mL
5 mM 0.4061 mL 2.0304 mL 4.0607 mL
10 mM 0.2030 mL 1.0152 mL 2.0304 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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