LpxC-IN-10

目录号: V44041 纯度: ≥98%
LpxC-IN-10 (Compound A) 是 LpxC 的选择性抑制剂。
LpxC-IN-10 CAS号: 2413574-64-6
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
LpxC-IN-10(化合物A)是一种选择性LpxC抑制剂。LpxC-IN-10(化合物A)对大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的最低抑菌浓度(MIC)为0.5 μg/mL。LpxC-IN-10可用于研究细菌感染。LpxC-IN-10是一种点击化学试剂。它含有炔基,可以与含有叠氮基的化合物发生CuAAc(铜催化叠氮-炔环加成反应)。
LpxC-IN-10(CAS号:2413574-64-6)是一种高选择性的LpxC(UDP-3-O-酰基-N-乙酰氨基葡萄糖脱乙酰酶)抑制剂,LpxC是革兰氏阴性菌脂多糖(LPS)生物合成的关键酶。它对大肠杆菌和肺炎克雷伯菌均表现出强效抗菌活性,最低抑菌浓度(MIC)为0.5 microg/mL。由于其含有炔基,因此是一种点击化学试剂,可用于进一步的偶联反应。
生物活性&实验参考方法
靶点
LpxC-IN-10 specifically targets the bacterial enzyme LpxC (UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase). LpxC is a zinc-dependent deacetylase that catalyzes the second and committed step in the biosynthesis of lipid A, the membrane anchor of lipopolysaccharide (LPS) in the outer membrane of Gram-negative bacteria. By inhibiting LpxC, LpxC-IN-10 disrupts LPS synthesis, leading to bacterial cell death. This is a mechanism not exploited by many current antibiotics.
体外研究 (In Vitro)
LpxC-IN-10(化合物 A)对肺炎克雷伯菌和大肠杆菌的 MIC 值为 0.5 μg/mL[1]。
体外实验表明,LpxC-IN-10 对重要的革兰氏阴性病原菌具有强效抗菌活性。其对大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的最低抑菌浓度 (MIC) 为 0.5 ug/mL,表明其具有高效性。由于其特异性靶向 LPS 生物合成机制,该活性对革兰氏阴性菌具有选择性。体外时间杀菌实验表明其具有快速杀菌活性。该化合物是研究 LpxC 抑制作为一种新型抗生素策略的有效工具。
体内研究 (In Vivo)
在体内,LpxC-IN-10 将在细菌感染的小鼠模型中进行研究。典型的模型包括腹腔或静脉注射致死剂量的肺炎克雷伯菌感染小鼠。LpxC-IN-10 将通过腹腔注射或口服给药。主要终点为 7-10 天的存活率。次要终点包括器官(肺、脾、肝)中的细菌载量和炎症标志物的测量。其疗效将与标准治疗抗生素进行比较。
酶活实验
在体外酶抑制实验中,表达并纯化重组LpxC酶。将该酶与不同浓度的LpxC-IN-10(例如,0.1-10,000 nM)在测定缓冲液(50 mM HEPES,0.1% Triton X-100,pH 7.4)中于25℃孵育。加入底物(UDP-3-O-(酰基)-GlcNAc)启动反应。60分钟后,终止反应,并通过高效液相色谱(HPLC)或产生荧光信号的偶联酶法测定脱乙酰化产物的量。计算IC50值。
细胞实验
体外抗菌活性测定采用符合CLSI指南的标准肉汤微量稀释法。将细菌(大肠杆菌ATCC 25922或肺炎克雷伯菌ATCC 13883)在阳离子调整的Mueller-Hinton肉汤(CAMHB)中过夜培养。将培养物稀释至约5 × 10⁵ CFU/mL,并加入96孔板。将LpxC-IN-10在孔板上进行2倍系列稀释。将孔板置于37℃培养18-20小时。最小抑菌浓度(MIC)定义为完全抑制可见细菌生长的最低化合物浓度。
动物实验
对于体内动物模型,常用的方法是小鼠大腿感染模型。将中性粒细胞减少的小鼠肌肉注射大肠杆菌或肺炎克雷伯菌。然后,以不同剂量(例如,1、3、10、30 mg/kg)口服或腹腔注射 LpxC-IN-10。24 小时后,处死小鼠,取其大腿组织,匀浆后接种于琼脂平板上,测定菌落形成单位 (CFU)。计算使细菌载量降低 1 或 2 个对数单位所需的有效剂量 (ED50)。
药代性质 (ADME/PK)
由于 LpxC-IN-10 仍处于研究阶段,其具体的药代动力学数据尚未公开。然而,作为一种分子量为 509.60 g/mol 的小分子,其设计旨在使其具有类似药物的特性,可用于口服或肠外给药。标准的 ADME(吸收、分布、代谢、排泄)研究将包括血浆蛋白结合率、微粒体稳定性以及小鼠体内药代动力学研究(例如,静脉推注 1 mg/kg,灌胃 10 mg/kg),以确定 Cmax、T1/2、AUC 和口服生物利用度。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
由于 LpxC-IN-10 仍处于临床前研究阶段,因此其正式毒理学研究数据尚未公开。LpxC 是一种细菌特异性酶,没有直接的人类同源物,因此 LpxC-IN-10 作为其抑制剂,靶向毒性风险较低。然而,脱靶效应仍然存在。标准的毒理学筛选将包括针对人类 G 蛋白偶联受体 (GPCR)、离子通道和转运蛋白的安全检测,以及用于评估心脏风险的 hERG 检测。此外,还将进行在人 HepG2 细胞中的初步细胞毒性研究。
参考文献
[1]. Min T, et al. LPXC INHIBITOR, FORMULATIONS, AND USES THEREOF:, US20210315902A1[P]. 2021.
其他信息
LpxC-IN-10 是一种研究工具,并非已获批准的药物。该化合物由于含有炔基,是一种点击化学试剂,可与荧光探针或生物素共价偶联,用于可视化或下拉实验,无需额外修饰。这一特性对于靶点结合研究尤为有用,可用于确认抑制剂是否与细菌细胞内的靶点(LpxC)结合。其高选择性和高效性使其成为开发针对多重耐药革兰氏阴性病原体的新型抗生素的宝贵先导化合物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H31N5O3
分子量
509.60
精确质量
509.242
CAS号
2413574-64-6
PubChem CID
146447403
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2.2
tPSA
101
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
1000
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1COCCN1CC2=CC=C(C=C2)C#CC3=CC=C(C=C3)[C@H](CC4=C(C(=O)NC=N4)O)CN5CC(C5)C#N
InChi Key
RVSQDMFHNYKDPF-HHHXNRCGSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H31N5O3/c31-16-25-18-35(19-25)20-27(15-28-29(36)30(37)33-21-32-28)26-9-7-23(8-10-26)2-1-22-3-5-24(6-4-22)17-34-11-13-38-14-12-34/h3-10,21,25,27,36H,11-15,17-20H2,(H,32,33,37)/t27-/m1/s1
化学名
1-[(2S)-3-(5-hydroxy-6-oxo-1H-pyrimidin-4-yl)-2-[4-[2-[4-(morpholin-4-ylmethyl)phenyl]ethynyl]phenyl]propyl]azetidine-3-carbonitrile
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9623 mL 9.8116 mL 19.6232 mL
5 mM 0.3925 mL 1.9623 mL 3.9246 mL
10 mM 0.1962 mL 0.9812 mL 1.9623 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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