| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Alkylglycerone phosphate synthase (AGPS). The compound is a covalent inhibitor targeting AGPS by binding to its active site, involving interactions with the FAD cofactor and key residues such as Asp303, Ser527, His616, and His617. [1]
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| 体外研究 (In Vitro) |
- 结合亲和力（ThermoFAD）： 在测定蛋白热迁移（ΔTm）的ThermoFAD实验中，化合物2i在该系列中显示出最高的结合亲和力，ΔTm为+5.0°C。 [1]
其拆分得到的单一对映体中，第一个洗脱的对映体ΔTm为+3.0°C，第二个洗脱的对映体ΔTm为+6.0°C。 [1] - 酶活性抑制（放射性实验）： 在使用棕榈酰‑DHAP和[1‑14C]十六醇作为底物的放射性酶活测定中，2i（180 μM）对AGPS酶活性的抑制效果与参考化合物1相当或略强。 [1] 由于底物疏水性易形成胶束，无法准确测定Km及Ki/IC50值。 [1] - 降低醚脂水平（231MFP细胞）： 用500 μM 2i处理231MFP乳腺癌细胞24小时后，通过LC‑MS/MS脂质组学分析发现，多种醚磷脂（如MAG、PA、PI、PC、PS、LPC、LPE、LPA的醚形式）的水平降低了50‑70%。 [1] - 抑制细胞迁移（231MFP细胞）： 在Transwell迁移实验中，用500 μM 2i预处理231MFP细胞6小时，细胞迁移率较DMSO对照组降低78%。 [1] - 细胞存活率影响（231MFP细胞）： 用500 μM 2i处理231MFP细胞24小时和48小时后，细胞存活率分别降低44%和57%（相对于DMSO对照）。 [1] - 细胞增殖影响（PC‑3、MDA‑MB‑231、Met5A细胞）： 在PC‑3前列腺癌和MDA‑MB‑231乳腺癌细胞中，2i（50、100、250 μM）处理24小时后，细胞增殖呈浓度依赖性降低，在250 μM时抑制作用显著，尤其在MDA‑MB‑231细胞中（该细胞AGPS mRNA表达水平较高）。 [1] 在非致瘤性Met5A细胞中，即使250 μM的2i对增殖的影响也可忽略不计，表明其具有癌细胞选择性。 [1] - EMT标志物调节（PC‑3、MDA‑MB‑231细胞）： 用50或100 μM 2i处理PC‑3和MDA‑MB‑231细胞24小时后，RT‑PCR检测显示E‑钙粘蛋白（E‑cadherin）mRNA水平升高，而Snail和MMP2 mRNA水平降低。 [1] 这些变化与化合物1相似或更显著，而阴性对照化合物2s无活性。 [1] - AGPS敲低联合实验（MDA‑MB‑231细胞）： 在转染AGPS siRNA的MDA‑MB‑231细胞中，再用100 μM 2i处理24小时，E‑钙粘蛋白、Snail和MMP2 mRNA水平的变化与单独使用siRNA或单独使用2i相似，无叠加效应，证实2i对EMT的调节特异性依赖于AGPS抑制。 [1] |
| 酶活实验 |
- ThermoFAD结合实验： 为评估化合物与AGPS的结合，进行了ThermoFAD实验。将5 μM AGPS与180 μM待测化合物在缓冲液（50 mM HEPES pH 7.5、50 mM NaCl、5%甘油）中混合，终体积20 μL。 [1]
施加25°C至70°C的温度梯度，每0.2°C监测荧光（激发485±30 nm，发射625±30 nm）5秒。从FAD释放时荧光增加确定蛋白解折叠温度（Tm）。ΔTm表示加入化合物后Tm的变化，反映结合亲和力。2i的ΔTm为+5.0°C。 [1] - 放射性酶活抑制实验： 采用放射性底物测定AGPS酶活性。反应体系包含AGPS蛋白、100 μM棕榈酰‑DHAP、96 μM [1‑14C]十六醇及180 μM抑制剂。 [1] 随时间监测[1‑14C]十六烷基‑DHAP的生成量。无活性的AGPS突变体T578F作为阴性对照。通过比较产物生成曲线评估抑制效果。2i抑制AGPS活性，效果与化合物1相当或略强。 [1] 由于底物疏水，在测定条件下易形成胶束并沉淀，无法准确测定Km及Ki/IC50值。 [1] |
| 细胞实验 |
- 脂质组学分析（231MFP细胞）： 将231MFP细胞在无血清培养基中培养24小时以减少血清来源代谢物干扰，然后用500 μM 2i或DMSO处理24小时。 [1]
收集细胞（1×10⁶），PBS洗涤，速冻。用4 mL氯仿:甲醇:磷酸盐缓冲盐水（2:1:1，pH 7.4，含内标C12:0十二烷基甘油和十五烷酸）提取脂质。 [1] 收集有机相，氮气吹干，溶于120 μL氯仿。取10 μL用基于SRM的LC‑MS/MS分析。 [1] 通过比较峰面积与DMSO对照，计算各醚脂的相对水平。2i处理使多种醚磷脂降低50‑70%。 [1] - 细胞迁移实验（231MFP细胞）： 使用预包被胶原的Transwell小室。231MFP细胞用500 μM 2i预处理24小时，胰酶消化后重悬于无血清培养基，接种于上室（2×10⁴细胞/孔），下室加入含血清培养基作为趋化剂。 [1] 培养6小时后，擦去上室未迁移细胞，下室迁移细胞经固定、染色后计数。迁移率表示为DMSO对照的百分比。2i处理使迁移率降低78%。 [1] - 细胞存活率测定（231MFP细胞）： 231MFP细胞接种于96孔板，用500 μM 2i处理24或48小时，加入MTS试剂，测定490 nm吸光度。 [1] 存活率表示为处理组与DMSO对照吸光度百分比。24小时和48小时分别降低44%和57%。 [1] - 细胞增殖测定（PC‑3、MDA‑MB‑231、Met5A细胞）： 细胞以20×10³/孔接种于96孔板，培养24小时后换用含不同浓度2i（50、100、250 μM）的培养基，继续培养24小时，加入MTS试剂测定490 nm吸光度。 [1] 存活率表示为DMSO对照百分比。进行3次独立实验（共8次测定）。 [1] - RNA提取和RT‑qPCR（PC‑3、MDA‑MB‑231细胞）： 细胞用50或100 μM 2i处理24小时，提取总RNA并逆转录。 [1] 用SYBR Green qPCR预混液及E‑钙粘蛋白、Snail、MMP2和内参L32的特异性引物进行qPCR。相对表达量用2⁻ΔCt法计算并以L32归一化。2i使E‑钙粘蛋白mRNA升高，Snail和MMP2 mRNA降低。 [1] - siRNA干扰实验（MDA‑MB‑231细胞）： 用脂质体转染试剂将AGPS siRNA或对照siRNA转染MDA‑MB‑231细胞。 [1] 转染24小时后换液，加入100 μM 2i或等体积DMSO，继续培养24小时。提取RNA，通过RT‑qPCR检测AGPS、E‑钙粘蛋白、Snail和MMP2 mRNA水平。 [1] AGPS敲低与2i联合处理产生的变化与单独处理相似，证实2i对AGPS的特异性。 [1] |
| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
对非肿瘤细胞的影响：在非肿瘤性人间皮细胞 Met5A 中，用浓度高达 250 μM 的 2i 处理 24 小时后，对细胞增殖的影响可以忽略不计，表明其对癌细胞具有一定的选择性。[1]
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
背景与机制：AGPS 是一种过氧化物酶体黄素酶，它催化醚脂生物合成的关键步骤，即以 FAD 为辅因子，通过非氧化还原机制将酰基-DHAP 的脂肪酰链与脂肪醇交换。[1]
AGPS 在多种侵袭性癌症（乳腺癌、黑色素瘤、前列腺癌）中表达上调，其敲低可降低醚脂水平和致癌信号分子，从而抑制肿瘤生长。[1] 化合物 2i 是通过对首个 AGPS 抑制剂 1 进行基于结构的优化而开发的，在苯环上引入了 2,6-二氟取代基，增强了底物结合通道内的疏水相互作用，从而提高了结合能力和抑制效力。 [1] - EMT 调控：通过抑制 AGPS，2i 上调 E-钙黏蛋白，下调 Snail 和 MMP2，从而抑制上皮-间质转化 (EMT)，EMT 是肿瘤侵袭和转移的关键过程。[1] 这些效应已在 PC-3 和 MDA-MB-231 细胞中得到证实，并且与 AGPS 基因敲低的表型相似，表明这些效应是由 AGPS 抑制特异性介导的。[1] - 癌细胞选择性：2i 在 AGPS 高表达的癌细胞（例如 MDA-MB-231）中表现出比在非肿瘤性 Met5A 细胞中更强的抗增殖活性，这表明其具有癌症选择性治疗的潜力。[1] |
| 分子式 |
C18H17F2N3O2
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|---|---|
| 分子量 |
345.3
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| 精确质量 |
345.128
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| 元素分析 |
C, 62.60; H, 4.96; F, 11.00; N, 12.17; O, 9.27
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| CAS号 |
2316782-88-2
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| PubChem CID |
155559442
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| 外观&性状 |
Off-white to light brown solid powder
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| LogP |
2.1
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| tPSA |
70.2
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
|
| 可旋转键数目(RBC) |
5
|
| 重原子数目 |
25
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| 分子复杂度/Complexity |
495
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C(C1=CC=C2NC(=O)NC2=C1)NC(=O)CC(C1C(=CC=CC=1F)F)C
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| InChi Key |
VDLFVZUKOKPJRH-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C18H17F2N3O2/c1-10(17-12(19)3-2-4-13(17)20)7-16(24)21-9-11-5-6-14-15(8-11)23-18(25)22-14/h2-6,8,10H,7,9H2,1H3,(H,21,24)(H2,22,23,25)
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| 化学名 |
3-(2,6-difluorophenyl)-N-[(2-oxo-1,3-dihydrobenzimidazol-5-yl)methyl]butanamide
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| 别名 |
AGPS-IN-1; 2316782-88-2; AGPS-IN-2i; 3-(2,6-Difluorophenyl)-N-((2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)methyl)butanamide; AGPS-IN-2i?;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: ~125 mg/mL (362 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8960 mL | 14.4802 mL | 28.9603 mL | |
| 5 mM | 0.5792 mL | 2.8960 mL | 5.7921 mL | |
| 10 mM | 0.2896 mL | 1.4480 mL | 2.8960 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
Lalistat 2
D-(-)-3-Phosphoglyceric acid disodium (3-Phospho-D-glyceric acid disodium)
STC-15
TSR-033
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