| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
Alkylglycerone phosphate synthase (AGPS). The compound is a covalent inhibitor targeting AGPS by binding to its active site, involving interactions with the FAD cofactor and key residues such as Asp303, Ser527, His616, and His617. [1]
AGPS-IN-1 targets alkylglyceronephosphate synthase (AGPS), a key enzyme in ether lipid biosynthesis. By binding to AGPS, it reduces ether lipid levels and inhibits cell migration. It specifically reverses the EMT process by upregulating E-cadherin and downregulating Snail and MMP2. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
结合亲和力（ThermoFAD）：在测量蛋白质热位移 (ΔTm) 的 ThermoFAD 检测中，化合物 2i 在该系列化合物中表现出最高的结合亲和力，ΔTm 为 +5.0 °C。[1]
其分离的单一对映异构体，第一个洗脱的对映异构体的 ΔTm 为 +3.0 °C，第二个洗脱的对映异构体的 ΔTm 为 +6.0 °C。[1] - 酶抑制（放射性测定）：在以棕榈酰-DHAP 和 [1-14C]十六烷醇为底物的放射性测定中，化合物 2i (180 μM) 对 AGPS 酶活性的抑制程度与参考化合物 1 相当或略优。[1] 由于底物的疏水性导致胶束形成，因此无法准确测定 Km 和 Ki/IC50 值。 [1] - 醚脂减少（231MFP 细胞）：用 500 μM 2i 处理 231MFP 乳腺癌细胞 24 小时后，LC-MS/MS 脂质组学分析显示，多种醚磷脂（例如，MAG、PA、PI、PC、PS、LPC、LPE、LPA 的醚形式）的水平降低了 50-70%。[1] - 细胞迁移抑制（231MFP 细胞）：在 Transwell 迁移实验中，用 500 μM 2i 预处理 231MFP 细胞 6 小时后，与 DMSO 对照组相比，细胞迁移率降低了 78%。 [1] - 细胞活力效应（231MFP 细胞）：用 500 μM 的 2i 处理 231MFP 细胞 24 小时和 48 小时后，细胞活力分别比 DMSO 对照组降低了 44% 和 57%。[1] - 增殖效应（PC-3、MDA-MB-231、Met5A 细胞）：在 PC-3 前列腺癌细胞和 MDA-MB-231 乳腺癌细胞中，2i（50、100、250 μM）处理 24 小时后，细胞增殖呈浓度依赖性降低，其中 250 μM 的抑制作用尤为显著，尤其是在 MDA-MB-231 细胞（该细胞表达较高水平的 AGPS mRNA）中。 [1]在非肿瘤性Met5A细胞中，即使浓度高达250 μM，2i也几乎没有作用，表明其对癌细胞具有选择性。[1] - EMT标志物调控（PC-3、MDA-MB-231细胞）：用50或100 μM的2i处理PC-3和MDA-MB-231细胞24小时后，RT-PCR检测显示E-钙黏蛋白mRNA水平升高，Snail和MMP2 mRNA水平降低。[1]这些作用与化合物1的作用相似或更强，而无活性的类似物2s则没有作用。 [1] - AGPS 敲低组合（MDA-MB-231 细胞）：在用 AGPS siRNA 转染的 MDA-MB-231 细胞中，用 100 μM 2i 处理 24 小时后，E-钙黏蛋白、Snail 和 MMP2 mRNA 水平的变化与单独使用 siRNA 或 2i 观察到的变化相似，没有叠加效应，这证实了 2i 对 EMT 的调控特异性地依赖于 AGPS 抑制。[1] 体外实验表明，AGPS-IN-1 可降低醚脂水平和细胞迁移率。它抑制前列腺癌 PC-3 和乳腺癌 MDA-MB-231 细胞的上皮-间质转化 (EMT)。它上调 E-钙黏蛋白，下调 Snail 和 MMP2。该化合物在研究侵袭性肿瘤方面显示出潜力。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在体内，AGPS-IN-1在癌症研究中具有潜在应用价值，尤其适用于侵袭性肿瘤。其逆转EMT和降低细胞迁移的能力提示其可能具有抑制转移的潜力。然而，目前关于其体内疗效的详细数据有限，需要进一步研究。
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| 酶活实验 |
ThermoFAD结合实验：为了评估化合物与AGPS的结合，进行了ThermoFAD实验。将5 μM AGPS与180 μM测试化合物在缓冲液（50 mM HEPES pH 7.5、50 mM NaCl、5%甘油）中孵育，最终体积为20 μL。[1]
施加25 °C至70 °C的温度梯度，并以0.2 °C的间隔监测荧光（激发波长485±30 nm，发射波长625±30 nm），持续5秒。通过FAD从蛋白质释放后荧光强度的增加来确定展开温度（Tm）。ΔTm表示加入化合物后Tm的变化，反映了结合亲和力。对于2i，ΔTm为+5.0 °C。 [1] - 放射性酶活性测定：使用放射性底物测定 AGPS 酶活性。反应混合物包含 AGPS 蛋白、100 μM 棕榈酰-DHAP、96 μM [1-14C]十六醇和 180 μM 抑制剂。[1] 监测 [1-14C]十六烷基-DHAP 的生成情况。催化失活的 AGPS 突变体 T578F 作为阴性对照。通过比较产物生成曲线评估抑制效果。2i 对 AGPS 活性的抑制效力与化合物 1 相似或略优。[1] 由于底物的疏水性，在测定条件下容易形成胶束并沉淀，因此无法确定准确的 Km 和 Ki/IC50 值。[1] AGPS-IN-1 的无细胞测定包括 AGPS 结合研究。将该化合物与纯化的AGPS孵育，并使用表面等离子共振或等温滴定量热法测定其结合亲和力。酶活性测定可通过监测底物向产物的转化来测量AGPS抑制情况。 |
| 细胞实验 |
脂质组学分析（231MFP 细胞）：将 231MFP 细胞在无血清培养基中培养 24 小时，以最大程度地减少血清来源的代谢物，然后用 500 μM 2i 或 DMSO 处理 24 小时。[1]
收集细胞（1×10⁶），用 PBS 洗涤，并速冻。用 4 mL 含有内标（C12:0 十二烷基甘油和十五烷酸）的氯仿：甲醇：磷酸盐缓冲液（2:1:1，pH 7.4）提取脂质。[1] 收集有机层，在氮气下干燥，并溶解于 120 μL 氯仿中。取 10 μL 样品，使用配备 ESI 源和 Luna C5 反相柱的 Agilent 6430 QQQ 液相色谱仪，通过基于 SRM 的 LC-MS/MS 进行分析。 [1] 通过与DMSO对照组比较峰面积来计算醚脂的相对含量。用2i处理可使多种醚磷脂含量降低50-70%。[1] -细胞迁移实验（231MFP细胞）：使用Transwell小室（预先包被胶原蛋白）。将231MFP细胞用500 μM 2i预处理24小时，然后用胰蛋白酶消化并重悬于无血清培养基中。[1] 将细胞（2×10⁴）接种于上室，下室加入含血清培养基作为趋化因子。6小时后，去除上室未迁移的细胞，并将下室迁移的细胞固定、染色和计数。迁移率以DMSO对照组的百分比表示。2i使细胞迁移率降低了78%。 [1] - 细胞活力检测（231MFP 细胞）：将 231MFP 细胞接种于 96 孔板中，并用 500 μM 的 2i 处理 24 或 48 小时。[1] 加入 MTS 试剂，并在 490 nm 处测量吸光度。细胞活力以 DMSO 对照组的百分比表示。24 小时和 48 小时后分别观察到细胞活力下降 44% 和 57%。[1] - 细胞增殖检测（PC-3、MDA-MB-231、Met5A 细胞）：将细胞（20×10³/孔）接种于 96 孔板中。24 小时后，加入含有 2i（50、100、250 μM）或 DMSO 的培养基，并继续培养 24 小时。 [1] 随后加入MTS试剂，并在490 nm处测量吸光度。细胞活力以DMSO对照组的百分比表示。进行了三次独立实验（共8次测量）。[1] - RNA提取和RT-qPCR（PC-3、MDA-MB-231细胞）：用50或100 μM的2i处理细胞24小时。[1] 使用商业试剂盒分离总RNA并进行逆转录。使用SYBR Green Master Mix和针对E-cadherin、Snail、MMP2和管家基因L32的特异性引物进行qPCR。[1] 使用2⁻ΔCt法计算相对表达量，并以L32进行标准化。2i增加了E-cadherin mRNA的表达水平，并降低了Snail和MMP2 mRNA的表达水平。 [1] - siRNA 敲低实验（MDA-MB-231 细胞）：使用脂质体转染试剂将 AGPS siRNA（AGPS#1 和 AGPS#2，总计 100 pmol）或对照 siRNA 转染至细胞中。[1] 24 小时后，更换新鲜培养基，加入 100 μM 2i 或等体积的 DMSO，继续培养 24 小时。提取 RNA，并通过 RT-qPCR 分析 AGPS、E-cadherin、Snail 和 MMP2 的表达。[1] AGPS 敲低联合 2i 处理的效果与单独处理相似，证实了 2i 对 AGPS 的特异性。[1] AGPS-IN-1 的细胞实验采用前列腺癌 PC-3 细胞和乳腺癌 MDA-MB-231 细胞。将细胞用浓度为 0.1-100 µM 的 AGPS-IN-1 处理 24-72 小时。采用 LC-MS/MS 法测定醚脂水平。通过划痕实验或 Transwell 实验评估细胞迁移能力。采用 Western blot 或 qPCR 法检测 EMT 标志物（E-cadherin、Snail、MMP2）。 |
| 动物实验 |
关于AGPS-IN-1的体内动物研究报道不多。基于其体外活性，可采用前列腺癌或乳腺癌异种移植小鼠模型评估其疗效。将AGPS-IN-1给药于小鼠，并评估肿瘤生长、转移和EMT标志物。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
AGPS-IN-1 的药代动力学性质尚未得到充分表征。分子量：345.34。溶解度：DMSO 中溶解度为 125 mg/mL (361.96 mM)。储存条件：-20°C。纯度：≥98%。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
对非肿瘤细胞的影响：在非肿瘤人上皮细胞Met5A中，浓度高达250 μM的2i处理24小时后，对细胞增殖的影响可忽略不计，表明其对癌细胞具有一定的选择性。[1]
AGPS-IN-1的全面毒性数据有限。该化合物仅供研究使用，尚未获准用于临床。应遵循标准的实验室安全预防措施。目前尚未有具体的毒理学研究报告。 |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
背景与机制：AGPS 是一种过氧化物酶体黄素酶，催化醚脂生物合成的关键步骤，即以 FAD 为辅因子，通过非氧化还原机制将酰基-DHAP 的脂肪酰链与脂肪醇交换。[1]
AGPS 在多种侵袭性癌症（如乳腺癌、黑色素瘤、前列腺癌）中表达上调，其敲低可降低醚脂水平和致癌信号分子，从而抑制肿瘤生长。[1] 化合物 2i 是通过优化首个 AGPS 抑制剂 1 的结构而开发的，在苯环上引入 2,6-二氟取代基，以增强底物结合通道内的疏水相互作用，从而提高结合能力和抑制效力。 [1] - EMT 调控：化合物 2i 通过抑制 AGPS，上调 E-钙黏蛋白，下调 Snail 和 MMP2，从而抑制上皮-间质转化 (EMT)，EMT 是肿瘤侵袭和转移的关键过程。[1] 这些作用已在 PC-3 和 MDA-MB-231 细胞中得到证实，并且与 AGPS 基因敲低的表型相似，表明这些作用是由 AGPS 抑制特异性介导的。[1] - 癌细胞选择性：化合物 2i 在 AGPS 过表达的癌细胞（例如 MDA-MB-231）中表现出比在非肿瘤 Met5A 细胞中更强的抗增殖活性，表明其具有选择性癌症治疗的潜力。[1] AGPS-IN-1 是一种研究化合物，具有在癌症研究，特别是 EMT 和转移研究中的潜在应用价值。它是一种AGPS结合剂，可降低醚脂水平并抑制细胞迁移。该化合物可从化学品供应商处获得。目前尚未有临床试验或FDA批准的报道。 |
| 分子式 |
C18H17F2N3O2
|
|---|---|
| 分子量 |
345.3
|
| 精确质量 |
345.128
|
| 元素分析 |
C, 62.60; H, 4.96; F, 11.00; N, 12.17; O, 9.27
|
| CAS号 |
2316782-88-2
|
| PubChem CID |
155559442
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| 外观&性状 |
Off-white to light brown solid powder
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| LogP |
2.1
|
| tPSA |
70.2
|
| 氢键供体(HBD)数目 |
3
|
| 氢键受体(HBA)数目 |
4
|
| 可旋转键数目(RBC) |
5
|
| 重原子数目 |
25
|
| 分子复杂度/Complexity |
495
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
C(C1=CC=C2NC(=O)NC2=C1)NC(=O)CC(C1C(=CC=CC=1F)F)C
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| InChi Key |
VDLFVZUKOKPJRH-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C18H17F2N3O2/c1-10(17-12(19)3-2-4-13(17)20)7-16(24)21-9-11-5-6-14-15(8-11)23-18(25)22-14/h2-6,8,10H,7,9H2,1H3,(H,21,24)(H2,22,23,25)
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| 化学名 |
3-(2,6-difluorophenyl)-N-[(2-oxo-1,3-dihydrobenzimidazol-5-yl)methyl]butanamide
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| 别名 |
AGPS-IN-1; 2316782-88-2; AGPS-IN-2i; 3-(2,6-Difluorophenyl)-N-((2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-5-yl)methyl)butanamide; AGPS-IN-2i?;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: ~125 mg/mL (362 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方，主要用于溶解难溶或不溶于水的产品（水溶度<1 mg/mL）。 建议您先取少量样品进行尝试，如该配方可行，再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80： Saline = 10 : 5 : 85 (如： 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备：将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中，得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 ：Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如： 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如： 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液，加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如：100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中，得到0.5%CMC-Na澄清溶液；然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中，得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8960 mL | 14.4802 mL | 28.9603 mL | |
| 5 mM | 0.5792 mL | 2.8960 mL | 5.7921 mL | |
| 10 mM | 0.2896 mL | 1.4480 mL | 2.8960 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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