| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
IC50: 64.5 μM (METTL3-METTL14)[1]
METTL3-METTL14 (methyltransferase-like 3 and 14 complex). STM2120 targets the METTL3-METTL14 heterodimer complex, which is the primary enzyme responsible for catalyzing N⁶-methyladenosine (m⁶A) modification of RNA. By inhibiting this complex, STM2120 disrupts the methylation of adenosine residues in RNA, affecting RNA stability, splicing, and translation. The compound has an IC₅₀ of 64.5 μM against METTL3-METTL14. However, it is significantly less potent than STM2457 and is primarily used as a negative control in studies investigating METTL3 function. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
STM2120(0.04-50 μM;72 小时)不影响 MOLM-13 细胞的增殖。为了研究靶向 METTL3 酶活性作为抗白血病策略的治疗潜力,我们开发了小分子 STM2457。我们对 25 万种不同的类药化合物进行了高通量筛选 (HTS)。STM1760 [半数抑制浓度 (IC50) = 51.7 μM] 是 HTS 筛选出的仅有的两个非 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 相关化合物之一(扩展数据图 1a、b)。经过效力、体外 ADME 和体内药代动力学性质的优化,我们最终确定了 STM2457(图 1a)。 STM2120 (IC50 = 64.5 μM) 被鉴定为结构相关化合物,但其活性比 STM2457 低 1000 倍(图 1b 和扩展数据图 1a)[1]。
在生化酶活性测定中,STM2120 对 METTL3-METTL14 的抑制活性较弱,IC₅₀ 为 64.5 μM。在细胞实验中,STM2120(0.04-50 μM;72 小时)不影响 MOLM-13 细胞的增殖。这种缺乏细胞活性与其作为阴性对照的作用相符,因为其活性比强效 METTL3 抑制剂 STM2457 低约 1000 倍。该化合物可作为区分细胞研究中特异性 METTL3 抑制作用和非特异性作用的有效工具。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
STM2120 并非设计用于体内治疗,主要用作阴性对照化合物。其活性较弱(IC₅₀ = 64.5 μM),且效力比 STM2457 低 1000 倍,因此不适用于实现有效的体内 METTL3 抑制。在研究环境中,它用于验证观察到的生物学效应是否特异性地归因于 METTL3 抑制,而非更强效化合物的脱靶效应。
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| 酶活实验 |
METTL3/14 RF/MS 甲基转移酶活性测定[1]
建立此酶活性测定方法是为了测定 RNA 甲基转移酶活性的 IC50 值。所用酶为杆状病毒表达系统中共表达的全长 His 标签 METTL3 和全长 FLAG 标签 METTL14。酶复合物采用标准亲和层析法纯化。酶促反应在室温下于 384 孔板中进行,反应体系为 20 μL,包含 20 mM Tris-HCl (pH 7.6)、1 mM DTT 和 0.01% Tween-20。将终浓度为 5 nM 的 METTL3/14 与不同浓度的化合物预孵育 10 分钟,随后加入终浓度为 0.2 μM 的合成 RNA 底物(5'P-uacacucgaucuggacuaaagcugcuc-3')和终浓度为 0.5 μM 的 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM)。反应在室温下继续孵育 60 分钟,然后加入 40 μL 含有内标的 7.5% 三氯乙酸 (TCA) 终止反应。反应结束后,密封反应板,离心,并于 4°C 保存直至分析。使用 RapidFire™ 质谱 (RF/MS) 平台测定 S-腺苷同型半胱氨酸 (SAH) 产物来评估 METTL3 活性。将已停止反应且稳定的检测板置于安捷伦 RF300 集成自动进样器/固相萃取 (SPE) 系统(与 ABSciex 4000 质谱仪联用)上进行分析,以定量 SAH,并以两个内标的信号比值进行归一化。产物 (SAH) 的质量跃迁为 384.9/135.9 Da。内标的跃迁用于基质效应的归一化。[2] STM2120 的非细胞检测方法包括使用 RapidFire™ 质谱 (RF/MS) 平台测定 METTL3/14 甲基转移酶活性。该酶活性测定使用杆状病毒系统中共表达的全长 His 标签 METTL3 和 FLAG 标签 METTL14。反应在含有 20 mM TrisCl(pH 7.6)、1 mM DTT 和 0.01% Tween-20 的 384 孔板中进行,其中预先加入 5 nM METTL3/14 与化合物孵育 10 分钟,随后加入 0.2 μM RNA 底物和 0.5 μM SAM。60 分钟后,用 7.5% TCA 终止反应,并通过 RF/MS 分析 SAH 产物。 |
| 细胞实验 |
药物和增殖实验[1]
所有悬浮细胞均以每孔5,000–10,000个细胞的密度接种于96孔板中,每个处理设置三个复孔,并用载体或指定浓度的STM2457和STM2120(0.04–50 μM)处理72小时。第4天,用新鲜培养基和化合物将等体积的培养基分装至所有孔中,使每个孔中的细胞密度与初始接种密度一致。第6天使用CellTiter 96 AQueous非放射性细胞增殖检测试剂盒检测细胞增殖情况,以计算相对细胞增殖率。所有化合物均溶于DMSO。 基于细胞的STM2120实验通常使用MOLM-13白血病细胞来评估其对细胞增殖的影响。将细胞用浓度范围为 0.04 至 50 μM 的 STM2120 处理 72 小时,并使用标准细胞活力检测方法测量细胞增殖情况。该化合物对 MOLM-13 细胞增殖无影响,证实其作为阴性对照的无活性。后续的细胞实验可能包括评估化合物处理后 m⁶A RNA 甲基化水平,以确认该化合物在细胞环境中不抑制 METTL3 活性。 |
| 动物实验 |
由于STM2120通常用作活性较弱的阴性对照化合物,因此很少进行其体内研究。该化合物一般不用于动物治疗或药理学研究。相反,它作为参考化合物用于生化和细胞实验,以验证活性更强的化合物(例如STM2457)对METTL3抑制的特异性。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
STM2120 的分子量为 333.34 g/mol,分子式为 C₁₈H₁₅N₅O₂。其 LogP 值为 1.4,tPSA 值为 79.1 Ų。该化合物可溶于 DMSO(100 mg/mL,~300 mM)。外观为灰白色至浅黄色固体。储存建议:粉末在 -20°C 下可保存 3 年,或在 4°C 下可保存 2 年;溶剂在 -80°C 下可保存 6 个月,或在 -20°C 下可保存 1 个月。纯度 ≥98%。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
STM2120的具体毒性数据有限。作为一种主要用作阴性对照的研究化合物,尚未有全面的毒理学研究报道。该化合物在浓度高达50 μM时对MOLM-13细胞增殖无影响,表明其对该细胞系的细胞毒性较低。处理该化合物时应遵循标准实验室安全操作规程,包括使用个人防护装备。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
N6-甲基腺苷 (m6A) 是一种丰富的 RNA 内修饰1,2,主要由 METTL3-METTL14 甲基转移酶复合物催化3,4。m6A 甲基转移酶 METTL3 与急性髓系白血病 (AML) 的发生和维持密切相关,但靶向该酶的治疗潜力尚不明确5-7。本文报道了高效、高选择性的首创 METTL3 催化抑制剂 STM2457 的鉴定和表征,并解析了 STM2457-METTL3-METTL14 复合物的晶体结构。STM2457 治疗可抑制 AML 细胞生长,并促进细胞分化和凋亡。这些细胞效应伴随着已知白血病 mRNA 上 m6A 水平的选择性降低以及这些 mRNA 表达的下降,这与翻译缺陷相一致。我们证实,在多种急性髓系白血病 (AML) 小鼠模型中,体内 METTL3 的药理学抑制可导致移植失败并延长生存期,尤其能靶向 AML 的关键干细胞亚群。总体而言,这些结果表明抑制 METTL3 是治疗 AML 的一种潜在策略,并为靶向 RNA 修饰酶作为一种有前景的抗癌治疗方法提供了概念验证。[1] STM2120 是一种 METTL3-METTL14 抑制剂,作为强效 METTL3 抑制剂 STM2457 的阴性对照而开发。它是从 25 万个类药化合物的高通量筛选中发现的,其中 STM1760 (IC₅₀ = 51.7 μM) 是仅有的两个非 SAM 相关化合物之一。STM2120 (IC₅₀ = 64.5 μM) 与 STM2457 结构相关,但活性比 STM2457 低 1000 倍。 METTL3是m⁶A甲基转移酶复合物的催化亚基,抑制METTL3正被探索作为一种抗白血病策略。该化合物仅供研究使用。
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| 分子式 |
C18H15N5O2
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|---|---|
| 分子量 |
333.344002962112
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| 精确质量 |
333.122574
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| CAS号 |
2762286-04-2
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| PubChem CID |
168355665
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| 外观&性状 |
Typically exists as Off-white to light yellow solids at room temperature
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| LogP |
1.4
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| tPSA |
79.1Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
1
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
3
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| 重原子数目 |
25
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| 分子复杂度/Complexity |
708
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
O=C(C1=CC(N2C=CC=CC2=N1)=O)NCC1=CN2C(C)=CC=CC2=N1
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| InChi Key |
BOTBQIXFHWFWHV-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C18H15N5O2/c1-12-5-4-7-15-20-13(11-23(12)15)10-19-18(25)14-9-17(24)22-8-3-2-6-16(22)21-14/h2-9,11H,10H2,1H3,(H,19,25)
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| 化学名 |
N-[(5-methylimidazo[1,2-a]pyridin-2-yl)methyl]-4-oxopyrido[1,2-a]pyrimidine-2-carboxamide
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| 别名 |
STM-2120; EX-A8309; DA-67811; STM2120; EXA8309; DA67811;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.9999 mL | 14.9997 mL | 29.9994 mL | |
| 5 mM | 0.6000 mL | 2.9999 mL | 5.9999 mL | |
| 10 mM | 0.3000 mL | 1.5000 mL | 2.9999 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。