STM2120

别名: STM-2120; EX-A8309; DA-67811; STM2120; EXA8309; DA67811; STM-2120
目录号: V62100 纯度: ≥98%
STM2120是一种METTL3-METTL14抑制剂(拮抗剂),IC50为64.5 μM。
STM2120 CAS号: 2762286-04-2
产品类别: Others 12
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
STM2120 是一种 METTL3-METTL14 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 64.5 μM。其活性比 STM2457 低 1000 倍,因此常被用作 STM2457 的阴性对照。
STM2120(CAS 2762286-04-2)是一种 METTL3-METTL14 甲基转移酶复合物的小分子抑制剂,分子式为 C₁₈H₁₅N₅O₂,分子量为 333.34 g/mol。它作为活性更强的 METTL3 抑制剂 STM2457 的阴性对照,其活性大约低 1000 倍。该化合物被鉴定为 METTL3-METTL14 抑制剂,IC₅₀ 为 64.5 μM。 STM2120 用于研究 METTL3 在 RNA 甲基化中的作用,尤其是在癌症和其他疾病的背景下。它是一种研究级化合物,仅供实验室使用。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 64.5 μM (METTL3-METTL14)[1]
METTL3-METTL14 (methyltransferase-like 3 and 14 complex). STM2120 targets the METTL3-METTL14 heterodimer complex, which is the primary enzyme responsible for catalyzing N⁶-methyladenosine (m⁶A) modification of RNA. By inhibiting this complex, STM2120 disrupts the methylation of adenosine residues in RNA, affecting RNA stability, splicing, and translation. The compound has an IC₅₀ of 64.5 μM against METTL3-METTL14. However, it is significantly less potent than STM2457 and is primarily used as a negative control in studies investigating METTL3 function.
体外研究 (In Vitro)
STM2120(0.04-50 μM;72 小时)不影响 MOLM-13 细胞的增殖。为了研究靶向 METTL3 酶活性作为抗白血病策略的治疗潜力,我们开发了小分子 STM2457。我们对 25 万种不同的类药化合物进行了高通量筛选 (HTS)。STM1760 [半数抑制浓度 (IC50) = 51.7 μM] 是 HTS 筛选出的仅有的两个非 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 相关化合物之一(扩展数据图 1a、b)。经过效力、体外 ADME 和体内药代动力学性质的优化,我们最终确定了 STM2457(图 1a)。 STM2120 (IC50 = 64.5 μM) 被鉴定为结构相关化合物,但其活性比 STM2457 低 1000 倍(图 1b 和扩展数据图 1a)[1]。
在生化酶活性测定中,STM2120 对 METTL3-METTL14 的抑制活性较弱,IC₅₀ 为 64.5 μM。在细胞实验中,STM2120(0.04-50 μM;72 小时)不影响 MOLM-13 细胞的增殖。这种缺乏细胞活性与其作为阴性对照的作用相符,因为其活性比强效 METTL3 抑制剂 STM2457 低约 1000 倍。该化合物可作为区分细胞研究中特异性 METTL3 抑制作用和非特异性作用的有效工具。
体内研究 (In Vivo)
STM2120 并非设计用于体内治疗,主要用作阴性对照化合物。其活性较弱(IC₅₀ = 64.5 μM),且效力比 STM2457 低 1000 倍,因此不适用于实现有效的体内 METTL3 抑制。在研究环境中,它用于验证观察到的生物学效应是否特异性地归因于 METTL3 抑制,而非更强效化合物的脱靶效应。
酶活实验
METTL3/14 RF/MS 甲基转移酶活性测定[1]
建立此酶活性测定方法是为了测定 RNA 甲基转移酶活性的 IC50 值。所用酶为杆状病毒表达系统中共表达的全长 His 标签 METTL3 和全长 FLAG 标签 METTL14。酶复合物采用标准亲和层析法纯化。酶促反应在室温下于 384 孔板中进行,反应体系为 20 μL,包含 20 mM Tris-HCl (pH 7.6)、1 mM DTT 和 0.01% Tween-20。将终浓度为 5 nM 的 METTL3/14 与不同浓度的化合物预孵育 10 分钟,随后加入终浓度为 0.2 μM 的合成 RNA 底物(5'P-uacacucgaucuggacuaaagcugcuc-3')和终浓度为 0.5 μM 的 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM)。反应在室温下继续孵育 60 分钟,然后加入 40 μL 含有内标的 7.5% 三氯乙酸 (TCA) 终止反应。反应结束后,密封反应板,离心,并于 4°C 保存直至分析。使用 RapidFire™ 质谱 (RF/MS) 平台测定 S-腺苷同型半胱氨酸 (SAH) 产物来评估 METTL3 活性。将已停止反应且稳定的检测板置于安捷伦 RF300 集成自动进样器/固相萃取 (SPE) 系统(与 ABSciex 4000 质谱仪联用)上进行分析,以定量 SAH,并以两个内标的信号比值进行归一化。产物 (SAH) 的质量跃迁为 384.9/135.9 Da。内标的跃迁用于基质效应的归一化。[2]
STM2120 的非细胞检测方法包括使用 RapidFire™ 质谱 (RF/MS) 平台测定 METTL3/14 甲基转移酶活性。该酶活性测定使用杆状病毒系统中共表达的全长 His 标签 METTL3 和 FLAG 标签 METTL14。反应在含有 20 mM TrisCl(pH 7.6)、1 mM DTT 和 0.01% Tween-20 的 384 孔板中进行,其中预先加入 5 nM METTL3/14 与化合物孵育 10 分钟,随后加入 0.2 μM RNA 底物和 0.5 μM SAM。60 分钟后,用 7.5% TCA 终止反应,并通过 RF/MS 分析 SAH 产物。
细胞实验
药物和增殖实验[1]
所有悬浮细胞均以每孔5,000–10,000个细胞的密度接种于96孔板中,每个处理设置三个复孔,并用载体或指定浓度的STM2457和STM2120(0.04–50 μM)处理72小时。第4天,用新鲜培养基和化合物将等体积的培养基分装至所有孔中,使每个孔中的细胞密度与初始接种密度一致。第6天使用CellTiter 96 AQueous非放射性细胞增殖检测试剂盒检测细胞增殖情况,以计算相对细胞增殖率。所有化合物均溶于DMSO。
基于细胞的STM2120实验通常使用MOLM-13白血病细胞来评估其对细胞增殖的影响。将细胞用浓度范围为 0.04 至 50 μM 的 STM2120 处理 72 小时,并使用标准细胞活力检测方法测量细胞增殖情况。该化合物对 MOLM-13 细胞增殖无影响,证实其作为阴性对照的无活性。后续的细胞实验可能包括评估化合物处理后 m⁶A RNA 甲基化水平,以确认该化合物在细胞环境中不抑制 METTL3 活性。
动物实验
由于STM2120通常用作活性较弱的阴性对照化合物,因此很少进行其体内研究。该化合物一般不用于动物治疗或药理学研究。相反,它作为参考化合物用于生化和细胞实验,以验证活性更强的化合物(例如STM2457)对METTL3抑制的特异性。
药代性质 (ADME/PK)
STM2120 的分子量为 333.34 g/mol,分子式为 C₁₈H₁₅N₅O₂。其 LogP 值为 1.4,tPSA 值为 79.1 Ų。该化合物可溶于 DMSO(100 mg/mL,~300 mM)。外观为灰白色至浅黄色固体。储存建议:粉末在 -20°C 下可保存 3 年,或在 4°C 下可保存 2 年;溶剂在 -80°C 下可保存 6 个月,或在 -20°C 下可保存 1 个月。纯度 ≥98%。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
STM2120的具体毒性数据有限。作为一种主要用作阴性对照的研究化合物,尚未有全面的毒理学研究报道。该化合物在浓度高达50 μM时对MOLM-13细胞增殖无影响,表明其对该细胞系的细胞毒性较低。处理该化合物时应遵循标准实验室安全操作规程,包括使用个人防护装备。该化合物仅供研究使用,不得用于人体。
参考文献

[1]. Small-molecule inhibition of METTL3 as a strategy against myeloid leukaemia. Nature. 2021 May;593(7860):597-601.

其他信息
N6-甲基腺苷 (m6A) 是一种丰富的 RNA 内修饰1,2,主要由 METTL3-METTL14 甲基转移酶复合物催化3,4。m6A 甲基转移酶 METTL3 与急性髓系白血病 (AML) 的发生和维持密切相关,但靶向该酶的治疗潜力尚不明确5-7。本文报道了高效、高选择性的首创 METTL3 催化抑制剂 STM2457 的鉴定和表征,并解析了 STM2457-METTL3-METTL14 复合物的晶体结构。STM2457 治疗可抑制 AML 细胞生长,并促进细胞分化和凋亡。这些细胞效应伴随着已知白血病 mRNA 上 m6A 水平的选择性降低以及这些 mRNA 表达的下降,这与翻译缺陷相一致。我们证实,在多种急性髓系白血病 (AML) 小鼠模型中,体内 METTL3 的药理学抑制可导致移植失败并延长生存期,尤其能靶向 AML 的关键干细胞亚群。总体而言,这些结果表明抑制 METTL3 是治疗 AML 的一种潜在策略,并为靶向 RNA 修饰酶作为一种有前景的抗癌治疗方法提供了概念验证。[1] STM2120 是一种 METTL3-METTL14 抑制剂,作为强效 METTL3 抑制剂 STM2457 的阴性对照而开发。它是从 25 万个类药化合物的高通量筛选中发现的,其中 STM1760 (IC₅₀ = 51.7 μM) 是仅有的两个非 SAM 相关化合物之一。STM2120 (IC₅₀ = 64.5 μM) 与 STM2457 结构相关,但活性比 STM2457 低 1000 倍。 METTL3是m⁶A甲基转移酶复合物的催化亚基,抑制METTL3正被探索作为一种抗白血病策略。该化合物仅供研究使用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H15N5O2
分子量
333.344002962112
精确质量
333.122574
CAS号
2762286-04-2
PubChem CID
168355665
外观&性状
Typically exists as Off-white to light yellow solids at room temperature
LogP
1.4
tPSA
79.1Ų
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
708
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C(C1=CC(N2C=CC=CC2=N1)=O)NCC1=CN2C(C)=CC=CC2=N1
InChi Key
BOTBQIXFHWFWHV-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H15N5O2/c1-12-5-4-7-15-20-13(11-23(12)15)10-19-18(25)14-9-17(24)22-8-3-2-6-16(22)21-14/h2-9,11H,10H2,1H3,(H,19,25)
化学名
N-[(5-methylimidazo[1,2-a]pyridin-2-yl)methyl]-4-oxopyrido[1,2-a]pyrimidine-2-carboxamide
别名
STM-2120; EX-A8309; DA-67811; STM2120; EXA8309; DA67811;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9999 mL 14.9997 mL 29.9994 mL
5 mM 0.6000 mL 2.9999 mL 5.9999 mL
10 mM 0.3000 mL 1.5000 mL 2.9999 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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